MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_153kb

Total Repeats: 2508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009705	ATA	2	6	621	626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930720
2	NC_009705	TGA	2	6	787	792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930720
3	NC_009705	GTAT	2	8	841	848	25 %	50 %	25 %	0 %	153930720
4	NC_009705	ACAA	2	8	879	886	75 %	0 %	0 %	25 %	153930720
5	NC_009705	ATTT	2	8	901	908	25 %	75 %	0 %	0 %	153930720
6	NC_009705	TGA	2	6	913	918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930720
7	NC_009705	CTT	2	6	926	931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930720
8	NC_009705	GTGA	2	8	947	954	25 %	25 %	50 %	0 %	153930720
9	NC_009705	CTG	2	6	996	1001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930720
10	NC_009705	ATT	2	6	1004	1009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930720
11	NC_009705	GAC	2	6	1219	1224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930720
12	NC_009705	TTG	2	6	1407	1412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930720
13	NC_009705	TTG	2	6	1418	1423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930720
14	NC_009705	A	6	6	1530	1535	100 %	0 %	0 %	0 %	153930720
15	NC_009705	CGC	2	6	1594	1599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930720
16	NC_009705	TGA	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930720
17	NC_009705	ACA	2	6	1636	1641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930720
18	NC_009705	ATTA	2	8	1777	1784	50 %	50 %	0 %	0 %	153930720
19	NC_009705	ACG	2	6	1787	1792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930720
20	NC_009705	TAAA	2	8	1836	1843	75 %	25 %	0 %	0 %	153930720
21	NC_009705	GAA	2	6	1844	1849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930720
22	NC_009705	TCGT	2	8	1852	1859	0 %	50 %	25 %	25 %	153930720
23	NC_009705	TAA	2	6	1972	1977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930732
24	NC_009705	A	6	6	1983	1988	100 %	0 %	0 %	0 %	153930732
25	NC_009705	TGT	2	6	2028	2033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930732
26	NC_009705	TTTGG	2	10	2094	2103	0 %	60 %	40 %	0 %	153930732
27	NC_009705	AAGAA	2	10	2119	2128	80 %	0 %	20 %	0 %	153930732
28	NC_009705	TGATAA	2	12	2137	2148	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153930732
29	NC_009705	ATT	2	6	2171	2176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930732
30	NC_009705	AAC	2	6	2183	2188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930732
31	NC_009705	TTGA	2	8	2204	2211	25 %	50 %	25 %	0 %	153930732
32	NC_009705	CTT	2	6	2287	2292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930732
33	NC_009705	GAT	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930732
34	NC_009705	AT	3	6	2509	2514	50 %	50 %	0 %	0 %	153930732
35	NC_009705	CGA	2	6	2518	2523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930732
36	NC_009705	GCT	2	6	2532	2537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930732
37	NC_009705	ATA	2	6	2561	2566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930732
38	NC_009705	TTC	2	6	2625	2630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930732
39	NC_009705	TTAC	2	8	2753	2760	25 %	50 %	0 %	25 %	153930732
40	NC_009705	TGG	2	6	2763	2768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930732
41	NC_009705	AAGC	2	8	2786	2793	50 %	0 %	25 %	25 %	153930732
42	NC_009705	TCA	2	6	2937	2942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930732
43	NC_009705	AGA	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930732
44	NC_009705	A	6	6	2968	2973	100 %	0 %	0 %	0 %	153930732
45	NC_009705	TAC	2	6	3023	3028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930732
46	NC_009705	TCA	2	6	3059	3064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930732
47	NC_009705	TTA	2	6	3197	3202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930732
48	NC_009705	GCAAA	2	10	3259	3268	60 %	0 %	20 %	20 %	153930732
49	NC_009705	TGTT	2	8	3369	3376	0 %	75 %	25 %	0 %	153930732
50	NC_009705	TGA	2	6	3457	3462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930732
51	NC_009705	CAT	2	6	3501	3506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930732
52	NC_009705	TGC	2	6	3517	3522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930732
53	NC_009705	CTA	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930732
54	NC_009705	TC	4	8	3616	3623	0 %	50 %	0 %	50 %	153930732
55	NC_009705	ACA	2	6	3625	3630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930732
56	NC_009705	CAA	2	6	3636	3641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930732
57	NC_009705	TGG	2	6	3730	3735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930732
58	NC_009705	ATC	2	6	3830	3835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930732
59	NC_009705	TCA	2	6	3903	3908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930732
60	NC_009705	AAT	2	6	4016	4021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930732
61	NC_009705	GTG	2	6	4077	4082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930732
62	NC_009705	TAC	2	6	4100	4105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930732
63	NC_009705	GGC	2	6	4149	4154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153930732
64	NC_009705	A	6	6	4206	4211	100 %	0 %	0 %	0 %	153930732
65	NC_009705	ACCA	2	8	4215	4222	50 %	0 %	0 %	50 %	153930732
66	NC_009705	ATC	2	6	4317	4322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930732
67	NC_009705	CAG	2	6	4337	4342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930732
