MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 chromosome

Total Repeats: 76142

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009708	TAC	2	6	320879	320884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153948812
5002	NC_009708	GGT	2	6	320971	320976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153948812
5003	NC_009708	ATG	2	6	320987	320992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153948812
5004	NC_009708	ATT	2	6	321031	321036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153948812
5005	NC_009708	TA	3	6	321200	321205	50 %	50 %	0 %	0 %	153948812
5006	NC_009708	TTC	2	6	321235	321240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153948812
5007	NC_009708	CTA	2	6	321257	321262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153948812
5008	NC_009708	CGG	2	6	321263	321268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153948812
5009	NC_009708	CGAC	2	8	321275	321282	25 %	0 %	25 %	50 %	153948812
5010	NC_009708	CTT	2	6	321303	321308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153948812
5011	NC_009708	TTA	2	6	321319	321324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153948812
5012	NC_009708	TGG	2	6	321339	321344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153948812
5013	NC_009708	GGC	2	6	321364	321369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153948812
5014	NC_009708	GCG	2	6	321465	321470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153948812
5015	NC_009708	TCG	2	6	321554	321559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153948812
5016	NC_009708	TGA	2	6	321570	321575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153948812
5017	NC_009708	GCT	2	6	321589	321594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153948812
5018	NC_009708	AGT	2	6	321758	321763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153948812
5019	NC_009708	AATACT	2	12	321789	321800	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	153949595
5020	NC_009708	CTT	2	6	321836	321841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153949595
5021	NC_009708	TAA	2	6	321990	321995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153949595
5022	NC_009708	TTA	2	6	322202	322207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153949595
5023	NC_009708	AAG	2	6	322241	322246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153949595
5024	NC_009708	ATA	2	6	328606	328611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153947942
5025	NC_009708	T	7	7	328656	328662	0 %	100 %	0 %	0 %	153947942
5026	NC_009708	AAC	2	6	328686	328691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153947942
5027	NC_009708	GTC	2	6	328704	328709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153947942
5028	NC_009708	GTG	2	6	328777	328782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153947942
5029	NC_009708	GAA	2	6	328815	328820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153947942
5030	NC_009708	GTC	2	6	328875	328880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153947942
5031	NC_009708	GCC	2	6	328915	328920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153947942
5032	NC_009708	TCT	2	6	328921	328926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153947942
5033	NC_009708	GAT	2	6	329016	329021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153947942
5034	NC_009708	GCCA	2	8	329173	329180	25 %	0 %	25 %	50 %	153947942
5035	NC_009708	CAG	2	6	329187	329192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153947942
5036	NC_009708	CGA	2	6	329417	329422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153947942
5037	NC_009708	GGT	2	6	329430	329435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153947942
5038	NC_009708	TG	3	6	329476	329481	0 %	50 %	50 %	0 %	153947942
5039	NC_009708	CGT	2	6	329561	329566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153947942
5040	NC_009708	TGA	2	6	330316	330321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153950063
5041	NC_009708	A	7	7	330434	330440	100 %	0 %	0 %	0 %	153950063
5042	NC_009708	CT	3	6	330470	330475	0 %	50 %	0 %	50 %	153950063
5043	NC_009708	TTG	2	6	330503	330508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153950063
5044	NC_009708	AAC	2	6	330554	330559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153950063
5045	NC_009708	CTC	2	6	330621	330626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153950063
5046	NC_009708	TAT	2	6	330676	330681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153950063
5047	NC_009708	GGC	2	6	330736	330741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153950063
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5049	NC_009708	CT	3	6	330788	330793	0 %	50 %	0 %	50 %	153950063
5050	NC_009708	TATC	2	8	330796	330803	25 %	50 %	0 %	25 %	153950063
5051	NC_009708	TGA	2	6	330847	330852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153950063
5052	NC_009708	CTC	2	6	330864	330869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153950063
5053	NC_009708	CAA	2	6	330905	330910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153950063
5054	NC_009708	GTC	2	6	330934	330939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153950063
5055	NC_009708	AGA	2	6	330940	330945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153950063
5056	NC_009708	ATG	2	6	331011	331016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153950063
5057	NC_009708	ATT	2	6	331083	331088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153950063
5058	NC_009708	CAT	2	6	331122	331127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153950063
5059	NC_009708	ACT	2	6	331167	331172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153950063
5060	NC_009708	ATTTG	2	10	331192	331201	20 %	60 %	20 %	0 %	153950063
5061	NC_009708	GATT	2	8	331223	331230	25 %	50 %	25 %	0 %	153950063
5062	NC_009708	ATAA	2	8	331438	331445	75 %	25 %	0 %	0 %	153950613
5063	NC_009708	A	7	7	331451	331457	100 %	0 %	0 %	0 %	153950613
5064	NC_009708	AATT	2	8	331496	331503	50 %	50 %	0 %	0 %	153950613
5065	NC_009708	ATT	2	6	331505	331510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153950613
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5069	NC_009708	TGC	2	6	331698	331703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153947089
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5077	NC_009708	ATTG	2	8	332130	332137	25 %	50 %	25 %	0 %	153947089
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5088	NC_009708	CAGT	2	8	332539	332546	25 %	25 %	25 %	25 %	153947089
5089	NC_009708	TTG	2	6	332584	332589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153947089
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5103	NC_009708	CAA	2	6	333311	333316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153947695
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5108	NC_009708	TGC	2	6	333462	333467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153947695
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5121	NC_009708	TGC	2	6	333937	333942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153947695
5122	NC_009708	GATGCG	2	12	333995	334006	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	153947695
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5368	NC_009708	TTCA	2	8	347096	347103	25 %	50 %	0 %	25 %	153950832
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5479	NC_009708	CGT	2	6	354726	354731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153950615
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5482	NC_009708	TAGT	2	8	354866	354873	25 %	50 %	25 %	0 %	153950615
5483	NC_009708	GGCGAT	2	12	354877	354888	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	153950615
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5486	NC_009708	AACC	2	8	355090	355097	50 %	0 %	0 %	50 %	153950615
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5489	NC_009708	TTG	2	6	355509	355514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153950133
5490	NC_009708	TTG	2	6	355586	355591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153950133
5491	NC_009708	CGG	2	6	355677	355682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153950133
5492	NC_009708	CGA	2	6	355692	355697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153950133
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5494	NC_009708	GCA	2	6	355728	355733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153950133
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