MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_010159	GCC	2	6	1404094	1404099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421516
21003	NC_010159	ACG	2	6	1404165	1404170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421516
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21005	NC_010159	CAC	2	6	1404683	1404688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421837
21006	NC_010159	TGC	2	6	1404704	1404709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421837
21007	NC_010159	CAT	2	6	1404773	1404778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421837
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21009	NC_010159	TTG	2	6	1404832	1404837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421837
21010	NC_010159	ATC	2	6	1404873	1404878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421837
21011	NC_010159	TCT	2	6	1404958	1404963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421837
21012	NC_010159	T	6	6	1404963	1404968	0 %	100 %	0 %	0 %	162421837
21013	NC_010159	GTT	2	6	1404990	1404995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421837
21014	NC_010159	CAGC	2	8	1405007	1405014	25 %	0 %	25 %	50 %	162421837
21015	NC_010159	CGTTAA	2	12	1405040	1405051	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	162421837
21016	NC_010159	GTT	2	6	1405080	1405085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421837
21017	NC_010159	CTT	2	6	1405376	1405381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420720
21018	NC_010159	TAAAC	2	10	1405485	1405494	60 %	20 %	0 %	20 %	162420720
21019	NC_010159	C	6	6	1405499	1405504	0 %	0 %	0 %	100 %	162420720
21020	NC_010159	GCA	2	6	1405527	1405532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420720
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21022	NC_010159	ACG	2	6	1405820	1405825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420720
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21024	NC_010159	ATA	2	6	1405964	1405969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420720
21025	NC_010159	A	6	6	1406013	1406018	100 %	0 %	0 %	0 %	162420720
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21029	NC_010159	CTG	2	6	1406144	1406149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420720
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21031	NC_010159	TCTGT	2	10	1406188	1406197	0 %	60 %	20 %	20 %	162420720
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21034	NC_010159	CCCG	2	8	1406362	1406369	0 %	0 %	25 %	75 %	162420060
21035	NC_010159	AATT	2	8	1406403	1406410	50 %	50 %	0 %	0 %	162420060
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21042	NC_010159	GAA	2	6	1406892	1406897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420060
21043	NC_010159	A	6	6	1406924	1406929	100 %	0 %	0 %	0 %	162420060
21044	NC_010159	ATG	2	6	1406993	1406998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420060
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21052	NC_010159	TCT	2	6	1407417	1407422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420158
21053	NC_010159	TAA	2	6	1407537	1407542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420158
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21055	NC_010159	TATT	2	8	1407602	1407609	25 %	75 %	0 %	0 %	162420158
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21067	NC_010159	TTC	2	6	1408106	1408111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420158
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21092	NC_010159	AT	4	8	1409759	1409766	50 %	50 %	0 %	0 %	162418884
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21100	NC_010159	AT	3	6	1410089	1410094	50 %	50 %	0 %	0 %	162418884
21101	NC_010159	GATC	2	8	1410142	1410149	25 %	25 %	25 %	25 %	162418884
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21105	NC_010159	CTG	2	6	1410236	1410241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418884
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21107	NC_010159	AT	3	6	1410369	1410374	50 %	50 %	0 %	0 %	162418884
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21117	NC_010159	ATT	2	6	1411062	1411067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421486
21118	NC_010159	TCA	2	6	1411174	1411179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421486
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21233	NC_010159	TTA	2	6	1417562	1417567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420906
21234	NC_010159	TTAC	2	8	1417993	1418000	25 %	50 %	0 %	25 %	162420467
21235	NC_010159	CA	3	6	1418275	1418280	50 %	0 %	0 %	50 %	162420467
21236	NC_010159	TTG	2	6	1418472	1418477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420467
21237	NC_010159	A	6	6	1419409	1419414	100 %	0 %	0 %	0 %	162419767
21238	NC_010159	GA	3	6	1419426	1419431	50 %	0 %	50 %	0 %	162419767
21239	NC_010159	CTT	2	6	1419724	1419729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418807
21240	NC_010159	CT	3	6	1419783	1419788	0 %	50 %	0 %	50 %	162418807
21241	NC_010159	GT	3	6	1419801	1419806	0 %	50 %	50 %	0 %	162418807
21242	NC_010159	AGTT	2	8	1419890	1419897	25 %	50 %	25 %	0 %	162418246
21243	NC_010159	TTC	2	6	1419992	1419997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418246
21244	NC_010159	ATC	2	6	1420024	1420029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418246
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21247	NC_010159	GCG	2	6	1420233	1420238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418246
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21249	NC_010159	TTC	2	6	1420264	1420269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418246
