MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_009381	ACCA	2	8	2211555	2211562	50 %	0 %	0 %	50 %	145599238
35002	NC_009381	CAG	2	6	2211632	2211637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599239
35003	NC_009381	CAG	2	6	2211641	2211646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599239
35004	NC_009381	GGCA	2	8	2211654	2211661	25 %	0 %	50 %	25 %	145599239
35005	NC_009381	GAA	2	6	2211740	2211745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145599239
35006	NC_009381	GGC	2	6	2211774	2211779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145599239
35007	NC_009381	ACC	2	6	2211797	2211802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599239
35008	NC_009381	GAA	2	6	2211860	2211865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145599239
35009	NC_009381	CTGG	2	8	2211928	2211935	0 %	25 %	50 %	25 %	145599239
35010	NC_009381	AGCC	2	8	2212057	2212064	25 %	0 %	25 %	50 %	145599239
35011	NC_009381	TTA	2	6	2212158	2212163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145599239
35012	NC_009381	CAT	2	6	2212208	2212213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599239
35013	NC_009381	GAA	2	6	2212217	2212222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145599239
35014	NC_009381	CAG	3	9	2212286	2212294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599239
35015	NC_009381	TCT	2	6	2212359	2212364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145599239
35016	NC_009381	GAA	2	6	2212367	2212372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145599239
35017	NC_009381	CAAC	2	8	2212390	2212397	50 %	0 %	0 %	50 %	145599239
35018	NC_009381	CAG	2	6	2212454	2212459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599239
35019	NC_009381	ACC	2	6	2212500	2212505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599239
35020	NC_009381	TCAA	2	8	2212545	2212552	50 %	25 %	0 %	25 %	145599239
35021	NC_009381	CACC	2	8	2212605	2212612	25 %	0 %	0 %	75 %	145599240
35022	NC_009381	TGG	2	6	2212618	2212623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145599240
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35024	NC_009381	GCA	2	6	2212754	2212759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599240
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35028	NC_009381	TCCC	2	8	2212924	2212931	0 %	25 %	0 %	75 %	145599240
35029	NC_009381	C	7	7	2212975	2212981	0 %	0 %	0 %	100 %	145599240
35030	NC_009381	CTG	2	6	2213047	2213052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145599240
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35032	NC_009381	CA	3	6	2213266	2213271	50 %	0 %	0 %	50 %	145599240
35033	NC_009381	GTCCA	2	10	2213297	2213306	20 %	20 %	20 %	40 %	145599240
35034	NC_009381	GGC	2	6	2213310	2213315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145599240
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35052	NC_009381	GCA	2	6	2214246	2214251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599240
35053	NC_009381	GTT	3	9	2214273	2214281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145599240
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35082	NC_009381	ACCCG	2	10	2215993	2216002	20 %	0 %	20 %	60 %	145599241
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35088	NC_009381	AT	3	6	2216356	2216361	50 %	50 %	0 %	0 %	145599241
35089	NC_009381	CCA	2	6	2216426	2216431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599241
35090	NC_009381	CAG	2	6	2216454	2216459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599241
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35101	NC_009381	T	6	6	2216948	2216953	0 %	100 %	0 %	0 %	145599242
35102	NC_009381	GCC	2	6	2216961	2216966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145599242
35103	NC_009381	AC	3	6	2216993	2216998	50 %	0 %	0 %	50 %	145599242
35104	NC_009381	GCA	2	6	2217180	2217185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599242
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35117	NC_009381	CGT	2	6	2218104	2218109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145599243
35118	NC_009381	AAT	2	6	2218208	2218213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599243
35119	NC_009381	CAC	2	6	2218252	2218257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599243
35120	NC_009381	CGGT	2	8	2218328	2218335	0 %	25 %	50 %	25 %	145599243
35121	NC_009381	TCT	2	6	2218374	2218379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145599243
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35124	NC_009381	TTC	2	6	2218426	2218431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145599243
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35127	NC_009381	TCT	2	6	2218577	2218582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145599243
35128	NC_009381	CGGG	2	8	2218622	2218629	0 %	0 %	75 %	25 %	145599243
35129	NC_009381	CAT	2	6	2218669	2218674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599243
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35131	NC_009381	GTT	2	6	2218947	2218952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145599243
35132	NC_009381	CAG	2	6	2218975	2218980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599243
35133	NC_009381	TTGC	2	8	2219022	2219029	0 %	50 %	25 %	25 %	145599243
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35137	NC_009381	CGT	2	6	2219128	2219133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145599243
