MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_010159	TCA	2	6	985141	985146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420270
15003	NC_010159	TAA	2	6	985191	985196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420270
15004	NC_010159	GCC	2	6	985309	985314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420270
15005	NC_010159	C	6	6	985321	985326	0 %	0 %	0 %	100 %	162420270
15006	NC_010159	ATC	2	6	985365	985370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420270
15007	NC_010159	CAT	2	6	985394	985399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420270
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15010	NC_010159	GGAT	2	8	985534	985541	25 %	25 %	50 %	0 %	162420270
15011	NC_010159	GTGG	2	8	985565	985572	0 %	25 %	75 %	0 %	162420270
15012	NC_010159	A	6	6	985583	985588	100 %	0 %	0 %	0 %	162420270
15013	NC_010159	C	6	6	985612	985617	0 %	0 %	0 %	100 %	162420270
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15018	NC_010159	ATC	2	6	985869	985874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419488
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15030	NC_010159	AAAAC	2	10	986583	986592	80 %	0 %	0 %	20 %	162419927
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15053	NC_010159	CAC	2	6	988120	988125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418356
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15103	NC_010159	GACT	2	8	990621	990628	25 %	25 %	25 %	25 %	162419435
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15238	NC_010159	ATG	2	6	1002577	1002582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420062
15239	NC_010159	GTG	2	6	1002685	1002690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420062
15240	NC_010159	GTT	2	6	1002693	1002698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420062
15241	NC_010159	ACG	2	6	1002699	1002704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420062
15242	NC_010159	ATG	2	6	1002844	1002849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420062
15243	NC_010159	GCC	2	6	1002880	1002885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420062
15244	NC_010159	AG	3	6	1002913	1002918	50 %	0 %	50 %	0 %	162420062
15245	NC_010159	CCG	2	6	1002928	1002933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420062
15246	NC_010159	AT	3	6	1003117	1003122	50 %	50 %	0 %	0 %	162419628
15247	NC_010159	TGC	2	6	1003199	1003204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419480
15248	NC_010159	GCT	2	6	1003208	1003213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419480
15249	NC_010159	TCA	2	6	1003220	1003225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419480
15250	NC_010159	CGA	2	6	1003407	1003412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419480
15251	NC_010159	TCA	2	6	1003533	1003538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419480
15252	NC_010159	CT	3	6	1003636	1003641	0 %	50 %	0 %	50 %	162419480
15253	NC_010159	CCG	2	6	1003647	1003652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419480
15254	NC_010159	AGA	2	6	1003680	1003685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419480
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15256	NC_010159	TCA	2	6	1003733	1003738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419480
15257	NC_010159	ACC	2	6	1003781	1003786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419480
15258	NC_010159	TCA	2	6	1003820	1003825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419480
15259	NC_010159	GC	3	6	1003834	1003839	0 %	0 %	50 %	50 %	162419480
15260	NC_010159	GC	3	6	1003943	1003948	0 %	0 %	50 %	50 %	162419480
15261	NC_010159	ATA	2	6	1003949	1003954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419480
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15268	NC_010159	CGC	2	6	1004818	1004823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418825
15269	NC_010159	CATC	2	8	1004832	1004839	25 %	25 %	0 %	50 %	162418825
15270	NC_010159	TGT	2	6	1004847	1004852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418825
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15274	NC_010159	GCG	2	6	1005180	1005185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418825
15275	NC_010159	GGCA	2	8	1005193	1005200	25 %	0 %	50 %	25 %	162418825
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15283	NC_010159	CG	3	6	1005616	1005621	0 %	0 %	50 %	50 %	162418825
15284	NC_010159	TCGG	2	8	1005690	1005697	0 %	25 %	50 %	25 %	162418825
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15291	NC_010159	TCC	2	6	1006016	1006021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162418825
15292	NC_010159	CACG	2	8	1006116	1006123	25 %	0 %	25 %	50 %	162418825
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15296	NC_010159	TAA	2	6	1006285	1006290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418825
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15301	NC_010159	CG	4	8	1006911	1006918	0 %	0 %	50 %	50 %	162421785
15302	NC_010159	ATG	2	6	1006920	1006925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421785
15303	NC_010159	GCT	2	6	1006946	1006951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421785
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15350	NC_010159	GCA	2	6	1010274	1010279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418209
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15354	NC_010159	AAT	2	6	1010891	1010896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418209
15355	NC_010159	A	6	6	1011026	1011031	100 %	0 %	0 %	0 %	162418209
