MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Z176003 chromosome

Total Repeats: 70701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014029	GCA	2	6	39199	39204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502137
502	NC_014029	TCTG	2	8	39376	39383	0 %	50 %	25 %	25 %	294502138
503	NC_014029	TTTGA	2	10	39401	39410	20 %	60 %	20 %	0 %	294502138
504	NC_014029	GTG	2	6	39422	39427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502138
505	NC_014029	TGC	2	6	39458	39463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502138
506	NC_014029	GAA	2	6	39554	39559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502138
507	NC_014029	CTT	2	6	39568	39573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502138
508	NC_014029	CTGA	2	8	39575	39582	25 %	25 %	25 %	25 %	294502138
509	NC_014029	TCA	2	6	39600	39605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502138
510	NC_014029	ATG	2	6	39606	39611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502138
511	NC_014029	G	6	6	39619	39624	0 %	0 %	100 %	0 %	294502138
512	NC_014029	CGT	2	6	39644	39649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502138
513	NC_014029	CTG	3	9	39697	39705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502138
514	NC_014029	TGAG	2	8	39826	39833	25 %	25 %	50 %	0 %	294502138
515	NC_014029	CCG	2	6	39904	39909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502138
516	NC_014029	TGA	2	6	39948	39953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502138
517	NC_014029	TTC	2	6	39965	39970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502138
518	NC_014029	TGT	2	6	40023	40028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502138
519	NC_014029	GCGCT	2	10	40039	40048	0 %	20 %	40 %	40 %	294502138
520	NC_014029	CAT	2	6	40109	40114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502138
521	NC_014029	CTC	2	6	40122	40127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502139
522	NC_014029	GAT	2	6	40155	40160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502139
523	NC_014029	TCA	2	6	40193	40198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502139
524	NC_014029	T	6	6	40216	40221	0 %	100 %	0 %	0 %	294502139
525	NC_014029	CTG	2	6	40246	40251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502139
526	NC_014029	CAGC	2	8	40321	40328	25 %	0 %	25 %	50 %	294502139
527	NC_014029	ACCTT	2	10	40439	40448	20 %	40 %	0 %	40 %	294502139
528	NC_014029	GA	3	6	40482	40487	50 %	0 %	50 %	0 %	294502139
529	NC_014029	ACA	2	6	40587	40592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502139
530	NC_014029	CG	3	6	40596	40601	0 %	0 %	50 %	50 %	294502139
531	NC_014029	CAC	2	6	40605	40610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502139
532	NC_014029	AAG	2	6	40613	40618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502139
533	NC_014029	GTC	2	6	40770	40775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502139
534	NC_014029	CGAAC	2	10	40788	40797	40 %	0 %	20 %	40 %	294502139
535	NC_014029	GCTCCT	2	12	40803	40814	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	294502139
536	NC_014029	GA	4	8	40823	40830	50 %	0 %	50 %	0 %	294502139
537	NC_014029	GAAT	2	8	40833	40840	50 %	25 %	25 %	0 %	294502139
538	NC_014029	GCGA	2	8	40888	40895	25 %	0 %	50 %	25 %	294502139
539	NC_014029	CAG	2	6	40980	40985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502139
540	NC_014029	GGC	2	6	41003	41008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502139
541	NC_014029	ATT	2	6	41449	41454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502140
542	NC_014029	ATG	2	6	41521	41526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502140
543	NC_014029	CAT	2	6	41535	41540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502140
544	NC_014029	TA	3	6	41587	41592	50 %	50 %	0 %	0 %	294502140
545	NC_014029	CAA	2	6	41648	41653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502140
546	NC_014029	AGG	2	6	41701	41706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502140
547	NC_014029	GTG	2	6	41718	41723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502140
548	NC_014029	GC	3	6	41728	41733	0 %	0 %	50 %	50 %	294502140
549	NC_014029	T	7	7	41750	41756	0 %	100 %	0 %	0 %	294502140
550	NC_014029	TTTG	2	8	41769	41776	0 %	75 %	25 %	0 %	294502140
551	NC_014029	GA	3	6	41782	41787	50 %	0 %	50 %	0 %	294502140
552	NC_014029	CGA	2	6	41842	41847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502140
553	NC_014029	GAT	2	6	41850	41855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502140
554	NC_014029	GCA	2	6	41888	41893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502140
555	NC_014029	A	6	6	41923	41928	100 %	0 %	0 %	0 %	294502140
556	NC_014029	ACC	2	6	41970	41975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502140
557	NC_014029	TGC	2	6	42073	42078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502140
558	NC_014029	ATT	2	6	42102	42107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502140
559	NC_014029	GGC	2	6	42148	42153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502140
560	NC_014029	TGAGT	2	10	42167	42176	20 %	40 %	40 %	0 %	294502140
561	NC_014029	TGC	2	6	42292	42297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502140
562	NC_014029	TAAT	2	8	42323	42330	50 %	50 %	0 %	0 %	294502140
563	NC_014029	CTG	2	6	42472	42477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502141
564	NC_014029	TGAT	2	8	42507	42514	25 %	50 %	25 %	0 %	294502141
565	NC_014029	TTG	2	6	42515	42520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502141
566	NC_014029	AG	3	6	42543	42548	50 %	0 %	50 %	0 %	294502141
567	NC_014029	GGGT	2	8	42556	42563	0 %	25 %	75 %	0 %	294502141
568	NC_014029	A	6	6	42657	42662	100 %	0 %	0 %	0 %	294502141
569	NC_014029	CTG	2	6	42785	42790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502141
570	NC_014029	TTA	2	6	42834	42839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502141
571	NC_014029	TGC	2	6	42916	42921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502141
572	NC_014029	CTG	2	6	42922	42927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502141
