MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis PB1/+ chromosome

Total Repeats: 76493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_010634	TTTGC	2	10	1097133	1097142	0 %	60 %	20 %	20 %	186894289
17503	NC_010634	TGC	2	6	1097198	1097203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186894289
17504	NC_010634	TGGA	2	8	1097217	1097224	25 %	25 %	50 %	0 %	186894289
17505	NC_010634	TTTA	2	8	1097264	1097271	25 %	75 %	0 %	0 %	186894289
17506	NC_010634	TTA	2	6	1097310	1097315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186894289
17507	NC_010634	GTT	2	6	1097354	1097359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186894289
17508	NC_010634	TGCCT	2	10	1097374	1097383	0 %	40 %	20 %	40 %	186894289
17509	NC_010634	TGA	2	6	1097393	1097398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186894289
17510	NC_010634	TAT	2	6	1097476	1097481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186894289
17511	NC_010634	GGC	2	6	1097498	1097503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186894289
17512	NC_010634	GCG	2	6	1097528	1097533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186894289
17513	NC_010634	G	6	6	1097535	1097540	0 %	0 %	100 %	0 %	186894289
17514	NC_010634	GTG	2	6	1097560	1097565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186894289
17515	NC_010634	TGG	2	6	1097608	1097613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186894289
17516	NC_010634	GAT	2	6	1097628	1097633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186894289
17517	NC_010634	GGA	2	6	1097697	1097702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	186894289
17518	NC_010634	TGTGG	2	10	1097761	1097770	0 %	40 %	60 %	0 %	186894289
17519	NC_010634	GTTG	2	8	1098000	1098007	0 %	50 %	50 %	0 %	186894290
17520	NC_010634	CGC	2	6	1098019	1098024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186894290
17521	NC_010634	GCC	2	6	1098079	1098084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186894290
17522	NC_010634	CGAT	2	8	1098209	1098216	25 %	25 %	25 %	25 %	186894290
17523	NC_010634	ATG	2	6	1098409	1098414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186894290
17524	NC_010634	TGG	2	6	1098425	1098430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186894290
17525	NC_010634	TAT	2	6	1098458	1098463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186894290
17526	NC_010634	TAC	2	6	1098522	1098527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186894290
17527	NC_010634	CATT	2	8	1098604	1098611	25 %	50 %	0 %	25 %	186894290
17528	NC_010634	GATT	2	8	1098823	1098830	25 %	50 %	25 %	0 %	186894291
17529	NC_010634	AGC	2	6	1098841	1098846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186894291
17530	NC_010634	CAT	2	6	1098864	1098869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186894291
17531	NC_010634	CAG	2	6	1098909	1098914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186894291
17532	NC_010634	ATA	2	6	1099066	1099071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186894291
17533	NC_010634	GTG	2	6	1099104	1099109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186894291
17534	NC_010634	CTT	2	6	1099119	1099124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186894291
17535	NC_010634	GTTG	2	8	1099285	1099292	0 %	50 %	50 %	0 %	186894291
17536	NC_010634	ATC	2	6	1099342	1099347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186894291
17537	NC_010634	ATT	2	6	1099354	1099359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186894291
17538	NC_010634	GAA	2	6	1099363	1099368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186894291
17539	NC_010634	ACC	2	6	1099388	1099393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186894291
17540	NC_010634	CGA	2	6	1099449	1099454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186894291
17541	NC_010634	AGT	2	6	1099458	1099463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186894291
17542	NC_010634	GT	3	6	1099462	1099467	0 %	50 %	50 %	0 %	186894291
17543	NC_010634	CGA	2	6	1099533	1099538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186894291
17544	NC_010634	CGG	2	6	1099554	1099559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186894291
17545	NC_010634	CGG	2	6	1099759	1099764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186894291
17546	NC_010634	CGG	2	6	1099842	1099847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186894291
17547	NC_010634	CAGT	2	8	1099848	1099855	25 %	25 %	25 %	25 %	186894291
17548	NC_010634	GCT	2	6	1099877	1099882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186894291
17549	NC_010634	GGT	2	6	1100056	1100061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186894291
17550	NC_010634	T	8	8	1100158	1100165	0 %	100 %	0 %	0 %	186894291
17551	NC_010634	TAA	2	6	1100304	1100309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186894291
17552	NC_010634	C	8	8	1100348	1100355	0 %	0 %	0 %	100 %	186894291
17553	NC_010634	ACT	2	6	1100381	1100386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186894291
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17557	NC_010634	TCG	2	6	1101126	1101131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186894292
17558	NC_010634	GAAA	2	8	1101356	1101363	75 %	0 %	25 %	0 %	186894292
17559	NC_010634	CAA	2	6	1101367	1101372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186894292
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17561	NC_010634	AAAGT	2	10	1101441	1101450	60 %	20 %	20 %	0 %	186894292
17562	NC_010634	AGA	2	6	1101460	1101465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186894292
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17566	NC_010634	A	7	7	1101951	1101957	100 %	0 %	0 %	0 %	186894293
17567	NC_010634	TCT	2	6	1101960	1101965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186894293
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17572	NC_010634	GC	3	6	1102223	1102228	0 %	0 %	50 %	50 %	186894293
