MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009381	TGC	2	6	346019	346024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597619
5502	NC_009381	CGG	2	6	346060	346065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597619
5503	NC_009381	TCA	2	6	346136	346141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597619
5504	NC_009381	TCA	2	6	346203	346208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597619
5505	NC_009381	GGC	2	6	346209	346214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597619
5506	NC_009381	CGG	2	6	346283	346288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597619
5507	NC_009381	CTG	2	6	346318	346323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597619
5508	NC_009381	TGA	2	6	346338	346343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597619
5509	NC_009381	CA	3	6	346386	346391	50 %	0 %	0 %	50 %	145597619
5510	NC_009381	CAAA	2	8	346452	346459	75 %	0 %	0 %	25 %	145597619
5511	NC_009381	ATA	2	6	346465	346470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597619
5512	NC_009381	ACC	2	6	346504	346509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597619
5513	NC_009381	CACCGT	2	12	346548	346559	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	145597619
5514	NC_009381	ATG	3	9	346655	346663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597619
5515	NC_009381	TGA	2	6	346676	346681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597619
5516	NC_009381	CCA	2	6	346927	346932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597619
5517	NC_009381	ATT	2	6	346942	346947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597619
5518	NC_009381	ACG	2	6	347063	347068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597620
5519	NC_009381	CAC	2	6	347108	347113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597620
5520	NC_009381	GATA	2	8	347162	347169	50 %	25 %	25 %	0 %	145597620
5521	NC_009381	ACCC	2	8	347182	347189	25 %	0 %	0 %	75 %	145597620
5522	NC_009381	GCCA	2	8	347234	347241	25 %	0 %	25 %	50 %	145597620
5523	NC_009381	TGA	4	12	347377	347388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597620
5524	NC_009381	CCG	2	6	347398	347403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597620
5525	NC_009381	CAAT	2	8	347428	347435	50 %	25 %	0 %	25 %	145597620
5526	NC_009381	GCC	2	6	347450	347455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597620
5527	NC_009381	ACCG	2	8	347549	347556	25 %	0 %	25 %	50 %	145597620
5528	NC_009381	TCA	2	6	347572	347577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597620
5529	NC_009381	AGC	2	6	347658	347663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597620
5530	NC_009381	GAC	2	6	347678	347683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597620
5531	NC_009381	GAT	2	6	347705	347710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597620
5532	NC_009381	AACC	2	8	347802	347809	50 %	0 %	0 %	50 %	145597620
5533	NC_009381	GTT	2	6	347830	347835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597620
5534	NC_009381	AGTA	2	8	347841	347848	50 %	25 %	25 %	0 %	145597620
5535	NC_009381	TCA	2	6	347854	347859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597620
5536	NC_009381	GA	3	6	347866	347871	50 %	0 %	50 %	0 %	145597620
5537	NC_009381	TTC	2	6	347919	347924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597620
5538	NC_009381	CAG	2	6	347934	347939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597620
5539	NC_009381	AGA	3	9	347956	347964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597620
5540	NC_009381	GAA	2	6	348116	348121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597620
5541	NC_009381	TGCCG	2	10	348168	348177	0 %	20 %	40 %	40 %	145597620
5542	NC_009381	CACTT	2	10	348200	348209	20 %	40 %	0 %	40 %	145597620
5543	NC_009381	CAAT	2	8	348223	348230	50 %	25 %	0 %	25 %	145597620
5544	NC_009381	ATC	2	6	348242	348247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597620
5545	NC_009381	GA	3	6	348309	348314	50 %	0 %	50 %	0 %	145597620
5546	NC_009381	TGAC	2	8	348381	348388	25 %	25 %	25 %	25 %	145597620
5547	NC_009381	CCA	2	6	348412	348417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597620
5548	NC_009381	CTG	2	6	348440	348445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597620
5549	NC_009381	AAT	3	9	348889	348897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597621
5550	NC_009381	TGC	2	6	348938	348943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597621
5551	NC_009381	G	6	6	349045	349050	0 %	0 %	100 %	0 %	145597621
5552	NC_009381	CTG	2	6	349063	349068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597621
5553	NC_009381	GAG	2	6	349146	349151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597621
5554	NC_009381	CCA	2	6	349191	349196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597621
