MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65001	NC_009381	AAAC	2	8	4115582	4115589	75 %	0 %	0 %	25 %	145600827
65002	NC_009381	GCC	2	6	4115600	4115605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145600827
65003	NC_009381	CTCA	2	8	4115667	4115674	25 %	25 %	0 %	50 %	145600827
65004	NC_009381	CAA	2	6	4115687	4115692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145600827
65005	NC_009381	ATC	2	6	4115720	4115725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600827
65006	NC_009381	AGC	2	6	4115751	4115756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145600827
65007	NC_009381	GCA	2	6	4115831	4115836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145600827
65008	NC_009381	AGA	2	6	4115854	4115859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145600827
65009	NC_009381	GAT	2	6	4115902	4115907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600827
65010	NC_009381	GCA	2	6	4115977	4115982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145600827
65011	NC_009381	CA	3	6	4116004	4116009	50 %	0 %	0 %	50 %	145600827
65012	NC_009381	ACC	2	6	4116019	4116024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600827
65013	NC_009381	GGCG	2	8	4116045	4116052	0 %	0 %	75 %	25 %	145600827
65014	NC_009381	AAT	2	6	4116110	4116115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145600827
65015	NC_009381	CGG	2	6	4116291	4116296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145600828
65016	NC_009381	GCACCA	2	12	4116304	4116315	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	145600828
65017	NC_009381	CAT	2	6	4116372	4116377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600828
65018	NC_009381	CGC	2	6	4116407	4116412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145600828
65019	NC_009381	GGCT	2	8	4116426	4116433	0 %	25 %	50 %	25 %	145600828
65020	NC_009381	GGGAT	2	10	4116512	4116521	20 %	20 %	60 %	0 %	145600828
65021	NC_009381	CCTG	2	8	4116532	4116539	0 %	25 %	25 %	50 %	145600828
65022	NC_009381	CAT	2	6	4116578	4116583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600828
65023	NC_009381	CTG	2	6	4116633	4116638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600828
65024	NC_009381	CTT	2	6	4116674	4116679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145600828
65025	NC_009381	CG	3	6	4116684	4116689	0 %	0 %	50 %	50 %	145600828
65026	NC_009381	CAA	2	6	4116750	4116755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145600828
65027	NC_009381	TGC	2	6	4116796	4116801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600828
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65030	NC_009381	GCT	2	6	4117274	4117279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600829
65031	NC_009381	A	6	6	4117322	4117327	100 %	0 %	0 %	0 %	145600829
65032	NC_009381	TGA	2	6	4117331	4117336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600829
65033	NC_009381	CA	3	6	4117415	4117420	50 %	0 %	0 %	50 %	145600829
65034	NC_009381	TGGA	2	8	4117488	4117495	25 %	25 %	50 %	0 %	145600829
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65036	NC_009381	TTA	2	6	4117525	4117530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600829
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65038	NC_009381	CTG	2	6	4117557	4117562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600829
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65041	NC_009381	ACA	2	6	4117648	4117653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145600829
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65043	NC_009381	GAC	2	6	4117691	4117696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145600829
65044	NC_009381	ATA	2	6	4117759	4117764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145600829
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65049	NC_009381	AAC	2	6	4118332	4118337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145600830
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65051	NC_009381	T	6	6	4118476	4118481	0 %	100 %	0 %	0 %	145600830
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65053	NC_009381	TTAC	2	8	4118681	4118688	25 %	50 %	0 %	25 %	145600831
65054	NC_009381	CA	3	6	4118963	4118968	50 %	0 %	0 %	50 %	145600831
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65062	NC_009381	GC	3	6	4119870	4119875	0 %	0 %	50 %	50 %	145600833
65063	NC_009381	AATC	2	8	4119988	4119995	50 %	25 %	0 %	25 %	145600833
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65112	NC_009381	ACA	2	6	4123178	4123183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145600837
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65114	NC_009381	CAC	2	6	4123196	4123201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600837
