MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_009381	TCCAT	2	10	1060894	1060903	20 %	40 %	0 %	40 %	145598230
17002	NC_009381	TATG	2	8	1061001	1061008	25 %	50 %	25 %	0 %	145598231
17003	NC_009381	ATTTA	2	10	1061012	1061021	40 %	60 %	0 %	0 %	145598231
17004	NC_009381	TAA	2	6	1061023	1061028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145598231
17005	NC_009381	TGC	2	6	1061080	1061085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598231
17006	NC_009381	CATCAA	2	12	1061111	1061122	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	145598231
17007	NC_009381	AGC	2	6	1061436	1061441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598232
17008	NC_009381	CTG	2	6	1061446	1061451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598232
17009	NC_009381	ACTG	2	8	1061460	1061467	25 %	25 %	25 %	25 %	145598232
17010	NC_009381	TTA	2	6	1061471	1061476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145598232
17011	NC_009381	AAC	2	6	1061513	1061518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145598232
17012	NC_009381	AGC	2	6	1061603	1061608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598232
17013	NC_009381	TGG	2	6	1061654	1061659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145598232
17014	NC_009381	TAT	2	6	1061666	1061671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145598232
17015	NC_009381	GTT	2	6	1061682	1061687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145598232
17016	NC_009381	TC	4	8	1061745	1061752	0 %	50 %	0 %	50 %	145598232
17017	NC_009381	TTC	2	6	1061821	1061826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145598232
17018	NC_009381	GA	3	6	1061887	1061892	50 %	0 %	50 %	0 %	145598232
17019	NC_009381	TGC	2	6	1061904	1061909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598232
17020	NC_009381	GCCA	2	8	1061958	1061965	25 %	0 %	25 %	50 %	145598232
17021	NC_009381	CTT	2	6	1061989	1061994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145598232
17022	NC_009381	TAT	2	6	1061996	1062001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145598232
17023	NC_009381	C	6	6	1062027	1062032	0 %	0 %	0 %	100 %	145598232
17024	NC_009381	TGC	2	6	1062083	1062088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598232
17025	NC_009381	TATT	2	8	1062094	1062101	25 %	75 %	0 %	0 %	145598232
17026	NC_009381	CCG	2	6	1062325	1062330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145598233
17027	NC_009381	GACCAA	2	12	1062370	1062381	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	145598233
17028	NC_009381	TCA	2	6	1062386	1062391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598233
17029	NC_009381	GCT	2	6	1062468	1062473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598233
17030	NC_009381	TCA	2	6	1062491	1062496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598233
17031	NC_009381	GGC	2	6	1062499	1062504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598233
17032	NC_009381	CAG	2	6	1062561	1062566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598233
17033	NC_009381	CCA	2	6	1062582	1062587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598233
17034	NC_009381	CGC	2	6	1062599	1062604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145598233
17035	NC_009381	GTG	2	6	1062633	1062638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145598233
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17037	NC_009381	CAT	2	6	1063039	1063044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598234
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17039	NC_009381	CAC	2	6	1063066	1063071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598234
17040	NC_009381	CAT	2	6	1063181	1063186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598234
17041	NC_009381	C	7	7	1063280	1063286	0 %	0 %	0 %	100 %	145598234
17042	NC_009381	TGC	2	6	1063317	1063322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598234
17043	NC_009381	CAC	2	6	1063412	1063417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598234
17044	NC_009381	GGCG	2	8	1063503	1063510	0 %	0 %	75 %	25 %	145598234
17045	NC_009381	AAT	2	6	1063547	1063552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145598234
17046	NC_009381	ATA	2	6	1063597	1063602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145598234
17047	NC_009381	CAT	2	6	1063655	1063660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598234
17048	NC_009381	TCA	2	6	1063666	1063671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598234
17049	NC_009381	CAA	2	6	1063762	1063767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145598234
17050	NC_009381	A	6	6	1063787	1063792	100 %	0 %	0 %	0 %	145598234
17051	NC_009381	ATC	2	6	1063803	1063808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598234
17052	NC_009381	GCG	2	6	1063836	1063841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598234
17053	NC_009381	T	6	6	1063985	1063990	0 %	100 %	0 %	0 %	145598234
17054	NC_009381	AT	4	8	1063995	1064002	50 %	50 %	0 %	0 %	145598234
17055	NC_009381	T	6	6	1064270	1064275	0 %	100 %	0 %	0 %	145598235
17056	NC_009381	TTG	2	6	1064315	1064320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145598235
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17058	NC_009381	TTA	2	6	1064444	1064449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145598235
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17061	NC_009381	TTTC	2	8	1064601	1064608	0 %	75 %	0 %	25 %	145598235
17062	NC_009381	AGA	2	6	1064756	1064761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145598235
17063	NC_009381	TAAA	2	8	1064767	1064774	75 %	25 %	0 %	0 %	145598235
17064	NC_009381	AAC	3	9	1064859	1064867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145598236
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17067	NC_009381	AT	3	6	1064952	1064957	50 %	50 %	0 %	0 %	145598236
17068	NC_009381	GGTT	2	8	1064963	1064970	0 %	50 %	50 %	0 %	145598236
17069	NC_009381	TGG	2	6	1064989	1064994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145598236
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17071	NC_009381	TGC	2	6	1065092	1065097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598236
17072	NC_009381	A	6	6	1065157	1065162	100 %	0 %	0 %	0 %	145598236
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17074	NC_009381	TGA	2	6	1065229	1065234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598236
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17078	NC_009381	ACC	2	6	1065791	1065796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598237
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17084	NC_009381	GGC	2	6	1066306	1066311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598237
17085	NC_009381	GAC	2	6	1066346	1066351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598237
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17087	NC_009381	GAC	2	6	1066517	1066522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598237
17088	NC_009381	GTT	2	6	1066535	1066540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145598237
17089	NC_009381	A	7	7	1066564	1066570	100 %	0 %	0 %	0 %	145598237
17090	NC_009381	TAT	2	6	1066615	1066620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145598237
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17095	NC_009381	GTACT	2	10	1066867	1066876	20 %	40 %	20 %	20 %	145598238
17096	NC_009381	TCA	2	6	1067030	1067035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598238
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17100	NC_009381	CTT	2	6	1067094	1067099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145598238
17101	NC_009381	GGT	2	6	1067177	1067182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145598238
17102	NC_009381	GCG	2	6	1067246	1067251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598238
17103	NC_009381	GCA	2	6	1067267	1067272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598238
17104	NC_009381	CAG	2	6	1067356	1067361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598238
17105	NC_009381	CAA	2	6	1067367	1067372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145598238
17106	NC_009381	A	6	6	1067394	1067399	100 %	0 %	0 %	0 %	145598238
17107	NC_009381	TTA	2	6	1067436	1067441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145598238
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17111	NC_009381	TGA	2	6	1068302	1068307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598240
17112	NC_009381	GTG	2	6	1068350	1068355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145598240
17113	NC_009381	TTGG	2	8	1068357	1068364	0 %	50 %	50 %	0 %	145598240
17114	NC_009381	TGA	2	6	1068429	1068434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598240
17115	NC_009381	GA	4	8	1068433	1068440	50 %	0 %	50 %	0 %	145598240
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17467	NC_009381	ACA	2	6	1096175	1096180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145598262
17468	NC_009381	T	6	6	1096223	1096228	0 %	100 %	0 %	0 %	145598262
17469	NC_009381	TTC	2	6	1096235	1096240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145598262
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17482	NC_009381	T	6	6	1096703	1096708	0 %	100 %	0 %	0 %	145598262
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