MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_010159	T	6	6	1129757	1129762	0 %	100 %	0 %	0 %	162419928
17002	NC_010159	CGT	2	6	1129772	1129777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419928
17003	NC_010159	TTGG	2	8	1129779	1129786	0 %	50 %	50 %	0 %	162419928
17004	NC_010159	ACC	2	6	1129935	1129940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419928
17005	NC_010159	GCT	2	6	1129970	1129975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419928
17006	NC_010159	GGC	2	6	1130128	1130133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419928
17007	NC_010159	GGA	2	6	1130217	1130222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162419928
17008	NC_010159	GCTCAA	2	12	1130227	1130238	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	162419928
17009	NC_010159	TCA	2	6	1130266	1130271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419928
17010	NC_010159	AAC	2	6	1134048	1134053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421725
17011	NC_010159	ATTGA	2	10	1134131	1134140	40 %	40 %	20 %	0 %	162421725
17012	NC_010159	ACA	2	6	1134189	1134194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421725
17013	NC_010159	TGA	2	6	1134204	1134209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421725
17014	NC_010159	TC	3	6	1134237	1134242	0 %	50 %	0 %	50 %	162421725
17015	NC_010159	G	6	6	1134251	1134256	0 %	0 %	100 %	0 %	162421725
17016	NC_010159	GAAA	2	8	1134355	1134362	75 %	0 %	25 %	0 %	162421725
17017	NC_010159	CAA	2	6	1134370	1134375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421725
17018	NC_010159	ATC	2	6	1134414	1134419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421725
17019	NC_010159	TTTG	2	8	1134460	1134467	0 %	75 %	25 %	0 %	162421725
17020	NC_010159	TTCGC	2	10	1134694	1134703	0 %	40 %	20 %	40 %	162421305
17021	NC_010159	TGC	2	6	1134743	1134748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421305
17022	NC_010159	GAT	2	6	1134819	1134824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421305
17023	NC_010159	ACTG	2	8	1134834	1134841	25 %	25 %	25 %	25 %	162421305
17024	NC_010159	TGATT	2	10	1134872	1134881	20 %	60 %	20 %	0 %	162421305
17025	NC_010159	ATT	2	6	1134916	1134921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421305
17026	NC_010159	CCA	2	6	1135019	1135024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421305
17027	NC_010159	GGT	2	6	1135031	1135036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421305
17028	NC_010159	TTA	2	6	1135126	1135131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421305
17029	NC_010159	ACGGT	2	10	1135324	1135333	20 %	20 %	40 %	20 %	162421305
17030	NC_010159	ATC	2	6	1135365	1135370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421305
17031	NC_010159	TGG	2	6	1135555	1135560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421305
17032	NC_010159	AAT	2	6	1135563	1135568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421305
17033	NC_010159	CCG	2	6	1135628	1135633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421305
17034	NC_010159	CGC	2	6	1135673	1135678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421305
17035	NC_010159	CATC	2	8	1136419	1136426	25 %	25 %	0 %	50 %	162420904
17036	NC_010159	A	6	6	1136446	1136451	100 %	0 %	0 %	0 %	162420904
17037	NC_010159	TGTA	2	8	1136476	1136483	25 %	50 %	25 %	0 %	162420904
17038	NC_010159	GTC	2	6	1136517	1136522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420904
17039	NC_010159	TGG	2	6	1136551	1136556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420904
17040	NC_010159	TTG	2	6	1136590	1136595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420904
17041	NC_010159	GCT	2	6	1136645	1136650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420904
17042	NC_010159	TGC	2	6	1136711	1136716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420904
17043	NC_010159	ACC	2	6	1136721	1136726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420904
17044	NC_010159	TGG	2	6	1136764	1136769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420904
17045	NC_010159	TTTGG	2	10	1136805	1136814	0 %	60 %	40 %	0 %	162420904
17046	NC_010159	TGG	2	6	1136899	1136904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420904
17047	NC_010159	TTGC	2	8	1136968	1136975	0 %	50 %	25 %	25 %	162420904
17048	NC_010159	CTT	2	6	1136999	1137004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420904
17049	NC_010159	TGAA	2	8	1137064	1137071	50 %	25 %	25 %	0 %	162420904
17050	NC_010159	CCA	2	6	1137103	1137108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420904
17051	NC_010159	CCATCA	2	12	1137127	1137138	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	162420904
17052	NC_010159	GGC	2	6	1137152	1137157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420904
17053	NC_010159	GCG	2	6	1137216	1137221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420904
17054	NC_010159	CT	3	6	1137257	1137262	0 %	50 %	0 %	50 %	162420904
17055	NC_010159	GCA	2	6	1137283	1137288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420904
17056	NC_010159	TGGT	2	8	1137322	1137329	0 %	50 %	50 %	0 %	162420904
17057	NC_010159	TGT	2	6	1137394	1137399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420904
17058	NC_010159	AGTC	2	8	1137466	1137473	25 %	25 %	25 %	25 %	162420904
