MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 chromosome

Total Repeats: 76142

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009708	CAT	2	6	99871	99876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153948889
1502	NC_009708	CCA	2	6	99883	99888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153948889
1503	NC_009708	CA	3	6	99990	99995	50 %	0 %	0 %	50 %	153948889
1504	NC_009708	CCAA	2	8	100044	100051	50 %	0 %	0 %	50 %	153948889
1505	NC_009708	CCA	2	6	100054	100059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153948889
1506	NC_009708	CGC	2	6	100060	100065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153948889
1507	NC_009708	GC	3	6	100064	100069	0 %	0 %	50 %	50 %	153948889
1508	NC_009708	CAG	2	6	100070	100075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948889
1509	NC_009708	A	6	6	100097	100102	100 %	0 %	0 %	0 %	153948889
1510	NC_009708	CAT	2	6	100105	100110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153948889
1511	NC_009708	AAT	2	6	100444	100449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153949433
1512	NC_009708	GTA	2	6	100516	100521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153949433
1513	NC_009708	T	6	6	100567	100572	0 %	100 %	0 %	0 %	153949433
1514	NC_009708	GTG	2	6	100656	100661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153949433
1515	NC_009708	ATG	2	6	100667	100672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153949433
1516	NC_009708	CTT	2	6	100716	100721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153949433
1517	NC_009708	GCG	2	6	100801	100806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153949433
1518	NC_009708	CTTT	2	8	100832	100839	0 %	75 %	0 %	25 %	153949433
1519	NC_009708	GCC	2	6	100901	100906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153949433
1520	NC_009708	GGC	2	6	100923	100928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153949433
1521	NC_009708	TTC	2	6	100942	100947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153949433
1522	NC_009708	CAC	2	6	100983	100988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153949433
1523	NC_009708	AG	3	6	100999	101004	50 %	0 %	50 %	0 %	153949433
1524	NC_009708	GC	3	6	101060	101065	0 %	0 %	50 %	50 %	153949433
1525	NC_009708	GAC	2	6	101092	101097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153949433
1526	NC_009708	T	6	6	101106	101111	0 %	100 %	0 %	0 %	153949433
1527	NC_009708	A	6	6	101269	101274	100 %	0 %	0 %	0 %	153950051
1528	NC_009708	GCG	2	6	101351	101356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153950051
1529	NC_009708	ATTT	2	8	101361	101368	25 %	75 %	0 %	0 %	153950051
1530	NC_009708	TCAG	2	8	101374	101381	25 %	25 %	25 %	25 %	153950051
1531	NC_009708	AC	3	6	101410	101415	50 %	0 %	0 %	50 %	153950051
1532	NC_009708	ACGCC	2	10	101437	101446	20 %	0 %	20 %	60 %	153950051
1533	NC_009708	GGA	2	6	101506	101511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153950051
1534	NC_009708	ACA	2	6	101545	101550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153950051
1535	NC_009708	CGA	2	6	101554	101559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153950051
1536	NC_009708	CGG	2	6	101603	101608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153950051
1537	NC_009708	CAG	2	6	101636	101641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153950051
1538	NC_009708	CGG	2	6	101682	101687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153950051
1539	NC_009708	GTAT	2	8	101724	101731	25 %	50 %	25 %	0 %	153950051
1540	NC_009708	CCA	2	6	101818	101823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153950051
1541	NC_009708	GC	3	6	102001	102006	0 %	0 %	50 %	50 %	153950051
1542	NC_009708	ATT	2	6	102076	102081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153950051
1543	NC_009708	GAA	2	6	102083	102088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153950051
1544	NC_009708	A	6	6	102139	102144	100 %	0 %	0 %	0 %	153950051
1545	NC_009708	CTG	2	6	102203	102208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153950051
1546	NC_009708	AGT	2	6	102250	102255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153950051
1547	NC_009708	CCG	2	6	102270	102275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153950051
1548	NC_009708	TGG	2	6	102306	102311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153950051
1549	NC_009708	TCC	2	6	102320	102325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153950051
1550	NC_009708	ACGCG	2	10	102389	102398	20 %	0 %	40 %	40 %	153950051
1551	NC_009708	TGA	2	6	102408	102413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153950051
1552	NC_009708	T	6	6	102735	102740	0 %	100 %	0 %	0 %	153950628
1553	NC_009708	GCT	2	6	102751	102756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153950628
1554	NC_009708	CTG	2	6	102839	102844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153950628
1555	NC_009708	CCG	2	6	102865	102870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153950628
1556	NC_009708	TGC	2	6	102888	102893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153950628
1557	NC_009708	CTG	2	6	102896	102901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153950628
1558	NC_009708	CTTG	2	8	102905	102912	0 %	50 %	25 %	25 %	153950628
1559	NC_009708	AGCCTG	2	12	102942	102953	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	153950628
1560	NC_009708	GTT	2	6	103058	103063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153950628
1561	NC_009708	TTC	2	6	103162	103167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153950628
1562	NC_009708	TCA	2	6	103177	103182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153950628
1563	NC_009708	ATA	2	6	103219	103224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153950628
1564	NC_009708	CAG	2	6	103256	103261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153950628
1565	NC_009708	TAGA	2	8	103356	103363	50 %	25 %	25 %	0 %	153950628
1566	NC_009708	TAC	2	6	103451	103456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153950628
