MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_009381	AAT	2	6	1326967	1326972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145598472
21002	NC_009381	CTG	2	6	1326985	1326990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598472
21003	NC_009381	TAC	2	6	1326999	1327004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598472
21004	NC_009381	CCTGG	2	10	1327005	1327014	0 %	20 %	40 %	40 %	145598472
21005	NC_009381	CGC	2	6	1327105	1327110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145598472
21006	NC_009381	GAC	2	6	1327132	1327137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598472
21007	NC_009381	GCA	2	6	1327170	1327175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598472
21008	NC_009381	CAT	2	6	1327212	1327217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598472
21009	NC_009381	ATG	2	6	1327225	1327230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598472
21010	NC_009381	ACG	2	6	1327274	1327279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598473
21011	NC_009381	AC	3	6	1327327	1327332	50 %	0 %	0 %	50 %	145598473
21012	NC_009381	CAGC	2	8	1327404	1327411	25 %	0 %	25 %	50 %	145598473
21013	NC_009381	C	11	11	1327423	1327433	0 %	0 %	0 %	100 %	145598473
21014	NC_009381	TCA	2	6	1327546	1327551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598473
21015	NC_009381	ATG	2	6	1327552	1327557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598473
21016	NC_009381	CGC	2	6	1327568	1327573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145598473
21017	NC_009381	GCC	2	6	1327584	1327589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145598473
21018	NC_009381	CAC	2	6	1327628	1327633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598473
21019	NC_009381	CAC	2	6	1327667	1327672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598473
21020	NC_009381	GAC	2	6	1327710	1327715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598473
21021	NC_009381	TTC	2	6	1327745	1327750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145598473
21022	NC_009381	CGG	2	6	1327867	1327872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598473
21023	NC_009381	CTT	3	9	1327894	1327902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145598473
21024	NC_009381	AC	3	6	1327918	1327923	50 %	0 %	0 %	50 %	145598473
21025	NC_009381	GCA	2	6	1327966	1327971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598473
21026	NC_009381	CACC	2	8	1327975	1327982	25 %	0 %	0 %	75 %	145598473
21027	NC_009381	TTG	2	6	1327994	1327999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145598473
21028	NC_009381	CTG	2	6	1328099	1328104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598473
21029	NC_009381	CAG	2	6	1328162	1328167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598473
21030	NC_009381	CAC	2	6	1328197	1328202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598473
21031	NC_009381	CAA	2	6	1328221	1328226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145598473
21032	NC_009381	CCAG	2	8	1328289	1328296	25 %	0 %	25 %	50 %	145598473
21033	NC_009381	TCGC	2	8	1328306	1328313	0 %	25 %	25 %	50 %	145598473
21034	NC_009381	CCGG	2	8	1328340	1328347	0 %	0 %	50 %	50 %	145598473
21035	NC_009381	AT	3	6	1328356	1328361	50 %	50 %	0 %	0 %	145598473
21036	NC_009381	ATCG	2	8	1328405	1328412	25 %	25 %	25 %	25 %	145598473
21037	NC_009381	CAGC	2	8	1328416	1328423	25 %	0 %	25 %	50 %	145598473
21038	NC_009381	CGG	2	6	1328440	1328445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598473
21039	NC_009381	CATAA	2	10	1328517	1328526	60 %	20 %	0 %	20 %	145598473
21040	NC_009381	ATC	2	6	1328545	1328550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598474
21041	NC_009381	GGA	2	6	1328626	1328631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145598474
21042	NC_009381	GAA	2	6	1328632	1328637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145598474
21043	NC_009381	ACC	2	6	1328726	1328731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598474
21044	NC_009381	CGCC	2	8	1328748	1328755	0 %	0 %	25 %	75 %	145598474
21045	NC_009381	AAT	2	6	1328773	1328778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145598474
21046	NC_009381	ATC	2	6	1328788	1328793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598474
21047	NC_009381	ACC	2	6	1328827	1328832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598474
21048	NC_009381	GCAA	2	8	1328869	1328876	50 %	0 %	25 %	25 %	145598474
21049	NC_009381	CGC	2	6	1328916	1328921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145598474
21050	NC_009381	ATA	2	6	1328978	1328983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145598474
21051	NC_009381	AAG	2	6	1328984	1328989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145598474
21052	NC_009381	TCA	2	6	1329005	1329010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598474
21053	NC_009381	GAC	2	6	1329080	1329085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598474
21054	NC_009381	GAG	2	6	1329114	1329119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145598474
21055	NC_009381	ACC	3	9	1329161	1329169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598474
21056	NC_009381	AGCAC	2	10	1329294	1329303	40 %	0 %	20 %	40 %	145598474
21057	NC_009381	TAA	3	9	1329313	1329321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145598474
21058	NC_009381	CATG	2	8	1329341	1329348	25 %	25 %	25 %	25 %	145598474
21059	NC_009381	CAC	2	6	1329397	1329402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598474
21060	NC_009381	AGC	2	6	1329416	1329421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598474
21061	NC_009381	CAT	2	6	1329508	1329513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598474
21062	NC_009381	AAT	3	9	1329515	1329523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145598474
21063	NC_009381	CCA	2	6	1329552	1329557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598474
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21067	NC_009381	AGT	2	6	1329725	1329730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598474
