MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_010159	GCG	2	6	859765	859770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418917
13002	NC_010159	CAC	2	6	859802	859807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418917
13003	NC_010159	CCT	2	6	859834	859839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162418917
13004	NC_010159	ATCGC	2	10	859848	859857	20 %	20 %	20 %	40 %	162418917
13005	NC_010159	C	6	6	859862	859867	0 %	0 %	0 %	100 %	162418917
13006	NC_010159	TGG	2	6	859960	859965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418917
13007	NC_010159	ATC	2	6	859988	859993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418917
13008	NC_010159	CA	3	6	860005	860010	50 %	0 %	0 %	50 %	162418917
13009	NC_010159	A	7	7	860141	860147	100 %	0 %	0 %	0 %	162418917
13010	NC_010159	TGG	2	6	860155	860160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418917
13011	NC_010159	TAA	2	6	860170	860175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418917
13012	NC_010159	CTG	2	6	860230	860235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418917
13013	NC_010159	GCCC	2	8	860317	860324	0 %	0 %	25 %	75 %	162418917
13014	NC_010159	C	6	6	860322	860327	0 %	0 %	0 %	100 %	162418917
13015	NC_010159	CCA	2	6	860413	860418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418917
13016	NC_010159	TGA	2	6	860522	860527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418241
13017	NC_010159	AAT	2	6	860535	860540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418241
13018	NC_010159	CAC	2	6	860544	860549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418241
13019	NC_010159	TGC	2	6	860562	860567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418241
13020	NC_010159	CCA	2	6	860590	860595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418241
13021	NC_010159	AAT	2	6	860622	860627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418241
13022	NC_010159	AAT	2	6	860634	860639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418241
13023	NC_010159	ATC	2	6	860980	860985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421555
13024	NC_010159	CTG	2	6	861008	861013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421555
13025	NC_010159	GCA	2	6	861020	861025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421555
13026	NC_010159	ACG	2	6	861170	861175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421555
13027	NC_010159	TTC	2	6	861220	861225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421555
13028	NC_010159	TTC	2	6	861284	861289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421555
13029	NC_010159	GGC	2	6	861331	861336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421555
13030	NC_010159	TAA	2	6	861375	861380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421555
13031	NC_010159	AAC	2	6	861394	861399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421555
13032	NC_010159	TG	3	6	861422	861427	0 %	50 %	50 %	0 %	162421555
13033	NC_010159	CTC	2	6	861900	861905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162420702
13034	NC_010159	TTC	2	6	861910	861915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420702
13035	NC_010159	CG	3	6	861937	861942	0 %	0 %	50 %	50 %	162420702
13036	NC_010159	GCA	2	6	862019	862024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420702
13037	NC_010159	GTT	2	6	862050	862055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420702
13038	NC_010159	AAC	2	6	862114	862119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420702
13039	NC_010159	GCG	2	6	862152	862157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420702
13040	NC_010159	ATA	2	6	862258	862263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420702
13041	NC_010159	CAC	2	6	862329	862334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420702
13042	NC_010159	TCTT	2	8	862336	862343	0 %	75 %	0 %	25 %	162420702
13043	NC_010159	CACGGT	2	12	862409	862420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	162420702
13044	NC_010159	CGGTGC	2	12	862515	862526	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	162420702
13045	NC_010159	GAA	2	6	862584	862589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420702
13046	NC_010159	GTT	2	6	862716	862721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420702
13047	NC_010159	TCT	2	6	862990	862995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420702
13048	NC_010159	CAG	2	6	863026	863031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420702
13049	NC_010159	CCG	2	6	863036	863041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420702
13050	NC_010159	GCC	2	6	863109	863114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420702
13051	NC_010159	GTT	2	6	863156	863161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420702
13052	NC_010159	TTTCCA	2	12	863162	863173	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	162420702
13053	NC_010159	ATG	2	6	863190	863195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420702
