MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_017154	AGCATC	2	12	3468172	3468183	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384123321
54002	NC_017154	TA	3	6	3468228	3468233	50 %	50 %	0 %	0 %	384123321
54003	NC_017154	TGC	2	6	3468278	3468283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123321
54004	NC_017154	AAT	2	6	3468310	3468315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123321
54005	NC_017154	GAA	2	6	3468342	3468347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123321
54006	NC_017154	CCA	2	6	3468380	3468385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123321
54007	NC_017154	CGCA	2	8	3468400	3468407	25 %	0 %	25 %	50 %	384123321
54008	NC_017154	GAA	2	6	3468451	3468456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123321
54009	NC_017154	C	7	7	3468520	3468526	0 %	0 %	0 %	100 %	384123321
54010	NC_017154	TAT	2	6	3468564	3468569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384123321
54011	NC_017154	ACC	2	6	3468596	3468601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123321
54012	NC_017154	CCA	2	6	3468611	3468616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123321
54013	NC_017154	TAAA	2	8	3468637	3468644	75 %	25 %	0 %	0 %	384123321
54014	NC_017154	TCG	2	6	3468660	3468665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123321
54015	NC_017154	AGC	2	6	3468712	3468717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123321
54016	NC_017154	GATT	2	8	3468751	3468758	25 %	50 %	25 %	0 %	384123321
54017	NC_017154	TAA	2	6	3468760	3468765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123321
54018	NC_017154	CTT	2	6	3469013	3469018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123322
54019	NC_017154	AGAT	2	8	3469033	3469040	50 %	25 %	25 %	0 %	384123322
54020	NC_017154	ACAAA	2	10	3469181	3469190	80 %	0 %	0 %	20 %	384123322
54021	NC_017154	CCG	2	6	3469195	3469200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384123322
54022	NC_017154	GCTT	2	8	3469309	3469316	0 %	50 %	25 %	25 %	384123322
54023	NC_017154	AATT	2	8	3469338	3469345	50 %	50 %	0 %	0 %	384123322
54024	NC_017154	TCAC	2	8	3469360	3469367	25 %	25 %	0 %	50 %	384123322
54025	NC_017154	CTA	2	6	3469463	3469468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123322
54026	NC_017154	TCATT	2	10	3469508	3469517	20 %	60 %	0 %	20 %	384123322
54027	NC_017154	AAG	2	6	3469628	3469633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123322
54028	NC_017154	ATA	2	6	3469645	3469650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123322
54029	NC_017154	CCA	2	6	3469669	3469674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123322
54030	NC_017154	TTGGTT	2	12	3469685	3469696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384123322
54031	NC_017154	TAC	2	6	3469698	3469703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123322
54032	NC_017154	ATTT	2	8	3469827	3469834	25 %	75 %	0 %	0 %	384123323
54033	NC_017154	TGAT	2	8	3469847	3469854	25 %	50 %	25 %	0 %	384123323
54034	NC_017154	AGC	2	6	3469867	3469872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123323
54035	NC_017154	ATC	2	6	3469877	3469882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123323
54036	NC_017154	ATC	2	6	3469981	3469986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123323
54037	NC_017154	ACA	2	6	3469994	3469999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123323
54038	NC_017154	AATG	2	8	3470007	3470014	50 %	25 %	25 %	0 %	384123323
54039	NC_017154	CTG	2	6	3470067	3470072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123323
54040	NC_017154	CCA	2	6	3470159	3470164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123323
54041	NC_017154	ACGA	2	8	3470194	3470201	50 %	0 %	25 %	25 %	384123323
54042	NC_017154	ATG	2	6	3470261	3470266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123323
54043	NC_017154	AAC	2	6	3470284	3470289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123323
54044	NC_017154	TACG	2	8	3470292	3470299	25 %	25 %	25 %	25 %	384123323
54045	NC_017154	ACC	2	6	3470320	3470325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123323
54046	NC_017154	TAA	2	6	3470364	3470369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123323
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54048	NC_017154	GA	3	6	3470429	3470434	50 %	0 %	50 %	0 %	384123323
54049	NC_017154	T	9	9	3470487	3470495	0 %	100 %	0 %	0 %	384123323
54050	NC_017154	ATA	2	6	3470515	3470520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123323
54051	NC_017154	CAA	2	6	3470558	3470563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384123323
54052	NC_017154	ATA	2	6	3470747	3470752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123323
54053	NC_017154	GATG	2	8	3470756	3470763	25 %	25 %	50 %	0 %	384123323
54054	NC_017154	TA	3	6	3471383	3471388	50 %	50 %	0 %	0 %	384123324
54055	NC_017154	TCG	2	6	3471428	3471433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123324
54056	NC_017154	TC	3	6	3471462	3471467	0 %	50 %	0 %	50 %	384123324