17573	NC_010634	CAT	2	6	1102352	1102357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186894293
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17584	NC_010634	TGA	2	6	1103153	1103158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186894294
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17587	NC_010634	CCAG	2	8	1103321	1103328	25 %	0 %	25 %	50 %	186894294
17588	NC_010634	CAT	2	6	1103354	1103359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186894294
17589	NC_010634	GGT	2	6	1103390	1103395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186894294
17590	NC_010634	CGTT	2	8	1103460	1103467	0 %	50 %	25 %	25 %	186894294
17591	NC_010634	TTC	2	6	1103511	1103516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186894294
17592	NC_010634	ACCT	2	8	1103587	1103594	25 %	25 %	0 %	50 %	186894294
17593	NC_010634	CAG	2	6	1103658	1103663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186894294
17594	NC_010634	T	6	6	1103684	1103689	0 %	100 %	0 %	0 %	186894294
17595	NC_010634	TCA	2	6	1103710	1103715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186894294
17596	NC_010634	A	6	6	1103865	1103870	100 %	0 %	0 %	0 %	186894295
17597	NC_010634	GC	3	6	1103878	1103883	0 %	0 %	50 %	50 %	186894295
17598	NC_010634	CCG	2	6	1103884	1103889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186894295
17599	NC_010634	GCGTG	2	10	1103908	1103917	0 %	20 %	60 %	20 %	186894295
17600	NC_010634	GAA	2	6	1103978	1103983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186894295
17601	NC_010634	CCAGG	2	10	1104041	1104050	20 %	0 %	40 %	40 %	186894295
17602	NC_010634	CGG	2	6	1104118	1104123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186894295
17603	NC_010634	AGA	2	6	1104163	1104168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186894295
17604	NC_010634	CAAT	2	8	1104189	1104196	50 %	25 %	0 %	25 %	186894295
17605	NC_010634	TGA	2	6	1104274	1104279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186894295
17606	NC_010634	GCT	2	6	1104344	1104349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186894295
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17608	NC_010634	TGA	2	6	1104367	1104372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186894295
17609	NC_010634	ATT	2	6	1104391	1104396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186894295
17610	NC_010634	ATC	2	6	1104401	1104406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186894295
17611	NC_010634	GGC	2	6	1104485	1104490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186894295
17612	NC_010634	CGGT	2	8	1104495	1104502	0 %	25 %	50 %	25 %	186894295
17613	NC_010634	AGA	2	6	1104511	1104516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186894295
17614	NC_010634	AGA	2	6	1104556	1104561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186894295
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17847	NC_010634	CAT	2	6	1119580	1119585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186894311
17848	NC_010634	GGC	2	6	1119607	1119612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186894311
17849	NC_010634	TTC	2	6	1119633	1119638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186894311
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17852	NC_010634	GAC	2	6	1119738	1119743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186894311
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17854	NC_010634	ATTT	2	8	1119758	1119765	25 %	75 %	0 %	0 %	186894311
17855	NC_010634	CG	3	6	1120025	1120030	0 %	0 %	50 %	50 %	186894311
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17857	NC_010634	GC	3	6	1120244	1120249	0 %	0 %	50 %	50 %	186894312
17858	NC_010634	TA	3	6	1120267	1120272	50 %	50 %	0 %	0 %	186894312
17859	NC_010634	TGA	2	6	1120315	1120320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186894312
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17863	NC_010634	TGA	2	6	1120497	1120502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186894312
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17882	NC_010634	CTGG	2	8	1122000	1122007	0 %	25 %	50 %	25 %	186894314
17883	NC_010634	T	6	6	1122035	1122040	0 %	100 %	0 %	0 %	186894314
17884	NC_010634	GCT	2	6	1122070	1122075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186894314
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17964	NC_010634	ACG	2	6	1126124	1126129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186894318
17965	NC_010634	GAA	2	6	1126175	1126180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186894318
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17975	NC_010634	GAA	2	6	1126526	1126531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186894318
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17986	NC_010634	AG	3	6	1127091	1127096	50 %	0 %	50 %	0 %	186894318
17987	NC_010634	TTAA	2	8	1127100	1127107	50 %	50 %	0 %	0 %	186894318
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17990	NC_010634	TCA	2	6	1127200	1127205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186894318
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17992	NC_010634	GTG	2	6	1127276	1127281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186894318
17993	NC_010634	GGT	2	6	1127283	1127288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186894318
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17995	NC_010634	CAT	2	6	1127333	1127338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186894318
17996	NC_010634	T	7	7	1127401	1127407	0 %	100 %	0 %	0 %	186894318
17997	NC_010634	AGC	2	6	1127468	1127473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186894318
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17999	NC_010634	AAT	3	9	1127492	1127500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186894318
18000	NC_010634	GT	3	6	1127599	1127604	0 %	50 %	50 %	0 %	186894319

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