MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_010159	ATTG	2	8	1048757	1048764	25 %	50 %	25 %	0 %	162421675
16002	NC_010159	GCAC	2	8	1048765	1048772	25 %	0 %	25 %	50 %	162421675
16003	NC_010159	CTT	2	6	1048778	1048783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421675
16004	NC_010159	GCTC	2	8	1048832	1048839	0 %	25 %	25 %	50 %	162421675
16005	NC_010159	GCC	2	6	1048855	1048860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421675
16006	NC_010159	TTCA	2	8	1048902	1048909	25 %	50 %	0 %	25 %	162421675
16007	NC_010159	CGG	2	6	1049376	1049381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421710
16008	NC_010159	TCA	2	6	1049414	1049419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421710
16009	NC_010159	CGC	2	6	1049452	1049457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421710
16010	NC_010159	ACC	2	6	1049531	1049536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421710
16011	NC_010159	TGC	2	6	1049650	1049655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421710
16012	NC_010159	GGT	2	6	1049669	1049674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421710
16013	NC_010159	CCAC	2	8	1049676	1049683	25 %	0 %	0 %	75 %	162421710
16014	NC_010159	CGG	2	6	1049727	1049732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421710
16015	NC_010159	TCG	2	6	1049777	1049782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421710
16016	NC_010159	ACA	2	6	1049805	1049810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421710
16017	NC_010159	CAT	2	6	1049817	1049822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421710
16018	NC_010159	CA	3	6	1049838	1049843	50 %	0 %	0 %	50 %	162421710
16019	NC_010159	TG	3	6	1049852	1049857	0 %	50 %	50 %	0 %	162421710
16020	NC_010159	GCATCG	2	12	1049897	1049908	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	162421710
16021	NC_010159	CAG	2	6	1049914	1049919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421710
16022	NC_010159	GCCA	2	8	1049930	1049937	25 %	0 %	25 %	50 %	162421710
16023	NC_010159	CGA	2	6	1049972	1049977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421710
16024	NC_010159	ATC	2	6	1049996	1050001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421710
16025	NC_010159	AAC	2	6	1050013	1050018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421710
16026	NC_010159	CAG	2	6	1050087	1050092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421710
16027	NC_010159	TCT	2	6	1050186	1050191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421710
16028	NC_010159	CTT	2	6	1050207	1050212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421710
16029	NC_010159	CCG	2	6	1050357	1050362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421710
16030	NC_010159	CCG	2	6	1050401	1050406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421710
16031	NC_010159	ATG	2	6	1050452	1050457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421710
16032	NC_010159	CGC	2	6	1050480	1050485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421710
16033	NC_010159	ATG	2	6	1050494	1050499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421710
16034	NC_010159	TG	3	6	1050511	1050516	0 %	50 %	50 %	0 %	162421710
16035	NC_010159	GTC	2	6	1050521	1050526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421710
16036	NC_010159	GTA	2	6	1050638	1050643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421710
16037	NC_010159	CCGA	2	8	1050653	1050660	25 %	0 %	25 %	50 %	162421710
16038	NC_010159	CAGG	2	8	1050795	1050802	25 %	0 %	50 %	25 %	162421710
16039	NC_010159	TGG	2	6	1050822	1050827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421710
16040	NC_010159	TTCAA	2	10	1050896	1050905	40 %	40 %	0 %	20 %	162421710
16041	NC_010159	CGA	2	6	1050935	1050940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421710
16042	NC_010159	AGA	2	6	1051041	1051046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421710
16043	NC_010159	ACCAC	2	10	1051070	1051079	40 %	0 %	0 %	60 %	162421710
16044	NC_010159	GTC	2	6	1051108	1051113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421710
16045	NC_010159	ATA	2	6	1051125	1051130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421710
16046	NC_010159	GGA	2	6	1051153	1051158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162421710
16047	NC_010159	T	6	6	1051201	1051206	0 %	100 %	0 %	0 %	162421710
16048	NC_010159	TTC	2	6	1051213	1051218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421710
16049	NC_010159	TTC	2	6	1051277	1051282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421710
16050	NC_010159	ATC	2	6	1051345	1051350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421710
16051	NC_010159	TACGGT	2	12	1051378	1051389	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	162421710
16052	NC_010159	GATA	2	8	1051415	1051422	50 %	25 %	25 %	0 %	162421710
16053	NC_010159	TCT	2	6	1051487	1051492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421710
16054	NC_010159	CGT	2	6	1051494	1051499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421710
16055	NC_010159	CGC	2	6	1051540	1051545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421710
16056	NC_010159	AGC	2	6	1051619	1051624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421710
16057	NC_010159	AGC	2	6	1051678	1051683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421710
16058	NC_010159	TCA	2	6	1051712	1051717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421710
16059	NC_010159	CAG	2	6	1051741	1051746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421710
16060	NC_010159	TTC	3	9	1051759	1051767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421710
16061	NC_010159	T	6	6	1051781	1051786	0 %	100 %	0 %	0 %	162421710
16062	NC_010159	GCA	2	6	1051847	1051852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421710
16063	NC_010159	TTC	2	6	1051876	1051881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421710
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16065	NC_010159	CA	3	6	1052739	1052744	50 %	0 %	0 %	50 %	162420384
16066	NC_010159	TTG	2	6	1052936	1052941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420384
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16069	NC_010159	CAC	2	6	1054063	1054068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419484
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16072	NC_010159	AACC	2	8	1054213	1054220	50 %	0 %	0 %	50 %	162419484
16073	NC_010159	TG	3	6	1054375	1054380	0 %	50 %	50 %	0 %	162419484