54057	NC_017154	TTC	2	6	3471508	3471513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123324
54058	NC_017154	GGCA	2	8	3471667	3471674	25 %	0 %	50 %	25 %	384123324
54059	NC_017154	GGATA	2	10	3471717	3471726	40 %	20 %	40 %	0 %	384123324
54060	NC_017154	ATC	2	6	3471727	3471732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123324
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54062	NC_017154	GCG	2	6	3471932	3471937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123324
54063	NC_017154	TAA	2	6	3472000	3472005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123324
54064	NC_017154	TGC	2	6	3472078	3472083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123324
54065	NC_017154	CTG	2	6	3472093	3472098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123324
54066	NC_017154	GCG	2	6	3472099	3472104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123324
54067	NC_017154	TCCA	2	8	3472133	3472140	25 %	25 %	0 %	50 %	384123324
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54069	NC_017154	GCA	2	6	3472197	3472202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123324
54070	NC_017154	CCA	2	6	3472207	3472212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123324
54071	NC_017154	CGG	2	6	3472238	3472243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384123324
54072	NC_017154	TTTGC	2	10	3472330	3472339	0 %	60 %	20 %	20 %	384123324
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54080	NC_017154	TG	3	6	3472858	3472863	0 %	50 %	50 %	0 %	384123325
54081	NC_017154	TAAC	2	8	3472886	3472893	50 %	25 %	0 %	25 %	384123325
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54084	NC_017154	ATG	2	6	3473017	3473022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123325
54085	NC_017154	CAG	2	6	3473061	3473066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123325
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54090	NC_017154	GTTCA	2	10	3473467	3473476	20 %	40 %	20 %	20 %	384123326
54091	NC_017154	ACTTC	2	10	3473484	3473493	20 %	40 %	0 %	40 %	384123326
54092	NC_017154	CTT	2	6	3473670	3473675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123326
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54099	NC_017154	GCA	3	9	3473858	3473866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123326
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54101	NC_017154	TAA	2	6	3473885	3473890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123326
54102	NC_017154	CTT	2	6	3474027	3474032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123326
54103	NC_017154	ATGCC	2	10	3474036	3474045	20 %	20 %	20 %	40 %	384123326
54104	NC_017154	TTG	2	6	3474049	3474054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384123326
54105	NC_017154	CAT	2	6	3474078	3474083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123326
54106	NC_017154	GCA	2	6	3474108	3474113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384123326
54107	NC_017154	AC	3	6	3474267	3474272	50 %	0 %	0 %	50 %	384123326
54108	NC_017154	TCG	2	6	3474446	3474451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123326
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54110	NC_017154	TCT	2	6	3474524	3474529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384123326
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54114	NC_017154	GATT	2	8	3474847	3474854	25 %	50 %	25 %	0 %	384123326
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54116	NC_017154	ATC	2	6	3475112	3475117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123326
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54224	NC_017154	ATCAG	2	10	3482533	3482542	40 %	20 %	20 %	20 %	384123332
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54447	NC_017154	CAT	2	6	3497978	3497983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384123343
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54452	NC_017154	CTC	2	6	3498214	3498219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384123344
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54455	NC_017154	TAA	2	6	3498886	3498891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384123345
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54457	NC_017154	TGA	2	6	3498916	3498921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123345
54458	NC_017154	TCG	2	6	3498980	3498985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384123345
54459	NC_017154	ACC	2	6	3499003	3499008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384123345
54460	NC_017154	T	6	6	3499018	3499023	0 %	100 %	0 %	0 %	384123345
54461	NC_017154	AGGTA	2	10	3499203	3499212	40 %	20 %	40 %	0 %	384123345
54462	NC_017154	AAG	2	6	3499297	3499302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384123345
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54464	NC_017154	TAG	2	6	3499420	3499425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384123345
54465	NC_017154	TAGC	2	8	3499439	3499446	25 %	25 %	25 %	25 %	384123345
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