MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid pMT-pPCP

Total Repeats: 1593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010158	TCG	2	6	38976	38981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417832
502	NC_010158	GATT	2	8	38986	38993	25 %	50 %	25 %	0 %	162417832
503	NC_010158	CTG	2	6	39067	39072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417883
504	NC_010158	AGA	2	6	39109	39114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417883
505	NC_010158	ATC	2	6	39138	39143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417883
506	NC_010158	TG	3	6	40401	40406	0 %	50 %	50 %	0 %	162417905
507	NC_010158	GTAA	2	8	40681	40688	50 %	25 %	25 %	0 %	162417905
508	NC_010158	CTT	2	6	41010	41015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417926
509	NC_010158	TGA	2	6	41114	41119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417926
510	NC_010158	TGG	2	6	41190	41195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417847
511	NC_010158	AAC	2	6	41259	41264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417847
512	NC_010158	CCA	2	6	41283	41288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417847
513	NC_010158	CAA	2	6	41340	41345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417847
514	NC_010158	CAG	2	6	41504	41509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417853
515	NC_010158	GGGGA	2	10	41711	41720	20 %	0 %	80 %	0 %	162417853
516	NC_010158	CAA	2	6	41731	41736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417853
517	NC_010158	CTGG	2	8	41843	41850	0 %	25 %	50 %	25 %	162417853
518	NC_010158	AGGGG	2	10	41859	41868	20 %	0 %	80 %	0 %	162417830
519	NC_010158	CTTT	2	8	41881	41888	0 %	75 %	0 %	25 %	162417830
520	NC_010158	CCA	2	6	41893	41898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417830
521	NC_010158	AG	3	6	41928	41933	50 %	0 %	50 %	0 %	162417830
522	NC_010158	CGG	2	6	41979	41984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417830
523	NC_010158	GCG	2	6	42046	42051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417830
524	NC_010158	A	6	6	42417	42422	100 %	0 %	0 %	0 %	162417874
525	NC_010158	CAA	2	6	42428	42433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417874
526	NC_010158	A	6	6	42465	42470	100 %	0 %	0 %	0 %	162417874
527	NC_010158	GC	3	6	42575	42580	0 %	0 %	50 %	50 %	162417929
528	NC_010158	TCG	2	6	42623	42628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417929
529	NC_010158	ACT	2	6	42629	42634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417929
530	NC_010158	AATT	2	8	42802	42809	50 %	50 %	0 %	0 %	162417907
531	NC_010158	TGC	2	6	42866	42871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417907
532	NC_010158	AGC	2	6	42883	42888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417907
533	NC_010158	TCT	2	6	42903	42908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417907
534	NC_010158	GATT	2	8	42933	42940	25 %	50 %	25 %	0 %	162417907
535	NC_010158	GTTG	2	8	42942	42949	0 %	50 %	50 %	0 %	162417907
536	NC_010158	AATTT	2	10	42971	42980	40 %	60 %	0 %	0 %	162417907
537	NC_010158	T	6	6	42988	42993	0 %	100 %	0 %	0 %	162417907
538	NC_010158	TTCA	2	8	42997	43004	25 %	50 %	0 %	25 %	162417907
539	NC_010158	TCA	2	6	43043	43048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417907
540	NC_010158	TGCT	2	8	43206	43213	0 %	50 %	25 %	25 %	162417907
541	NC_010158	GTA	2	6	43222	43227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417907
542	NC_010158	TCA	2	6	43247	43252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417907
543	NC_010158	GTT	2	6	43270	43275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417907
544	NC_010158	TTG	2	6	43376	43381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417907
545	NC_010158	CAG	2	6	43413	43418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417907
546	NC_010158	GAT	2	6	43423	43428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417907
547	NC_010158	T	6	6	43432	43437	0 %	100 %	0 %	0 %	162417907
548	NC_010158	GAC	2	6	43817	43822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417841
549	NC_010158	C	7	7	43880	43886	0 %	0 %	0 %	100 %	162417841
550	NC_010158	GGGCA	2	10	44110	44119	20 %	0 %	60 %	20 %	162417841
551	NC_010158	CGA	2	6	44138	44143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417841
552	NC_010158	GA	3	6	44207	44212	50 %	0 %	50 %	0 %	162417841
553	NC_010158	CG	3	6	44254	44259	0 %	0 %	50 %	50 %	162417841
554	NC_010158	CAA	2	6	44459	44464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417842
555	NC_010158	TC	3	6	44525	44530	0 %	50 %	0 %	50 %	162417842
556	NC_010158	GATG	2	8	44541	44548	25 %	25 %	50 %	0 %	162417842
557	NC_010158	ACC	2	6	44587	44592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417842
558	NC_010158	TCT	2	6	44826	44831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417906
559	NC_010158	GCC	2	6	44904	44909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417906
560	NC_010158	TGA	2	6	44950	44955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417906
561	NC_010158	CT	3	6	45079	45084	0 %	50 %	0 %	50 %	162417900
562	NC_010158	CGT	2	6	45145	45150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417900
563	NC_010158	TATT	2	8	45191	45198	25 %	75 %	0 %	0 %	162417900
564	NC_010158	TAA	2	6	45219	45224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417900
565	NC_010158	GCCACC	2	12	45298	45309	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	162417900
566	NC_010158	CCTG	2	8	45382	45389	0 %	25 %	25 %	50 %	162417900
567	NC_010158	CTG	2	6	45398	45403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417900
568	NC_010158	TCA	2	6	45471	45476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417900
569	NC_010158	GAT	2	6	45908	45913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417900
570	NC_010158	CAG	2	6	45934	45939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417900
571	NC_010158	GGT	2	6	45984	45989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417900
572	NC_010158	T	6	6	45994	45999	0 %	100 %	0 %	0 %	162417900
573	NC_010158	CG	3	6	46014	46019	0 %	0 %	50 %	50 %	162417900
574	NC_010158	CG	3	6	46144	46149	0 %	0 %	50 %	50 %	162417900
575	NC_010158	GATT	2	8	46156	46163	25 %	50 %	25 %	0 %	162417900
576	NC_010158	AGC	2	6	46237	46242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417900
