MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_010159	CG	3	6	1236179	1236184	0 %	0 %	50 %	50 %	162418726
18502	NC_010159	TCG	2	6	1236260	1236265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418726
18503	NC_010159	CGG	2	6	1236281	1236286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418726
18504	NC_010159	CCA	2	6	1236306	1236311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418726
18505	NC_010159	CCA	2	6	1236330	1236335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418726
18506	NC_010159	GCCACC	2	12	1236580	1236591	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	162418726
18507	NC_010159	CCA	2	6	1236624	1236629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418726
18508	NC_010159	CCA	2	6	1236693	1236698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418726
18509	NC_010159	CGG	2	6	1236753	1236758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418726
18510	NC_010159	TGC	2	6	1236926	1236931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418726
18511	NC_010159	T	6	6	1236972	1236977	0 %	100 %	0 %	0 %	162418726
18512	NC_010159	CAC	2	6	1236978	1236983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418726
18513	NC_010159	TGA	2	6	1237032	1237037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418726
18514	NC_010159	CTGGA	2	10	1237070	1237079	20 %	20 %	40 %	20 %	162418726
18515	NC_010159	GGC	2	6	1237101	1237106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418726
18516	NC_010159	TGG	2	6	1237218	1237223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421179
18517	NC_010159	AAT	2	6	1237231	1237236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421179
18518	NC_010159	TGC	2	6	1237279	1237284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421179
18519	NC_010159	GCC	2	6	1237345	1237350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421179
18520	NC_010159	AAT	2	6	1237371	1237376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421179
18521	NC_010159	CGG	2	6	1237417	1237422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421179
18522	NC_010159	GCA	2	6	1237447	1237452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421179
18523	NC_010159	ACC	2	6	1237645	1237650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421179
18524	NC_010159	CTG	2	6	1237656	1237661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421179
18525	NC_010159	ATC	2	6	1237764	1237769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421179
18526	NC_010159	CTG	2	6	1237783	1237788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421179
18527	NC_010159	CTT	2	6	1237874	1237879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421179
18528	NC_010159	GCA	2	6	1237927	1237932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421179
18529	NC_010159	AAC	2	6	1237942	1237947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421179
18530	NC_010159	CTG	2	6	1237998	1238003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421179
18531	NC_010159	AAT	2	6	1238053	1238058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421179
18532	NC_010159	ATGG	2	8	1238114	1238121	25 %	25 %	50 %	0 %	162419054
18533	NC_010159	GCA	2	6	1238199	1238204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419054
18534	NC_010159	GCC	2	6	1238211	1238216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419054
18535	NC_010159	TGA	2	6	1238278	1238283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419054
18536	NC_010159	GCC	2	6	1238343	1238348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419054
18537	NC_010159	ATCA	2	8	1238354	1238361	50 %	25 %	0 %	25 %	162419054
18538	NC_010159	TCA	2	6	1238377	1238382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419054
18539	NC_010159	C	8	8	1238517	1238524	0 %	0 %	0 %	100 %	162419054
18540	NC_010159	T	6	6	1238643	1238648	0 %	100 %	0 %	0 %	162419054
18541	NC_010159	GGT	2	6	1238654	1238659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419054
18542	NC_010159	TGC	2	6	1238742	1238747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419054
18543	NC_010159	GCCC	2	8	1238766	1238773	0 %	0 %	25 %	75 %	162419054
18544	NC_010159	TAA	2	6	1239015	1239020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419054
18545	NC_010159	CCCA	2	8	1239155	1239162	25 %	0 %	0 %	75 %	162419054
18546	NC_010159	GAT	2	6	1239243	1239248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419054
18547	NC_010159	GAA	2	6	1239261	1239266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419054
18548	NC_010159	ATG	2	6	1239268	1239273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419054
18549	NC_010159	AAT	2	6	1239312	1239317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419054
18550	NC_010159	GCCA	2	8	1239318	1239325	25 %	0 %	25 %	50 %	162419054
18551	NC_010159	ATC	2	6	1239368	1239373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419054
18552	NC_010159	T	7	7	1239388	1239394	0 %	100 %	0 %	0 %	162419054
18553	NC_010159	TTG	2	6	1239468	1239473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419054
18554	NC_010159	AG	3	6	1239488	1239493	50 %	0 %	50 %	0 %	162419054
18555	NC_010159	GCG	2	6	1239562	1239567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419054
18556	NC_010159	CTTT	2	8	1239586	1239593	0 %	75 %	0 %	25 %	162419054
18557	NC_010159	GCAG	2	8	1239723	1239730	25 %	0 %	50 %	25 %	162419054
18558	NC_010159	AAG	2	6	1239759	1239764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419054
18559	NC_010159	GCT	2	6	1239772	1239777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419054