573	NC_014029	TGTT	2	8	43034	43041	0 %	75 %	25 %	0 %	294502141
574	NC_014029	TAA	2	6	43249	43254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502141
575	NC_014029	CAT	2	6	43282	43287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502141
576	NC_014029	T	6	6	43320	43325	0 %	100 %	0 %	0 %	294502141
577	NC_014029	CAT	2	6	43339	43344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502141
578	NC_014029	CAGCC	2	10	43348	43357	20 %	0 %	20 %	60 %	294502141
579	NC_014029	ATCA	2	8	43376	43383	50 %	25 %	0 %	25 %	294502141
580	NC_014029	ATT	2	6	43424	43429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502141
581	NC_014029	TCT	2	6	43437	43442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502141
582	NC_014029	GTT	2	6	43452	43457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502141
583	NC_014029	CAG	2	6	43507	43512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502141
584	NC_014029	GGTCAG	2	12	43565	43576	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294502141
585	NC_014029	C	6	6	43712	43717	0 %	0 %	0 %	100 %	294502141
586	NC_014029	CTGG	2	8	43745	43752	0 %	25 %	50 %	25 %	294502141
587	NC_014029	T	6	6	43758	43763	0 %	100 %	0 %	0 %	294502141
588	NC_014029	TCAG	2	8	43893	43900	25 %	25 %	25 %	25 %	294502141
589	NC_014029	CTG	2	6	43928	43933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502141
590	NC_014029	GAT	2	6	44011	44016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502141
591	NC_014029	AG	4	8	44028	44035	50 %	0 %	50 %	0 %	294502141
592	NC_014029	AGCC	2	8	44070	44077	25 %	0 %	25 %	50 %	294502141
593	NC_014029	AGCAC	2	10	44107	44116	40 %	0 %	20 %	40 %	294502141
594	NC_014029	CAG	2	6	44132	44137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502141
595	NC_014029	AGC	2	6	44148	44153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502141
596	NC_014029	TAAGT	2	10	44342	44351	40 %	40 %	20 %	0 %	294502142
597	NC_014029	AGA	2	6	44384	44389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502142
598	NC_014029	GCT	2	6	44434	44439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502142
599	NC_014029	TGC	2	6	44589	44594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502142
600	NC_014029	CAG	2	6	44608	44613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502142
601	NC_014029	ATG	2	6	44628	44633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502142
602	NC_014029	ATT	2	6	44637	44642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502142
603	NC_014029	CAA	2	6	44647	44652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502142
604	NC_014029	ATT	2	6	44696	44701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502142
605	NC_014029	AT	3	6	44793	44798	50 %	50 %	0 %	0 %	294502142
606	NC_014029	GGC	2	6	44971	44976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502142
607	NC_014029	TAA	3	9	45107	45115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502142
608	NC_014029	ACC	3	9	45158	45166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502142
609	NC_014029	ATC	2	6	45207	45212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502142
610	NC_014029	ATA	2	6	45240	45245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502142
611	NC_014029	GCA	2	6	45259	45264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502142
612	NC_014029	GCC	2	6	45318	45323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502142
613	NC_014029	ATC	2	6	45324	45329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502142
614	NC_014029	T	6	6	45351	45356	0 %	100 %	0 %	0 %	294502142
615	NC_014029	C	7	7	45365	45371	0 %	0 %	0 %	100 %	294502142
616	NC_014029	TAA	2	6	45493	45498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502142
617	NC_014029	TCT	2	6	45510	45515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502142
618	NC_014029	CAA	2	6	45565	45570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502142
619	NC_014029	CGGT	2	8	45620	45627	0 %	25 %	50 %	25 %	294502142
620	NC_014029	GGT	2	6	45634	45639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502142
621	NC_014029	GGT	2	6	46064	46069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502143
622	NC_014029	TGG	2	6	46074	46079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502143
623	NC_014029	ATG	2	6	46085	46090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502143
624	NC_014029	AGA	2	6	46101	46106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502143
625	NC_014029	GCTGG	2	10	46108	46117	0 %	20 %	60 %	20 %	294502143
626	NC_014029	CTT	2	6	46162	46167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502143
627	NC_014029	GTT	2	6	46244	46249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502143
628	NC_014029	CTG	2	6	46256	46261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502143
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633	NC_014029	TGG	2	6	46468	46473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502143
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748	NC_014029	GTT	2	6	54349	54354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502148
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751	NC_014029	GCAA	2	8	54376	54383	50 %	0 %	25 %	25 %	294502148
752	NC_014029	GGGTG	2	10	54388	54397	0 %	20 %	80 %	0 %	294502148
753	NC_014029	TCTCCG	2	12	54437	54448	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	294502148
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872	NC_014029	ACT	2	6	61825	61830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502156
873	NC_014029	T	7	7	61836	61842	0 %	100 %	0 %	0 %	294502156
874	NC_014029	TGA	2	6	61869	61874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502156
875	NC_014029	GTT	2	6	62013	62018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502156
876	NC_014029	TCATC	2	10	62021	62030	20 %	40 %	0 %	40 %	294502156
877	NC_014029	CA	3	6	62065	62070	50 %	0 %	0 %	50 %	294502156
878	NC_014029	GA	3	6	62106	62111	50 %	0 %	50 %	0 %	294502156
879	NC_014029	T	7	7	62112	62118	0 %	100 %	0 %	0 %	294502156
880	NC_014029	CAG	2	6	62182	62187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502156
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