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1568	NC_009708	CAG	2	6	103754	103759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948825
1569	NC_009708	TCT	2	6	103989	103994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153948825
1570	NC_009708	TCAAA	2	10	104074	104083	60 %	20 %	0 %	20 %	153948825
1571	NC_009708	CCTT	2	8	104127	104134	0 %	50 %	0 %	50 %	153948825
1572	NC_009708	GTT	2	6	104181	104186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153948825
1573	NC_009708	TTA	2	6	104200	104205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153948825
1574	NC_009708	TGC	2	6	104213	104218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153948825
1575	NC_009708	CAA	2	6	104222	104227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153948825
1576	NC_009708	TAT	2	6	104228	104233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153948825
1577	NC_009708	TCA	2	6	104402	104407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153947093
1578	NC_009708	CAG	2	6	104417	104422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153947093
1579	NC_009708	GCG	2	6	104452	104457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153947093
1580	NC_009708	TCAG	2	8	104539	104546	25 %	25 %	25 %	25 %	153947093
1581	NC_009708	GCC	2	6	104582	104587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153947093
1582	NC_009708	GTC	3	9	104588	104596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153947093
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1584	NC_009708	TGG	2	6	104627	104632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153947093
1585	NC_009708	TTG	2	6	104636	104641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153947093
1586	NC_009708	G	6	6	104703	104708	0 %	0 %	100 %	0 %	153947093
1587	NC_009708	ATG	2	6	104741	104746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153947093
1588	NC_009708	CTGT	2	8	105231	105238	0 %	50 %	25 %	25 %	153949807
1589	NC_009708	CA	3	6	105348	105353	50 %	0 %	0 %	50 %	153949807
1590	NC_009708	TTC	2	6	105457	105462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153949807
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1592	NC_009708	GGTA	2	8	105527	105534	25 %	25 %	50 %	0 %	153949807
1593	NC_009708	GCG	2	6	105557	105562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153949807
1594	NC_009708	GTACCA	2	12	105564	105575	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	153949807
1595	NC_009708	TTC	2	6	105679	105684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153949807
1596	NC_009708	A	6	6	105692	105697	100 %	0 %	0 %	0 %	153949807
1597	NC_009708	GCTT	2	8	105704	105711	0 %	50 %	25 %	25 %	153949807
1598	NC_009708	ATC	2	6	105716	105721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153949807
1599	NC_009708	C	8	8	105726	105733	0 %	0 %	0 %	100 %	153949807
1600	NC_009708	TTCC	2	8	105765	105772	0 %	50 %	0 %	50 %	153949807
1601	NC_009708	CGG	2	6	105885	105890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153949807
1602	NC_009708	ATAATT	2	12	105983	105994	50 %	50 %	0 %	0 %	153949807
1603	NC_009708	GCG	2	6	106199	106204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153948358
1604	NC_009708	CAG	2	6	106229	106234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948358
1605	NC_009708	GATA	2	8	106264	106271	50 %	25 %	25 %	0 %	153948358
1606	NC_009708	AGA	2	6	106309	106314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153948358
1607	NC_009708	GCA	2	6	106348	106353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948358
1608	NC_009708	TAA	2	6	106388	106393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153948358
1609	NC_009708	GCG	2	6	106409	106414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153948358
1610	NC_009708	GCA	2	6	106494	106499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948358
1611	NC_009708	CCA	2	6	106521	106526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153948358
1612	NC_009708	GCA	2	6	106578	106583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948358
1613	NC_009708	TGC	2	6	106623	106628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153948358
1614	NC_009708	GCG	2	6	106632	106637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153948358
1615	NC_009708	ATG	2	6	106638	106643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153948358
1616	NC_009708	CAGC	2	8	106684	106691	25 %	0 %	25 %	50 %	153948358
1617	NC_009708	ACC	2	6	106776	106781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153948358
1618	NC_009708	TTGGC	2	10	106854	106863	0 %	40 %	40 %	20 %	153948358
1619	NC_009708	TCG	2	6	106965	106970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153948358
1620	NC_009708	TTGA	2	8	107012	107019	25 %	50 %	25 %	0 %	153948358
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1622	NC_009708	GCA	2	6	107043	107048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153948358
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1987	NC_009708	TGG	2	6	129644	129649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153947213
1988	NC_009708	GTT	2	6	129702	129707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153947213
1989	NC_009708	GGT	2	6	129837	129842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153947213
1990	NC_009708	GCC	2	6	129848	129853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153947213
1991	NC_009708	CTG	2	6	129859	129864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153947213
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1993	NC_009708	GAC	2	6	129970	129975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153947213
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1995	NC_009708	AGC	2	6	130084	130089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153947213
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1999	NC_009708	TC	3	6	130350	130355	0 %	50 %	0 %	50 %	153947213
2000	NC_009708	CTG	2	6	130448	130453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153947213

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