MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_59kb

Total Repeats: 1049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009704	CCTCT	2	10	560	569	0 %	40 %	0 %	60 %	153930590
2	NC_009704	CTTT	2	8	677	684	0 %	75 %	0 %	25 %	153930590
3	NC_009704	T	7	7	686	692	0 %	100 %	0 %	0 %	153930590
4	NC_009704	ACA	2	6	733	738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930590
5	NC_009704	T	6	6	744	749	0 %	100 %	0 %	0 %	153930590
6	NC_009704	AAC	2	6	771	776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930590
7	NC_009704	T	6	6	802	807	0 %	100 %	0 %	0 %	153930590
8	NC_009704	AGTG	2	8	808	815	25 %	25 %	50 %	0 %	153930590
9	NC_009704	CTT	3	9	870	878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930590
10	NC_009704	T	6	6	898	903	0 %	100 %	0 %	0 %	153930590
11	NC_009704	TATT	2	8	919	926	25 %	75 %	0 %	0 %	153930590
12	NC_009704	TAA	2	6	927	932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930590
13	NC_009704	CATC	2	8	944	951	25 %	25 %	0 %	50 %	153930590
14	NC_009704	AAG	2	6	967	972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930590
15	NC_009704	AAC	2	6	1038	1043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930590
16	NC_009704	AAT	2	6	1046	1051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930590
17	NC_009704	CTT	2	6	1252	1257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930590
18	NC_009704	ACT	2	6	1384	1389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930590
19	NC_009704	CAG	2	6	1394	1399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930590
20	NC_009704	TA	3	6	1431	1436	50 %	50 %	0 %	0 %	153930590
21	NC_009704	CAT	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930598
22	NC_009704	AAC	2	6	1948	1953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930598
23	NC_009704	GTC	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930598
24	NC_009704	TAG	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930598
25	NC_009704	TGC	2	6	2040	2045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930598
26	NC_009704	TTC	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930598
27	NC_009704	CCT	2	6	2111	2116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153930598
28	NC_009704	AGG	2	6	2141	2146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930621
29	NC_009704	CATT	2	8	2181	2188	25 %	50 %	0 %	25 %	153930621
30	NC_009704	CTCTT	2	10	2261	2270	0 %	60 %	0 %	40 %	153930621
31	NC_009704	CTT	2	6	2291	2296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930621
32	NC_009704	TA	3	6	3355	3360	50 %	50 %	0 %	0 %	153930608
33	NC_009704	ATT	2	6	3447	3452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930608
34	NC_009704	GCT	2	6	3478	3483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930608
35	NC_009704	GCT	2	6	3487	3492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930608
36	NC_009704	TA	3	6	3577	3582	50 %	50 %	0 %	0 %	153930608
37	NC_009704	TGT	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930608
38	NC_009704	TA	3	6	3593	3598	50 %	50 %	0 %	0 %	153930608
39	NC_009704	T	7	7	3948	3954	0 %	100 %	0 %	0 %	153930566
40	NC_009704	AG	3	6	4041	4046	50 %	0 %	50 %	0 %	153930566
41	NC_009704	CAA	2	6	4116	4121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930566
42	NC_009704	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930566
43	NC_009704	TCTT	2	8	4298	4305	0 %	75 %	0 %	25 %	153930566
44	NC_009704	TTC	2	6	4426	4431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930566
45	NC_009704	GTTG	2	8	4495	4502	0 %	50 %	50 %	0 %	153930566
46	NC_009704	TCA	2	6	4544	4549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930566
47	NC_009704	T	6	6	4607	4612	0 %	100 %	0 %	0 %	153930566
48	NC_009704	TTC	2	6	4630	4635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930566
49	NC_009704	GCA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930566
50	NC_009704	ATC	2	6	4705	4710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930566
51	NC_009704	ATCTT	2	10	5641	5650	20 %	60 %	0 %	20 %	153930626
52	NC_009704	TTC	2	6	5662	5667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930626
53	NC_009704	AGA	2	6	5675	5680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930626
54	NC_009704	CT	3	6	5852	5857	0 %	50 %	0 %	50 %	153930626
55	NC_009704	GAG	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930626
56	NC_009704	ATC	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930626
57	NC_009704	T	6	6	6051	6056	0 %	100 %	0 %	0 %	153930606
58	NC_009704	ACAA	2	8	6068	6075	75 %	0 %	0 %	25 %	153930606
59	NC_009704	GTT	2	6	6083	6088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930606
60	NC_009704	CAT	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930606
61	NC_009704	GAA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930606
62	NC_009704	AAAAG	2	10	6202	6211	80 %	0 %	20 %	0 %	153930606
63	NC_009704	TCA	2	6	6234	6239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930606
64	NC_009704	AAGAT	2	10	6252	6261	60 %	20 %	20 %	0 %	153930606
65	NC_009704	CCG	2	6	6264	6269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930606
66	NC_009704	TCTT	2	8	6340	6347	0 %	75 %	0 %	25 %	153930606
67	NC_009704	AGT	2	6	6475	6480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930606
68	NC_009704	TGG	2	6	6622	6627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930606
69	NC_009704	TCA	2	6	6705	6710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930606
