MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_009381	GCG	2	6	934611	934616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598127
15002	NC_009381	TGC	2	6	934661	934666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598127
15003	NC_009381	AAG	2	6	934745	934750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145598127
15004	NC_009381	GAT	2	6	934758	934763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598127
15005	NC_009381	GAA	2	6	934765	934770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145598127
15006	NC_009381	CAA	2	6	934792	934797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145598127
15007	NC_009381	TCTG	2	8	934855	934862	0 %	50 %	25 %	25 %	145598127
15008	NC_009381	A	7	7	935531	935537	100 %	0 %	0 %	0 %	145598128
15009	NC_009381	CAT	2	6	935551	935556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598128
15010	NC_009381	GGT	2	6	935566	935571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145598128
15011	NC_009381	AGC	3	9	935575	935583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598128
15012	NC_009381	GAT	2	6	935638	935643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598128
15013	NC_009381	ACTGA	2	10	935645	935654	40 %	20 %	20 %	20 %	145598128
15014	NC_009381	CAA	2	6	935666	935671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145598128
15015	NC_009381	AAG	2	6	935685	935690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145598128
15016	NC_009381	GCGG	2	8	935701	935708	0 %	0 %	75 %	25 %	145598128
15017	NC_009381	A	6	6	935714	935719	100 %	0 %	0 %	0 %	145598128
15018	NC_009381	CAT	2	6	935746	935751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598128
15019	NC_009381	CAC	2	6	935764	935769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145598128
15020	NC_009381	GCA	2	6	935786	935791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598128
15021	NC_009381	AGG	2	6	935794	935799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145598128
15022	NC_009381	TTCAA	2	10	935811	935820	40 %	40 %	0 %	20 %	145598128
15023	NC_009381	T	6	6	935940	935945	0 %	100 %	0 %	0 %	145598129
15024	NC_009381	TTA	2	6	935953	935958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145598129
15025	NC_009381	CAAT	2	8	936032	936039	50 %	25 %	0 %	25 %	145598129
15026	NC_009381	T	6	6	936055	936060	0 %	100 %	0 %	0 %	145598129
15027	NC_009381	AGC	2	6	936061	936066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598129
15028	NC_009381	GCG	2	6	936325	936330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598129
15029	NC_009381	GGA	2	6	936478	936483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145598129
15030	NC_009381	CGG	2	6	936500	936505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598129
15031	NC_009381	GGC	2	6	936593	936598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598129
15032	NC_009381	TGTT	2	8	936599	936606	0 %	75 %	25 %	0 %	145598129
15033	NC_009381	ATC	2	6	936618	936623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598129
15034	NC_009381	A	6	6	936630	936635	100 %	0 %	0 %	0 %	145598129
15035	NC_009381	TCCG	2	8	936666	936673	0 %	25 %	25 %	50 %	145598129
15036	NC_009381	GGT	2	6	936693	936698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145598129
15037	NC_009381	TAA	3	9	936723	936731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145598129
15038	NC_009381	ATAA	2	8	936742	936749	75 %	25 %	0 %	0 %	145598129
15039	NC_009381	T	6	6	937180	937185	0 %	100 %	0 %	0 %	145598130
15040	NC_009381	T	6	6	937206	937211	0 %	100 %	0 %	0 %	145598130
15041	NC_009381	GTG	2	6	937212	937217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145598130
15042	NC_009381	CTG	2	6	937244	937249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598130
15043	NC_009381	GTGCTG	4	24	937250	937273	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	145598130
15044	NC_009381	TAC	2	6	937296	937301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598130
15045	NC_009381	GCA	2	6	937342	937347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598130
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15047	NC_009381	AT	3	6	938009	938014	50 %	50 %	0 %	0 %	145598131
15048	NC_009381	TGGT	2	8	938031	938038	0 %	50 %	50 %	0 %	145598131
15049	NC_009381	ATGG	2	8	938075	938082	25 %	25 %	50 %	0 %	145598131
15050	NC_009381	CTA	2	6	938093	938098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598131
15051	NC_009381	TGGT	2	8	938102	938109	0 %	50 %	50 %	0 %	145598131
15052	NC_009381	TA	3	6	938266	938271	50 %	50 %	0 %	0 %	145598131
15053	NC_009381	TAA	2	6	938562	938567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145598132
15054	NC_009381	CCG	2	6	938606	938611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145598132
15055	NC_009381	AAG	2	6	938645	938650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145598132
15056	NC_009381	TGA	2	6	938742	938747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598132
15057	NC_009381	T	6	6	938844	938849	0 %	100 %	0 %	0 %	145598132
15058	NC_009381	TGAAG	2	10	938889	938898	40 %	20 %	40 %	0 %	145598132
15059	NC_009381	CAGGG	2	10	938981	938990	20 %	0 %	60 %	20 %	145598132
15060	NC_009381	G	7	7	939002	939008	0 %	0 %	100 %	0 %	145598132
