MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 chromosome

Total Repeats: 70701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014029	CGGTA	2	10	197943	197952	20 %	20 %	40 %	20 %	294502267
3002	NC_014029	G	6	6	197981	197986	0 %	0 %	100 %	0 %	294502267
3003	NC_014029	GTT	2	6	198043	198048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502267
3004	NC_014029	GCA	2	6	198073	198078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502267
3005	NC_014029	AAC	2	6	198094	198099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502267
3006	NC_014029	CT	3	6	198139	198144	0 %	50 %	0 %	50 %	294502267
3007	NC_014029	GTG	2	6	198152	198157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502267
3008	NC_014029	TACT	2	8	198195	198202	25 %	50 %	0 %	25 %	294502267
3009	NC_014029	GCAAG	2	10	198282	198291	40 %	0 %	40 %	20 %	294502267
3010	NC_014029	CAT	2	6	198395	198400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502268
3011	NC_014029	GTTG	2	8	198482	198489	0 %	50 %	50 %	0 %	294502268
3012	NC_014029	GTT	2	6	198524	198529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502268
3013	NC_014029	ATA	2	6	198580	198585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502268
3014	NC_014029	CGAG	2	8	198608	198615	25 %	0 %	50 %	25 %	294502268
3015	NC_014029	GTG	2	6	198618	198623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502268
3016	NC_014029	GCG	2	6	198710	198715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502268
3017	NC_014029	G	6	6	198789	198794	0 %	0 %	100 %	0 %	294502268
3018	NC_014029	GCTG	2	8	198824	198831	0 %	25 %	50 %	25 %	294502268
3019	NC_014029	TGT	2	6	198907	198912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502268
3020	NC_014029	GCAA	2	8	198934	198941	50 %	0 %	25 %	25 %	294502268
3021	NC_014029	GAA	2	6	198966	198971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502268
3022	NC_014029	TGC	2	6	198997	199002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502268
3023	NC_014029	GCCAGG	2	12	199007	199018	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	294502268
3024	NC_014029	GGT	2	6	199022	199027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502268
3025	NC_014029	CGCC	2	8	199109	199116	0 %	0 %	25 %	75 %	294502268
3026	NC_014029	TACGT	2	10	199177	199186	20 %	40 %	20 %	20 %	294502269
3027	NC_014029	A	7	7	199223	199229	100 %	0 %	0 %	0 %	294502269
3028	NC_014029	CCG	2	6	199234	199239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502269
3029	NC_014029	GGT	2	6	199288	199293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502269
3030	NC_014029	TGG	2	6	199301	199306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502269
3031	NC_014029	CAG	2	6	199355	199360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502269
3032	NC_014029	GCA	2	6	199420	199425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502269
3033	NC_014029	GCT	2	6	199430	199435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502269
3034	NC_014029	CGTTG	2	10	199453	199462	0 %	40 %	40 %	20 %	294502269
3035	NC_014029	GGC	2	6	199465	199470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502269
3036	NC_014029	GTG	2	6	199524	199529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502269
3037	NC_014029	CCG	2	6	199565	199570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502269
3038	NC_014029	ATTT	2	8	199634	199641	25 %	75 %	0 %	0 %	294502269
3039	NC_014029	GGC	2	6	199666	199671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502269
3040	NC_014029	GCC	2	6	199712	199717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502269
3041	NC_014029	GGT	2	6	199818	199823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502269
3042	NC_014029	TGG	2	6	199830	199835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502269
3043	NC_014029	GCTGA	2	10	199838	199847	20 %	20 %	40 %	20 %	294502269
3044	NC_014029	CCG	2	6	199884	199889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502269
3045	NC_014029	ATT	2	6	199940	199945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502269
3046	NC_014029	AAC	2	6	200007	200012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502269
3047	NC_014029	AATG	2	8	200013	200020	50 %	25 %	25 %	0 %	294502269
3048	NC_014029	AATATT	2	12	200071	200082	50 %	50 %	0 %	0 %	294502270
3049	NC_014029	CAG	2	6	200179	200184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502270
3050	NC_014029	GAA	2	6	200251	200256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502270
3051	NC_014029	CCG	2	6	200273	200278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502270
3052	NC_014029	CGC	2	6	200333	200338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502270
3053	NC_014029	GCC	2	6	200356	200361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502270
3054	NC_014029	AAC	2	6	200363	200368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502270
3055	NC_014029	GGT	2	6	200380	200385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502270
3056	NC_014029	GCACC	2	10	200502	200511	20 %	0 %	20 %	60 %	294502270
3057	NC_014029	AGA	2	6	200517	200522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502270
3058	NC_014029	AGA	2	6	200549	200554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502270
3059	NC_014029	ATT	2	6	200610	200615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502270
3060	NC_014029	AAT	2	6	200640	200645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502270
