MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis PB1/+ chromosome

Total Repeats: 76493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010634	ACTGG	2	10	141	150	20 %	20 %	40 %	20 %	186893345
2	NC_010634	CTTA	2	8	183	190	25 %	50 %	0 %	25 %	186893345
3	NC_010634	CA	3	6	257	262	50 %	0 %	0 %	50 %	186893345
4	NC_010634	CAGC	2	8	275	282	25 %	0 %	25 %	50 %	186893345
5	NC_010634	AC	3	6	390	395	50 %	0 %	0 %	50 %	186893345
6	NC_010634	TTG	2	6	407	412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893345
7	NC_010634	GCC	2	6	442	447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893345
8	NC_010634	GGT	2	6	469	474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893345
9	NC_010634	AAT	2	6	631	636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893345
10	NC_010634	TTA	2	6	679	684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893345
11	NC_010634	GAT	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893345
12	NC_010634	T	6	6	700	705	0 %	100 %	0 %	0 %	186893345
13	NC_010634	AAG	2	6	725	730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893345
14	NC_010634	CAG	2	6	769	774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893345
15	NC_010634	TTGG	2	8	842	849	0 %	50 %	50 %	0 %	186893345
16	NC_010634	CCA	2	6	871	876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893345
17	NC_010634	GAA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893345
18	NC_010634	GCCAAT	2	12	1018	1029	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	186893345
19	NC_010634	GATT	2	8	1050	1057	25 %	50 %	25 %	0 %	186893345
20	NC_010634	TTG	2	6	1081	1086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893345
21	NC_010634	ATA	2	6	1115	1120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893345
22	NC_010634	GCCC	2	8	1195	1202	0 %	0 %	25 %	75 %	186893345
23	NC_010634	AACC	2	8	1236	1243	50 %	0 %	0 %	50 %	186893345
24	NC_010634	GCCT	2	8	1247	1254	0 %	25 %	25 %	50 %	186893345
25	NC_010634	TGG	2	6	1272	1277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893345
26	NC_010634	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893345
27	NC_010634	TCC	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186893345
28	NC_010634	TTG	2	6	1490	1495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893346
29	NC_010634	TGGAGA	2	12	1539	1550	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	186893346
30	NC_010634	TGG	2	6	1551	1556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893346
31	NC_010634	T	6	6	1616	1621	0 %	100 %	0 %	0 %	186893346
32	NC_010634	TTA	2	6	1849	1854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893346
33	NC_010634	TGG	2	6	2017	2022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893346
34	NC_010634	TAA	2	6	2053	2058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893346
35	NC_010634	ATTTT	2	10	2079	2088	20 %	80 %	0 %	0 %	186893346
36	NC_010634	CGC	2	6	2126	2131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893346
37	NC_010634	GAA	2	6	2140	2145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893346
38	NC_010634	GTG	2	6	2229	2234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893346
39	NC_010634	TAA	2	6	2275	2280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893346
40	NC_010634	GAA	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893346
41	NC_010634	AGA	2	6	2299	2304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893346
42	NC_010634	TGAC	2	8	2412	2419	25 %	25 %	25 %	25 %	186893346
43	NC_010634	GCCA	2	8	2450	2457	25 %	0 %	25 %	50 %	186893346
44	NC_010634	GTC	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893346
45	NC_010634	GTA	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893346
46	NC_010634	GGC	2	6	2729	2734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893347
47	NC_010634	T	6	6	2744	2749	0 %	100 %	0 %	0 %	186893347
48	NC_010634	GCAG	2	8	2835	2842	25 %	0 %	50 %	25 %	186893347
49	NC_010634	TTA	2	6	3036	3041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893347
50	NC_010634	GC	3	6	3062	3067	0 %	0 %	50 %	50 %	186893347
51	NC_010634	T	6	6	3068	3073	0 %	100 %	0 %	0 %	186893347
52	NC_010634	T	7	7	3104	3110	0 %	100 %	0 %	0 %	186893347
53	NC_010634	AGC	2	6	3142	3147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893347
54	NC_010634	CGC	2	6	3152	3157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893347
55	NC_010634	ATC	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893347
56	NC_010634	GCG	2	6	3264	3269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893347
57	NC_010634	AG	3	6	3344	3349	50 %	0 %	50 %	0 %	186893347
58	NC_010634	GTT	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893347
59	NC_010634	GC	3	6	3369	3374	0 %	0 %	50 %	50 %	186893347
60	NC_010634	CCG	2	6	3406	3411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893347
61	NC_010634	AGA	2	6	3461	3466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893347
62	NC_010634	GCGG	2	8	3544	3551	0 %	0 %	75 %	25 %	186893347
63	NC_010634	GCC	2	6	3598	3603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893347
64	NC_010634	CTC	2	6	3789	3794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186893348
65	NC_010634	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893348
66	NC_010634	CAC	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893348
67	NC_010634	GAT	2	6	3988	3993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893348
68	NC_010634	GCA	2	6	4039	4044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893348
69	NC_010634	TCA	2	6	4049	4054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893348
70	NC_010634	CGG	2	6	4107	4112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893348
71	NC_010634	GTT	2	6	4135	4140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893348
72	NC_010634	GTG	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893348
73	NC_010634	CT	3	6	4351	4356	0 %	50 %	0 %	50 %	186893348
74	NC_010634	TCAA	2	8	4375	4382	50 %	25 %	0 %	25 %	186893348
75	NC_010634	AGA	2	6	4407	4412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893348
76	NC_010634	GGT	2	6	4429	4434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893348
77	NC_010634	TTG	2	6	4445	4450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893348
78	NC_010634	CCA	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893348
79	NC_010634	TGG	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893348
80	NC_010634	AAG	2	6	4667	4672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893348
81	NC_010634	A	6	6	4681	4686	100 %	0 %	0 %	0 %	186893348
