MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009381	AAGA	2	8	159395	159402	75 %	0 %	25 %	0 %	145597473
2502	NC_009381	CTT	2	6	159433	159438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597473
2503	NC_009381	CAA	2	6	159440	159445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597473
2504	NC_009381	TTGGG	2	10	159483	159492	0 %	40 %	60 %	0 %	145597473
2505	NC_009381	CAG	2	6	159496	159501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597473
2506	NC_009381	GCA	2	6	159555	159560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597473
2507	NC_009381	GCGCT	2	10	159563	159572	0 %	20 %	40 %	40 %	145597473
2508	NC_009381	CTA	2	6	159643	159648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597473
2509	NC_009381	GTC	2	6	159721	159726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597473
2510	NC_009381	CGT	2	6	159816	159821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597474
2511	NC_009381	CG	3	6	159855	159860	0 %	0 %	50 %	50 %	145597474
2512	NC_009381	AAC	2	6	159883	159888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597474
2513	NC_009381	GTCT	2	8	159919	159926	0 %	50 %	25 %	25 %	145597474
2514	NC_009381	ACT	2	6	160000	160005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597474
2515	NC_009381	AGC	2	6	160013	160018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597474
2516	NC_009381	GTC	2	6	160066	160071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597474
2517	NC_009381	GTT	2	6	160164	160169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597474
2518	NC_009381	CTT	2	6	160177	160182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597474
2519	NC_009381	GCTG	2	8	160259	160266	0 %	25 %	50 %	25 %	145597474
2520	NC_009381	GT	3	6	160318	160323	0 %	50 %	50 %	0 %	145597474
2521	NC_009381	TCG	2	6	160378	160383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597474
2522	NC_009381	ACGC	2	8	160489	160496	25 %	0 %	25 %	50 %	145597475
2523	NC_009381	TAC	2	6	160616	160621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597475
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2526	NC_009381	GCA	2	6	160803	160808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597475
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2528	NC_009381	ATTC	2	8	160900	160907	25 %	50 %	0 %	25 %	145597475
2529	NC_009381	GAA	2	6	160909	160914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597475
2530	NC_009381	GTC	2	6	160931	160936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597475
2531	NC_009381	TAG	2	6	160940	160945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597475
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2533	NC_009381	CGAT	2	8	161054	161061	25 %	25 %	25 %	25 %	145597475
2534	NC_009381	CCG	2	6	161076	161081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597475
2535	NC_009381	AGA	2	6	161154	161159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597475
2536	NC_009381	CGATC	2	10	161172	161181	20 %	20 %	20 %	40 %	145597475
2537	NC_009381	CTG	2	6	161182	161187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597475
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2539	NC_009381	TCTT	2	8	161358	161365	0 %	75 %	0 %	25 %	145597475
2540	NC_009381	CCA	2	6	161389	161394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597475
2541	NC_009381	GTC	2	6	161475	161480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597476
2542	NC_009381	CAG	2	6	161494	161499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597476
2543	NC_009381	ATC	2	6	161552	161557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597476
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2545	NC_009381	CGAAAG	2	12	161571	161582	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	145597476
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2550	NC_009381	TGC	2	6	161809	161814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597476
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2552	NC_009381	TGC	2	6	161833	161838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597476
2553	NC_009381	TAC	2	6	162349	162354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597477
2554	NC_009381	ATG	2	6	162367	162372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597477
2555	NC_009381	GAAC	2	8	162382	162389	50 %	0 %	25 %	25 %	145597477
2556	NC_009381	TGG	2	6	162393	162398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597477
2557	NC_009381	ATT	2	6	162489	162494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597477
2558	NC_009381	CAT	2	6	162517	162522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597477
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2560	NC_009381	TTG	2	6	162630	162635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597477
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2590	NC_009381	ATA	2	6	164106	164111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597480
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2595	NC_009381	A	6	6	164411	164416	100 %	0 %	0 %	0 %	145597480
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2602	NC_009381	TA	3	6	164729	164734	50 %	50 %	0 %	0 %	145597480
2603	NC_009381	AAT	2	6	164775	164780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597480
2604	NC_009381	GGCA	2	8	164794	164801	25 %	0 %	50 %	25 %	145597480
2605	NC_009381	TCA	2	6	164814	164819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597480
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2607	NC_009381	CACC	2	8	164980	164987	25 %	0 %	0 %	75 %	145597480
2608	NC_009381	TGCCC	2	10	165015	165024	0 %	20 %	20 %	60 %	145597480
2609	NC_009381	AAT	2	6	165029	165034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597480
2610	NC_009381	T	6	6	165102	165107	0 %	100 %	0 %	0 %	145597481
2611	NC_009381	AGA	2	6	165122	165127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597481
2612	NC_009381	GCT	2	6	165172	165177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597481
2613	NC_009381	GTA	2	6	165178	165183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597481
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2616	NC_009381	GGC	2	6	165389	165394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597481
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2619	NC_009381	GAT	2	6	165731	165736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597481
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