3061	NC_014029	AAAG	2	8	200659	200666	75 %	0 %	25 %	0 %	294502270
3062	NC_014029	T	6	6	200682	200687	0 %	100 %	0 %	0 %	294502270
3063	NC_014029	CAC	2	6	200697	200702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502270
3064	NC_014029	GCA	2	6	200733	200738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502270
3065	NC_014029	GAT	2	6	200740	200745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502270
3066	NC_014029	CTAC	2	8	200793	200800	25 %	25 %	0 %	50 %	294502270
3067	NC_014029	GCG	2	6	200805	200810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502270
3068	NC_014029	CGA	2	6	200825	200830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502270
3069	NC_014029	TTA	2	6	200872	200877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502271
3070	NC_014029	GGC	2	6	200899	200904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502271
3071	NC_014029	CCA	2	6	201021	201026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502271
3072	NC_014029	CGG	2	6	201069	201074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502271
3073	NC_014029	CGC	2	6	201100	201105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502271
3074	NC_014029	GTC	2	6	201112	201117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502271
3075	NC_014029	GACA	2	8	201131	201138	50 %	0 %	25 %	25 %	294502271
3076	NC_014029	TGC	2	6	201161	201166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502271
3077	NC_014029	GTT	2	6	201174	201179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502271
3078	NC_014029	CTG	2	6	201180	201185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502271
3079	NC_014029	TTA	2	6	201275	201280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502271
3080	NC_014029	GTC	2	6	201472	201477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502271
3081	NC_014029	CCA	2	6	201557	201562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502271
3082	NC_014029	AGC	2	6	201572	201577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502271
3083	NC_014029	GCC	2	6	201600	201605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502271
3084	NC_014029	TC	3	6	201658	201663	0 %	50 %	0 %	50 %	294502271
3085	NC_014029	GATT	2	8	201725	201732	25 %	50 %	25 %	0 %	294502271
3086	NC_014029	CTG	3	9	201759	201767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502271
3087	NC_014029	GTT	2	6	201774	201779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502271
3088	NC_014029	TTAT	2	8	201944	201951	25 %	75 %	0 %	0 %	294502272
3089	NC_014029	GC	3	6	201955	201960	0 %	0 %	50 %	50 %	294502272
3090	NC_014029	T	6	6	202110	202115	0 %	100 %	0 %	0 %	294502272
3091	NC_014029	TAA	2	6	202119	202124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502272
3092	NC_014029	GGT	2	6	202180	202185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502272
3093	NC_014029	GGC	2	6	202194	202199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502272
3094	NC_014029	ATA	2	6	202219	202224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502272
3095	NC_014029	GCG	2	6	202242	202247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502272
3096	NC_014029	GGT	2	6	202356	202361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502272
3097	NC_014029	TTG	2	6	202491	202496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502272
3098	NC_014029	CTG	2	6	202605	202610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502272
3099	NC_014029	CTG	2	6	202617	202622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502272
3100	NC_014029	GCCA	2	8	202648	202655	25 %	0 %	25 %	50 %	294502272
3101	NC_014029	ATC	2	6	202656	202661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502272
3102	NC_014029	CTG	2	6	202737	202742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502272
3103	NC_014029	AGT	2	6	202786	202791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502272
3104	NC_014029	AAT	2	6	202827	202832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502272
3105	NC_014029	TA	3	6	203073	203078	50 %	50 %	0 %	0 %	294502273
3106	NC_014029	TTG	2	6	203174	203179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502273
3107	NC_014029	GC	3	6	203207	203212	0 %	0 %	50 %	50 %	294502273
3108	NC_014029	TGT	2	6	203367	203372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502273
3109	NC_014029	CCA	2	6	203434	203439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502273
3110	NC_014029	CTG	2	6	203444	203449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502273
3111	NC_014029	CGT	2	6	203488	203493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502273
3112	NC_014029	GGT	2	6	203513	203518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502273
3113	NC_014029	ACC	3	9	203547	203555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502273
3114	NC_014029	ATCA	2	8	203570	203577	50 %	25 %	0 %	25 %	294502273
3115	NC_014029	TCCAAA	2	12	203604	203615	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	294502273
3116	NC_014029	TGGT	2	8	203616	203623	0 %	50 %	50 %	0 %	294502273
3117	NC_014029	CAG	2	6	203633	203638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502273
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3119	NC_014029	TC	3	6	203689	203694	0 %	50 %	0 %	50 %	294502273
3120	NC_014029	GCGG	2	8	203705	203712	0 %	0 %	75 %	25 %	294502273
3121	NC_014029	GGTC	2	8	203716	203723	0 %	25 %	50 %	25 %	294502273