82	NC_010634	TGA	2	6	4707	4712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893348
83	NC_010634	TGT	2	6	4734	4739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893348
84	NC_010634	TCT	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893348
85	NC_010634	CGG	2	6	4811	4816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893348
86	NC_010634	TGA	2	6	4826	4831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893348
87	NC_010634	GTTG	2	8	4839	4846	0 %	50 %	50 %	0 %	186893348
88	NC_010634	TTG	2	6	4852	4857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893348
89	NC_010634	GCGG	2	8	5053	5060	0 %	0 %	75 %	25 %	186893348
90	NC_010634	CCGTAA	2	12	5076	5087	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	186893348
91	NC_010634	CT	3	6	5155	5160	0 %	50 %	0 %	50 %	186893348
92	NC_010634	GTT	3	9	5295	5303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893348
93	NC_010634	CTT	2	6	5307	5312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893348
94	NC_010634	ATT	2	6	5332	5337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893348
95	NC_010634	GAA	2	6	5382	5387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893348
96	NC_010634	GAT	3	9	5413	5421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893348
97	NC_010634	CTGG	2	8	5494	5501	0 %	25 %	50 %	25 %	186893348
98	NC_010634	AGA	2	6	5543	5548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893348
99	NC_010634	AAG	2	6	5618	5623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893348
100	NC_010634	GATT	2	8	5658	5665	25 %	50 %	25 %	0 %	186893348
101	NC_010634	TGG	2	6	5669	5674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893348
102	NC_010634	GCA	2	6	5702	5707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893348
103	NC_010634	GTG	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893348
104	NC_010634	TGG	2	6	5820	5825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893348
105	NC_010634	CGT	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893348
106	NC_010634	CCG	2	6	5961	5966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893348
107	NC_010634	AG	3	6	6042	6047	50 %	0 %	50 %	0 %	186893348
108	NC_010634	CGT	2	6	6049	6054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893348
109	NC_010634	TGC	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893348
110	NC_010634	CGC	2	6	6084	6089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893348
111	NC_010634	ACT	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893348
112	NC_010634	TCG	2	6	6132	6137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893348
113	NC_010634	GC	3	6	6162	6167	0 %	0 %	50 %	50 %	186893348
114	NC_010634	ATGG	2	8	6429	6436	25 %	25 %	50 %	0 %	186893349
115	NC_010634	TGC	3	9	6488	6496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893349
116	NC_010634	TG	3	6	6513	6518	0 %	50 %	50 %	0 %	186893349
117	NC_010634	ATT	2	6	6592	6597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893349
118	NC_010634	AAC	2	6	6606	6611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893349
119	NC_010634	GGC	2	6	6629	6634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893349
120	NC_010634	TA	3	6	6745	6750	50 %	50 %	0 %	0 %	186893349
121	NC_010634	TGA	3	9	6862	6870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893349
122	NC_010634	TGA	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893349
123	NC_010634	ATG	2	6	6906	6911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893349
124	NC_010634	TAT	2	6	6938	6943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893349
125	NC_010634	GCTG	2	8	7010	7017	0 %	25 %	50 %	25 %	186893349
126	NC_010634	ATT	2	6	7211	7216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893349
127	NC_010634	GCG	2	6	7851	7856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893350
128	NC_010634	CTGGA	2	10	7969	7978	20 %	20 %	40 %	20 %	186893350
129	NC_010634	ATG	2	6	8034	8039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893350
130	NC_010634	GAGG	2	8	8127	8134	25 %	0 %	75 %	0 %	186893350
131	NC_010634	AAG	2	6	8137	8142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893350
132	NC_010634	CTA	2	6	8167	8172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893350
133	NC_010634	AGAA	2	8	8236	8243	75 %	0 %	25 %	0 %	186893350
134	NC_010634	GC	3	6	8255	8260	0 %	0 %	50 %	50 %	186893350
135	NC_010634	A	6	6	8276	8281	100 %	0 %	0 %	0 %	186893350
136	NC_010634	GA	3	6	8294	8299	50 %	0 %	50 %	0 %	186893350
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143	NC_010634	TGA	2	6	8577	8582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893351
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156	NC_010634	ATT	2	6	9096	9101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893351
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255	NC_010634	A	6	6	16748	16753	100 %	0 %	0 %	0 %	186893362
256	NC_010634	AGA	2	6	16781	16786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893362
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260	NC_010634	GTG	2	6	16934	16939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893362
261	NC_010634	TGTT	2	8	16949	16956	0 %	75 %	25 %	0 %	186893362
262	NC_010634	AT	3	6	16965	16970	50 %	50 %	0 %	0 %	186893362
263	NC_010634	ATG	2	6	16979	16984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893362
264	NC_010634	TGT	2	6	17031	17036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893362
265	NC_010634	CTG	2	6	17044	17049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893362
266	NC_010634	AAT	2	6	17057	17062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893362
267	NC_010634	TTG	2	6	17583	17588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893363
268	NC_010634	CAC	2	6	17628	17633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893363
269	NC_010634	CTG	3	9	17696	17704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893363
270	NC_010634	AGT	2	6	17728	17733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893363
271	NC_010634	TGA	2	6	17761	17766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893363
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273	NC_010634	GAT	2	6	17807	17812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893363
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280	NC_010634	TGGG	2	8	18174	18181	0 %	25 %	75 %	0 %	186893363
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299	NC_010634	GCTG	2	8	19399	19406	0 %	25 %	50 %	25 %	186893363
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