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17060	NC_010159	TG	3	6	1137848	1137853	0 %	50 %	50 %	0 %	162420484
17061	NC_010159	GTAA	2	8	1138128	1138135	50 %	25 %	25 %	0 %	162420484
17062	NC_010159	TCTCAA	2	12	1138264	1138275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420476
17063	NC_010159	GAC	2	6	1138300	1138305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420476
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17065	NC_010159	CAG	2	6	1138331	1138336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420476
17066	NC_010159	TCAA	2	8	1138350	1138357	50 %	25 %	0 %	25 %	162420476
17067	NC_010159	GAT	2	6	1138541	1138546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420476
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17069	NC_010159	CAG	2	6	1138607	1138612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420476
17070	NC_010159	GCA	2	6	1138626	1138631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420476
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17074	NC_010159	GAA	2	6	1138715	1138720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420476
17075	NC_010159	A	6	6	1138736	1138741	100 %	0 %	0 %	0 %	162420476
17076	NC_010159	T	6	6	1138932	1138937	0 %	100 %	0 %	0 %	162421650
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17085	NC_010159	TTA	2	6	1139381	1139386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421650
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17087	NC_010159	TCA	2	6	1139480	1139485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421650
17088	NC_010159	TCA	2	6	1139496	1139501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421650
17089	NC_010159	CCG	2	6	1139552	1139557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421650
17090	NC_010159	TCA	3	9	1139735	1139743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421650
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17094	NC_010159	CAAC	2	8	1140029	1140036	50 %	0 %	0 %	50 %	162421650
17095	NC_010159	CGA	2	6	1140086	1140091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421650
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17097	NC_010159	TGAA	2	8	1140193	1140200	50 %	25 %	25 %	0 %	162421650
17098	NC_010159	ATC	2	6	1140260	1140265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421650
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17101	NC_010159	CAA	2	6	1142274	1142279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419999
17102	NC_010159	ACC	2	6	1142349	1142354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419999
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17105	NC_010159	CTG	2	6	1142611	1142616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419999
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17108	NC_010159	GCCA	2	8	1142704	1142711	25 %	0 %	25 %	50 %	162419999
17109	NC_010159	ACC	2	6	1142762	1142767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419999
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17116	NC_010159	CG	3	6	1143066	1143071	0 %	0 %	50 %	50 %	162419999
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17350	NC_010159	TGGC	2	8	1158450	1158457	0 %	25 %	50 %	25 %	162419412
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17466	NC_010159	TATG	2	8	1166733	1166740	25 %	50 %	25 %	0 %	162421641
17467	NC_010159	TCTG	2	8	1166799	1166806	0 %	50 %	25 %	25 %	162421641
17468	NC_010159	AAC	2	6	1167098	1167103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421641
17469	NC_010159	CTT	2	6	1167130	1167135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421641
17470	NC_010159	GC	3	6	1167242	1167247	0 %	0 %	50 %	50 %	162421641
17471	NC_010159	TCA	2	6	1167252	1167257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421641
17472	NC_010159	TGAT	2	8	1167360	1167367	25 %	50 %	25 %	0 %	162421641
17473	NC_010159	CCG	2	6	1167393	1167398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421641
17474	NC_010159	GCC	2	6	1167420	1167425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421641
17475	NC_010159	TGGA	2	8	1167440	1167447	25 %	25 %	50 %	0 %	162421641
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17480	NC_010159	TCT	2	6	1167783	1167788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421641
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17483	NC_010159	ATT	2	6	1168112	1168117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421641
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17486	NC_010159	GGTT	2	8	1168366	1168373	0 %	50 %	50 %	0 %	162421641
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17488	NC_010159	GGC	2	6	1168508	1168513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421641
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17496	NC_010159	TGG	2	6	1169457	1169462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421641
17497	NC_010159	CGT	2	6	1169540	1169545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421641
17498	NC_010159	ACT	2	6	1169580	1169585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421641
17499	NC_010159	AAAC	2	8	1169704	1169711	75 %	0 %	0 %	25 %	162421641
17500	NC_010159	CCG	2	6	1169783	1169788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421641

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