577	NC_010158	ATC	3	9	46292	46300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417900
578	NC_010158	TCA	2	6	46580	46585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417900
579	NC_010158	A	6	6	47464	47469	100 %	0 %	0 %	0 %	162417908
580	NC_010158	CAG	2	6	47479	47484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417908
581	NC_010158	GCC	2	6	47500	47505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417908
582	NC_010158	ACG	2	6	47549	47554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417908
583	NC_010158	TCA	2	6	47555	47560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417908
584	NC_010158	GTC	2	6	47573	47578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417908
585	NC_010158	GGC	2	6	47583	47588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417908
586	NC_010158	CTGG	2	8	47593	47600	0 %	25 %	50 %	25 %	162417908
587	NC_010158	CGA	2	6	47628	47633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417908
588	NC_010158	GAA	3	9	47641	47649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417908
589	NC_010158	ACG	2	6	47696	47701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417908
590	NC_010158	GCA	2	6	47712	47717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417908
591	NC_010158	GCA	2	6	47792	47797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417908
592	NC_010158	AGAA	2	8	47858	47865	75 %	0 %	25 %	0 %	162417908
593	NC_010158	GAA	2	6	47899	47904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417908
594	NC_010158	CTG	2	6	47942	47947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417908
595	NC_010158	TTGC	2	8	47971	47978	0 %	50 %	25 %	25 %	162417908
596	NC_010158	GGA	2	6	47985	47990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162417908
597	NC_010158	TCT	2	6	48043	48048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417908
598	NC_010158	GCTG	2	8	48054	48061	0 %	25 %	50 %	25 %	162417908
599	NC_010158	TGC	2	6	48256	48261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417884
600	NC_010158	CAA	2	6	48326	48331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417884
601	NC_010158	ACC	2	6	48363	48368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417884
602	NC_010158	GCT	2	6	48383	48388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417884
603	NC_010158	GCC	2	6	48507	48512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417884
604	NC_010158	GCC	2	6	48576	48581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417884
605	NC_010158	TGG	2	6	48604	48609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417884
606	NC_010158	CGA	2	6	48610	48615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417884
607	NC_010158	GAA	2	6	48629	48634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417884
608	NC_010158	ACA	3	9	48740	48748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417836
609	NC_010158	CTG	2	6	48766	48771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417836
610	NC_010158	GAA	2	6	48772	48777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417836
611	NC_010158	TGA	2	6	48824	48829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417836
612	NC_010158	CAA	2	6	48831	48836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417836
613	NC_010158	TCA	2	6	48920	48925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417836
614	NC_010158	GACA	2	8	48956	48963	50 %	0 %	25 %	25 %	162417903
615	NC_010158	TCA	3	9	48964	48972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417903
616	NC_010158	TAT	2	6	49110	49115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417903
617	NC_010158	GAC	2	6	49128	49133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417903
618	NC_010158	TGG	2	6	49138	49143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417903
619	NC_010158	CGT	2	6	49145	49150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417903
620	NC_010158	CTG	3	9	49170	49178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417903
621	NC_010158	ACC	2	6	49215	49220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417903
622	NC_010158	ACC	2	6	49224	49229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417903
623	NC_010158	AAC	3	9	49260	49268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417903
624	NC_010158	CCGTT	2	10	49283	49292	0 %	40 %	20 %	40 %	162417903
625	NC_010158	CGGCGT	2	12	49310	49321	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	162417903
626	NC_010158	ATC	2	6	49368	49373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417903
627	NC_010158	GTC	2	6	49382	49387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417903
628	NC_010158	TCCG	2	8	49435	49442	0 %	25 %	25 %	50 %	162417903
629	NC_010158	TTCCG	2	10	49491	49500	0 %	40 %	20 %	40 %	162417903
630	NC_010158	TGAG	2	8	49543	49550	25 %	25 %	50 %	0 %	162417903
631	NC_010158	CGT	3	9	49557	49565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417903
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633	NC_010158	TGG	2	6	49663	49668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417903
634	NC_010158	GCT	2	6	49688	49693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417903
635	NC_010158	CTG	2	6	49785	49790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417903
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650	NC_010158	AAG	2	6	50643	50648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417941
651	NC_010158	TCG	2	6	50733	50738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417941
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655	NC_010158	TGA	2	6	50933	50938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417941
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667	NC_010158	TAC	2	6	51632	51637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417876
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750	NC_010158	CT	3	6	55519	55524	0 %	50 %	0 %	50 %	162417932
751	NC_010158	CGC	2	6	55549	55554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417932
752	NC_010158	TGCCG	2	10	55711	55720	0 %	20 %	40 %	40 %	162417850
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1000	NC_010158	CAC	2	6	70971	70976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417852

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