68	NC_009705	CTGAAC	2	12	4353	4364	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	153930732
69	NC_009705	CAG	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930732
70	NC_009705	ACC	2	6	4573	4578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930732
71	NC_009705	A	6	6	4620	4625	100 %	0 %	0 %	0 %	153930732
72	NC_009705	GTG	2	6	4628	4633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930732
73	NC_009705	GCAA	2	8	4670	4677	50 %	0 %	25 %	25 %	153930732
74	NC_009705	GAT	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930732
75	NC_009705	GCA	2	6	4718	4723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930732
76	NC_009705	GAT	2	6	4769	4774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930732
77	NC_009705	AGA	2	6	4804	4809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930732
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79	NC_009705	AAT	2	6	4958	4963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930732
80	NC_009705	A	6	6	5051	5056	100 %	0 %	0 %	0 %	153930732
81	NC_009705	AAT	2	6	5069	5074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930732
82	NC_009705	A	6	6	5132	5137	100 %	0 %	0 %	0 %	153930732
83	NC_009705	ATG	2	6	5145	5150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930732
84	NC_009705	CTAC	2	8	5196	5203	25 %	25 %	0 %	50 %	153930732
85	NC_009705	TAAAAA	2	12	5227	5238	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153930732
86	NC_009705	TAC	2	6	5247	5252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930732
87	NC_009705	ATC	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930732
88	NC_009705	CAG	2	6	5322	5327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930732
89	NC_009705	CAT	2	6	5373	5378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930732
90	NC_009705	GCT	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930732
91	NC_009705	GGAT	2	8	5518	5525	25 %	25 %	50 %	0 %	153930732
92	NC_009705	GTC	2	6	5532	5537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930732
93	NC_009705	ATT	2	6	5547	5552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930732
94	NC_009705	AGT	2	6	5759	5764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930732
95	NC_009705	TCTCG	2	10	5772	5781	0 %	40 %	20 %	40 %	153930732
96	NC_009705	TC	3	6	5793	5798	0 %	50 %	0 %	50 %	153930732
97	NC_009705	AGA	2	6	5824	5829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930732
98	NC_009705	CGCTG	2	10	5839	5848	0 %	20 %	40 %	40 %	153930732
99	NC_009705	TTA	2	6	5906	5911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930732
100	NC_009705	TGA	2	6	5953	5958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930732
101	NC_009705	GCG	2	6	6007	6012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153930732
102	NC_009705	CTG	2	6	6017	6022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930732
103	NC_009705	A	6	6	6207	6212	100 %	0 %	0 %	0 %	153930732
104	NC_009705	CGAT	2	8	6243	6250	25 %	25 %	25 %	25 %	153930732
105	NC_009705	ATAA	2	8	6332	6339	75 %	25 %	0 %	0 %	153930732
106	NC_009705	TCA	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930732
107	NC_009705	TCA	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930732
108	NC_009705	CAA	2	6	6518	6523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930732
109	NC_009705	GCC	2	6	6527	6532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930732
110	NC_009705	CCG	2	6	6590	6595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930732
111	NC_009705	GCCT	2	8	6618	6625	0 %	25 %	25 %	50 %	153930732
112	NC_009705	AGAC	2	8	6635	6642	50 %	0 %	25 %	25 %	153930732
113	NC_009705	ATG	2	6	6644	6649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930732
114	NC_009705	CGA	2	6	6718	6723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930732
115	NC_009705	CAA	2	6	6862	6867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930732
116	NC_009705	TGA	3	9	6882	6890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930732
117	NC_009705	AAC	2	6	6954	6959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930732
118	NC_009705	GGT	2	6	7015	7020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930732
119	NC_009705	TGA	2	6	7132	7137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930732
120	NC_009705	CAA	3	9	7159	7167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930732
121	NC_009705	CTT	2	6	7492	7497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930732
122	NC_009705	ATT	2	6	7641	7646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930732
123	NC_009705	CAG	2	6	7649	7654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930732
124	NC_009705	AGAGTT	2	12	7675	7686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930732
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126	NC_009705	TTA	2	6	7727	7732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930732
127	NC_009705	GCC	2	6	7763	7768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930732
128	NC_009705	AAC	2	6	7770	7775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930732
129	NC_009705	TGA	2	6	7833	7838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930732
130	NC_009705	A	6	6	7957	7962	100 %	0 %	0 %	0 %	153930732
131	NC_009705	GGA	2	6	8002	8007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930732
132	NC_009705	AATT	2	8	8022	8029	50 %	50 %	0 %	0 %	153930732
133	NC_009705	ATA	2	6	8085	8090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930732
134	NC_009705	A	6	6	8127	8132	100 %	0 %	0 %	0 %	153930732
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