MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_009381	ATA	2	6	2408704	2408709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599408
38003	NC_009381	AAT	2	6	2408763	2408768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599408
38004	NC_009381	ATC	2	6	2408775	2408780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599408
38005	NC_009381	TCA	2	6	2408815	2408820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599408
38006	NC_009381	ATCA	2	8	2408838	2408845	50 %	25 %	0 %	25 %	145599408
38007	NC_009381	TAA	2	6	2408858	2408863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599408
38008	NC_009381	TGA	2	6	2408914	2408919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145599408
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38010	NC_009381	AGC	2	6	2409271	2409276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599409
38011	NC_009381	T	6	6	2409296	2409301	0 %	100 %	0 %	0 %	145599409
38012	NC_009381	AGA	2	6	2409306	2409311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145599409
38013	NC_009381	ACA	2	6	2409321	2409326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145599409
38014	NC_009381	TGG	2	6	2409333	2409338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145599409
38015	NC_009381	TA	4	8	2409366	2409373	50 %	50 %	0 %	0 %	145599409
38016	NC_009381	ATT	2	6	2409403	2409408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145599409
38017	NC_009381	AG	3	6	2409439	2409444	50 %	0 %	50 %	0 %	145599409
38018	NC_009381	AT	4	8	2409453	2409460	50 %	50 %	0 %	0 %	145599409
38019	NC_009381	ATA	2	6	2409469	2409474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599409
38020	NC_009381	CAT	2	6	2409481	2409486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599409
38021	NC_009381	ATA	2	6	2410104	2410109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599410
38022	NC_009381	CCACGG	2	12	2410176	2410187	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145599410
38023	NC_009381	ATA	2	6	2410208	2410213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599410
38024	NC_009381	CCA	2	6	2410279	2410284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599410
38025	NC_009381	AAT	2	6	2410287	2410292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599410
38026	NC_009381	CAG	2	6	2410370	2410375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599410
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38030	NC_009381	GAA	2	6	2410823	2410828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145599411
38031	NC_009381	GGTGGC	2	12	2410829	2410840	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145599411
38032	NC_009381	GTG	2	6	2411074	2411079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145599411
38033	NC_009381	GGT	2	6	2411087	2411092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145599411
38034	NC_009381	TAC	2	6	2411108	2411113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599411
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38036	NC_009381	CATT	2	8	2411131	2411138	25 %	50 %	0 %	25 %	145599411
38037	NC_009381	GCCA	2	8	2411163	2411170	25 %	0 %	25 %	50 %	145599411
38038	NC_009381	A	6	6	2411198	2411203	100 %	0 %	0 %	0 %	145599411
38039	NC_009381	TGA	2	6	2411209	2411214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145599411
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38041	NC_009381	T	6	6	2411264	2411269	0 %	100 %	0 %	0 %	145599411
38042	NC_009381	GGC	2	6	2411338	2411343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145599411
38043	NC_009381	TCG	2	6	2411355	2411360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145599411
38044	NC_009381	CG	3	6	2411359	2411364	0 %	0 %	50 %	50 %	145599411
38045	NC_009381	GCTGG	2	10	2411374	2411383	0 %	20 %	60 %	20 %	145599411
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38051	NC_009381	ATG	2	6	2411710	2411715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145599412
38052	NC_009381	CCG	2	6	2411749	2411754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145599412
38053	NC_009381	A	7	7	2411828	2411834	100 %	0 %	0 %	0 %	145599412
38054	NC_009381	GCA	2	6	2411866	2411871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599412
38055	NC_009381	G	6	6	2411887	2411892	0 %	0 %	100 %	0 %	145599412
38056	NC_009381	GC	3	6	2411976	2411981	0 %	0 %	50 %	50 %	145599412
38057	NC_009381	GCA	2	6	2412063	2412068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599412
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38086	NC_009381	AGCAC	2	10	2413551	2413560	40 %	0 %	20 %	40 %	145599413
38087	NC_009381	TTA	2	6	2413562	2413567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145599413
38088	NC_009381	AAT	2	6	2413600	2413605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599413
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38099	NC_009381	AAT	2	6	2414152	2414157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599413
38100	NC_009381	CCCAGC	2	12	2414282	2414293	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145599413
38101	NC_009381	CGG	2	6	2414295	2414300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145599413
38102	NC_009381	GCA	2	6	2414366	2414371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599413
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38104	NC_009381	TTGG	2	8	2414441	2414448	0 %	50 %	50 %	0 %	145599413
38105	NC_009381	TGA	2	6	2414480	2414485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145599413
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38109	NC_009381	C	8	8	2414940	2414947	0 %	0 %	0 %	100 %	145599414
38110	NC_009381	TTC	2	6	2415001	2415006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145599414
38111	NC_009381	CGG	2	6	2415017	2415022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145599414
38112	NC_009381	ACC	2	6	2415131	2415136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599414
38113	NC_009381	ACA	2	6	2415156	2415161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145599414
38114	NC_009381	TGT	2	6	2415203	2415208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145599414
38115	NC_009381	GACA	2	8	2415304	2415311	50 %	0 %	25 %	25 %	145599414
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38117	NC_009381	CAAT	2	8	2415554	2415561	50 %	25 %	0 %	25 %	145599415
38118	NC_009381	TGGCT	2	10	2415582	2415591	0 %	40 %	40 %	20 %	145599415
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38217	NC_009381	C	7	7	2422204	2422210	0 %	0 %	0 %	100 %	145599422
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38222	NC_009381	ACA	3	9	2422454	2422462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145599422
38223	NC_009381	TGA	2	6	2422498	2422503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145599422
38224	NC_009381	TGG	2	6	2422504	2422509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145599422
38225	NC_009381	CAG	2	6	2422586	2422591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599422
38226	NC_009381	ATGCG	2	10	2422633	2422642	20 %	20 %	40 %	20 %	145599422
38227	NC_009381	ACTA	2	8	2422668	2422675	50 %	25 %	0 %	25 %	145599422
38228	NC_009381	CCG	2	6	2422756	2422761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145599422
38229	NC_009381	GCC	2	6	2422941	2422946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145599422
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38233	NC_009381	GGT	2	6	2423207	2423212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145599422
38234	NC_009381	TGG	2	6	2423302	2423307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145599422
38235	NC_009381	TGG	3	9	2423320	2423328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145599422
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