MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis D106004 chromosome

Total Repeats: 71889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017154	TGGC	2	8	286672	286679	0 %	25 %	50 %	25 %	384120845
4502	NC_017154	CTC	2	6	286686	286691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384120845
4503	NC_017154	TAT	2	6	286701	286706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120845
4504	NC_017154	GAG	2	6	286917	286922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384120845
4505	NC_017154	ATT	2	6	287422	287427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120846
4506	NC_017154	GCC	3	9	287455	287463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120846
4507	NC_017154	CA	3	6	287486	287491	50 %	0 %	0 %	50 %	384120846
4508	NC_017154	CCA	2	6	287621	287626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120846
4509	NC_017154	TCA	2	6	287810	287815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120846
4510	NC_017154	ACC	2	6	287823	287828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120846
4511	NC_017154	GCGCA	2	10	287832	287841	20 %	0 %	40 %	40 %	384120846
4512	NC_017154	CAT	2	6	287934	287939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120846
4513	NC_017154	GTA	2	6	287974	287979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120846
4514	NC_017154	T	6	6	288114	288119	0 %	100 %	0 %	0 %	384120846
4515	NC_017154	TAA	2	6	288138	288143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120846
4516	NC_017154	GA	3	6	288155	288160	50 %	0 %	50 %	0 %	384120846
4517	NC_017154	CAT	2	6	288173	288178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120846
4518	NC_017154	TAT	2	6	288233	288238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120846
4519	NC_017154	AAT	3	9	288240	288248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120846
4520	NC_017154	TCA	2	6	288320	288325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120846
4521	NC_017154	CTT	2	6	288379	288384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120847
4522	NC_017154	TCT	2	6	288397	288402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120847
4523	NC_017154	GAA	2	6	288478	288483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120847
4524	NC_017154	CAC	2	6	288560	288565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120847
4525	NC_017154	GGC	2	6	288587	288592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120847
4526	NC_017154	CCG	2	6	288613	288618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120847
4527	NC_017154	GTT	2	6	288640	288645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120847
4528	NC_017154	GC	3	6	288772	288777	0 %	0 %	50 %	50 %	384120847
4529	NC_017154	ATA	2	6	288780	288785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120847
4530	NC_017154	ATC	3	9	288803	288811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120847
4531	NC_017154	ACC	2	6	288852	288857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120847
4532	NC_017154	CGA	2	6	288943	288948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120847
4533	NC_017154	AT	3	6	288981	288986	50 %	50 %	0 %	0 %	384120847
4534	NC_017154	TCA	2	6	288999	289004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120847
4535	NC_017154	GAT	2	6	289019	289024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120847
4536	NC_017154	CG	3	6	289100	289105	0 %	0 %	50 %	50 %	384120847
4537	NC_017154	CAC	2	6	289169	289174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120847
4538	NC_017154	AGGTG	2	10	289222	289231	20 %	20 %	60 %	0 %	384120847
4539	NC_017154	TCGG	2	8	289236	289243	0 %	25 %	50 %	25 %	384120847
4540	NC_017154	CTGA	2	8	289253	289260	25 %	25 %	25 %	25 %	384120847
4541	NC_017154	AAT	2	6	289270	289275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120847
4542	NC_017154	ATT	2	6	289419	289424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120848
4543	NC_017154	TTA	2	6	289426	289431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120848
4544	NC_017154	AAAT	2	8	289446	289453	75 %	25 %	0 %	0 %	384120848
4545	NC_017154	TTG	2	6	289645	289650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120848
4546	NC_017154	TG	3	6	289729	289734	0 %	50 %	50 %	0 %	384120848
4547	NC_017154	TCA	2	6	289748	289753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120848
4548	NC_017154	CAT	2	6	289821	289826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120848
4549	NC_017154	TGTC	2	8	289915	289922	0 %	50 %	25 %	25 %	384120848
4550	NC_017154	GTG	2	6	289948	289953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120848
4551	NC_017154	TCT	2	6	289993	289998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120848
4552	NC_017154	CCA	2	6	290048	290053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120848
4553	NC_017154	AGG	2	6	290121	290126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384120848
4554	NC_017154	CA	3	6	290183	290188	50 %	0 %	0 %	50 %	384120848
4555	NC_017154	A	7	7	290188	290194	100 %	0 %	0 %	0 %	384120848
4556	NC_017154	CA	3	6	290221	290226	50 %	0 %	0 %	50 %	384120849
4557	NC_017154	TGA	2	6	290315	290320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120849
4558	NC_017154	GAT	2	6	290374	290379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120849
4559	NC_017154	GGT	2	6	290704	290709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120849
4560	NC_017154	ACC	2	6	290771	290776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120849
4561	NC_017154	GAA	2	6	290814	290819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120849
4562	NC_017154	GTG	2	6	290840	290845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120849
4563	NC_017154	GC	3	6	290891	290896	0 %	0 %	50 %	50 %	384120849
4564	NC_017154	A	7	7	291002	291008	100 %	0 %	0 %	0 %	384120849
4565	NC_017154	CAG	2	6	291048	291053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120849
4566	NC_017154	TC	3	6	291118	291123	0 %	50 %	0 %	50 %	384120849
4567	NC_017154	TGG	2	6	291150	291155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120849
4568	NC_017154	GCC	2	6	291174	291179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120849
4569	NC_017154	GC	3	6	291206	291211	0 %	0 %	50 %	50 %	384120849
4570	NC_017154	CGG	2	6	291316	291321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120849
4571	NC_017154	TCA	2	6	291330	291335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120849
4572	NC_017154	TCA	2	6	291461	291466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120850
4573	NC_017154	CGC	2	6	291506	291511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120850