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65116	NC_009381	GTC	2	6	4123361	4123366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600837
65117	NC_009381	CGAAC	2	10	4123379	4123388	40 %	0 %	20 %	40 %	145600837
65118	NC_009381	GCTCCT	2	12	4123394	4123405	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	145600837
65119	NC_009381	GA	4	8	4123414	4123421	50 %	0 %	50 %	0 %	145600837
65120	NC_009381	GAAT	2	8	4123424	4123431	50 %	25 %	25 %	0 %	145600837
65121	NC_009381	GCGA	2	8	4123479	4123486	25 %	0 %	50 %	25 %	145600837
65122	NC_009381	CAG	2	6	4123571	4123576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145600837
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65124	NC_009381	AATG	2	8	4124039	4124046	50 %	25 %	25 %	0 %	145600838
65125	NC_009381	TGC	2	6	4124075	4124080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600838
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65128	NC_009381	TGA	2	6	4124294	4124299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600838
65129	NC_009381	CTG	2	6	4124341	4124346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600838
65130	NC_009381	AT	3	6	4124482	4124487	50 %	50 %	0 %	0 %	145600839
65131	NC_009381	GAT	2	6	4124495	4124500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600839
65132	NC_009381	AGT	2	6	4124551	4124556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600839
65133	NC_009381	GCCC	2	8	4124596	4124603	0 %	0 %	25 %	75 %	145600839
65134	NC_009381	CTT	2	6	4124609	4124614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145600839
65135	NC_009381	TTC	2	6	4124620	4124625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145600839
65136	NC_009381	GTT	2	6	4124630	4124635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145600839
65137	NC_009381	GCC	2	6	4124642	4124647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145600839
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65143	NC_009381	GCT	2	6	4125044	4125049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600839
65144	NC_009381	GC	3	6	4125109	4125114	0 %	0 %	50 %	50 %	145600839
65145	NC_009381	TCA	2	6	4125116	4125121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600839
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65148	NC_009381	GTG	2	6	4125466	4125471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145600839
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65151	NC_009381	TGT	2	6	4125619	4125624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145600839
65152	NC_009381	GCA	2	6	4125703	4125708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145600839
65153	NC_009381	GAT	2	6	4125764	4125769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600839
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65202	NC_009381	TCCC	2	8	4128594	4128601	0 %	25 %	0 %	75 %	145600841
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65207	NC_009381	TCT	2	6	4129011	4129016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145600841
65208	NC_009381	CAT	2	6	4129029	4129034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600841
65209	NC_009381	CTT	2	6	4129107	4129112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145600841
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65222	NC_009381	GAC	2	6	4129653	4129658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145600841
65223	NC_009381	CGCA	2	8	4129690	4129697	25 %	0 %	25 %	50 %	145600841
65224	NC_009381	ACG	2	6	4129699	4129704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145600841
65225	NC_009381	AAAT	2	8	4129800	4129807	75 %	25 %	0 %	0 %	145600841
65226	NC_009381	CAA	2	6	4130118	4130123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145600842
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65230	NC_009381	GA	3	6	4130424	4130429	50 %	0 %	50 %	0 %	145600842
65231	NC_009381	GA	3	6	4130451	4130456	50 %	0 %	50 %	0 %	145600842
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65233	NC_009381	GGT	2	6	4131037	4131042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145600843
65234	NC_009381	CTT	2	6	4131162	4131167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145600843
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65337	NC_009381	TAAA	2	8	4136778	4136785	75 %	25 %	0 %	0 %	145600848
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65340	NC_009381	TGAAC	2	10	4137035	4137044	40 %	20 %	20 %	20 %	145600849
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65343	NC_009381	CA	3	6	4137166	4137171	50 %	0 %	0 %	50 %	145600849
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65345	NC_009381	TGA	2	6	4137254	4137259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600849
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65347	NC_009381	A	8	8	4137385	4137392	100 %	0 %	0 %	0 %	145600849
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