MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_017154	ACA	2	6	3534204	3534209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123374
55002	NC_017154	TCA	2	6	3534219	3534224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123374
55003	NC_017154	CTG	2	6	3534244	3534249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123374
55004	NC_017154	GTTTG	2	10	3534366	3534375	0 %	60 %	40 %	0 %	384123374
55005	NC_017154	CGG	3	9	3534398	3534406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123374
55006	NC_017154	ATG	2	6	3534440	3534445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123374
55007	NC_017154	GAT	3	9	3534463	3534471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123374
55008	NC_017154	GAT	2	6	3534612	3534617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123374
55009	NC_017154	TG	3	6	3534653	3534658	0 %	50 %	50 %	0 %	384123374
55010	NC_017154	TTA	2	6	3534700	3534705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123374
55011	NC_017154	ATT	2	6	3534804	3534809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123374
55012	NC_017154	CAA	2	6	3534919	3534924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123374
55013	NC_017154	CAAA	2	8	3534970	3534977	75 %	0 %	0 %	25 %	384123374
55014	NC_017154	AGG	2	6	3534995	3535000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384123374
55015	NC_017154	ATT	2	6	3535072	3535077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123374
55016	NC_017154	TAA	2	6	3535083	3535088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123374
55017	NC_017154	AGA	2	6	3535298	3535303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123375
55018	NC_017154	TGC	2	6	3535312	3535317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123375
55019	NC_017154	AAAG	2	8	3535320	3535327	75 %	0 %	25 %	0 %	384123375
55020	NC_017154	TGA	2	6	3535343	3535348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123375
55021	NC_017154	ACTG	2	8	3535421	3535428	25 %	25 %	25 %	25 %	384123375
55022	NC_017154	TCA	2	6	3535484	3535489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123375
55023	NC_017154	GCC	2	6	3535516	3535521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123375
55024	NC_017154	CTA	2	6	3535534	3535539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123375
55025	NC_017154	GA	3	6	3535579	3535584	50 %	0 %	50 %	0 %	384123375
55026	NC_017154	ACG	2	6	3535591	3535596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123375
55027	NC_017154	CTC	2	6	3535613	3535618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384123375
55028	NC_017154	TGC	2	6	3535652	3535657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123375
55029	NC_017154	AAC	2	6	3535824	3535829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123375
55030	NC_017154	TAT	2	6	3535843	3535848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123375
55031	NC_017154	A	6	6	3535884	3535889	100 %	0 %	0 %	0 %	384123375
55032	NC_017154	ACC	2	6	3535904	3535909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123375
55033	NC_017154	CTG	2	6	3535920	3535925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123375
55034	NC_017154	GTT	2	6	3535970	3535975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384123375
55035	NC_017154	ATG	2	6	3536017	3536022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123375
55036	NC_017154	AC	3	6	3536024	3536029	50 %	0 %	0 %	50 %	384123375
55037	NC_017154	A	6	6	3536045	3536050	100 %	0 %	0 %	0 %	384123375
55038	NC_017154	CAT	2	6	3536084	3536089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123375
55039	NC_017154	AGC	2	6	3536193	3536198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123375
55040	NC_017154	CG	3	6	3536314	3536319	0 %	0 %	50 %	50 %	384123375
55041	NC_017154	CAA	2	6	3536328	3536333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123375
55042	NC_017154	AAC	2	6	3536356	3536361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123375
55043	NC_017154	TGG	2	6	3536393	3536398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123375
55044	NC_017154	ATG	2	6	3536461	3536466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123375
55045	NC_017154	TGA	2	6	3536603	3536608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123375
55046	NC_017154	TAC	2	6	3536737	3536742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123375
55047	NC_017154	CTTTG	2	10	3536769	3536778	0 %	60 %	20 %	20 %	384123375
55048	NC_017154	TGG	2	6	3536830	3536835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384123375
55049	NC_017154	GAA	2	6	3536862	3536867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123375
55050	NC_017154	GCA	2	6	3536883	3536888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123375
55051	NC_017154	GAA	2	6	3536913	3536918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123375
55052	NC_017154	CAT	2	6	3536924	3536929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123375
55053	NC_017154	G	8	8	3536930	3536937	0 %	0 %	100 %	0 %	384123375
55054	NC_017154	GCG	2	6	3537066	3537071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123375
55055	NC_017154	TTAC	2	8	3537286	3537293	25 %	50 %	0 %	25 %	384123376
55056	NC_017154	CA	3	6	3537568	3537573	50 %	0 %	0 %	50 %	384123376
55057	NC_017154	TTG	2	6	3537765	3537770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384123376
55058	NC_017154	GCA	3	9	3537995	3538003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123377
55059	NC_017154	AAT	2	6	3538015	3538020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123377
55060	NC_017154	ATC	2	6	3538021	3538026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123377
55061	NC_017154	CAA	2	6	3538176	3538181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123377
55062	NC_017154	CA	3	6	3538190	3538195	50 %	0 %	0 %	50 %	384123377
55063	NC_017154	TAC	2	6	3538197	3538202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123377
55064	NC_017154	CAA	2	6	3538276	3538281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123377