15356	NC_010159	CTG	2	6	1011032	1011037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418209
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15358	NC_010159	GCT	2	6	1011151	1011156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418209
15359	NC_010159	TGC	2	6	1011167	1011172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418209
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15363	NC_010159	GTT	2	6	1011249	1011254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418209
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15365	NC_010159	AT	3	6	1011261	1011266	50 %	50 %	0 %	0 %	162418209
15366	NC_010159	TCA	2	6	1011488	1011493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418606
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15369	NC_010159	TTCT	2	8	1011594	1011601	0 %	75 %	0 %	25 %	162418606
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15374	NC_010159	TCT	2	6	1011866	1011871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418606
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15377	NC_010159	C	6	6	1012077	1012082	0 %	0 %	0 %	100 %	162418606
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15380	NC_010159	TCT	2	6	1012142	1012147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418606
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15384	NC_010159	T	6	6	1012282	1012287	0 %	100 %	0 %	0 %	162418606
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15450	NC_010159	AGAC	2	8	1016494	1016501	50 %	0 %	25 %	25 %	162418992
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15455	NC_010159	CAAG	2	8	1016721	1016728	50 %	0 %	25 %	25 %	162418992
15456	NC_010159	CAC	2	6	1016757	1016762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418992
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15459	NC_010159	AAT	2	6	1016899	1016904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418992
15460	NC_010159	AACA	2	8	1017016	1017023	75 %	0 %	0 %	25 %	162418992
15461	NC_010159	C	6	6	1017149	1017154	0 %	0 %	0 %	100 %	162418992
15462	NC_010159	GCC	2	6	1017211	1017216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418992
15463	NC_010159	CCA	2	6	1017241	1017246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418992
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15465	NC_010159	C	6	6	1017298	1017303	0 %	0 %	0 %	100 %	162418992
15466	NC_010159	A	6	6	1017329	1017334	100 %	0 %	0 %	0 %	162418992
15467	NC_010159	CAT	2	6	1017340	1017345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418992
15468	NC_010159	AGC	2	6	1017419	1017424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418992
15469	NC_010159	TAA	2	6	1017469	1017474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418992
15470	NC_010159	ACA	2	6	1017491	1017496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418992
15471	NC_010159	AAT	2	6	1017511	1017516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418992
15472	NC_010159	GTT	2	6	1017594	1017599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418992
15473	NC_010159	AAT	2	6	1017904	1017909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419540
15474	NC_010159	ATA	2	6	1017923	1017928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419540
15475	NC_010159	AAT	2	6	1017943	1017948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419540
15476	NC_010159	CGGG	2	8	1018042	1018049	0 %	0 %	75 %	25 %	162421547
15477	NC_010159	GTGC	2	8	1018062	1018069	0 %	25 %	50 %	25 %	162421547
15478	NC_010159	CCA	2	6	1018348	1018353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421547
15479	NC_010159	GATAA	2	10	1018392	1018401	60 %	20 %	20 %	0 %	162421547
15480	NC_010159	GCT	2	6	1018414	1018419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421547
15481	NC_010159	TTGT	2	8	1018436	1018443	0 %	75 %	25 %	0 %	162421547
15482	NC_010159	AC	3	6	1018517	1018522	50 %	0 %	0 %	50 %	162421547
15483	NC_010159	AAG	2	6	1018582	1018587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421547
15484	NC_010159	TAT	2	6	1018595	1018600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421547
15485	NC_010159	CCTG	2	8	1018652	1018659	0 %	25 %	25 %	50 %	162421547
15486	NC_010159	GC	3	6	1018664	1018669	0 %	0 %	50 %	50 %	162421547
15487	NC_010159	TG	3	6	1018672	1018677	0 %	50 %	50 %	0 %	162421547
15488	NC_010159	ATC	2	6	1018698	1018703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421547
15489	NC_010159	GC	3	6	1018741	1018746	0 %	0 %	50 %	50 %	162421547
15490	NC_010159	ATT	2	6	1018750	1018755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421547
15491	NC_010159	TGG	2	6	1018796	1018801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421547
15492	NC_010159	TGG	2	6	1018823	1018828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421547
15493	NC_010159	CCG	2	6	1018829	1018834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421547
15494	NC_010159	AATG	2	8	1018841	1018848	50 %	25 %	25 %	0 %	162421547
15495	NC_010159	TGCC	2	8	1018922	1018929	0 %	25 %	25 %	50 %	162421547
15496	NC_010159	TC	3	6	1018939	1018944	0 %	50 %	0 %	50 %	162421547
15497	NC_010159	TGG	2	6	1019032	1019037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421547
15498	NC_010159	TGA	2	6	1019107	1019112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421547
15499	NC_010159	TTC	2	6	1019139	1019144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421547
15500	NC_010159	GAA	2	6	1019157	1019162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421547

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