MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_153kb

Total Repeats: 2508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009705	GTT	2	6	26801	26806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930637
502	NC_009705	TGAGC	2	10	26845	26854	20 %	20 %	40 %	20 %	153930637
503	NC_009705	TTG	2	6	26862	26867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930637
504	NC_009705	ACA	2	6	26873	26878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930637
505	NC_009705	CAA	2	6	26918	26923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930637
506	NC_009705	CCA	2	6	26929	26934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930637
507	NC_009705	CAA	2	6	26937	26942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930637
508	NC_009705	ATTA	2	8	26970	26977	50 %	50 %	0 %	0 %	153930637
509	NC_009705	TAT	2	6	27054	27059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930635
510	NC_009705	CTG	2	6	27062	27067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930635
511	NC_009705	CTT	2	6	27096	27101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930635
512	NC_009705	GTCAA	2	10	27111	27120	40 %	20 %	20 %	20 %	153930635
513	NC_009705	TGC	2	6	27121	27126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930635
514	NC_009705	ATT	2	6	27149	27154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930635
515	NC_009705	AT	3	6	27169	27174	50 %	50 %	0 %	0 %	153930635
516	NC_009705	GAA	2	6	27176	27181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930635
517	NC_009705	AAT	2	6	27182	27187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930635
518	NC_009705	GCA	3	9	27200	27208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930635
519	NC_009705	ACC	2	6	27209	27214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930635
520	NC_009705	TCA	2	6	27225	27230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930635
521	NC_009705	ACC	2	6	27233	27238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930635
522	NC_009705	AT	3	6	27259	27264	50 %	50 %	0 %	0 %	153930635
523	NC_009705	CAG	2	6	27327	27332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930635
524	NC_009705	GTG	2	6	27363	27368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930635
525	NC_009705	AC	3	6	27408	27413	50 %	0 %	0 %	50 %	153930635
526	NC_009705	GGT	2	6	27425	27430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930635
527	NC_009705	CTA	2	6	27450	27455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930635
528	NC_009705	GAAT	2	8	27615	27622	50 %	25 %	25 %	0 %	153930635
529	NC_009705	ATA	2	6	27645	27650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930635
530	NC_009705	ACC	2	6	27752	27757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930635
531	NC_009705	GGC	2	6	27779	27784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153930635
532	NC_009705	AAC	2	6	27793	27798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930635
533	NC_009705	CGG	2	6	27805	27810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153930635
534	NC_009705	GCA	2	6	27915	27920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930635
535	NC_009705	AGG	2	6	27931	27936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930635
536	NC_009705	TAA	2	6	27949	27954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930635
537	NC_009705	GCA	2	6	28073	28078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930635
538	NC_009705	GT	3	6	28104	28109	0 %	50 %	50 %	0 %	153930635
539	NC_009705	ATT	2	6	28137	28142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930635
540	NC_009705	G	6	6	28166	28171	0 %	0 %	100 %	0 %	153930635
541	NC_009705	CAA	2	6	28172	28177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930635
542	NC_009705	GGA	2	6	28208	28213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930635
543	NC_009705	A	6	6	29062	29067	100 %	0 %	0 %	0 %	153930697
544	NC_009705	ATA	2	6	29135	29140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930697
545	NC_009705	TTC	2	6	29211	29216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930697
546	NC_009705	TAT	2	6	29243	29248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930697
547	NC_009705	TTG	2	6	29305	29310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930697
548	NC_009705	ACCT	2	8	29510	29517	25 %	25 %	0 %	50 %	153930697
549	NC_009705	ATT	2	6	29653	29658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930697
550	NC_009705	TC	3	6	29711	29716	0 %	50 %	0 %	50 %	153930697
551	NC_009705	TGC	2	6	29754	29759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930697
552	NC_009705	AGA	2	6	29843	29848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930697
553	NC_009705	TGA	2	6	29940	29945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930697
554	NC_009705	TGA	2	6	29955	29960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930697
555	NC_009705	A	7	7	29960	29966	100 %	0 %	0 %	0 %	153930697
556	NC_009705	TTA	2	6	30001	30006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930697
557	NC_009705	T	6	6	30361	30366	0 %	100 %	0 %	0 %	153930763
558	NC_009705	TGC	2	6	30370	30375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930763
559	NC_009705	GAA	2	6	30380	30385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930763
560	NC_009705	GCA	2	6	30397	30402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930763
561	NC_009705	ATC	2	6	30433	30438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930763