5555	NC_009381	GCG	2	6	349243	349248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597621
5556	NC_009381	GGT	2	6	349255	349260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597621
5557	NC_009381	CAGA	2	8	349358	349365	50 %	0 %	25 %	25 %	145597621
5558	NC_009381	CG	3	6	349383	349388	0 %	0 %	50 %	50 %	145597621
5559	NC_009381	CAC	2	6	349393	349398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597621
5560	NC_009381	T	6	6	349401	349406	0 %	100 %	0 %	0 %	145597621
5561	NC_009381	GTT	2	6	349476	349481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597621
5562	NC_009381	TTG	2	6	349552	349557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597621
5563	NC_009381	GTAC	2	8	349577	349584	25 %	25 %	25 %	25 %	145597621
5564	NC_009381	CGAGA	2	10	349608	349617	40 %	0 %	40 %	20 %	145597621
5565	NC_009381	ATG	2	6	349622	349627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597621
5566	NC_009381	CAA	2	6	349629	349634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597621
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5568	NC_009381	G	7	7	350063	350069	0 %	0 %	100 %	0 %	145597622
5569	NC_009381	CAGA	2	8	350082	350089	50 %	0 %	25 %	25 %	145597622
5570	NC_009381	AGT	2	6	350107	350112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597622
5571	NC_009381	AT	3	6	350114	350119	50 %	50 %	0 %	0 %	145597622
5572	NC_009381	CAG	2	6	350213	350218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597622
5573	NC_009381	TTG	2	6	350242	350247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597622
5574	NC_009381	A	6	6	350344	350349	100 %	0 %	0 %	0 %	145597622
5575	NC_009381	ACA	2	6	350414	350419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597622
5576	NC_009381	A	8	8	350483	350490	100 %	0 %	0 %	0 %	145597622
5577	NC_009381	TAA	2	6	350511	350516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597622
5578	NC_009381	ACG	2	6	350836	350841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597623
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5581	NC_009381	GGT	2	6	350995	351000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597623
5582	NC_009381	CAA	2	6	351036	351041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597623
5583	NC_009381	TGAC	2	8	351061	351068	25 %	25 %	25 %	25 %	145597623
5584	NC_009381	ATC	2	6	351085	351090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597623
5585	NC_009381	GATC	2	8	351111	351118	25 %	25 %	25 %	25 %	145597623
5586	NC_009381	TGC	2	6	351144	351149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597623
5587	NC_009381	GCA	2	6	351182	351187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597623
5588	NC_009381	AGTTT	2	10	351194	351203	20 %	60 %	20 %	0 %	145597623
5589	NC_009381	GTA	2	6	351368	351373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597624
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5591	NC_009381	ACT	2	6	351547	351552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597624
5592	NC_009381	TTG	2	6	351612	351617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597624
5593	NC_009381	TCA	3	9	351818	351826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597624
5594	NC_009381	TTG	2	6	351902	351907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597625
5595	NC_009381	TAG	2	6	351912	351917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597625
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5599	NC_009381	AGA	2	6	352210	352215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597625
5600	NC_009381	AATG	2	8	352251	352258	50 %	25 %	25 %	0 %	145597625
5601	NC_009381	CTT	2	6	352438	352443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597625
5602	NC_009381	TGAC	2	8	352483	352490	25 %	25 %	25 %	25 %	145597625
5603	NC_009381	TGC	2	6	352534	352539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597625
5604	NC_009381	GCGGGT	2	12	352598	352609	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145597625
5605	NC_009381	A	6	6	352619	352624	100 %	0 %	0 %	0 %	145597625
5606	NC_009381	AAC	2	6	352650	352655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597625
5607	NC_009381	GAT	2	6	352736	352741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597625
5608	NC_009381	T	6	6	352768	352773	0 %	100 %	0 %	0 %	145597625
5609	NC_009381	AAC	2	6	353131	353136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597626
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5619	NC_009381	AAGG	2	8	353603	353610	50 %	0 %	50 %	0 %	162202302
5620	NC_009381	GGAA	2	8	353670	353677	50 %	0 %	50 %	0 %	162202302
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5622	NC_009381	CAG	2	6	353771	353776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162202302
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