MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_010159	GAA	2	6	828441	828446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418682
12502	NC_010159	CAA	2	6	828569	828574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418682
12503	NC_010159	AAGC	2	8	828584	828591	50 %	0 %	25 %	25 %	162418682
12504	NC_010159	AAT	2	6	828609	828614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418682
12505	NC_010159	ACC	2	6	828635	828640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418682
12506	NC_010159	GAT	2	6	828682	828687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418682
12507	NC_010159	CGG	2	6	828719	828724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418682
12508	NC_010159	CAA	2	6	828772	828777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418682
12509	NC_010159	CAA	2	6	828904	828909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418682
12510	NC_010159	GAT	2	6	829165	829170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418682
12511	NC_010159	TTAC	2	8	829408	829415	25 %	50 %	0 %	25 %	162418323
12512	NC_010159	CA	3	6	829690	829695	50 %	0 %	0 %	50 %	162418323
12513	NC_010159	TTG	2	6	829887	829892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418323
12514	NC_010159	TTG	2	6	830778	830783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421261
12515	NC_010159	GGT	2	6	830784	830789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421261
12516	NC_010159	TAA	2	6	830819	830824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421261
12517	NC_010159	TGT	2	6	830893	830898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421261
12518	NC_010159	TGA	2	6	830949	830954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421261
12519	NC_010159	C	6	6	831057	831062	0 %	0 %	0 %	100 %	162421236
12520	NC_010159	AGA	2	6	831076	831081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421236
12521	NC_010159	AC	3	6	831099	831104	50 %	0 %	0 %	50 %	162421236
12522	NC_010159	GTT	2	6	831134	831139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421236
12523	NC_010159	ATG	2	6	831150	831155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421236
12524	NC_010159	TTG	2	6	831236	831241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421236
12525	NC_010159	TGA	2	6	831340	831345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421236
12526	NC_010159	CTG	2	6	831398	831403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421236
12527	NC_010159	GAA	2	6	831434	831439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421236
12528	NC_010159	TGC	2	6	831555	831560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421236
12529	NC_010159	TTG	2	6	831602	831607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421236
12530	NC_010159	A	7	7	831608	831614	100 %	0 %	0 %	0 %	162421236
12531	NC_010159	CCG	2	6	831664	831669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421236
12532	NC_010159	CCA	2	6	831717	831722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421236
12533	NC_010159	AGA	2	6	831757	831762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421236
12534	NC_010159	TTA	2	6	831937	831942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421180
12535	NC_010159	GGCAC	2	10	831956	831965	20 %	0 %	40 %	40 %	162421180
12536	NC_010159	CAA	2	6	831990	831995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421180
12537	NC_010159	GAC	2	6	832051	832056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421180
12538	NC_010159	T	6	6	832114	832119	0 %	100 %	0 %	0 %	162421180
12539	NC_010159	TCT	2	6	832187	832192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421180
12540	NC_010159	CCG	2	6	832217	832222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421180
12541	NC_010159	ATC	2	6	832267	832272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421180
12542	NC_010159	TCC	2	6	832340	832345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162421180
12543	NC_010159	AAAG	2	8	832367	832374	75 %	0 %	25 %	0 %	162421180
12544	NC_010159	T	7	7	832398	832404	0 %	100 %	0 %	0 %	162421180
12545	NC_010159	TGC	2	6	832713	832718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418434
12546	NC_010159	AAG	2	6	832800	832805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418434
12547	NC_010159	GCA	2	6	832884	832889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418434
12548	NC_010159	CG	3	6	832900	832905	0 %	0 %	50 %	50 %	162418434
12549	NC_010159	A	6	6	832909	832914	100 %	0 %	0 %	0 %	162418434
12550	NC_010159	TTACC	2	10	833024	833033	20 %	40 %	0 %	40 %	162418434
12551	NC_010159	AAC	2	6	833036	833041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418434
12552	NC_010159	AC	3	6	833092	833097	50 %	0 %	0 %	50 %	162418434
12553	NC_010159	CAA	2	6	833125	833130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418434
12554	NC_010159	ACG	2	6	833227	833232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418434
12555	NC_010159	ATG	2	6	833318	833323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418434
12556	NC_010159	CCT	2	6	833452	833457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162418434
12557	NC_010159	TCA	2	6	833509	833514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418838
12558	NC_010159	ACGTAA	2	12	833619	833630	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	162418838
12559	NC_010159	CGC	2	6	833632	833637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418838
12560	NC_010159	CAA	2	6	833658	833663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418838
12561	NC_010159	CAA	2	6	833670	833675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418838