15061	NC_009381	AAG	2	6	939089	939094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145598132
15062	NC_009381	ATA	2	6	939132	939137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145598132
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15065	NC_009381	CCT	2	6	940062	940067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145598133
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15069	NC_009381	ATG	2	6	940217	940222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598133
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15073	NC_009381	ACTG	2	8	940338	940345	25 %	25 %	25 %	25 %	145598134
15074	NC_009381	CAAA	2	8	940365	940372	75 %	0 %	0 %	25 %	145598134
15075	NC_009381	TC	4	8	940408	940415	0 %	50 %	0 %	50 %	145598134
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15079	NC_009381	TCT	2	6	940691	940696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145598134
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15081	NC_009381	CTT	2	6	940767	940772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145598134
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15086	NC_009381	ATT	2	6	940906	940911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145598134
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15090	NC_009381	GCCC	2	8	940975	940982	0 %	0 %	25 %	75 %	145598134
15091	NC_009381	GTA	3	9	941005	941013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145598134
15092	NC_009381	CG	3	6	941074	941079	0 %	0 %	50 %	50 %	145598134
15093	NC_009381	CCG	2	6	941094	941099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145598134
15094	NC_009381	GCC	2	6	941101	941106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145598134
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15098	NC_009381	GTC	2	6	941203	941208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598134
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15101	NC_009381	T	6	6	941317	941322	0 %	100 %	0 %	0 %	145598134
15102	NC_009381	CTC	2	6	941324	941329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145598134
15103	NC_009381	CTGC	2	8	941386	941393	0 %	25 %	25 %	50 %	145598134
15104	NC_009381	GCTG	3	12	941409	941420	0 %	25 %	50 %	25 %	145598134
15105	NC_009381	CAT	2	6	941421	941426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598134
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15107	NC_009381	TGC	2	6	941451	941456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598134
15108	NC_009381	CAG	2	6	941482	941487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598134
15109	NC_009381	CTG	2	6	941536	941541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598134
15110	NC_009381	TGC	2	6	941610	941615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598134
15111	NC_009381	TGT	2	6	941646	941651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145598134
15112	NC_009381	TGG	2	6	941652	941657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145598134
15113	NC_009381	TCG	2	6	941696	941701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598134
15114	NC_009381	GGT	2	6	941758	941763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145598134
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15121	NC_009381	CGG	2	6	942087	942092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145598134
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15357	NC_009381	CATAT	2	10	956101	956110	40 %	40 %	0 %	20 %	145598144
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15361	NC_009381	ATC	2	6	956194	956199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598144
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15464	NC_009381	ATGA	2	8	963757	963764	50 %	25 %	25 %	0 %	145598151
15465	NC_009381	CAG	2	6	963786	963791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145598151
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15470	NC_009381	TCA	2	6	963915	963920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598151
15471	NC_009381	ACTTT	2	10	963950	963959	20 %	60 %	0 %	20 %	145598151
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15475	NC_009381	TGC	2	6	964082	964087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598151
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15480	NC_009381	CATT	2	8	964290	964297	25 %	50 %	0 %	25 %	145598151
15481	NC_009381	TCAATA	2	12	964337	964348	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	145598151
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15483	NC_009381	ATC	2	6	964399	964404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598151
15484	NC_009381	CAAT	2	8	964422	964429	50 %	25 %	0 %	25 %	145598151
15485	NC_009381	TTG	2	6	964438	964443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145598151
15486	NC_009381	CGAG	2	8	964459	964466	25 %	0 %	50 %	25 %	145598151
15487	NC_009381	GCAT	2	8	964469	964476	25 %	25 %	25 %	25 %	145598151
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15489	NC_009381	GTC	2	6	964541	964546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145598151
15490	NC_009381	TTGC	2	8	964575	964582	0 %	50 %	25 %	25 %	145598151
15491	NC_009381	ATC	2	6	964646	964651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145598151
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