18560	NC_010159	GTG	2	6	1239783	1239788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419054
18561	NC_010159	CAT	2	6	1239850	1239855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419054
18562	NC_010159	CAG	2	6	1239908	1239913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419054
18563	NC_010159	TGT	2	6	1239916	1239921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419054
18564	NC_010159	CT	3	6	1239957	1239962	0 %	50 %	0 %	50 %	162419054
18565	NC_010159	CCAC	2	8	1240005	1240012	25 %	0 %	0 %	75 %	162419054
18566	NC_010159	GTG	2	6	1240051	1240056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419054
18567	NC_010159	AGT	2	6	1240066	1240071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419054
18568	NC_010159	TTTC	2	8	1240120	1240127	0 %	75 %	0 %	25 %	162419054
18569	NC_010159	ATG	2	6	1240140	1240145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419054
18570	NC_010159	TGC	2	6	1240156	1240161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419054
18571	NC_010159	GT	3	6	1240182	1240187	0 %	50 %	50 %	0 %	162419054
18572	NC_010159	TA	3	6	1240351	1240356	50 %	50 %	0 %	0 %	162419054
18573	NC_010159	C	7	7	1240379	1240385	0 %	0 %	0 %	100 %	162419054
18574	NC_010159	CAT	2	6	1240462	1240467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419054
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18577	NC_010159	GC	3	6	1240639	1240644	0 %	0 %	50 %	50 %	162419054
18578	NC_010159	ACTCA	2	10	1240745	1240754	40 %	20 %	0 %	40 %	162419054
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18581	NC_010159	GGGT	2	8	1240936	1240943	0 %	25 %	75 %	0 %	162419054
18582	NC_010159	GCT	2	6	1241002	1241007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419054
18583	NC_010159	CGG	2	6	1241130	1241135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419054
18584	NC_010159	CTGA	2	8	1241204	1241211	25 %	25 %	25 %	25 %	162419054
18585	NC_010159	GCA	2	6	1241212	1241217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419054
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18588	NC_010159	TAT	2	6	1241293	1241298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419054
18589	NC_010159	CAAC	2	8	1241303	1241310	50 %	0 %	0 %	50 %	162419054
18590	NC_010159	AT	3	6	1241349	1241354	50 %	50 %	0 %	0 %	162419054
18591	NC_010159	ATT	2	6	1241363	1241368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419054
18592	NC_010159	CAC	2	6	1241408	1241413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419054
18593	NC_010159	GTGTG	2	10	1241641	1241650	0 %	40 %	60 %	0 %	162419054
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18596	NC_010159	CA	3	6	1241718	1241723	50 %	0 %	0 %	50 %	162419054
18597	NC_010159	GCA	2	6	1241908	1241913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419054
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18599	NC_010159	CAA	2	6	1241947	1241952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419054
18600	NC_010159	ATT	2	6	1241976	1241981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419054
18601	NC_010159	CAT	2	6	1242095	1242100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419477
18602	NC_010159	CAC	2	6	1242101	1242106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419477
18603	NC_010159	CGA	2	6	1242160	1242165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419477
18604	NC_010159	ATG	2	6	1242263	1242268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419477
18605	NC_010159	GCCACG	2	12	1242326	1242337	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	162419477
18606	NC_010159	AATG	2	8	1242471	1242478	50 %	25 %	25 %	0 %	162419477
18607	NC_010159	GAT	2	6	1242493	1242498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419477
18608	NC_010159	AAT	2	6	1242524	1242529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419477
18609	NC_010159	TCTG	2	8	1242669	1242676	0 %	50 %	25 %	25 %	162419477
18610	NC_010159	ACC	2	6	1242692	1242697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419477
18611	NC_010159	AG	3	6	1242723	1242728	50 %	0 %	50 %	0 %	162419477
18612	NC_010159	CAT	2	6	1242748	1242753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419477
18613	NC_010159	AT	3	6	1242813	1242818	50 %	50 %	0 %	0 %	162419477
18614	NC_010159	CCA	2	6	1242832	1242837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419477
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18616	NC_010159	CTT	2	6	1242959	1242964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419477
18617	NC_010159	CGG	2	6	1243009	1243014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419477
18618	NC_010159	CTT	2	6	1243021	1243026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419477
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18732	NC_010159	CGC	2	6	1251132	1251137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418710
18733	NC_010159	TGA	2	6	1251224	1251229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418710
18734	NC_010159	CTG	2	6	1251322	1251327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418710
18735	NC_010159	GGACT	2	10	1251427	1251436	20 %	20 %	40 %	20 %	162418710
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18748	NC_010159	GCA	2	6	1252383	1252388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419044
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18752	NC_010159	GTCA	2	8	1252822	1252829	25 %	25 %	25 %	25 %	162420832
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18759	NC_010159	GCTG	2	8	1253503	1253510	0 %	25 %	50 %	25 %	162421369
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