562	NC_009705	TCT	2	6	30458	30463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930763
563	NC_009705	T	6	6	30512	30517	0 %	100 %	0 %	0 %	153930763
564	NC_009705	AC	3	6	30576	30581	50 %	0 %	0 %	50 %	153930763
565	NC_009705	TGGCT	2	10	30620	30629	0 %	40 %	40 %	20 %	153930763
566	NC_009705	CAG	2	6	30681	30686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930763
567	NC_009705	CGA	2	6	30714	30719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930763
568	NC_009705	CAT	2	6	30786	30791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930763
569	NC_009705	T	6	6	30809	30814	0 %	100 %	0 %	0 %	153930763
570	NC_009705	AC	3	6	30815	30820	50 %	0 %	0 %	50 %	153930763
571	NC_009705	CTC	2	6	30841	30846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153930763
572	NC_009705	AAC	2	6	31076	31081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930696
573	NC_009705	CAA	2	6	31088	31093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930696
574	NC_009705	CG	3	6	31171	31176	0 %	0 %	50 %	50 %	153930696
575	NC_009705	CT	3	6	31252	31257	0 %	50 %	0 %	50 %	153930738
576	NC_009705	TTGA	2	8	31290	31297	25 %	50 %	25 %	0 %	153930738
577	NC_009705	TTG	2	6	31324	31329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930738
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579	NC_009705	TGGC	2	8	31470	31477	0 %	25 %	50 %	25 %	153930738
580	NC_009705	CTT	2	6	31507	31512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930738
581	NC_009705	ATC	2	6	31541	31546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930738
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583	NC_009705	CAT	2	6	31591	31596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930738
584	NC_009705	TCT	2	6	31632	31637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930738
585	NC_009705	TC	3	6	31661	31666	0 %	50 %	0 %	50 %	153930738
586	NC_009705	TTA	2	6	31710	31715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930738
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588	NC_009705	GCA	2	6	32038	32043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930738
589	NC_009705	GCGTA	2	10	32055	32064	20 %	20 %	40 %	20 %	153930738
590	NC_009705	TCAT	2	8	32070	32077	25 %	50 %	0 %	25 %	153930738
591	NC_009705	CAG	2	6	32248	32253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930738
592	NC_009705	CAT	2	6	32269	32274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930738
593	NC_009705	CAT	2	6	32296	32301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930738
594	NC_009705	GCAG	2	8	32347	32354	25 %	0 %	50 %	25 %	153930738
595	NC_009705	CTT	2	6	32356	32361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930738
596	NC_009705	GA	3	6	32372	32377	50 %	0 %	50 %	0 %	153930738
597	NC_009705	ACC	2	6	32429	32434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930738
598	NC_009705	GGATGA	2	12	32559	32570	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	153930738
599	NC_009705	ATC	2	6	32586	32591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930738
600	NC_009705	CTT	2	6	32604	32609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930738
601	NC_009705	AACA	2	8	32646	32653	75 %	0 %	0 %	25 %	153930738
602	NC_009705	CAG	2	6	32665	32670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930738
603	NC_009705	TTA	2	6	32706	32711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930738
604	NC_009705	TAT	2	6	32952	32957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930679
605	NC_009705	AG	3	6	32980	32985	50 %	0 %	50 %	0 %	153930679
606	NC_009705	TGA	2	6	33001	33006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930679
607	NC_009705	TCG	2	6	33040	33045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930679
608	NC_009705	AAT	2	6	33116	33121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930679
609	NC_009705	ATT	2	6	33163	33168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930679
610	NC_009705	T	6	6	33184	33189	0 %	100 %	0 %	0 %	153930679
611	NC_009705	ATG	2	6	33233	33238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930679
612	NC_009705	AAT	2	6	33239	33244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930679
613	NC_009705	GTT	2	6	33248	33253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930679
614	NC_009705	TTA	2	6	33281	33286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930679
615	NC_009705	TCA	2	6	33287	33292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930679
616	NC_009705	ACA	2	6	33293	33298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930679
617	NC_009705	C	7	7	33306	33312	0 %	0 %	0 %	100 %	153930679
618	NC_009705	CA	3	6	33367	33372	50 %	0 %	0 %	50 %	153930679
619	NC_009705	ATG	2	6	33393	33398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930679
620	NC_009705	TATC	2	8	33412	33419	25 %	50 %	0 %	25 %	153930679
621	NC_009705	CATGG	2	10	33545	33554	20 %	20 %	40 %	20 %	153930679
622	NC_009705	GAA	2	6	33578	33583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930679
623	NC_009705	ATGA	2	8	33605	33612	50 %	25 %	25 %	0 %	153930679
624	NC_009705	TCC	2	6	33619	33624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153930679
625	NC_009705	A	6	6	33697	33702	100 %	0 %	0 %	0 %	153930679
626	NC_009705	TGA	2	6	33799	33804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930679
627	NC_009705	CTTT	2	8	33844	33851	0 %	75 %	0 %	25 %	153930679
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