MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 chromosome

Total Repeats: 70701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014029	TAT	2	6	227036	227041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502303
3502	NC_014029	GGT	2	6	227046	227051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502303
3503	NC_014029	GC	3	6	227057	227062	0 %	0 %	50 %	50 %	294502303
3504	NC_014029	CTA	2	6	227113	227118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502303
3505	NC_014029	GAA	2	6	227208	227213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502303
3506	NC_014029	TGG	3	9	227539	227547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502304
3507	NC_014029	CGT	2	6	227552	227557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502304
3508	NC_014029	GGT	2	6	227567	227572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502304
3509	NC_014029	TCG	2	6	227587	227592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502304
3510	NC_014029	GAT	2	6	227626	227631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502304
3511	NC_014029	GTCT	2	8	227646	227653	0 %	50 %	25 %	25 %	294502304
3512	NC_014029	GTT	2	6	227711	227716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502304
3513	NC_014029	TGC	2	6	227809	227814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502304
3514	NC_014029	GCT	2	6	227822	227827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502304
3515	NC_014029	TGTT	2	8	227926	227933	0 %	75 %	25 %	0 %	294502305
3516	NC_014029	AGC	2	6	228016	228021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502305
3517	NC_014029	AG	3	6	228022	228027	50 %	0 %	50 %	0 %	294502305
3518	NC_014029	CAT	2	6	228032	228037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502305
3519	NC_014029	TGG	2	6	228059	228064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502305
3520	NC_014029	ATT	2	6	228123	228128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502305
3521	NC_014029	GGT	2	6	228143	228148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502305
3522	NC_014029	AAAG	2	8	228170	228177	75 %	0 %	25 %	0 %	294502305
3523	NC_014029	CGT	2	6	228192	228197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502305
3524	NC_014029	ATCG	2	8	228248	228255	25 %	25 %	25 %	25 %	294502305
3525	NC_014029	AATC	2	8	228302	228309	50 %	25 %	0 %	25 %	294502305
3526	NC_014029	GCTTT	2	10	228313	228322	0 %	60 %	20 %	20 %	294502305
3527	NC_014029	TGT	2	6	228335	228340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502305
3528	NC_014029	TTG	2	6	228439	228444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502305
3529	NC_014029	TCC	2	6	228452	228457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502305
3530	NC_014029	TCC	2	6	228505	228510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502305
3531	NC_014029	GTTG	2	8	228518	228525	0 %	50 %	50 %	0 %	294502305
3532	NC_014029	CTT	2	6	228548	228553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502305
3533	NC_014029	GTT	2	6	228555	228560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502305
3534	NC_014029	CGT	2	6	228579	228584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502305
3535	NC_014029	CAA	2	6	228609	228614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502305
3536	NC_014029	GTC	2	6	228616	228621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502305
3537	NC_014029	GCA	2	6	228630	228635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502305
3538	NC_014029	CA	3	6	228641	228646	50 %	0 %	0 %	50 %	294502305
3539	NC_014029	CAT	2	6	228727	228732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502305
3540	NC_014029	GAC	2	6	228764	228769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502305
3541	NC_014029	ATC	2	6	228828	228833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502305
3542	NC_014029	TTC	2	6	228834	228839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502305
3543	NC_014029	TCT	2	6	228844	228849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502305
3544	NC_014029	CAG	2	6	228880	228885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502305
3545	NC_014029	GAA	2	6	228893	228898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502305
3546	NC_014029	TGG	2	6	229058	229063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502305
3547	NC_014029	GTG	2	6	229083	229088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502305
3548	NC_014029	TCA	2	6	229090	229095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502305
3549	NC_014029	TGA	2	6	229123	229128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502305
3550	NC_014029	GAA	2	6	229154	229159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502305
3551	NC_014029	TCGGCA	2	12	229552	229563	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294502306
3552	NC_014029	TGC	2	6	229589	229594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502306
3553	NC_014029	CGT	2	6	229692	229697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502306
3554	NC_014029	TCG	2	6	229757	229762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502306
3555	NC_014029	AAT	2	6	229837	229842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502306
3556	NC_014029	AAT	2	6	229854	229859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502307
3557	NC_014029	AAGA	2	8	229893	229900	75 %	0 %	25 %	0 %	294502307
3558	NC_014029	CTT	2	6	229931	229936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502307
3559	NC_014029	CAA	2	6	229938	229943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502307
3560	NC_014029	TTGGG	2	10	229981	229990	0 %	40 %	60 %	0 %	294502307
