MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_017154	GGT	2	6	3669782	3669787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123480
57002	NC_017154	CTT	2	6	3669845	3669850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123480
57003	NC_017154	CA	3	6	3669858	3669863	50 %	0 %	0 %	50 %	384123480
57004	NC_017154	TCG	2	6	3669889	3669894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123480
57005	NC_017154	GAG	2	6	3669899	3669904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384123480
57006	NC_017154	ATGGT	2	10	3669946	3669955	20 %	40 %	40 %	0 %	384123480
57007	NC_017154	AAT	2	6	3669973	3669978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123480
57008	NC_017154	T	6	6	3670147	3670152	0 %	100 %	0 %	0 %	384123481
57009	NC_017154	CCA	2	6	3670158	3670163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123481
57010	NC_017154	AGCTT	2	10	3670186	3670195	20 %	40 %	20 %	20 %	384123481
57011	NC_017154	GTTGCC	2	12	3670216	3670227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123481
57012	NC_017154	TTC	2	6	3670256	3670261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123481
57013	NC_017154	CAG	2	6	3670265	3670270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123481
57014	NC_017154	GCA	2	6	3670288	3670293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123481
57015	NC_017154	ATC	2	6	3670388	3670393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123481
57016	NC_017154	CTG	2	6	3670421	3670426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123481
57017	NC_017154	CAG	2	6	3670598	3670603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123481
57018	NC_017154	TCA	2	6	3670605	3670610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123481
57019	NC_017154	CAGC	2	8	3670630	3670637	25 %	0 %	25 %	50 %	384123481
57020	NC_017154	AC	3	6	3670638	3670643	50 %	0 %	0 %	50 %	384123481
57021	NC_017154	AT	3	6	3670731	3670736	50 %	50 %	0 %	0 %	384123481
57022	NC_017154	CCA	2	6	3670743	3670748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123481
57023	NC_017154	CG	3	6	3670778	3670783	0 %	0 %	50 %	50 %	384123481
57024	NC_017154	CTC	2	6	3670892	3670897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384123481
57025	NC_017154	TCC	2	6	3671187	3671192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384123481
57026	NC_017154	TGCC	2	8	3671225	3671232	0 %	25 %	25 %	50 %	384123481
57027	NC_017154	T	6	6	3671301	3671306	0 %	100 %	0 %	0 %	384123481
57028	NC_017154	TCA	2	6	3671421	3671426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123481
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57030	NC_017154	GAT	2	6	3671476	3671481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123481
57031	NC_017154	TAA	2	6	3671503	3671508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123481
57032	NC_017154	CCAA	2	8	3671674	3671681	50 %	0 %	0 %	50 %	384123481
57033	NC_017154	TCA	2	6	3671740	3671745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123481
57034	NC_017154	TAT	2	6	3671791	3671796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123482
57035	NC_017154	CCA	2	6	3671799	3671804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123482
57036	NC_017154	ATC	2	6	3671824	3671829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123482
57037	NC_017154	A	6	6	3671869	3671874	100 %	0 %	0 %	0 %	384123482
57038	NC_017154	CTA	2	6	3671930	3671935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123482
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57040	NC_017154	AGCC	2	8	3671980	3671987	25 %	0 %	25 %	50 %	384123482
57041	NC_017154	TAA	2	6	3672027	3672032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123482
57042	NC_017154	AAC	2	6	3672042	3672047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123482
57043	NC_017154	CAG	2	6	3672221	3672226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123483
57044	NC_017154	AGC	2	6	3672321	3672326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123483
57045	NC_017154	CAT	2	6	3672373	3672378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123483
57046	NC_017154	AAT	2	6	3672400	3672405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123483
57047	NC_017154	ATA	2	6	3672485	3672490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123483
57048	NC_017154	T	6	6	3672559	3672564	0 %	100 %	0 %	0 %	384123483
57049	NC_017154	A	6	6	3672573	3672578	100 %	0 %	0 %	0 %	384123483
57050	NC_017154	AGGT	2	8	3672631	3672638	25 %	25 %	50 %	0 %	384123483
57051	NC_017154	TCA	2	6	3672666	3672671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123483
57052	NC_017154	GCC	2	6	3672700	3672705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123483
57053	NC_017154	CCAT	2	8	3672744	3672751	25 %	25 %	0 %	50 %	384123483
57054	NC_017154	C	6	6	3674577	3674582	0 %	0 %	0 %	100 %	384123484
57055	NC_017154	GAC	2	6	3674599	3674604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123484
57056	NC_017154	CTG	2	6	3674624	3674629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123484
57057	NC_017154	TTTAC	2	10	3674658	3674667	20 %	60 %	0 %	20 %	384123484
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57059	NC_017154	ATC	2	6	3674708	3674713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123484
57060	NC_017154	TGG	2	6	3674719	3674724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123484
57061	NC_017154	CAATA	2	10	3674726	3674735	60 %	20 %	0 %	20 %	384123484
57062	NC_017154	ACTG	2	8	3674806	3674813	25 %	25 %	25 %	25 %	384123484
57063	NC_017154	CTGC	2	8	3674875	3674882	0 %	25 %	25 %	50 %	384123484
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57066	NC_017154	GTC	2	6	3675185	3675190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123484
57067	NC_017154	CGC	2	6	3675230	3675235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123484
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57071	NC_017154	GCA	2	6	3675420	3675425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123484
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