MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_010159	GCC	2	6	3631570	3631575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418463
53002	NC_010159	CAA	2	6	3631576	3631581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418463
53003	NC_010159	CGG	2	6	3631630	3631635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418463
53004	NC_010159	GGAC	2	8	3631638	3631645	25 %	0 %	50 %	25 %	162418463
53005	NC_010159	TAA	2	6	3631712	3631717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418463
53006	NC_010159	TAT	2	6	3631721	3631726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418463
53007	NC_010159	CGA	2	6	3631727	3631732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418463
53008	NC_010159	GGC	2	6	3631739	3631744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418463
53009	NC_010159	GTAA	2	8	3631762	3631769	50 %	25 %	25 %	0 %	162418463
53010	NC_010159	TGT	2	6	3631772	3631777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418463
53011	NC_010159	TAA	2	6	3631796	3631801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418463
53012	NC_010159	GCG	2	6	3631946	3631951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418463
53013	NC_010159	GCC	2	6	3631959	3631964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418463
53014	NC_010159	AG	3	6	3632000	3632005	50 %	0 %	50 %	0 %	162418463
53015	NC_010159	CTG	2	6	3632027	3632032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418463
53016	NC_010159	CTGCTC	2	12	3632063	3632074	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	162418463
53017	NC_010159	ATC	2	6	3632177	3632182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418463
53018	NC_010159	ATC	2	6	3632192	3632197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418463
53019	NC_010159	CTGTGC	2	12	3632216	3632227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418463
53020	NC_010159	TC	3	6	3632242	3632247	0 %	50 %	0 %	50 %	162418463
53021	NC_010159	AGT	2	6	3632259	3632264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418463
53022	NC_010159	GCC	2	6	3632301	3632306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418463
53023	NC_010159	AG	3	6	3632312	3632317	50 %	0 %	50 %	0 %	162418463
53024	NC_010159	CCG	2	6	3632320	3632325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418463
53025	NC_010159	CTT	2	6	3632398	3632403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418463
53026	NC_010159	CAC	2	6	3632492	3632497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418463
53027	NC_010159	TGC	2	6	3632526	3632531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418463
53028	NC_010159	TGAATA	2	12	3632577	3632588	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	162418463
53029	NC_010159	GTTCA	2	10	3632597	3632606	20 %	40 %	20 %	20 %	162418463
53030	NC_010159	GTT	2	6	3632614	3632619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418463
53031	NC_010159	CAC	2	6	3632665	3632670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418463
53032	NC_010159	CCA	2	6	3632677	3632682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418463
53033	NC_010159	AAAG	2	8	3632811	3632818	75 %	0 %	25 %	0 %	162418208
53034	NC_010159	AAC	2	6	3632862	3632867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418208
53035	NC_010159	CGA	2	6	3632873	3632878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418208
53036	NC_010159	ATC	2	6	3632904	3632909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418208
53037	NC_010159	GAC	2	6	3632948	3632953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418208
53038	NC_010159	AAGGA	2	10	3632972	3632981	60 %	0 %	40 %	0 %	162418208
53039	NC_010159	AAT	2	6	3632983	3632988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418208
53040	NC_010159	AAT	2	6	3633120	3633125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418208
53041	NC_010159	TTA	2	6	3633142	3633147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418208
53042	NC_010159	TCA	2	6	3633359	3633364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421234
53043	NC_010159	ACG	2	6	3633375	3633380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421234
53044	NC_010159	C	6	6	3633481	3633486	0 %	0 %	0 %	100 %	162421234
53045	NC_010159	ATC	2	6	3633511	3633516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421234
53046	NC_010159	GA	3	6	3633614	3633619	50 %	0 %	50 %	0 %	162421234
53047	NC_010159	GCA	2	6	3633641	3633646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421234
53048	NC_010159	CAC	2	6	3633680	3633685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421234
53049	NC_010159	GC	3	6	3633753	3633758	0 %	0 %	50 %	50 %	162421234
53050	NC_010159	TTC	2	6	3633780	3633785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421234
53051	NC_010159	TAA	2	6	3633827	3633832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421234
53052	NC_010159	ACG	2	6	3633912	3633917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421234
53053	NC_010159	TCT	2	6	3633920	3633925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421234
53054	NC_010159	TGA	2	6	3633946	3633951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421234
53055	NC_010159	AAT	2	6	3633954	3633959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421234
53056	NC_010159	CAA	2	6	3633995	3634000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421234
53057	NC_010159	ATC	2	6	3634008	3634013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421234
53058	NC_010159	CCAG	2	8	3634030	3634037	25 %	0 %	25 %	50 %	162421234
53059	NC_010159	GAC	2	6	3634085	3634090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421234
53060	NC_010159	TACC	2	8	3634343	3634350	25 %	25 %	0 %	50 %	162420959
53061	NC_010159	TAA	2	6	3634368	3634373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420959
53062	NC_010159	TAA	2	6	3634441	3634446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420959
53063	NC_010159	TCA	2	6	3634513	3634518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420959
53064	NC_010159	GTCA	2	8	3634527	3634534	25 %	25 %	25 %	25 %	162420959
53065	NC_010159	CAC	2	6	3634613	3634618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420959
53066	NC_010159	TCA	2	6	3634624	3634629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420959
53067	NC_010159	GAC	2	6	3634721	3634726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420959
53068	NC_010159	GGT	2	6	3634812	3634817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420959
53069	NC_010159	AAC	2	6	3634950	3634955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420959
53070	NC_010159	GGC	2	6	3634969	3634974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420959