4574	NC_017154	GTG	2	6	291576	291581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120850
4575	NC_017154	GGC	2	6	291654	291659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120850
4576	NC_017154	CTT	2	6	291689	291694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120850
4577	NC_017154	CAAC	2	8	291731	291738	50 %	0 %	0 %	50 %	384120850
4578	NC_017154	GGA	2	6	291747	291752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384120850
4579	NC_017154	T	6	6	291794	291799	0 %	100 %	0 %	0 %	384120850
4580	NC_017154	AAC	2	6	291837	291842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120850
4581	NC_017154	AGCC	2	8	291966	291973	25 %	0 %	25 %	50 %	384120850
4582	NC_017154	TCA	2	6	291985	291990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384120850
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4585	NC_017154	TAAAG	2	10	292071	292080	60 %	20 %	20 %	0 %	384120850
4586	NC_017154	GC	3	6	292094	292099	0 %	0 %	50 %	50 %	384120850
4587	NC_017154	GCT	2	6	292132	292137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120850
4588	NC_017154	TGC	2	6	292141	292146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120850
4589	NC_017154	TGA	2	6	292291	292296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120850
4590	NC_017154	ATG	2	6	292357	292362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120850
4591	NC_017154	C	6	6	292381	292386	0 %	0 %	0 %	100 %	384120850
4592	NC_017154	T	8	8	292399	292406	0 %	100 %	0 %	0 %	384120850
4593	NC_017154	TGA	2	6	292683	292688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120851
4594	NC_017154	AAAG	2	8	292724	292731	75 %	0 %	25 %	0 %	384120851
4595	NC_017154	CT	3	6	292739	292744	0 %	50 %	0 %	50 %	384120851
4596	NC_017154	A	7	7	292784	292790	100 %	0 %	0 %	0 %	384120851
4597	NC_017154	GGT	2	6	292799	292804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120851
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4599	NC_017154	TG	3	6	292853	292858	0 %	50 %	50 %	0 %	384120851
4600	NC_017154	TGA	3	9	292969	292977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120851
4601	NC_017154	TCT	2	6	293165	293170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384120851
4602	NC_017154	CAA	2	6	293179	293184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120851
4603	NC_017154	ATG	2	6	293243	293248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120851
4604	NC_017154	GGT	2	6	293266	293271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384120851
4605	NC_017154	TGA	2	6	293276	293281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120851
4606	NC_017154	GAT	2	6	293437	293442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120852
4607	NC_017154	ATCA	2	8	293503	293510	50 %	25 %	0 %	25 %	384120852
4608	NC_017154	GT	3	6	293606	293611	0 %	50 %	50 %	0 %	384120852
4609	NC_017154	TGA	2	6	293612	293617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120852
4610	NC_017154	GCG	2	6	293650	293655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120852
4611	NC_017154	TTG	2	6	293705	293710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384120852
4612	NC_017154	CGG	2	6	293724	293729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120852
4613	NC_017154	TGGTG	2	10	293754	293763	0 %	40 %	60 %	0 %	384120852
4614	NC_017154	AGA	2	6	293766	293771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384120852
4615	NC_017154	CGC	2	6	293829	293834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120852
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4617	NC_017154	TGA	2	6	293908	293913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120852
4618	NC_017154	GC	3	6	293958	293963	0 %	0 %	50 %	50 %	384120853
4619	NC_017154	GAT	2	6	294125	294130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384120853
4620	NC_017154	TTTA	2	8	294215	294222	25 %	75 %	0 %	0 %	384120853
4621	NC_017154	ATGA	2	8	294302	294309	50 %	25 %	25 %	0 %	384120853
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4623	NC_017154	TGAA	2	8	294351	294358	50 %	25 %	25 %	0 %	384120853
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4866	NC_017154	TGCC	2	8	311629	311636	0 %	25 %	25 %	50 %	384120863
4867	NC_017154	GCT	2	6	311672	311677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120863
4868	NC_017154	AG	3	6	311690	311695	50 %	0 %	50 %	0 %	384120863
4869	NC_017154	TTA	2	6	311797	311802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384120863
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4881	NC_017154	CGC	2	6	313521	313526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120864
4882	NC_017154	CTG	4	12	313799	313810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120865
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4886	NC_017154	CT	3	6	314039	314044	0 %	50 %	0 %	50 %	384120865
4887	NC_017154	TTTGG	2	10	314045	314054	0 %	60 %	40 %	0 %	384120865
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4891	NC_017154	GCC	2	6	314198	314203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120865
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4894	NC_017154	TGC	2	6	314373	314378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120865
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4986	NC_017154	GCG	2	6	320483	320488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120870
4987	NC_017154	GTC	2	6	321596	321601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120871
4988	NC_017154	GGC	2	6	321603	321608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384120871
4989	NC_017154	TGC	2	6	321653	321658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384120871
4990	NC_017154	GCTG	2	8	321711	321718	0 %	25 %	50 %	25 %	384120871
4991	NC_017154	C	6	6	321781	321786	0 %	0 %	0 %	100 %	384120871
4992	NC_017154	CAG	2	6	321850	321855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120871
4993	NC_017154	ACG	2	6	321917	321922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384120871
4994	NC_017154	GGCA	2	8	322080	322087	25 %	0 %	50 %	25 %	384120871
4995	NC_017154	CGC	2	6	322105	322110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384120871
4996	NC_017154	GGAACA	2	12	322116	322127	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384120871
4997	NC_017154	CAA	2	6	322159	322164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384120871
4998	NC_017154	ATA	2	6	322165	322170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384120871
4999	NC_017154	ACC	2	6	322298	322303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384120871
5000	NC_017154	AGG	2	6	322393	322398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384120871

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