12562	NC_010159	CTAA	2	8	833698	833705	50 %	25 %	0 %	25 %	162418838
12563	NC_010159	CAG	2	6	833720	833725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418838
12564	NC_010159	TGCA	2	8	833751	833758	25 %	25 %	25 %	25 %	162418838
12565	NC_010159	TCC	2	6	833759	833764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162418838
12566	NC_010159	CTT	2	6	833843	833848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418838
12567	NC_010159	CTG	2	6	833961	833966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418838
12568	NC_010159	TAA	2	6	833987	833992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418838
12569	NC_010159	GCA	2	6	834376	834381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421098
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12571	NC_010159	TTGGG	2	10	834449	834458	0 %	40 %	60 %	0 %	162421098
12572	NC_010159	ATA	2	6	834478	834483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421098
12573	NC_010159	ATGG	2	8	834494	834501	25 %	25 %	50 %	0 %	162421098
12574	NC_010159	TGC	2	6	834550	834555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421098
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12583	NC_010159	TCA	2	6	834966	834971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421610
12584	NC_010159	GTCA	2	8	835145	835152	25 %	25 %	25 %	25 %	162421610
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12587	NC_010159	CAC	2	6	835559	835564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421171
12588	NC_010159	CCAA	2	8	835571	835578	50 %	0 %	0 %	50 %	162421171
12589	NC_010159	TAG	2	6	835663	835668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421171
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12591	NC_010159	ATT	2	6	835731	835736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421171
12592	NC_010159	TCC	2	6	835873	835878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162421171
12593	NC_010159	CTC	2	6	835920	835925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162421171
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12599	NC_010159	CCA	2	6	836192	836197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421171
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12601	NC_010159	CAA	3	9	836268	836276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421171
12602	NC_010159	CCG	2	6	836318	836323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421171
12603	NC_010159	AGCC	2	8	836331	836338	25 %	0 %	25 %	50 %	162421171
12604	NC_010159	CAC	2	6	836360	836365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421171
12605	NC_010159	ACG	2	6	836385	836390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421171
12606	NC_010159	CAT	2	6	836459	836464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421171
12607	NC_010159	T	6	6	836522	836527	0 %	100 %	0 %	0 %	162421171
12608	NC_010159	ATG	2	6	836540	836545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421171
12609	NC_010159	ATC	2	6	836548	836553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421171
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12612	NC_010159	ACT	2	6	836658	836663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421171
12613	NC_010159	CAGTG	2	10	836685	836694	20 %	20 %	40 %	20 %	162421171
12614	NC_010159	GTT	2	6	836720	836725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421171
12615	NC_010159	AGTA	2	8	836728	836735	50 %	25 %	25 %	0 %	162421171
12616	NC_010159	TTG	2	6	836814	836819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421171
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12618	NC_010159	GGC	2	6	836946	836951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421171
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12980	NC_010159	TGC	2	6	858683	858688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419471
12981	NC_010159	GATGC	2	10	858862	858871	20 %	20 %	40 %	20 %	162419471
12982	NC_010159	GCC	2	6	858876	858881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419471
12983	NC_010159	G	6	6	858941	858946	0 %	0 %	100 %	0 %	162419471
12984	NC_010159	TCA	2	6	859053	859058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419471
12985	NC_010159	TCA	2	6	859129	859134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419471
12986	NC_010159	T	7	7	859151	859157	0 %	100 %	0 %	0 %	162418917
12987	NC_010159	CAGT	2	8	859225	859232	25 %	25 %	25 %	25 %	162418917
12988	NC_010159	ATTT	2	8	859253	859260	25 %	75 %	0 %	0 %	162418917
12989	NC_010159	TGC	2	6	859262	859267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418917
12990	NC_010159	TAT	2	6	859372	859377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418917
12991	NC_010159	TTTG	2	8	859395	859402	0 %	75 %	25 %	0 %	162418917
12992	NC_010159	ATA	2	6	859422	859427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418917
12993	NC_010159	AAT	2	6	859439	859444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418917
12994	NC_010159	TAA	2	6	859499	859504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418917
12995	NC_010159	GCG	2	6	859541	859546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418917
12996	NC_010159	CGG	2	6	859646	859651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418917
12997	NC_010159	GAT	2	6	859675	859680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418917
12998	NC_010159	TGC	3	9	859692	859700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418917
12999	NC_010159	TGC	2	6	859716	859721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418917
13000	NC_010159	GCT	2	6	859724	859729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418917

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