70	NC_009704	ACGATG	2	12	6779	6790	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	153930606
71	NC_009704	TCT	2	6	6865	6870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930606
72	NC_009704	AGG	2	6	6895	6900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930606
73	NC_009704	AGC	2	6	6901	6906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930606
74	NC_009704	TC	3	6	6960	6965	0 %	50 %	0 %	50 %	153930606
75	NC_009704	ATA	2	6	7019	7024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930606
76	NC_009704	CGC	2	6	7052	7057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930606
77	NC_009704	GTT	2	6	7067	7072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930606
78	NC_009704	AT	3	6	7099	7104	50 %	50 %	0 %	0 %	153930606
79	NC_009704	GAG	2	6	7119	7124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930606
80	NC_009704	AACAA	2	10	7166	7175	80 %	0 %	0 %	20 %	153930587
81	NC_009704	TTGCT	2	10	7191	7200	0 %	60 %	20 %	20 %	153930587
82	NC_009704	GGA	2	6	7244	7249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153930587
83	NC_009704	TGA	2	6	7261	7266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930587
84	NC_009704	TAG	2	6	7332	7337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930587
85	NC_009704	CTT	2	6	7417	7422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930587
86	NC_009704	GGC	2	6	7444	7449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	153930587
87	NC_009704	TA	3	6	7507	7512	50 %	50 %	0 %	0 %	153930587
88	NC_009704	ATGG	2	8	7570	7577	25 %	25 %	50 %	0 %	153930599
89	NC_009704	GCC	2	6	7612	7617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930599
90	NC_009704	TGC	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930599
91	NC_009704	CTTT	2	8	7649	7656	0 %	75 %	0 %	25 %	153930599
92	NC_009704	A	6	6	7756	7761	100 %	0 %	0 %	0 %	153930599
93	NC_009704	TAT	2	6	7762	7767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930599
94	NC_009704	AT	3	6	7831	7836	50 %	50 %	0 %	0 %	153930569
95	NC_009704	A	7	7	7921	7927	100 %	0 %	0 %	0 %	153930569
96	NC_009704	TGT	2	6	7975	7980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930569
97	NC_009704	TA	3	6	8031	8036	50 %	50 %	0 %	0 %	153930569
98	NC_009704	TGA	2	6	8041	8046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930569
99	NC_009704	ATTTC	2	10	8081	8090	20 %	60 %	0 %	20 %	153930569
100	NC_009704	ATCA	2	8	8093	8100	50 %	25 %	0 %	25 %	153930569
101	NC_009704	CTGG	2	8	8121	8128	0 %	25 %	50 %	25 %	153930569
102	NC_009704	TCG	2	6	8149	8154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930569
103	NC_009704	TGA	2	6	8218	8223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930569
104	NC_009704	CGT	2	6	8228	8233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930569
105	NC_009704	T	6	6	8270	8275	0 %	100 %	0 %	0 %	153930569
106	NC_009704	CTTAAC	2	12	8278	8289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
107	NC_009704	ATA	2	6	8321	8326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930569
108	NC_009704	TGA	3	9	8338	8346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930569
109	NC_009704	TCA	2	6	8377	8382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
110	NC_009704	A	6	6	8410	8415	100 %	0 %	0 %	0 %	153930569
111	NC_009704	TCA	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
112	NC_009704	GTTG	2	8	8517	8524	0 %	50 %	50 %	0 %	153930569
113	NC_009704	ATT	2	6	8543	8548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930569
114	NC_009704	TAT	2	6	8556	8561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930569
115	NC_009704	TA	3	6	8579	8584	50 %	50 %	0 %	0 %	153930569
116	NC_009704	TGG	2	6	8596	8601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930569
117	NC_009704	GTT	2	6	8621	8626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930569
118	NC_009704	TG	3	6	8654	8659	0 %	50 %	50 %	0 %	153930569
119	NC_009704	A	6	6	8798	8803	100 %	0 %	0 %	0 %	153930569
120	NC_009704	A	6	6	8811	8816	100 %	0 %	0 %	0 %	153930569
121	NC_009704	CAG	2	6	8898	8903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930569
122	NC_009704	TAC	2	6	8942	8947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
123	NC_009704	CAT	2	6	8956	8961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
124	NC_009704	TGC	2	6	9451	9456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930569
125	NC_009704	ATG	2	6	9459	9464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930569
126	NC_009704	AATGG	2	10	9523	9532	40 %	20 %	40 %	0 %	153930569
127	NC_009704	AAC	2	6	9565	9570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930569
128	NC_009704	GCT	2	6	9572	9577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930569
129	NC_009704	ATT	2	6	9649	9654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930569
130	NC_009704	TTC	2	6	9816	9821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930569
131	NC_009704	TTTA	2	8	9822	9829	25 %	75 %	0 %	0 %	153930569
132	NC_009704	A	6	6	9921	9926	100 %	0 %	0 %	0 %	153930569
133	NC_009704	AATTG	2	10	9954	9963	40 %	40 %	20 %	0 %	153930569
134	NC_009704	AGA	2	6	10075	10080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930569
135	NC_009704	CT	3	6	10092	10097	0 %	50 %	0 %	50 %	153930569
136	NC_009704	ATC	2	6	10133	10138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930569
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