16074	NC_010159	ATC	2	6	1054424	1054429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419484
16075	NC_010159	CAAC	2	8	1054489	1054496	50 %	0 %	0 %	50 %	162419484
16076	NC_010159	CAT	2	6	1054501	1054506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419484
16077	NC_010159	CTG	2	6	1054519	1054524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419484
16078	NC_010159	T	6	6	1054529	1054534	0 %	100 %	0 %	0 %	162419484
16079	NC_010159	TCT	2	6	1054560	1054565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419484
16080	NC_010159	TGCT	2	8	1054611	1054618	0 %	50 %	25 %	25 %	162419484
16081	NC_010159	CAC	2	6	1054640	1054645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419484
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16083	NC_010159	ACC	2	6	1054745	1054750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419484
16084	NC_010159	CAA	2	6	1054760	1054765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419484
16085	NC_010159	GAAT	2	8	1054831	1054838	50 %	25 %	25 %	0 %	162419484
16086	NC_010159	CGC	2	6	1054862	1054867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419484
16087	NC_010159	ATA	2	6	1054869	1054874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419484
16088	NC_010159	GTT	2	6	1054893	1054898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419484
16089	NC_010159	ACT	2	6	1054959	1054964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419484
16090	NC_010159	ACC	2	6	1054997	1055002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419484
16091	NC_010159	TGAT	2	8	1055010	1055017	25 %	50 %	25 %	0 %	162419484
16092	NC_010159	CAGC	2	8	1055086	1055093	25 %	0 %	25 %	50 %	162419484
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16094	NC_010159	C	8	8	1055167	1055174	0 %	0 %	0 %	100 %	162419484
16095	NC_010159	AGC	2	6	1055231	1055236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419484
16096	NC_010159	CTG	2	6	1055245	1055250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419484
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16099	NC_010159	CAA	2	6	1055461	1055466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419527
16100	NC_010159	TAA	2	6	1055534	1055539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419527
16101	NC_010159	CAA	2	6	1055570	1055575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419527
16102	NC_010159	ATCA	2	8	1055674	1055681	50 %	25 %	0 %	25 %	162418224
16103	NC_010159	GAT	2	6	1055759	1055764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418224
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16107	NC_010159	TTC	2	6	1056020	1056025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418224
16108	NC_010159	TTC	2	6	1056076	1056081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418224
16109	NC_010159	GCG	2	6	1056092	1056097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418224
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16111	NC_010159	T	6	6	1056139	1056144	0 %	100 %	0 %	0 %	162418224
16112	NC_010159	CTT	2	6	1056288	1056293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418224
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16116	NC_010159	GGC	2	6	1056559	1056564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418224
16117	NC_010159	GCG	2	6	1056569	1056574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418224
16118	NC_010159	GCTGGC	2	12	1056575	1056586	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	162418224
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16229	NC_010159	AGCC	2	8	1063823	1063830	25 %	0 %	25 %	50 %	162420202
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16466	NC_010159	GCT	2	6	1080204	1080209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418839
16467	NC_010159	TAT	2	6	1080224	1080229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418839
16468	NC_010159	AAATA	2	10	1080241	1080250	80 %	20 %	0 %	0 %	162418839
16469	NC_010159	CG	3	6	1080292	1080297	0 %	0 %	50 %	50 %	162418839
16470	NC_010159	GAG	2	6	1080352	1080357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162418839
16471	NC_010159	CAC	2	6	1080407	1080412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418839
16472	NC_010159	ACA	2	6	1080433	1080438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418839
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16474	NC_010159	AAT	2	6	1080550	1080555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418839
16475	NC_010159	GCC	2	6	1080564	1080569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418839
16476	NC_010159	GAT	2	6	1080581	1080586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418839
16477	NC_010159	TAAT	2	8	1080650	1080657	50 %	50 %	0 %	0 %	162418839
16478	NC_010159	AAT	2	6	1080719	1080724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418839
16479	NC_010159	AGC	2	6	1080844	1080849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418839
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16481	NC_010159	AAC	2	6	1080990	1080995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418545
16482	NC_010159	CAC	2	6	1081020	1081025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418545
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16484	NC_010159	AATA	2	8	1081073	1081080	75 %	25 %	0 %	0 %	162418545
16485	NC_010159	TCA	2	6	1081176	1081181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418545
16486	NC_010159	CGG	2	6	1081199	1081204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418545
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16490	NC_010159	CCGT	2	8	1081407	1081414	0 %	25 %	25 %	50 %	162418545
16491	NC_010159	AAAT	2	8	1081443	1081450	75 %	25 %	0 %	0 %	162418545
16492	NC_010159	TCA	2	6	1081457	1081462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418545
16493	NC_010159	ATA	2	6	1081514	1081519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418545
16494	NC_010159	ATT	2	6	1081570	1081575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418545
16495	NC_010159	T	6	6	1081602	1081607	0 %	100 %	0 %	0 %	162418545
16496	NC_010159	ATTTT	2	10	1081613	1081622	20 %	80 %	0 %	0 %	162418545
16497	NC_010159	ATCT	2	8	1081636	1081643	25 %	50 %	0 %	25 %	162418545
16498	NC_010159	ATT	2	6	1081648	1081653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418545
16499	NC_010159	TCCC	2	8	1081683	1081690	0 %	25 %	0 %	75 %	162418545
16500	NC_010159	GAAT	2	8	1081730	1081737	50 %	25 %	25 %	0 %	162418545

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