MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_010159	TGC	2	6	1439509	1439514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418915
21502	NC_010159	CT	3	6	1439587	1439592	0 %	50 %	0 %	50 %	162418915
21503	NC_010159	AAT	2	6	1439612	1439617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418915
21504	NC_010159	GCGAT	2	10	1439700	1439709	20 %	20 %	40 %	20 %	162418915
21505	NC_010159	TGA	2	6	1439914	1439919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418915
21506	NC_010159	CCG	2	6	1439971	1439976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418915
21507	NC_010159	CCG	2	6	1440014	1440019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418915
21508	NC_010159	CGC	2	6	1440136	1440141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420684
21509	NC_010159	GAA	2	6	1440168	1440173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420684
21510	NC_010159	ATG	2	6	1440183	1440188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420684
21511	NC_010159	GAAA	2	8	1440212	1440219	75 %	0 %	25 %	0 %	162420684
21512	NC_010159	GT	4	8	1440259	1440266	0 %	50 %	50 %	0 %	162420684
21513	NC_010159	GGT	2	6	1440380	1440385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420684
21514	NC_010159	GTC	2	6	1440396	1440401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420684
21515	NC_010159	CCA	2	6	1440468	1440473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420684
21516	NC_010159	AAC	2	6	1440499	1440504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420684
21517	NC_010159	TGC	2	6	1440546	1440551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420684
21518	NC_010159	TGG	2	6	1440573	1440578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420684
21519	NC_010159	TTG	2	6	1440592	1440597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420684
21520	NC_010159	GATA	2	8	1440632	1440639	50 %	25 %	25 %	0 %	162420684
21521	NC_010159	CTGG	2	8	1441182	1441189	0 %	25 %	50 %	25 %	162421198
21522	NC_010159	TCC	2	6	1441192	1441197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162421198
21523	NC_010159	GGCG	2	8	1441203	1441210	0 %	0 %	75 %	25 %	162421198
21524	NC_010159	AGC	2	6	1441229	1441234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421198
21525	NC_010159	TGA	2	6	1441269	1441274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421198
21526	NC_010159	CAA	2	6	1441304	1441309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421198
21527	NC_010159	CTC	2	6	1441389	1441394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162421198
21528	NC_010159	CAAG	2	8	1441419	1441426	50 %	0 %	25 %	25 %	162421198
21529	NC_010159	CTTCCG	2	12	1441452	1441463	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	162421198
21530	NC_010159	TCCT	2	8	1441530	1441537	0 %	50 %	0 %	50 %	162421198
21531	NC_010159	GCTG	2	8	1441614	1441621	0 %	25 %	50 %	25 %	162421198
21532	NC_010159	AT	3	6	1441671	1441676	50 %	50 %	0 %	0 %	162421198
21533	NC_010159	GAA	2	6	1441693	1441698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421198
21534	NC_010159	CAG	2	6	1441711	1441716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421198
21535	NC_010159	GTT	2	6	1441729	1441734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421198
21536	NC_010159	CCG	2	6	1441787	1441792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421198
21537	NC_010159	TC	3	6	1441844	1441849	0 %	50 %	0 %	50 %	162421198
21538	NC_010159	G	8	8	1441854	1441861	0 %	0 %	100 %	0 %	162421198
21539	NC_010159	GAT	2	6	1441887	1441892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421198
21540	NC_010159	GTC	2	6	1441924	1441929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421198
21541	NC_010159	AGA	2	6	1441989	1441994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421198
21542	NC_010159	TGA	2	6	1442001	1442006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421198
21543	NC_010159	ACC	2	6	1442054	1442059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421198
21544	NC_010159	GTT	2	6	1442149	1442154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421198
21545	NC_010159	GTGC	2	8	1442164	1442171	0 %	25 %	50 %	25 %	162421198
21546	NC_010159	TGC	2	6	1442210	1442215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421198
21547	NC_010159	GCG	2	6	1442236	1442241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421198
21548	NC_010159	CAA	2	6	1442328	1442333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421198
21549	NC_010159	GC	3	6	1442368	1442373	0 %	0 %	50 %	50 %	162421198
21550	NC_010159	TACTG	2	10	1442383	1442392	20 %	40 %	20 %	20 %	162421198
21551	NC_010159	TGA	2	6	1442436	1442441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421198
21552	NC_010159	ACGTG	2	10	1442499	1442508	20 %	20 %	40 %	20 %	162421198
21553	NC_010159	GATC	2	8	1442511	1442518	25 %	25 %	25 %	25 %	162421198
21554	NC_010159	CCG	2	6	1442529	1442534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421198
21555	NC_010159	A	6	6	1442596	1442601	100 %	0 %	0 %	0 %	162421198
21556	NC_010159	TG	3	6	1442716	1442721	0 %	50 %	50 %	0 %	162421198
21557	NC_010159	TGAAA	2	10	1442811	1442820	60 %	20 %	20 %	0 %	162421198
21558	NC_010159	CG	3	6	1442905	1442910	0 %	0 %	50 %	50 %	162421198
21559	NC_010159	G	7	7	1442942	1442948	0 %	0 %	100 %	0 %	162421198
21560	NC_010159	TTC	2	6	1443031	1443036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421198
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21562	NC_010159	GGT	2	6	1443246	1443251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421198
21563	NC_010159	TTA	2	6	1443263	1443268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421198
21564	NC_010159	TG	3	6	1443296	1443301	0 %	50 %	50 %	0 %	162421198
