MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis YPIII chromosome

Total Repeats: 75726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010465	ACTGG	2	10	141	150	20 %	20 %	40 %	20 %	170022263
2	NC_010465	CTTA	2	8	183	190	25 %	50 %	0 %	25 %	170022263
3	NC_010465	CA	3	6	257	262	50 %	0 %	0 %	50 %	170022263
4	NC_010465	CAGC	2	8	275	282	25 %	0 %	25 %	50 %	170022263
5	NC_010465	AC	3	6	390	395	50 %	0 %	0 %	50 %	170022263
6	NC_010465	TTG	2	6	407	412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022263
7	NC_010465	GCC	2	6	442	447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022263
8	NC_010465	GGT	2	6	469	474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022263
9	NC_010465	AAT	2	6	631	636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022263
10	NC_010465	TAT	2	6	658	663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022263
11	NC_010465	TTA	2	6	679	684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022263
12	NC_010465	GAT	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022263
13	NC_010465	T	6	6	700	705	0 %	100 %	0 %	0 %	170022263
14	NC_010465	AAG	2	6	725	730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022263
15	NC_010465	CAG	2	6	769	774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022263
16	NC_010465	TTGG	2	8	842	849	0 %	50 %	50 %	0 %	170022263
17	NC_010465	CCA	2	6	871	876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170022263
18	NC_010465	GAA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022263
19	NC_010465	GCCAAT	2	12	1018	1029	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170022263
20	NC_010465	GATT	2	8	1050	1057	25 %	50 %	25 %	0 %	170022263
21	NC_010465	TTG	2	6	1081	1086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022263
22	NC_010465	ATA	2	6	1115	1120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022263
23	NC_010465	GCCC	2	8	1195	1202	0 %	0 %	25 %	75 %	170022263
24	NC_010465	AACC	2	8	1236	1243	50 %	0 %	0 %	50 %	170022263
25	NC_010465	GCCT	2	8	1247	1254	0 %	25 %	25 %	50 %	170022263
26	NC_010465	TGG	2	6	1272	1277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022263
27	NC_010465	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022263
28	NC_010465	TCC	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170022263
29	NC_010465	TTG	2	6	1490	1495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022264
30	NC_010465	TGGAGA	2	12	1539	1550	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	170022264
31	NC_010465	TGG	2	6	1551	1556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022264
32	NC_010465	T	6	6	1616	1621	0 %	100 %	0 %	0 %	170022264
33	NC_010465	TTA	2	6	1849	1854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022264
34	NC_010465	TGG	2	6	2017	2022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022264
35	NC_010465	TAA	2	6	2053	2058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022264
36	NC_010465	ATTTT	2	10	2079	2088	20 %	80 %	0 %	0 %	170022264
37	NC_010465	CGC	2	6	2126	2131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022264
38	NC_010465	GAA	2	6	2140	2145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022264
39	NC_010465	GTG	2	6	2229	2234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022264
40	NC_010465	TAA	2	6	2275	2280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022264
41	NC_010465	GAA	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022264
42	NC_010465	AGA	2	6	2299	2304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022264
43	NC_010465	TGAC	2	8	2412	2419	25 %	25 %	25 %	25 %	170022264
44	NC_010465	GCCA	2	8	2450	2457	25 %	0 %	25 %	50 %	170022264
45	NC_010465	GTC	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022264
46	NC_010465	GTA	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022264
47	NC_010465	GGC	2	6	2729	2734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022265
48	NC_010465	T	6	6	2744	2749	0 %	100 %	0 %	0 %	170022265
49	NC_010465	GCAG	2	8	2835	2842	25 %	0 %	50 %	25 %	170022265
50	NC_010465	TTA	2	6	3036	3041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022265
51	NC_010465	GC	3	6	3062	3067	0 %	0 %	50 %	50 %	170022265
52	NC_010465	T	6	6	3068	3073	0 %	100 %	0 %	0 %	170022265
53	NC_010465	T	7	7	3104	3110	0 %	100 %	0 %	0 %	170022265
54	NC_010465	AGC	2	6	3142	3147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022265
55	NC_010465	CGC	2	6	3152	3157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022265
56	NC_010465	ATC	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022265
57	NC_010465	GCG	2	6	3264	3269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022265
58	NC_010465	AG	3	6	3344	3349	50 %	0 %	50 %	0 %	170022265
59	NC_010465	GTT	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022265
60	NC_010465	GC	3	6	3369	3374	0 %	0 %	50 %	50 %	170022265