3561	NC_014029	CAG	2	6	229994	229999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502307
3562	NC_014029	GCA	2	6	230053	230058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502307
3563	NC_014029	GCGCT	2	10	230061	230070	0 %	20 %	40 %	40 %	294502307
3564	NC_014029	CTA	2	6	230141	230146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502307
3565	NC_014029	GTC	2	6	230219	230224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502307
3566	NC_014029	CGT	2	6	230314	230319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502308
3567	NC_014029	CG	3	6	230353	230358	0 %	0 %	50 %	50 %	294502308
3568	NC_014029	AAC	2	6	230381	230386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502308
3569	NC_014029	GTCT	2	8	230417	230424	0 %	50 %	25 %	25 %	294502308
3570	NC_014029	ACT	2	6	230498	230503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502308
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3572	NC_014029	GTC	2	6	230564	230569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502308
3573	NC_014029	GTT	2	6	230662	230667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502308
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3575	NC_014029	GCTG	2	8	230757	230764	0 %	25 %	50 %	25 %	294502308
3576	NC_014029	GT	3	6	230816	230821	0 %	50 %	50 %	0 %	294502308
3577	NC_014029	TCG	2	6	230876	230881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502308
3578	NC_014029	ACGC	2	8	230987	230994	25 %	0 %	25 %	50 %	294502309
3579	NC_014029	TAC	2	6	231114	231119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502309
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3582	NC_014029	GCA	2	6	231301	231306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502309
3583	NC_014029	CGTGGT	2	12	231365	231376	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	294502309
3584	NC_014029	ATTC	2	8	231398	231405	25 %	50 %	0 %	25 %	294502309
3585	NC_014029	GAA	2	6	231407	231412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502309
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3588	NC_014029	AGC	2	6	231487	231492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502309
3589	NC_014029	CGAT	2	8	231552	231559	25 %	25 %	25 %	25 %	294502309
3590	NC_014029	CCG	2	6	231574	231579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502309
3591	NC_014029	AGA	2	6	231652	231657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502309
3592	NC_014029	CGATC	2	10	231670	231679	20 %	20 %	20 %	40 %	294502309
3593	NC_014029	CTG	2	6	231680	231685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502309
3594	NC_014029	A	6	6	231812	231817	100 %	0 %	0 %	0 %	294502309
3595	NC_014029	TCTT	2	8	231856	231863	0 %	75 %	0 %	25 %	294502309
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3601	NC_014029	CGAAAG	2	12	232069	232080	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294502310
3602	NC_014029	GTT	2	6	232092	232097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502310
3603	NC_014029	TCG	2	6	232139	232144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502310
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3605	NC_014029	AGTT	2	8	232294	232301	25 %	50 %	25 %	0 %	294502310
3606	NC_014029	TGC	2	6	232307	232312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502310
3607	NC_014029	AGT	2	6	232325	232330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502310
3608	NC_014029	TGC	2	6	232331	232336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502310
3609	NC_014029	TAC	2	6	232847	232852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502311
3610	NC_014029	ATG	2	6	232865	232870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502311
3611	NC_014029	GAAC	2	8	232880	232887	50 %	0 %	25 %	25 %	294502311
3612	NC_014029	TGG	2	6	232891	232896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502311
3613	NC_014029	ATT	2	6	232987	232992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502311
3614	NC_014029	CAT	2	6	233015	233020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502311
3615	NC_014029	AG	3	6	233089	233094	50 %	0 %	50 %	0 %	294502311
3616	NC_014029	TTG	2	6	233128	233133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502311
3617	NC_014029	CGA	2	6	233148	233153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502311
3618	NC_014029	AGA	2	6	233194	233199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502311
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3620	NC_014029	TG	3	6	233619	233624	0 %	50 %	50 %	0 %	294502312
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3988	NC_014029	TGG	2	6	254237	254242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502331
3989	NC_014029	GTG	2	6	254277	254282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502331
3990	NC_014029	TAA	2	6	254290	254295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502331
3991	NC_014029	CGG	2	6	254369	254374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502331
3992	NC_014029	CGCT	2	8	254389	254396	0 %	25 %	25 %	50 %	294502331
3993	NC_014029	GCCAGA	2	12	254405	254416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502331
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3995	NC_014029	GTT	2	6	254476	254481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502331
3996	NC_014029	TGA	2	6	254571	254576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502331
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3999	NC_014029	ATAA	2	8	254713	254720	75 %	25 %	0 %	0 %	294502331
4000	NC_014029	TGC	2	6	254726	254731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502331

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