55065	NC_017154	GAA	2	6	3538508	3538513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123378
55066	NC_017154	T	6	6	3538686	3538691	0 %	100 %	0 %	0 %	384123378
55067	NC_017154	CAC	2	6	3538732	3538737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123378
55068	NC_017154	TGGC	2	8	3538740	3538747	0 %	25 %	50 %	25 %	384123378
55069	NC_017154	TGC	2	6	3538758	3538763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123378
55070	NC_017154	GCA	2	6	3538797	3538802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123378
55071	NC_017154	AGCA	2	8	3538805	3538812	50 %	0 %	25 %	25 %	384123378
55072	NC_017154	GCA	2	6	3538929	3538934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123378
55073	NC_017154	CAC	2	6	3539062	3539067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123378
55074	NC_017154	AAGC	2	8	3539158	3539165	50 %	0 %	25 %	25 %	384123378
55075	NC_017154	CAGG	2	8	3539172	3539179	25 %	0 %	50 %	25 %	384123378
55076	NC_017154	GGAA	2	8	3539256	3539263	50 %	0 %	50 %	0 %	384123378
55077	NC_017154	AAG	2	6	3539324	3539329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123378
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55082	NC_017154	ATTG	2	8	3539768	3539775	25 %	50 %	25 %	0 %	384123379
55083	NC_017154	CAT	2	6	3539791	3539796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123379
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55085	NC_017154	GAAA	2	8	3539871	3539878	75 %	0 %	25 %	0 %	384123379
55086	NC_017154	TGC	2	6	3539903	3539908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123379
55087	NC_017154	GCG	2	6	3540059	3540064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123379
55088	NC_017154	AGC	2	6	3540068	3540073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123379
55089	NC_017154	TTA	2	6	3540167	3540172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123380
55090	NC_017154	CAT	2	6	3540351	3540356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123380
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55094	NC_017154	CGCAAT	2	12	3540514	3540525	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384123380
55095	NC_017154	CAA	2	6	3540549	3540554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123380
55096	NC_017154	GACC	2	8	3540744	3540751	25 %	0 %	25 %	50 %	384123381
55097	NC_017154	AGCT	2	8	3540805	3540812	25 %	25 %	25 %	25 %	384123381
55098	NC_017154	CCA	2	6	3540873	3540878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123381
55099	NC_017154	CAGA	2	8	3540926	3540933	50 %	0 %	25 %	25 %	384123381
55100	NC_017154	CAT	2	6	3540958	3540963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123381
55101	NC_017154	GTT	2	6	3541008	3541013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384123381
55102	NC_017154	ATC	2	6	3541036	3541041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123381
55103	NC_017154	AGCC	2	8	3541054	3541061	25 %	0 %	25 %	50 %	384123381
55104	NC_017154	ATG	2	6	3541347	3541352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123381
55105	NC_017154	GCA	2	6	3541520	3541525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123381
55106	NC_017154	GCG	2	6	3541544	3541549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123381
55107	NC_017154	CTC	2	6	3541620	3541625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384123381
55108	NC_017154	CGA	2	6	3541701	3541706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123381
55109	NC_017154	CGT	2	6	3541753	3541758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123381
55110	NC_017154	GC	3	6	3541980	3541985	0 %	0 %	50 %	50 %	384123382
55111	NC_017154	TTC	2	6	3541989	3541994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123382
55112	NC_017154	CCA	2	6	3542093	3542098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123382
55113	NC_017154	CAT	2	6	3542168	3542173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123382
55114	NC_017154	CGT	2	6	3542215	3542220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123382
55115	NC_017154	GGC	4	12	3542330	3542341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123382
55116	NC_017154	TCAC	2	8	3542356	3542363	25 %	25 %	0 %	50 %	384123382
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55123	NC_017154	TTC	2	6	3542855	3542860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123383
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55128	NC_017154	ATTT	2	8	3542976	3542983	25 %	75 %	0 %	0 %	384123383
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55142	NC_017154	ATTT	2	8	3543638	3543645	25 %	75 %	0 %	0 %	384123384
55143	NC_017154	TC	3	6	3543646	3543651	0 %	50 %	0 %	50 %	384123384
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55233	NC_017154	ATG	2	6	3549686	3549691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123389
55234	NC_017154	CTGG	2	8	3549717	3549724	0 %	25 %	50 %	25 %	384123389
55235	NC_017154	GCC	2	6	3549785	3549790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123389
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55237	NC_017154	TCA	2	6	3549887	3549892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123389
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55239	NC_017154	TCA	2	6	3550022	3550027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123389
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55253	NC_017154	ATG	2	6	3551112	3551117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123390
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55342	NC_017154	AACC	2	8	3557753	3557760	50 %	0 %	0 %	50 %	384123395
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55348	NC_017154	CCAGAC	2	12	3557902	3557913	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384123395
55349	NC_017154	ATG	2	6	3557963	3557968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123395
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55351	NC_017154	TCA	2	6	3558003	3558008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123395
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