13054	NC_010159	GTT	2	6	863269	863274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420702
13055	NC_010159	CAT	2	6	863548	863553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420155
13056	NC_010159	AGC	2	6	863720	863725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420155
13057	NC_010159	CTG	2	6	863984	863989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420444
13058	NC_010159	GC	3	6	863997	864002	0 %	0 %	50 %	50 %	162420444
13059	NC_010159	G	6	6	864160	864165	0 %	0 %	100 %	0 %	162420444
13060	NC_010159	GCT	2	6	864322	864327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420444
13061	NC_010159	AGTGA	2	10	864489	864498	40 %	20 %	40 %	0 %	162419874
13062	NC_010159	TGA	2	6	864512	864517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419874
13063	NC_010159	CAAT	2	8	864605	864612	50 %	25 %	0 %	25 %	162419874
13064	NC_010159	CAC	2	6	864615	864620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419874
13065	NC_010159	TAC	2	6	864711	864716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419874
13066	NC_010159	AAG	2	6	864733	864738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419874
13067	NC_010159	TGT	2	6	864794	864799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419874
13068	NC_010159	GTG	2	6	864814	864819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419874
13069	NC_010159	CGCAG	2	10	864822	864831	20 %	0 %	40 %	40 %	162419874
13070	NC_010159	CGC	2	6	864879	864884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419874
13071	NC_010159	ACAA	2	8	864910	864917	75 %	0 %	0 %	25 %	162419874
13072	NC_010159	TGATGC	2	12	864926	864937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	162419874
13073	NC_010159	TGG	2	6	864939	864944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419874
13074	NC_010159	GGT	2	6	864960	864965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419874
13075	NC_010159	GCA	2	6	865112	865117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419874
13076	NC_010159	AGCC	2	8	865169	865176	25 %	0 %	25 %	50 %	162419874
13077	NC_010159	AAT	2	6	865194	865199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419874
13078	NC_010159	GAT	2	6	865256	865261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419874
13079	NC_010159	ATG	2	6	865282	865287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419874
13080	NC_010159	CCG	2	6	865306	865311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419874
13081	NC_010159	G	7	7	865352	865358	0 %	0 %	100 %	0 %	162419874
13082	NC_010159	TCCT	2	8	865380	865387	0 %	50 %	0 %	50 %	162419874
13083	NC_010159	GAA	2	6	865496	865501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419874
13084	NC_010159	A	6	6	865500	865505	100 %	0 %	0 %	0 %	162419874
13085	NC_010159	CAT	2	6	866022	866027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419637
13086	NC_010159	AC	3	6	866029	866034	50 %	0 %	0 %	50 %	162419637
13087	NC_010159	GCATTA	2	12	866041	866052	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	162419637
13088	NC_010159	GCC	2	6	866063	866068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419637
13089	NC_010159	ACA	2	6	866122	866127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419637
13090	NC_010159	CCCAG	2	10	866191	866200	20 %	0 %	20 %	60 %	162419637
13091	NC_010159	GCA	2	6	866221	866226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419637
13092	NC_010159	ATG	3	9	866310	866318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419637
13093	NC_010159	CCCA	2	8	866319	866326	25 %	0 %	0 %	75 %	162419637
13094	NC_010159	AATGAT	2	12	866327	866338	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	162419637
13095	NC_010159	AT	3	6	866355	866360	50 %	50 %	0 %	0 %	162419637
13096	NC_010159	TGAATA	2	12	866618	866629	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	162419032
13097	NC_010159	AGCA	2	8	866656	866663	50 %	0 %	25 %	25 %	162419032
13098	NC_010159	CT	3	6	866668	866673	0 %	50 %	0 %	50 %	162419032
13099	NC_010159	CAT	2	6	866699	866704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419032
13100	NC_010159	ATC	2	6	866724	866729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419032
13101	NC_010159	TGA	2	6	866765	866770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419032
13102	NC_010159	GCG	2	6	866791	866796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419032
13103	NC_010159	ATTT	2	8	866912	866919	25 %	75 %	0 %	0 %	162419032
13104	NC_010159	TTA	2	6	866998	867003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419032
13105	NC_010159	T	6	6	867022	867027	0 %	100 %	0 %	0 %	162419032
13106	NC_010159	GAT	2	6	867109	867114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419032
13107	NC_010159	ATA	2	6	867119	867124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419032
13108	NC_010159	CAT	2	6	867144	867149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419032
13109	NC_010159	GTT	2	6	867324	867329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419032