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21254	NC_010159	ATG	2	6	1420402	1420407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418246
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21265	NC_010159	GTG	2	6	1420968	1420973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418246
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21273	NC_010159	ATTG	2	8	1422578	1422585	25 %	50 %	25 %	0 %	162421003
21274	NC_010159	TGA	2	6	1422606	1422611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421003
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21276	NC_010159	CCT	2	6	1422678	1422683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162421425
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21331	NC_010159	GCTTT	2	10	1428004	1428013	0 %	60 %	20 %	20 %	162418483
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21335	NC_010159	TTC	2	6	1428182	1428187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418483
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21337	NC_010159	TGC	2	6	1428207	1428212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418483
21338	NC_010159	ATCA	2	8	1428260	1428267	50 %	25 %	0 %	25 %	162418483
21339	NC_010159	CTTT	2	8	1428477	1428484	0 %	75 %	0 %	25 %	162418483
21340	NC_010159	TCC	2	6	1428525	1428530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162418483
21341	NC_010159	TC	3	6	1428616	1428621	0 %	50 %	0 %	50 %	162418483
21342	NC_010159	ACCATC	2	12	1428746	1428757	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	162418483
21343	NC_010159	GCTTTT	2	12	1428783	1428794	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	162418483
21344	NC_010159	ATG	2	6	1430171	1430176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421221
21345	NC_010159	ATC	2	6	1430212	1430217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421221
21346	NC_010159	T	6	6	1430233	1430238	0 %	100 %	0 %	0 %	162421221
21347	NC_010159	GA	3	6	1430291	1430296	50 %	0 %	50 %	0 %	162421221
21348	NC_010159	CAG	2	6	1430362	1430367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421221
21349	NC_010159	ACA	2	6	1430393	1430398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421221
21350	NC_010159	TTTGC	2	10	1430486	1430495	0 %	60 %	20 %	20 %	162421221
21351	NC_010159	CTT	2	6	1430550	1430555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421221
21352	NC_010159	T	6	6	1430620	1430625	0 %	100 %	0 %	0 %	162421221
21353	NC_010159	ATG	2	6	1430859	1430864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420386
21354	NC_010159	GCC	2	6	1430939	1430944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420386
21355	NC_010159	TAC	2	6	1430980	1430985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420386
21356	NC_010159	TGG	2	6	1431027	1431032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420386
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21358	NC_010159	TGG	2	6	1431289	1431294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420193
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21360	NC_010159	ATG	2	6	1431418	1431423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420193
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21362	NC_010159	A	6	6	1431497	1431502	100 %	0 %	0 %	0 %	162420193
21363	NC_010159	TCAG	2	8	1431690	1431697	25 %	25 %	25 %	25 %	162418747
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21366	NC_010159	GTT	2	6	1431757	1431762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418747
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21375	NC_010159	GTTT	2	8	1432247	1432254	0 %	75 %	25 %	0 %	162421663
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21386	NC_010159	TTG	2	6	1432756	1432761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421663
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21461	NC_010159	CGG	2	6	1436454	1436459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418132
21462	NC_010159	CAG	2	6	1436561	1436566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418132
21463	NC_010159	GCA	2	6	1436629	1436634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418132
21464	NC_010159	T	6	6	1436816	1436821	0 %	100 %	0 %	0 %	162418132
21465	NC_010159	TG	3	6	1437537	1437542	0 %	50 %	50 %	0 %	162418632
21466	NC_010159	A	6	6	1437555	1437560	100 %	0 %	0 %	0 %	162418632
21467	NC_010159	CGATT	2	10	1437589	1437598	20 %	40 %	20 %	20 %	162418632
21468	NC_010159	TCC	2	6	1437667	1437672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162418632
21469	NC_010159	AAG	2	6	1437703	1437708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418632
21470	NC_010159	GCAG	2	8	1437716	1437723	25 %	0 %	50 %	25 %	162418632
21471	NC_010159	CAT	2	6	1437728	1437733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418632
21472	NC_010159	T	7	7	1437740	1437746	0 %	100 %	0 %	0 %	162418632
21473	NC_010159	GTT	2	6	1437970	1437975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421861
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21479	NC_010159	GTC	2	6	1438208	1438213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421861
21480	NC_010159	TTTA	2	8	1438230	1438237	25 %	75 %	0 %	0 %	162421861
21481	NC_010159	TGTGG	2	10	1438252	1438261	0 %	40 %	60 %	0 %	162421861
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21493	NC_010159	GAA	2	6	1438780	1438785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418915
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21498	NC_010159	G	6	6	1439341	1439346	0 %	0 %	100 %	0 %	162418915
21499	NC_010159	TGT	2	6	1439401	1439406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418915
21500	NC_010159	GGGA	2	8	1439470	1439477	25 %	0 %	75 %	0 %	162418915

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