61	NC_010465	CCG	2	6	3406	3411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022265
62	NC_010465	AGA	2	6	3461	3466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022265
63	NC_010465	GCGG	2	8	3544	3551	0 %	0 %	75 %	25 %	170022265
64	NC_010465	GCC	2	6	3598	3603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022265
65	NC_010465	CTC	2	6	3789	3794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170022266
66	NC_010465	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022266
67	NC_010465	CAC	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170022266
68	NC_010465	GAT	2	6	3988	3993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022266
69	NC_010465	GCA	2	6	4039	4044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022266
70	NC_010465	TCA	2	6	4049	4054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022266
71	NC_010465	CGG	2	6	4107	4112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022266
72	NC_010465	GTT	2	6	4135	4140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022266
73	NC_010465	GTG	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022266
74	NC_010465	CT	3	6	4351	4356	0 %	50 %	0 %	50 %	170022266
75	NC_010465	TCAA	2	8	4375	4382	50 %	25 %	0 %	25 %	170022266
76	NC_010465	AGA	2	6	4407	4412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022266
77	NC_010465	GGT	2	6	4429	4434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022266
78	NC_010465	TTG	2	6	4445	4450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022266
79	NC_010465	CCA	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170022266
80	NC_010465	TGG	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022266
81	NC_010465	AAG	2	6	4667	4672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022266
82	NC_010465	A	6	6	4681	4686	100 %	0 %	0 %	0 %	170022266
83	NC_010465	TGA	2	6	4707	4712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022266
84	NC_010465	TGT	2	6	4734	4739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022266
85	NC_010465	TCT	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170022266
86	NC_010465	CGG	2	6	4811	4816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022266
87	NC_010465	TGA	2	6	4826	4831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022266
88	NC_010465	GTTG	2	8	4839	4846	0 %	50 %	50 %	0 %	170022266
89	NC_010465	TTG	2	6	4852	4857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022266
90	NC_010465	GCGG	2	8	5053	5060	0 %	0 %	75 %	25 %	170022266
91	NC_010465	CCGTAA	2	12	5076	5087	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170022266
92	NC_010465	CT	3	6	5155	5160	0 %	50 %	0 %	50 %	170022266
93	NC_010465	GTT	3	9	5295	5303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022266
94	NC_010465	CTT	2	6	5307	5312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170022266
95	NC_010465	ATT	2	6	5332	5337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022266
96	NC_010465	GAA	2	6	5382	5387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022266
97	NC_010465	GAT	3	9	5413	5421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022266
98	NC_010465	CTGG	2	8	5494	5501	0 %	25 %	50 %	25 %	170022266
99	NC_010465	AGA	2	6	5543	5548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022266
100	NC_010465	AAG	2	6	5618	5623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022266
101	NC_010465	GATT	2	8	5658	5665	25 %	50 %	25 %	0 %	170022266
102	NC_010465	TGG	2	6	5669	5674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022266
103	NC_010465	GCA	2	6	5702	5707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022266
104	NC_010465	GTG	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022266
105	NC_010465	TGG	2	6	5820	5825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022266
106	NC_010465	CGT	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022266
107	NC_010465	AG	3	6	6042	6047	50 %	0 %	50 %	0 %	170022266
108	NC_010465	CGT	2	6	6049	6054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022266
109	NC_010465	TGC	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022266
110	NC_010465	CGC	2	6	6084	6089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022266
111	NC_010465	ACT	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022266
112	NC_010465	TCG	2	6	6132	6137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022266
113	NC_010465	GC	3	6	6162	6167	0 %	0 %	50 %	50 %	170022266
114	NC_010465	ATGG	2	8	6429	6436	25 %	25 %	50 %	0 %	170022267
115	NC_010465	TGC	3	9	6488	6496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022267
116	NC_010465	TG	3	6	6513	6518	0 %	50 %	50 %	0 %	170022267
117	NC_010465	ATT	2	6	6592	6597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022267
118	NC_010465	AAC	2	6	6606	6611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022267
119	NC_010465	GGC	2	6	6629	6634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022267
