MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010159	GGT	2	6	397532	397537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421560
6002	NC_010159	ATC	2	6	397587	397592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421560
6003	NC_010159	C	6	6	397635	397640	0 %	0 %	0 %	100 %	162421560
6004	NC_010159	TGGCT	2	10	397675	397684	0 %	40 %	40 %	20 %	162421560
6005	NC_010159	GCG	2	6	397749	397754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421560
6006	NC_010159	CCCG	2	8	397800	397807	0 %	0 %	25 %	75 %	162421560
6007	NC_010159	GGC	2	6	397902	397907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421560
6008	NC_010159	TCA	2	6	397936	397941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421560
6009	NC_010159	GCC	3	9	397950	397958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421560
6010	NC_010159	CCGT	2	8	397959	397966	0 %	25 %	25 %	50 %	162421560
6011	NC_010159	CGC	2	6	397982	397987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421560
6012	NC_010159	AAT	2	6	398075	398080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421560
6013	NC_010159	TCA	2	6	398110	398115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421560
6014	NC_010159	TGG	2	6	398160	398165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421560
6015	NC_010159	TTG	2	6	398346	398351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421560
6016	NC_010159	GCA	2	6	398395	398400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421560
6017	NC_010159	GAA	2	6	398406	398411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421560
6018	NC_010159	CCG	2	6	398418	398423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421560
6019	NC_010159	AAT	2	6	398450	398455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421560
6020	NC_010159	ACT	2	6	398589	398594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421560
6021	NC_010159	ATCA	2	8	398612	398619	50 %	25 %	0 %	25 %	162421560
6022	NC_010159	AGA	2	6	398624	398629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421560
6023	NC_010159	GGCA	2	8	399116	399123	25 %	0 %	50 %	25 %	292659866
6024	NC_010159	GCA	2	6	399824	399829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419175
6025	NC_010159	TGAA	2	8	399876	399883	50 %	25 %	25 %	0 %	162419175
6026	NC_010159	GCC	2	6	399890	399895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419175
6027	NC_010159	GCA	2	6	399965	399970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419175
6028	NC_010159	CTT	2	6	399990	399995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419175
6029	NC_010159	GGT	2	6	400001	400006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419175
6030	NC_010159	TAT	2	6	400114	400119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419175
6031	NC_010159	ATG	2	6	400188	400193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419175
6032	NC_010159	GGCA	2	8	400201	400208	25 %	0 %	50 %	25 %	162419175
6033	NC_010159	GGC	2	6	400214	400219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419175
6034	NC_010159	GCC	2	6	400379	400384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419175
6035	NC_010159	GGT	2	6	400532	400537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419175
6036	NC_010159	CCG	2	6	400581	400586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419175
6037	NC_010159	ACC	2	6	400652	400657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419175
6038	NC_010159	ACC	2	6	400757	400762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419175
6039	NC_010159	TAC	2	6	400766	400771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419175
6040	NC_010159	GAT	2	6	400772	400777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419175
6041	NC_010159	TGA	2	6	400807	400812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419175
6042	NC_010159	ACC	2	6	400883	400888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419175
6043	NC_010159	CAA	2	6	400897	400902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419175
6044	NC_010159	CGG	2	6	401165	401170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418409
6045	NC_010159	CCA	2	6	401236	401241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418409
6046	NC_010159	GAA	2	6	401299	401304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418409
6047	NC_010159	GCC	2	6	401430	401435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418409
6048	NC_010159	CAC	2	6	401472	401477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418409
6049	NC_010159	CAT	2	6	401495	401500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418409
6050	NC_010159	TAC	2	6	401513	401518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418409
6051	NC_010159	GAA	2	6	401607	401612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418409
6052	NC_010159	TTC	2	6	401679	401684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418409
6053	NC_010159	GAC	2	6	401745	401750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418409
6054	NC_010159	CAC	2	6	401763	401768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418409
6055	NC_010159	ACT	2	6	401862	401867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418409
6056	NC_010159	TTTA	2	8	401972	401979	25 %	75 %	0 %	0 %	162418804
6057	NC_010159	T	6	6	401992	401997	0 %	100 %	0 %	0 %	162418804
6058	NC_010159	AG	3	6	402086	402091	50 %	0 %	50 %	0 %	162418804
6059	NC_010159	CTG	2	6	402110	402115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418804
6060	NC_010159	AGA	2	6	402119	402124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418804
6061	NC_010159	CAT	2	6	402140	402145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418804
6062	NC_010159	TTG	2	6	402257	402262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418804