53071	NC_010159	GA	3	6	3635091	3635096	50 %	0 %	50 %	0 %	162420959
53072	NC_010159	TCA	2	6	3635099	3635104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420959
53073	NC_010159	TGC	2	6	3635106	3635111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420959
53074	NC_010159	C	6	6	3635227	3635232	0 %	0 %	0 %	100 %	162420959
53075	NC_010159	CAT	2	6	3635312	3635317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420959
53076	NC_010159	TAT	2	6	3635417	3635422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420959
53077	NC_010159	GCT	2	6	3635627	3635632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420959
53078	NC_010159	CAG	2	6	3635642	3635647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420959
53079	NC_010159	ACG	2	6	3635667	3635672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420959
53080	NC_010159	CAC	2	6	3635684	3635689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420959
53081	NC_010159	CTG	2	6	3635975	3635980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420959
53082	NC_010159	GCA	2	6	3635996	3636001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420959
53083	NC_010159	T	7	7	3636011	3636017	0 %	100 %	0 %	0 %	162420959
53084	NC_010159	TCC	2	6	3636019	3636024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162420959
53085	NC_010159	GC	3	6	3636067	3636072	0 %	0 %	50 %	50 %	162420959
53086	NC_010159	ATC	2	6	3636082	3636087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420959
53087	NC_010159	ATG	2	6	3636103	3636108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420959
53088	NC_010159	CCAGC	2	10	3636143	3636152	20 %	0 %	20 %	60 %	162420959
53089	NC_010159	CAT	2	6	3636161	3636166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420959
53090	NC_010159	TCA	2	6	3636331	3636336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420959
53091	NC_010159	AGCT	2	8	3636351	3636358	25 %	25 %	25 %	25 %	162420959
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53098	NC_010159	CA	3	6	3637055	3637060	50 %	0 %	0 %	50 %	162420959
53099	NC_010159	TTC	2	6	3637065	3637070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420959
53100	NC_010159	CTG	2	6	3637083	3637088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420959
53101	NC_010159	TTC	2	6	3637099	3637104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420959
53102	NC_010159	CAT	2	6	3637133	3637138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420959
53103	NC_010159	TCA	2	6	3637177	3637182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420959
53104	NC_010159	CAT	2	6	3637193	3637198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420959
53105	NC_010159	GCA	2	6	3637243	3637248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420959
53106	NC_010159	TTC	2	6	3637260	3637265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420959
53107	NC_010159	AACCTG	2	12	3637344	3637355	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	162420959
53108	NC_010159	CCA	2	6	3637396	3637401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420959
53109	NC_010159	CAG	2	6	3637404	3637409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420959
53110	NC_010159	CTT	2	6	3637418	3637423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420959
53111	NC_010159	ATT	2	6	3637524	3637529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420959
53112	NC_010159	GTGAG	2	10	3637543	3637552	20 %	20 %	60 %	0 %	162420959
53113	NC_010159	TCA	2	6	3637558	3637563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420959
53114	NC_010159	GAT	2	6	3637599	3637604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420959
53115	NC_010159	GC	3	6	3637625	3637630	0 %	0 %	50 %	50 %	162420959
53116	NC_010159	GCA	2	6	3637699	3637704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420959
53117	NC_010159	AAT	2	6	3637751	3637756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420959
53118	NC_010159	GAT	2	6	3638003	3638008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421227
53119	NC_010159	TGT	2	6	3638068	3638073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421227
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53212	NC_010159	CA	3	6	3643109	3643114	50 %	0 %	0 %	50 %	162418603
53213	NC_010159	CGGTGT	2	12	3643174	3643185	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	162418603
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53220	NC_010159	GTT	2	6	3643552	3643557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418603
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53224	NC_010159	CCCA	2	8	3643828	3643835	25 %	0 %	0 %	75 %	162418603
53225	NC_010159	TCA	2	6	3644297	3644302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418603
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53228	NC_010159	T	6	6	3644533	3644538	0 %	100 %	0 %	0 %	162418603
53229	NC_010159	GC	3	6	3644578	3644583	0 %	0 %	50 %	50 %	162418603
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53464	NC_010159	CAC	2	6	3659769	3659774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421605
53465	NC_010159	ACA	2	6	3659819	3659824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421605
53466	NC_010159	CCAA	2	8	3659957	3659964	50 %	0 %	0 %	50 %	162421605
53467	NC_010159	AACC	2	8	3659977	3659984	50 %	0 %	0 %	50 %	162421605
53468	NC_010159	CAA	2	6	3660002	3660007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421605
53469	NC_010159	GATA	2	8	3660020	3660027	50 %	25 %	25 %	0 %	162421605
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53483	NC_010159	CATT	2	8	3661406	3661413	25 %	50 %	0 %	25 %	162421271
53484	NC_010159	TC	4	8	3661417	3661424	0 %	50 %	0 %	50 %	162421271
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53491	NC_010159	TC	3	6	3661760	3661765	0 %	50 %	0 %	50 %	162421271
53492	NC_010159	AAGGT	2	10	3661799	3661808	40 %	20 %	40 %	0 %	162421271
53493	NC_010159	GCTG	2	8	3661919	3661926	0 %	25 %	50 %	25 %	162421271
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53495	NC_010159	A	6	6	3662026	3662031	100 %	0 %	0 %	0 %	162421271
53496	NC_010159	TGA	2	6	3662049	3662054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421271
53497	NC_010159	CAT	2	6	3662086	3662091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421271
53498	NC_010159	TGA	2	6	3662131	3662136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421271
53499	NC_010159	AGCGC	2	10	3662199	3662208	20 %	0 %	40 %	40 %	162421673
53500	NC_010159	GAA	2	6	3662277	3662282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421673

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