120	NC_010465	CAA	2	6	6755	6760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022267
121	NC_010465	TGA	3	9	6862	6870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022267
122	NC_010465	TGA	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022267
123	NC_010465	ATG	2	6	6906	6911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022267
124	NC_010465	TAT	2	6	6938	6943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022267
125	NC_010465	GCTG	2	8	7010	7017	0 %	25 %	50 %	25 %	170022267
126	NC_010465	ATT	2	6	7211	7216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022267
127	NC_010465	CGAG	2	8	7533	7540	25 %	0 %	50 %	25 %	170022268
128	NC_010465	ATG	2	6	7584	7589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022268
129	NC_010465	GGTT	2	8	7672	7679	0 %	50 %	50 %	0 %	170022268
130	NC_010465	TC	3	6	7904	7909	0 %	50 %	0 %	50 %	170022269
131	NC_010465	GCTAAA	2	12	7927	7938	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	170022269
132	NC_010465	TGA	2	6	7957	7962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022269
133	NC_010465	CCA	2	6	8027	8032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170022269
134	NC_010465	CGG	2	6	8060	8065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022269
135	NC_010465	CCG	2	6	8099	8104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022269
136	NC_010465	GTG	3	9	8161	8169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022269
137	NC_010465	GTG	2	6	8212	8217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022269
138	NC_010465	CTC	2	6	8256	8261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170022269
139	NC_010465	GGC	2	6	8297	8302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022269
140	NC_010465	TCA	2	6	8306	8311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022269
141	NC_010465	GC	3	6	8387	8392	0 %	0 %	50 %	50 %	170022269
142	NC_010465	AGCC	2	8	8440	8447	25 %	0 %	25 %	50 %	170022269
143	NC_010465	CAT	2	6	8496	8501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022269
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145	NC_010465	AAT	2	6	8698	8703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022269
146	NC_010465	T	6	6	8735	8740	0 %	100 %	0 %	0 %	170022269
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149	NC_010465	ATC	2	6	8889	8894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022270
150	NC_010465	CTCA	2	8	8942	8949	25 %	25 %	0 %	50 %	170022270
151	NC_010465	ACC	2	6	9011	9016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170022270
152	NC_010465	CCT	2	6	9052	9057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170022270
153	NC_010465	TGG	2	6	9091	9096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022270
154	NC_010465	TGGC	2	8	9100	9107	0 %	25 %	50 %	25 %	170022270
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157	NC_010465	GCT	2	6	9214	9219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022270
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159	NC_010465	GCG	2	6	9309	9314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022270
160	NC_010465	CGG	2	6	9319	9324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022270
161	NC_010465	C	7	7	9368	9374	0 %	0 %	0 %	100 %	170022270
162	NC_010465	GCC	2	6	9405	9410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022270
163	NC_010465	TGC	2	6	9576	9581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022270
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165	NC_010465	TGG	2	6	9678	9683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022270
166	NC_010465	CT	3	6	9686	9691	0 %	50 %	0 %	50 %	170022270
167	NC_010465	AAC	2	6	9702	9707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022270
168	NC_010465	A	6	6	9933	9938	100 %	0 %	0 %	0 %	170022271
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172	NC_010465	GTG	2	6	10148	10153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022271
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181	NC_010465	C	7	7	10785	10791	0 %	0 %	0 %	100 %	170022271
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249	NC_010465	ATCA	2	8	15884	15891	50 %	25 %	0 %	25 %	170022276
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257	NC_010465	CCA	2	6	16428	16433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170022276
258	NC_010465	CATC	2	8	16474	16481	25 %	25 %	0 %	50 %	170022276
259	NC_010465	GAA	2	6	16607	16612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022276
260	NC_010465	TCT	2	6	16615	16620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170022276
261	NC_010465	AT	3	6	17013	17018	50 %	50 %	0 %	0 %	170022277
262	NC_010465	ATG	2	6	17063	17068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022277
263	NC_010465	AAT	2	6	17077	17082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022277