6063	NC_010159	CAA	2	6	402392	402397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418804
6064	NC_010159	CCA	2	6	402502	402507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418804
6065	NC_010159	TCT	2	6	402540	402545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418804
6066	NC_010159	ATT	2	6	402593	402598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418804
6067	NC_010159	GGT	2	6	402641	402646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418804
6068	NC_010159	ATT	2	6	402650	402655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418804
6069	NC_010159	CAT	2	6	402680	402685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418804
6070	NC_010159	AG	3	6	402717	402722	50 %	0 %	50 %	0 %	162418804
6071	NC_010159	TCC	2	6	402753	402758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162418804
6072	NC_010159	GCA	2	6	402816	402821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418804
6073	NC_010159	ATGCC	2	10	402827	402836	20 %	20 %	20 %	40 %	162418804
6074	NC_010159	CCG	2	6	402852	402857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418804
6075	NC_010159	ACC	3	9	402882	402890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418804
6076	NC_010159	AAT	2	6	402909	402914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418804
6077	NC_010159	T	6	6	402933	402938	0 %	100 %	0 %	0 %	162418804
6078	NC_010159	CTG	2	6	402950	402955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418804
6079	NC_010159	TTG	2	6	402977	402982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418804
6080	NC_010159	TGG	2	6	403087	403092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418804
6081	NC_010159	T	6	6	403110	403115	0 %	100 %	0 %	0 %	162418804
6082	NC_010159	ATG	2	6	403161	403166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418804
6083	NC_010159	C	6	6	403702	403707	0 %	0 %	0 %	100 %	162419925
6084	NC_010159	CTG	2	6	403737	403742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419925
6085	NC_010159	CCATCA	2	12	403852	403863	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	162419925
6086	NC_010159	CAC	2	6	403944	403949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419925
6087	NC_010159	GCC	2	6	403963	403968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419925
6088	NC_010159	CGGCA	2	10	403991	404000	20 %	0 %	40 %	40 %	162419925
6089	NC_010159	CAG	2	6	404028	404033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419925
6090	NC_010159	CAG	2	6	404199	404204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419925
6091	NC_010159	AGA	2	6	404329	404334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419593
6092	NC_010159	GCC	2	6	404336	404341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419593
6093	NC_010159	GGC	2	6	404438	404443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419593
6094	NC_010159	C	6	6	404462	404467	0 %	0 %	0 %	100 %	162419593
6095	NC_010159	GCT	2	6	404475	404480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419593
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6099	NC_010159	AGTGA	2	10	404621	404630	40 %	20 %	40 %	0 %	162419593
6100	NC_010159	GAT	2	6	404837	404842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419593
6101	NC_010159	CAT	2	6	404855	404860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419593
6102	NC_010159	CGA	2	6	404866	404871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419593
6103	NC_010159	GCA	2	6	404896	404901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419593
6104	NC_010159	CAG	2	6	404924	404929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419593
6105	NC_010159	ACC	2	6	404934	404939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419593
6106	NC_010159	TCA	2	6	404976	404981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419593
6107	NC_010159	TTG	2	6	405162	405167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419593
6108	NC_010159	GC	3	6	405223	405228	0 %	0 %	50 %	50 %	162419593
6109	NC_010159	CAG	3	9	405242	405250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419593
6110	NC_010159	CAATCA	2	12	405259	405270	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	162419593
6111	NC_010159	CAA	2	6	405392	405397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419593
6112	NC_010159	AGTG	2	8	405441	405448	25 %	25 %	50 %	0 %	162419593
6113	NC_010159	GCCA	2	8	405465	405472	25 %	0 %	25 %	50 %	162419593
6114	NC_010159	AGG	2	6	405481	405486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162419593
6115	NC_010159	ACC	2	6	405508	405513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419593
6116	NC_010159	GCC	2	6	405515	405520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419593
6117	NC_010159	ATA	2	6	405533	405538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419593
6118	NC_010159	ATG	2	6	405646	405651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419593
6119	NC_010159	AGC	2	6	405699	405704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419593
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6121	NC_010159	GA	3	6	405784	405789	50 %	0 %	50 %	0 %	162419593
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6243	NC_010159	TG	3	6	413429	413434	0 %	50 %	50 %	0 %	162420474
6244	NC_010159	CGT	2	6	413514	413519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420474
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6255	NC_010159	GCA	2	6	415250	415255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421294
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6482	NC_010159	CAGTTG	2	12	431671	431682	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	162419351
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