21565	NC_010159	CTC	2	6	1443351	1443356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162421198
21566	NC_010159	GT	3	6	1443406	1443411	0 %	50 %	50 %	0 %	162421198
21567	NC_010159	CCG	2	6	1443447	1443452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421198
21568	NC_010159	TAC	2	6	1443506	1443511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421198
21569	NC_010159	CCAT	2	8	1443513	1443520	25 %	25 %	0 %	50 %	162421198
21570	NC_010159	CAT	2	6	1443527	1443532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421198
21571	NC_010159	CTT	2	6	1443558	1443563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421198
21572	NC_010159	TGA	2	6	1443582	1443587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421198
21573	NC_010159	CTA	2	6	1443636	1443641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421198
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21577	NC_010159	ACA	3	9	1443924	1443932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421198
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21583	NC_010159	A	6	6	1444261	1444266	100 %	0 %	0 %	0 %	162418916
21584	NC_010159	CAGC	2	8	1444303	1444310	25 %	0 %	25 %	50 %	162418916
21585	NC_010159	GAA	3	9	1444314	1444322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418916
21586	NC_010159	CGC	2	6	1444350	1444355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418916
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21589	NC_010159	TGT	2	6	1444781	1444786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418916
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21591	NC_010159	TGG	2	6	1444976	1444981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418916
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21593	NC_010159	GCAT	2	8	1445041	1445048	25 %	25 %	25 %	25 %	162418916
21594	NC_010159	ATG	2	6	1445100	1445105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418916
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21599	NC_010159	GCGG	2	8	1445482	1445489	0 %	0 %	75 %	25 %	162421006
21600	NC_010159	G	6	6	1445502	1445507	0 %	0 %	100 %	0 %	162421006
21601	NC_010159	AGA	2	6	1445529	1445534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421006
21602	NC_010159	A	6	6	1445566	1445571	100 %	0 %	0 %	0 %	162421006
21603	NC_010159	AGC	2	6	1445628	1445633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421006
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21608	NC_010159	CCAAG	2	10	1446034	1446043	40 %	0 %	20 %	40 %	162421006
21609	NC_010159	TGC	2	6	1446063	1446068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421006
21610	NC_010159	GAACT	2	10	1446076	1446085	40 %	20 %	20 %	20 %	162421006
21611	NC_010159	TGG	2	6	1446168	1446173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421006
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21613	NC_010159	CAA	2	6	1446209	1446214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421006
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21617	NC_010159	GAA	2	6	1446340	1446345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421006
21618	NC_010159	GTT	3	9	1446364	1446372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421006
21619	NC_010159	TAA	2	6	1446384	1446389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421006
21620	NC_010159	TGC	2	6	1446438	1446443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421006
21621	NC_010159	AAT	2	6	1446494	1446499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421006
21622	NC_010159	GGC	2	6	1446627	1446632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420505
21623	NC_010159	ACT	2	6	1446684	1446689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420505
21624	NC_010159	CGAT	2	8	1446751	1446758	25 %	25 %	25 %	25 %	162420505
21625	NC_010159	TGG	2	6	1446814	1446819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420505
21626	NC_010159	GC	3	6	1446846	1446851	0 %	0 %	50 %	50 %	162420505
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21630	NC_010159	CGG	2	6	1447031	1447036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420505
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21721	NC_010159	CT	3	6	1453861	1453866	0 %	50 %	0 %	50 %	162421016
21722	NC_010159	GAC	2	6	1453873	1453878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421016
21723	NC_010159	GCGGTG	2	12	1453887	1453898	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	162421016
21724	NC_010159	GGC	2	6	1453901	1453906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421016
21725	NC_010159	CAACAG	2	12	1453964	1453975	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	162421016
21726	NC_010159	AGC	3	9	1453998	1454006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421016
21727	NC_010159	A	6	6	1454012	1454017	100 %	0 %	0 %	0 %	162421016
21728	NC_010159	AGC	2	6	1454022	1454027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421016
21729	NC_010159	GAA	2	6	1454033	1454038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421016
21730	NC_010159	GCA	2	6	1454041	1454046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421016
21731	NC_010159	GCT	2	6	1454054	1454059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421016
21732	NC_010159	AAC	2	6	1454061	1454066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421016
21733	NC_010159	AAG	2	6	1454106	1454111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421016
21734	NC_010159	GCTG	2	8	1454119	1454126	0 %	25 %	50 %	25 %	162421016
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21840	NC_010159	CAAA	2	8	1460069	1460076	75 %	0 %	0 %	25 %	162420055
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