264	NC_010465	TAA	2	6	17158	17163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022277
265	NC_010465	AAG	2	6	17189	17194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022277
266	NC_010465	ATTTT	2	10	17204	17213	20 %	80 %	0 %	0 %	170022277
267	NC_010465	AAG	2	6	17272	17277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022277
268	NC_010465	TCA	2	6	17301	17306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022277
269	NC_010465	CAT	2	6	17316	17321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022277
270	NC_010465	TAC	2	6	17337	17342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022277
271	NC_010465	A	6	6	17348	17353	100 %	0 %	0 %	0 %	170022277
272	NC_010465	AGT	2	6	17387	17392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022277
273	NC_010465	AAT	2	6	17395	17400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170022277
274	NC_010465	GGC	2	6	17900	17905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170022278
275	NC_010465	TTG	2	6	17928	17933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022278
276	NC_010465	TTG	2	6	17937	17942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022278
277	NC_010465	TGAC	2	8	17980	17987	25 %	25 %	25 %	25 %	170022278
278	NC_010465	CCGC	2	8	18093	18100	0 %	0 %	25 %	75 %	170022278
279	NC_010465	TCA	2	6	18103	18108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022278
280	NC_010465	AGA	2	6	18113	18118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170022278
281	NC_010465	CAA	2	6	18138	18143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022278
282	NC_010465	GCT	2	6	18161	18166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022278
283	NC_010465	TGT	2	6	18181	18186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022278
284	NC_010465	GTA	2	6	18363	18368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022278
285	NC_010465	CTG	2	6	18480	18485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022278
286	NC_010465	TTG	2	6	18492	18497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170022278
287	NC_010465	CCA	2	6	18777	18782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170022278
288	NC_010465	T	6	6	18884	18889	0 %	100 %	0 %	0 %	170022278
289	NC_010465	CTG	2	6	18891	18896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022278
290	NC_010465	TCA	2	6	18968	18973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170022278
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292	NC_010465	GTA	2	6	19080	19085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022278
293	NC_010465	C	6	6	19122	19127	0 %	0 %	0 %	100 %	170022278
294	NC_010465	TTA	2	6	19306	19311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022278
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298	NC_010465	CGTAA	2	10	19423	19432	40 %	20 %	20 %	20 %	170022278
299	NC_010465	GA	3	6	19440	19445	50 %	0 %	50 %	0 %	170022278
300	NC_010465	GAC	2	6	19557	19562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170022278
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304	NC_010465	TGA	2	6	20245	20250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170022279
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352	NC_010465	CAA	2	6	23881	23886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022282
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372	NC_010465	TAT	2	6	25118	25123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022284
373	NC_010465	ACA	2	6	25155	25160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170022284
374	NC_010465	TTCGT	2	10	25221	25230	0 %	60 %	20 %	20 %	170022284
375	NC_010465	TACT	2	8	25315	25322	25 %	50 %	0 %	25 %	170022284
376	NC_010465	G	7	7	25333	25339	0 %	0 %	100 %	0 %	170022284
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381	NC_010465	CTG	2	6	25649	25654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022284
382	NC_010465	TGG	2	6	25824	25829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170022285
383	NC_010465	GCC	2	6	25849	25854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022285
384	NC_010465	GGTGA	2	10	25931	25940	20 %	20 %	60 %	0 %	170022285
385	NC_010465	CGC	2	6	25948	25953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170022285
386	NC_010465	CGGCC	2	10	26023	26032	0 %	0 %	40 %	60 %	170022285
387	NC_010465	GCT	2	6	26149	26154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170022285
388	NC_010465	ATT	2	6	26188	26193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170022285
389	NC_010465	GGCA	2	8	26197	26204	25 %	0 %	50 %	25 %	170022285
390	NC_010465	CGTC	2	8	26275	26282	0 %	25 %	25 %	50 %	170022285
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392	NC_010465	ATCA	2	8	26473	26480	50 %	25 %	0 %	25 %	170022285
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