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35143	NC_009381	CCA	3	9	2219654	2219662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599244
35144	NC_009381	CCG	2	6	2219726	2219731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145599244
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35147	NC_009381	CATG	2	8	2219819	2219826	25 %	25 %	25 %	25 %	145599244
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35152	NC_009381	ACG	2	6	2220167	2220172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599245
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35154	NC_009381	AAAATG	2	12	2220243	2220254	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	145599245
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35201	NC_009381	TG	3	6	2224805	2224810	0 %	50 %	50 %	0 %	145599248
35202	NC_009381	GGA	2	6	2224827	2224832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145599248
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35204	NC_009381	TAA	2	6	2224845	2224850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599248
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35214	NC_009381	ACAG	2	8	2225820	2225827	50 %	0 %	25 %	25 %	145599249
35215	NC_009381	CCA	2	6	2225829	2225834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599249
35216	NC_009381	GTCA	2	8	2225860	2225867	25 %	25 %	25 %	25 %	145599249
35217	NC_009381	CAT	2	6	2225869	2225874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599249
35218	NC_009381	TGGC	2	8	2225922	2225929	0 %	25 %	50 %	25 %	145599249
35219	NC_009381	TCA	2	6	2225936	2225941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599249
35220	NC_009381	TAACTG	2	12	2225983	2225994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	145599249
35221	NC_009381	TCA	2	6	2226050	2226055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599249
35222	NC_009381	GCG	2	6	2226085	2226090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145599249
35223	NC_009381	CAC	2	6	2226097	2226102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599249
35224	NC_009381	CAC	2	6	2226222	2226227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599249
35225	NC_009381	ATCA	2	8	2226295	2226302	50 %	25 %	0 %	25 %	145599249
35226	NC_009381	CAT	2	6	2226309	2226314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599249
35227	NC_009381	CGA	2	6	2226328	2226333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599249
35228	NC_009381	CGA	2	6	2226356	2226361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599249
35229	NC_009381	CGC	2	6	2226365	2226370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145599249
35230	NC_009381	GC	3	6	2226407	2226412	0 %	0 %	50 %	50 %	145599249
35231	NC_009381	CAAT	2	8	2226438	2226445	50 %	25 %	0 %	25 %	145599249
35232	NC_009381	GAC	2	6	2226468	2226473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599249
35233	NC_009381	CGC	2	6	2226521	2226526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145599249
35234	NC_009381	GT	3	6	2226545	2226550	0 %	50 %	50 %	0 %	145599249
35235	NC_009381	C	6	6	2226560	2226565	0 %	0 %	0 %	100 %	145599249
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35239	NC_009381	CAT	2	6	2226751	2226756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145599249
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35262	NC_009381	TAA	2	6	2228285	2228290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599251
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35289	NC_009381	GATG	2	8	2230905	2230912	25 %	25 %	50 %	0 %	145599253
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35304	NC_009381	TGG	2	6	2231789	2231794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145599254
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35332	NC_009381	ACC	2	6	2233296	2233301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145599254
35333	NC_009381	GTG	2	6	2233387	2233392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145599254
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35335	NC_009381	ATCA	2	8	2233822	2233829	50 %	25 %	0 %	25 %	145599255
35336	NC_009381	T	7	7	2233854	2233860	0 %	100 %	0 %	0 %	145599255
35337	NC_009381	CT	3	6	2233907	2233912	0 %	50 %	0 %	50 %	145599255
35338	NC_009381	GCAA	2	8	2233924	2233931	50 %	0 %	25 %	25 %	145599255
35339	NC_009381	AGC	2	6	2233955	2233960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145599255
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35342	NC_009381	CCAT	2	8	2234143	2234150	25 %	25 %	0 %	50 %	145599255
35343	NC_009381	GCT	2	6	2234154	2234159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145599255
35344	NC_009381	AAAG	2	8	2234254	2234261	75 %	0 %	25 %	0 %	145599255
35345	NC_009381	ACA	2	6	2234303	2234308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145599255
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35349	NC_009381	CGG	2	6	2234583	2234588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145599255
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35465	NC_009381	GAA	2	6	2242422	2242427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145599263
35466	NC_009381	TAA	2	6	2242430	2242435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145599263
35467	NC_009381	AG	3	6	2242438	2242443	50 %	0 %	50 %	0 %	145599263
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35493	NC_009381	T	6	6	2243833	2243838	0 %	100 %	0 %	0 %	145599265
35494	NC_009381	CAA	2	6	2243877	2243882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145599265
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