3122	NC_014029	ACC	2	6	203747	203752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502273
3123	NC_014029	TGC	2	6	203769	203774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502273
3124	NC_014029	GGC	2	6	203794	203799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502273
3125	NC_014029	TGC	2	6	203805	203810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502273
3126	NC_014029	TCA	2	6	203820	203825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502273
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3130	NC_014029	TGG	2	6	204181	204186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502273
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3141	NC_014029	ATGGC	2	10	204662	204671	20 %	20 %	40 %	20 %	294502274
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3242	NC_014029	TG	4	8	211286	211293	0 %	50 %	50 %	0 %	294502280
3243	NC_014029	CAGCT	2	10	211492	211501	20 %	20 %	20 %	40 %	294502281
3244	NC_014029	A	6	6	211611	211616	100 %	0 %	0 %	0 %	294502281
3245	NC_014029	TAT	2	6	211749	211754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502281
3246	NC_014029	ATG	2	6	211788	211793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502281
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3248	NC_014029	GCA	2	6	212289	212294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502282
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3250	NC_014029	TA	3	6	212364	212369	50 %	50 %	0 %	0 %	294502282
3251	NC_014029	A	6	6	212381	212386	100 %	0 %	0 %	0 %	294502282
3252	NC_014029	TGG	2	6	212455	212460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502282
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3263	NC_014029	CTG	2	6	213123	213128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502283
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3266	NC_014029	CAGGAG	2	12	213452	213463	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	294502284
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3274	NC_014029	GAA	2	6	213902	213907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502284
3275	NC_014029	CTG	2	6	213912	213917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502284
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3351	NC_014029	CTG	2	6	219279	219284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502289
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3355	NC_014029	CTG	2	6	219566	219571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502289
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3363	NC_014029	TGC	2	6	219908	219913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502290
3364	NC_014029	TAAA	2	8	219940	219947	75 %	25 %	0 %	0 %	294502290
3365	NC_014029	GC	3	6	219961	219966	0 %	0 %	50 %	50 %	294502290
3366	NC_014029	CTG	2	6	220219	220224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502290
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3369	NC_014029	CTG	2	6	220274	220279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502291
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3471	NC_014029	CCCGT	2	10	225235	225244	0 %	20 %	20 %	60 %	294502299
3472	NC_014029	GTC	2	6	225270	225275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502299
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3475	NC_014029	CTC	2	6	225490	225495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502300
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3477	NC_014029	A	6	6	225668	225673	100 %	0 %	0 %	0 %	294502300
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3482	NC_014029	AAG	2	6	226066	226071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502301
3483	NC_014029	GTAGGC	2	12	226081	226092	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294502301
3484	NC_014029	GTG	2	6	226117	226122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502301
3485	NC_014029	TC	3	6	226139	226144	0 %	50 %	0 %	50 %	294502301
3486	NC_014029	GCA	2	6	226246	226251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502301
3487	NC_014029	CGT	2	6	226267	226272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502301
3488	NC_014029	CGA	2	6	226308	226313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502301
3489	NC_014029	AAG	3	9	226336	226344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502301
3490	NC_014029	AGC	2	6	226368	226373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502302
3491	NC_014029	CGT	2	6	226381	226386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502302
3492	NC_014029	CGC	2	6	226399	226404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502302
3493	NC_014029	TGG	2	6	226433	226438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502302
3494	NC_014029	AGC	2	6	226503	226508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502302
3495	NC_014029	CAA	2	6	226554	226559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502302
3496	NC_014029	GCA	2	6	226567	226572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502302
3497	NC_014029	GC	3	6	226596	226601	0 %	0 %	50 %	50 %	294502302
3498	NC_014029	TGC	2	6	226680	226685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502302
3499	NC_014029	AGT	2	6	226835	226840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502303
3500	NC_014029	GCA	2	6	226967	226972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502303

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