13110	NC_010159	CTG	2	6	867358	867363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419032
13111	NC_010159	CA	3	6	867406	867411	50 %	0 %	0 %	50 %	162419032
13112	NC_010159	CGG	2	6	867440	867445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419032
13113	NC_010159	GTG	2	6	867478	867483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419032
13114	NC_010159	TGG	2	6	867489	867494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419032
13115	NC_010159	GCCA	2	8	867538	867545	25 %	0 %	25 %	50 %	162419032
13116	NC_010159	ACG	2	6	867616	867621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419032
13117	NC_010159	C	6	6	867644	867649	0 %	0 %	0 %	100 %	162419032
13118	NC_010159	CAG	2	6	868374	868379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419183
13119	NC_010159	CGC	2	6	868388	868393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419183
13120	NC_010159	AAG	2	6	868436	868441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419183
13121	NC_010159	ATC	2	6	868519	868524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419183
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13231	NC_010159	CAG	2	6	876974	876979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419176
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13235	NC_010159	CAG	2	6	877074	877079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419176
13236	NC_010159	CTT	2	6	877174	877179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419176
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13359	NC_010159	CTTG	2	8	884613	884620	0 %	50 %	25 %	25 %	162420955
13360	NC_010159	TTG	2	6	884627	884632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420955
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13362	NC_010159	CGG	2	6	884775	884780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420955
13363	NC_010159	TGGC	2	8	884827	884834	0 %	25 %	50 %	25 %	162420955
13364	NC_010159	CTGG	2	8	884999	885006	0 %	25 %	50 %	25 %	162420955
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13382	NC_010159	TCG	2	6	885683	885688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421251
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13389	NC_010159	CTG	2	6	885922	885927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421251
13390	NC_010159	GCT	2	6	885933	885938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421251
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13457	NC_010159	CA	3	6	889941	889946	50 %	0 %	0 %	50 %	162419834
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13473	NC_010159	CAGC	2	8	890413	890420	25 %	0 %	25 %	50 %	162419834
13474	NC_010159	A	6	6	890454	890459	100 %	0 %	0 %	0 %	162419834
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13477	NC_010159	TCG	2	6	890535	890540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419834
13478	NC_010159	TCC	2	6	890607	890612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162419834
13479	NC_010159	GAG	2	6	890616	890621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162419834
13480	NC_010159	ATC	2	6	890622	890627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419834
13481	NC_010159	CG	3	6	890723	890728	0 %	0 %	50 %	50 %	162419834
13482	NC_010159	AAT	3	9	890807	890815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419834
13483	NC_010159	CTC	2	6	890864	890869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162419834
13484	NC_010159	TTGA	2	8	890939	890946	25 %	50 %	25 %	0 %	162419834
13485	NC_010159	GCC	2	6	890982	890987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419834
13486	NC_010159	ACC	2	6	890988	890993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419834
13487	NC_010159	CTG	2	6	891041	891046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419834
13488	NC_010159	AGA	2	6	891108	891113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419834
13489	NC_010159	ACC	2	6	891117	891122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419834
13490	NC_010159	GATT	2	8	891150	891157	25 %	50 %	25 %	0 %	162419834
13491	NC_010159	GCA	2	6	891177	891182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419834
13492	NC_010159	TGAA	2	8	891208	891215	50 %	25 %	25 %	0 %	162419834
13493	NC_010159	CCA	2	6	891246	891251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419834
13494	NC_010159	TGCT	2	8	891347	891354	0 %	50 %	25 %	25 %	162419834
13495	NC_010159	GGGA	2	8	891355	891362	25 %	0 %	75 %	0 %	162419834
13496	NC_010159	CTG	2	6	891383	891388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419834
13497	NC_010159	TCACGT	2	12	891423	891434	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	162419834
13498	NC_010159	AGC	2	6	891446	891451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419834
13499	NC_010159	CTG	2	6	891461	891466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419834
13500	NC_010159	CGA	2	6	891487	891492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419834

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