MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017154	GTG	2	6	322526	322531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120871
5003	NC_017154	A	6	6	322895	322900	100 %	0 %	0 %	0 %	384120872
5004	NC_017154	CCAA	2	8	322901	322908	50 %	0 %	0 %	50 %	384120872
5005	NC_017154	CCG	2	6	322955	322960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120872
5006	NC_017154	AACG	2	8	323009	323016	50 %	0 %	25 %	25 %	384120872
5007	NC_017154	GCC	2	6	323061	323066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120872
5008	NC_017154	TTG	2	6	323099	323104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120872
5009	NC_017154	G	6	6	323176	323181	0 %	0 %	100 %	0 %	384120872
5010	NC_017154	GCG	2	6	323222	323227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120872
5011	NC_017154	CGTG	2	8	323251	323258	0 %	25 %	50 %	25 %	384120872
5012	NC_017154	GCA	2	6	323331	323336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120872
5013	NC_017154	CTG	2	6	323345	323350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120872
5014	NC_017154	AAC	2	6	323457	323462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120872
5015	NC_017154	GGC	2	6	323563	323568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120872
5016	NC_017154	ACC	2	6	323588	323593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120872
5017	NC_017154	TG	3	6	323607	323612	0 %	50 %	50 %	0 %	384120872
5018	NC_017154	GAT	2	6	323623	323628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120872
5019	NC_017154	GATCA	2	10	323672	323681	40 %	20 %	20 %	20 %	384120872
5020	NC_017154	GAT	2	6	323744	323749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120872
5021	NC_017154	TGA	2	6	323812	323817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120872
5022	NC_017154	CTC	2	6	323818	323823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384120872
5023	NC_017154	GCG	2	6	323857	323862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120872
5024	NC_017154	G	6	6	323879	323884	0 %	0 %	100 %	0 %	384120872
5025	NC_017154	AGC	2	6	324045	324050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120872
5026	NC_017154	TTTA	2	8	324125	324132	25 %	75 %	0 %	0 %	384120872
5027	NC_017154	TGA	2	6	324136	324141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120872
5028	NC_017154	TGA	2	6	324160	324165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120872
5029	NC_017154	ATT	2	6	324182	324187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120872
5030	NC_017154	GAC	2	6	324281	324286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120872
5031	NC_017154	AGT	2	6	324288	324293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120872
5032	NC_017154	CAG	2	6	324402	324407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120873
5033	NC_017154	ACA	2	6	324439	324444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120873
5034	NC_017154	TGG	2	6	324474	324479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120873
5035	NC_017154	TGT	2	6	324481	324486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120873
5036	NC_017154	TTA	2	6	324512	324517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120873
5037	NC_017154	GCA	2	6	324521	324526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120873
5038	NC_017154	CA	4	8	324525	324532	50 %	0 %	0 %	50 %	384120873
5039	NC_017154	TGC	2	6	324615	324620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120873
5040	NC_017154	AGA	2	6	324640	324645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120873
5041	NC_017154	TGG	2	6	324657	324662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120873
5042	NC_017154	CCG	2	6	324678	324683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120873
5043	NC_017154	GGC	2	6	324892	324897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120873
5044	NC_017154	TGC	2	6	324931	324936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120873
5045	NC_017154	GCT	2	6	324962	324967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120873
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5049	NC_017154	TTA	2	6	325758	325763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120874
5050	NC_017154	TGC	2	6	325803	325808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120874
5051	NC_017154	TTTA	2	8	325847	325854	25 %	75 %	0 %	0 %	384120874
5052	NC_017154	ATT	3	9	325896	325904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120874
5053	NC_017154	GCG	2	6	326069	326074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120874
5054	NC_017154	GCA	2	6	326154	326159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120874
5055	NC_017154	GTT	2	6	326181	326186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120874
5056	NC_017154	TGC	2	6	326194	326199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120874
5057	NC_017154	TCTGA	2	10	326215	326224	20 %	40 %	20 %	20 %	384120874
5058	NC_017154	TGAA	2	8	326318	326325	50 %	25 %	25 %	0 %	384120874
5059	NC_017154	TCA	2	6	326372	326377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120874
5060	NC_017154	TCT	2	6	326396	326401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120874
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5062	NC_017154	GT	3	6	326437	326442	0 %	50 %	50 %	0 %	384120874
5063	NC_017154	GC	4	8	326565	326572	0 %	0 %	50 %	50 %	384120874
5064	NC_017154	GGCA	2	8	326576	326583	25 %	0 %	50 %	25 %	384120874
5065	NC_017154	TGG	2	6	326630	326635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120874
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5069	NC_017154	GAA	2	6	326774	326779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120874
5070	NC_017154	GCG	2	6	326833	326838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120874
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5073	NC_017154	TGG	2	6	327486	327491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120875
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5089	NC_017154	ATG	2	6	328928	328933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120876
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5091	NC_017154	TCA	2	6	329027	329032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120876
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5093	NC_017154	CGTT	2	8	329093	329100	0 %	50 %	25 %	25 %	384120876
5094	NC_017154	CATA	2	8	329139	329146	50 %	25 %	0 %	25 %	384120876
5095	NC_017154	TTTC	2	8	329283	329290	0 %	75 %	0 %	25 %	384120876
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5099	NC_017154	CGCAC	2	10	329489	329498	20 %	0 %	20 %	60 %	384120876
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5102	NC_017154	AG	3	6	329767	329772	50 %	0 %	50 %	0 %	384120876
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5105	NC_017154	CTG	2	6	329809	329814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120876
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5107	NC_017154	GTT	2	6	329854	329859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120876
5108	NC_017154	CT	3	6	329884	329889	0 %	50 %	0 %	50 %	384120876
5109	NC_017154	GGCA	2	8	329910	329917	25 %	0 %	50 %	25 %	384120876
5110	NC_017154	ATA	2	6	329931	329936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120876
5111	NC_017154	CTC	2	6	329938	329943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384120876
5112	NC_017154	CGG	2	6	329973	329978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120876
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5117	NC_017154	GT	3	6	330182	330187	0 %	50 %	50 %	0 %	384120876
5118	NC_017154	ACC	2	6	330206	330211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120876
5119	NC_017154	CGG	2	6	330230	330235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120876
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5121	NC_017154	CAT	2	6	330297	330302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120876
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5123	NC_017154	ACA	2	6	330584	330589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120876
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5243	NC_017154	TTTA	2	8	338206	338213	25 %	75 %	0 %	0 %	384120883
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5489	NC_017154	GGT	2	6	353570	353575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120893
5490	NC_017154	GGT	2	6	353598	353603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120893
5491	NC_017154	CCA	2	6	353630	353635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120893
5492	NC_017154	GCC	2	6	353692	353697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120893
5493	NC_017154	CAGCGC	2	12	353712	353723	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384120893
5494	NC_017154	AGA	3	9	353777	353785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120893
5495	NC_017154	GTTGT	2	10	353853	353862	0 %	60 %	40 %	0 %	384120893
5496	NC_017154	GATACA	2	12	353895	353906	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384120893
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5498	NC_017154	ATG	2	6	353998	354003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120893
5499	NC_017154	GTG	2	6	354019	354024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120893
5500	NC_017154	TCA	2	6	354026	354031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120893

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