21068	NC_009381	ATA	2	6	1329781	1329786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145598474
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21070	NC_009381	GTA	2	6	1329909	1329914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598474
21071	NC_009381	A	6	6	1329923	1329928	100 %	0 %	0 %	0 %	145598474
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21074	NC_009381	CAT	2	6	1330368	1330373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598475
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21077	NC_009381	CAG	2	6	1330619	1330624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598475
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21085	NC_009381	CAG	2	6	1333471	1333476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598476
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21099	NC_009381	TA	3	6	1334147	1334152	50 %	50 %	0 %	0 %	145598476
21100	NC_009381	ACC	2	6	1334190	1334195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598476
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21102	NC_009381	CGG	3	9	1334280	1334288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598476
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21104	NC_009381	TTA	2	6	1334412	1334417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145598476
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21107	NC_009381	GGC	2	6	1334488	1334493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598476
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21109	NC_009381	CCG	2	6	1334595	1334600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145598476
21110	NC_009381	GCA	2	6	1334610	1334615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598476
21111	NC_009381	CCA	2	6	1334698	1334703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598476
21112	NC_009381	TCA	2	6	1334782	1334787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598476
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21114	NC_009381	TGGT	2	8	1334923	1334930	0 %	50 %	50 %	0 %	145598476
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21116	NC_009381	TGAT	2	8	1335068	1335075	25 %	50 %	25 %	0 %	145598476
21117	NC_009381	ATCC	2	8	1335229	1335236	25 %	25 %	0 %	50 %	145598477
21118	NC_009381	AGC	2	6	1335259	1335264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598477
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21130	NC_009381	CAG	2	6	1336077	1336082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598477
21131	NC_009381	CTT	2	6	1336107	1336112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145598477
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21215	NC_009381	A	6	6	1342239	1342244	100 %	0 %	0 %	0 %	145598482
21216	NC_009381	CTG	2	6	1342284	1342289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598482
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21218	NC_009381	TA	3	6	1342326	1342331	50 %	50 %	0 %	0 %	145598482
21219	NC_009381	AG	3	6	1342335	1342340	50 %	0 %	50 %	0 %	145598482
21220	NC_009381	TGAT	2	8	1342348	1342355	25 %	50 %	25 %	0 %	145598482
21221	NC_009381	ACT	2	6	1342484	1342489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598482
21222	NC_009381	A	6	6	1342627	1342632	100 %	0 %	0 %	0 %	145598482
21223	NC_009381	ATG	2	6	1343065	1343070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598483
21224	NC_009381	ATG	2	6	1343083	1343088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598483
21225	NC_009381	ATT	2	6	1343101	1343106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145598483
21226	NC_009381	CAAC	2	8	1343148	1343155	50 %	0 %	0 %	50 %	145598483
21227	NC_009381	AC	3	6	1343154	1343159	50 %	0 %	0 %	50 %	145598483
21228	NC_009381	ATC	2	6	1343185	1343190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598483
21229	NC_009381	CGC	2	6	1343192	1343197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145598483
21230	NC_009381	TGC	2	6	1343218	1343223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598483
21231	NC_009381	TTG	2	6	1343286	1343291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145598483
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21233	NC_009381	C	6	6	1343337	1343342	0 %	0 %	0 %	100 %	145598483
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21351	NC_009381	TCT	2	6	1350418	1350423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145598491
21352	NC_009381	GAA	2	6	1350428	1350433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145598491
21353	NC_009381	CG	3	6	1350573	1350578	0 %	0 %	50 %	50 %	145598491
21354	NC_009381	GCG	3	9	1350590	1350598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598491
21355	NC_009381	TTGA	2	8	1350644	1350651	25 %	50 %	25 %	0 %	145598491
21356	NC_009381	CAT	2	6	1350697	1350702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598491
21357	NC_009381	GC	3	6	1350747	1350752	0 %	0 %	50 %	50 %	145598491
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21363	NC_009381	G	6	6	1351122	1351127	0 %	0 %	100 %	0 %	145598491
21364	NC_009381	CAT	2	6	1351153	1351158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598491
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21370	NC_009381	TGA	2	6	1352236	1352241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598492
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21449	NC_009381	GCA	2	6	1355982	1355987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598493
21450	NC_009381	CTG	2	6	1356037	1356042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598493
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21452	NC_009381	GCA	2	6	1356060	1356065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598493
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21459	NC_009381	GTC	2	6	1356541	1356546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598493
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21464	NC_009381	A	7	7	1357205	1357211	100 %	0 %	0 %	0 %	145598494
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