MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_010159	TGC	2	6	1271729	1271734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418542
19002	NC_010159	GC	3	6	1271772	1271777	0 %	0 %	50 %	50 %	162418542
19003	NC_010159	ACG	2	6	1271845	1271850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418542
19004	NC_010159	TCA	2	6	1271926	1271931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418542
19005	NC_010159	CAT	2	6	1271945	1271950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418542
19006	NC_010159	T	6	6	1272036	1272041	0 %	100 %	0 %	0 %	162418542
19007	NC_010159	TGC	2	6	1272146	1272151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418542
19008	NC_010159	TGT	2	6	1272328	1272333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418542
19009	NC_010159	ACG	2	6	1272431	1272436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418542
19010	NC_010159	CAG	2	6	1272462	1272467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418542
19011	NC_010159	ATG	2	6	1272745	1272750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419093
19012	NC_010159	CCG	2	6	1272769	1272774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419093
19013	NC_010159	GCG	2	6	1272800	1272805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419093
19014	NC_010159	GT	3	6	1272806	1272811	0 %	50 %	50 %	0 %	162419093
19015	NC_010159	AATC	2	8	1272819	1272826	50 %	25 %	0 %	25 %	162419093
19016	NC_010159	CTG	2	6	1272928	1272933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419093
19017	NC_010159	ATG	2	6	1272971	1272976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419093
19018	NC_010159	CCA	2	6	1273078	1273083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419093
19019	NC_010159	GCA	2	6	1273159	1273164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419093
19020	NC_010159	TGA	2	6	1273353	1273358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419093
19021	NC_010159	GCTTG	2	10	1273407	1273416	0 %	40 %	40 %	20 %	162419093
19022	NC_010159	ATCCT	2	10	1273449	1273458	20 %	40 %	0 %	40 %	162419093
19023	NC_010159	G	6	6	1273532	1273537	0 %	0 %	100 %	0 %	162419093
19024	NC_010159	AGA	2	6	1273542	1273547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419093
19025	NC_010159	ATG	2	6	1273565	1273570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419093
19026	NC_010159	CAG	2	6	1273571	1273576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419093
19027	NC_010159	AAGT	2	8	1273594	1273601	50 %	25 %	25 %	0 %	162419093
19028	NC_010159	ATT	2	6	1273788	1273793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419263
19029	NC_010159	GCT	2	6	1273794	1273799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419263
19030	NC_010159	TGT	2	6	1273924	1273929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419263
19031	NC_010159	GATC	2	8	1273947	1273954	25 %	25 %	25 %	25 %	162419263
19032	NC_010159	GCA	2	6	1274061	1274066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419263
19033	NC_010159	TCA	2	6	1274078	1274083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419263
19034	NC_010159	ATG	2	6	1274111	1274116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419263
19035	NC_010159	GC	3	6	1274121	1274126	0 %	0 %	50 %	50 %	162419263
19036	NC_010159	GCC	2	6	1274327	1274332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419263
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19038	NC_010159	GCCA	2	8	1274369	1274376	25 %	0 %	25 %	50 %	162419263
19039	NC_010159	CCT	2	6	1274399	1274404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162419631
19040	NC_010159	GCC	2	6	1274527	1274532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419631
19041	NC_010159	CAG	2	6	1274561	1274566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419631
19042	NC_010159	CAT	2	6	1274577	1274582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419631
19043	NC_010159	CT	3	6	1274608	1274613	0 %	50 %	0 %	50 %	162419631
19044	NC_010159	TCGCAT	2	12	1274639	1274650	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	162419631
19045	NC_010159	CCG	2	6	1274683	1274688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419631
19046	NC_010159	CAT	2	6	1274694	1274699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419631
19047	NC_010159	ATA	2	6	1274737	1274742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419631
19048	NC_010159	TCT	2	6	1274797	1274802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419631
19049	NC_010159	AG	3	6	1274811	1274816	50 %	0 %	50 %	0 %	162419631
19050	NC_010159	TAA	2	6	1274828	1274833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419631
19051	NC_010159	CAG	2	6	1275000	1275005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419631
19052	NC_010159	AAT	2	6	1275030	1275035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419631
19053	NC_010159	TCAA	2	8	1275040	1275047	50 %	25 %	0 %	25 %	162419631
19054	NC_010159	GCCC	2	8	1275065	1275072	0 %	0 %	25 %	75 %	162419631
19055	NC_010159	AAT	2	6	1275104	1275109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419631
19056	NC_010159	CCA	2	6	1275175	1275180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419631
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19058	NC_010159	CAC	2	6	1275224	1275229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419631
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19061	NC_010159	CCG	2	6	1275284	1275289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419631
19062	NC_010159	TGC	2	6	1275315	1275320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419631
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19068	NC_010159	TGG	2	6	1275656	1275661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419631
19069	NC_010159	TCCGC	2	10	1275668	1275677	0 %	20 %	20 %	60 %	162419631
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19075	NC_010159	CAA	2	6	1275896	1275901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419631
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19081	NC_010159	CCCCA	2	10	1276315	1276324	20 %	0 %	0 %	80 %	162419696
19082	NC_010159	AGAT	2	8	1276411	1276418	50 %	25 %	25 %	0 %	162419696
19083	NC_010159	GTG	2	6	1276432	1276437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419696
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19087	NC_010159	ATCAC	2	10	1276552	1276561	40 %	20 %	0 %	40 %	162419696
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19089	NC_010159	CGC	2	6	1276746	1276751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419696
19090	NC_010159	GATA	2	8	1276785	1276792	50 %	25 %	25 %	0 %	162419696
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19092	NC_010159	AATCAG	2	12	1276935	1276946	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	162419696
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19100	NC_010159	TAC	2	6	1277236	1277241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420094
19101	NC_010159	GGC	2	6	1277320	1277325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420094
19102	NC_010159	TGC	2	6	1277334	1277339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420094
19103	NC_010159	GCC	2	6	1277355	1277360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420094
19104	NC_010159	TCA	2	6	1277376	1277381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420094
19105	NC_010159	GAT	2	6	1277395	1277400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420094
19106	NC_010159	GTAAA	2	10	1277525	1277534	60 %	20 %	20 %	0 %	162420094
19107	NC_010159	CAG	2	6	1277536	1277541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420094
19108	NC_010159	CCG	2	6	1277727	1277732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420094
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19112	NC_010159	TGT	2	6	1277964	1277969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420307
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19116	NC_010159	CTT	2	6	1278124	1278129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420307
19117	NC_010159	GCG	2	6	1278303	1278308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420307
19118	NC_010159	GT	3	6	1278339	1278344	0 %	50 %	50 %	0 %	162420307
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19234	NC_010159	ATG	2	6	1285306	1285311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421827
19235	NC_010159	AGC	2	6	1285352	1285357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421827
19236	NC_010159	A	6	6	1285534	1285539	100 %	0 %	0 %	0 %	162421827
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19469	NC_010159	CGA	2	6	1299794	1299799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419595
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19472	NC_010159	CGT	2	6	1299938	1299943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419595
19473	NC_010159	TCG	2	6	1302669	1302674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419864
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19499	NC_010159	T	6	6	1303388	1303393	0 %	100 %	0 %	0 %	162419864
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