MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009381	AGA	2	6	317963	317968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597597
5002	NC_009381	GAA	2	6	317973	317978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597597
5003	NC_009381	GAA	2	6	317982	317987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597597
5004	NC_009381	GAA	2	6	317991	317996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597597
5005	NC_009381	CAC	2	6	318019	318024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597597
5006	NC_009381	AAT	2	6	318039	318044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597597
5007	NC_009381	CAG	2	6	318055	318060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597597
5008	NC_009381	GAT	2	6	318105	318110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597597
5009	NC_009381	T	9	9	318114	318122	0 %	100 %	0 %	0 %	145597597
5010	NC_009381	AAG	2	6	318146	318151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597597
5011	NC_009381	CCCATC	2	12	318167	318178	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	145597597
5012	NC_009381	ATT	2	6	318194	318199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597597
5013	NC_009381	TAA	2	6	318279	318284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597597
5014	NC_009381	ATA	3	9	318293	318301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597597
5015	NC_009381	AACG	2	8	318334	318341	50 %	0 %	25 %	25 %	145597597
5016	NC_009381	TTC	2	6	318407	318412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597597
5017	NC_009381	ATA	2	6	318420	318425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597597
5018	NC_009381	TCT	2	6	318582	318587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597597
5019	NC_009381	ATT	2	6	318593	318598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597597
5020	NC_009381	TAAA	2	8	318632	318639	75 %	25 %	0 %	0 %	145597597
5021	NC_009381	ACC	2	6	318690	318695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597597
5022	NC_009381	CCA	2	6	318705	318710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597597
5023	NC_009381	CTG	2	6	318767	318772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597597
5024	NC_009381	GTT	2	6	318817	318822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597597
5025	NC_009381	CGC	2	6	318833	318838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597597
5026	NC_009381	TTG	2	6	318878	318883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597597
5027	NC_009381	TGGC	2	8	318933	318940	0 %	25 %	50 %	25 %	145597597
5028	NC_009381	CAG	2	6	318959	318964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597597
5029	NC_009381	ATGG	2	8	319181	319188	25 %	25 %	50 %	0 %	145597597
5030	NC_009381	TCTT	2	8	319248	319255	0 %	75 %	0 %	25 %	145597597
5031	NC_009381	CGGG	2	8	319259	319266	0 %	0 %	75 %	25 %	145597597
5032	NC_009381	CT	3	6	319335	319340	0 %	50 %	0 %	50 %	145597597
5033	NC_009381	CAG	2	6	319357	319362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597597
5034	NC_009381	GTGA	2	8	319371	319378	25 %	25 %	50 %	0 %	145597597
5035	NC_009381	GGA	2	6	319381	319386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597597
5036	NC_009381	T	6	6	319404	319409	0 %	100 %	0 %	0 %	145597597
5037	NC_009381	GGT	2	6	319511	319516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597597
5038	NC_009381	TGT	2	6	319617	319622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597597
5039	NC_009381	AAT	2	6	319637	319642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597597
5040	NC_009381	AC	3	6	319689	319694	50 %	0 %	0 %	50 %	145597597
5041	NC_009381	CGGT	2	8	319749	319756	0 %	25 %	50 %	25 %	145597597
5042	NC_009381	GCC	2	6	319769	319774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597597
5043	NC_009381	GCGG	2	8	319798	319805	0 %	0 %	75 %	25 %	145597597
5044	NC_009381	GCG	2	6	319841	319846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597597
5045	NC_009381	GGTGT	2	10	319847	319856	0 %	40 %	60 %	0 %	145597597
5046	NC_009381	CGG	2	6	320070	320075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597597
5047	NC_009381	AT	3	6	320158	320163	50 %	50 %	0 %	0 %	145597597
5048	NC_009381	ATT	2	6	320174	320179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597597
5049	NC_009381	CTG	3	9	320392	320400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597598
5050	NC_009381	CAG	3	9	320412	320420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597598
5051	NC_009381	CTC	2	6	320428	320433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597598
5052	NC_009381	T	6	6	320487	320492	0 %	100 %	0 %	0 %	145597598
5053	NC_009381	GCTT	2	8	320519	320526	0 %	50 %	25 %	25 %	145597598
5054	NC_009381	GTG	2	6	320537	320542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597598
5055	NC_009381	TG	3	6	320555	320560	0 %	50 %	50 %	0 %	145597598
5056	NC_009381	TGAT	2	8	320567	320574	25 %	50 %	25 %	0 %	145597598
5057	NC_009381	GC	3	6	320584	320589	0 %	0 %	50 %	50 %	145597598
5058	NC_009381	GGCT	2	8	320640	320647	0 %	25 %	50 %	25 %	145597598
5059	NC_009381	ACA	2	6	320669	320674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597598
5060	NC_009381	CAG	2	6	320680	320685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597598
5061	NC_009381	CAT	2	6	320686	320691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597598
5062	NC_009381	C	7	7	320788	320794	0 %	0 %	0 %	100 %	145597599
5063	NC_009381	GGC	2	6	320820	320825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597599
5064	NC_009381	GGC	2	6	320927	320932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597599
5065	NC_009381	GCG	2	6	321036	321041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597599
5066	NC_009381	TCAT	2	8	321118	321125	25 %	50 %	0 %	25 %	145597599
5067	NC_009381	GTT	2	6	321339	321344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597600
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5070	NC_009381	A	7	7	321411	321417	100 %	0 %	0 %	0 %	145597600
5071	NC_009381	TCG	2	6	321652	321657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597601
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5073	NC_009381	CGG	2	6	321797	321802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597601
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5079	NC_009381	ACG	3	9	322037	322045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597601
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5081	NC_009381	TGA	2	6	322104	322109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597601
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5088	NC_009381	CAG	2	6	322492	322497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597601
5089	NC_009381	ACAGC	2	10	322568	322577	40 %	0 %	20 %	40 %	145597601
5090	NC_009381	TAC	2	6	322620	322625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597601
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5092	NC_009381	TAA	2	6	322780	322785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597601
5093	NC_009381	CTG	3	9	322876	322884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597601
5094	NC_009381	GCT	2	6	322929	322934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597601
5095	NC_009381	TTC	2	6	322939	322944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597601
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5098	NC_009381	GCCA	2	8	323126	323133	25 %	0 %	25 %	50 %	145597601
5099	NC_009381	ATTG	2	8	323173	323180	25 %	50 %	25 %	0 %	145597601
5100	NC_009381	GCA	2	6	323217	323222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597601
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5105	NC_009381	ATC	2	6	323467	323472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597601
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5107	NC_009381	GCA	2	6	323532	323537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597601
5108	NC_009381	TGCC	2	8	323592	323599	0 %	25 %	25 %	50 %	145597601
5109	NC_009381	GGTATC	2	12	323668	323679	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145597601
5110	NC_009381	CAT	2	6	323724	323729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597601
5111	NC_009381	GCGG	2	8	323746	323753	0 %	0 %	75 %	25 %	145597601
5112	NC_009381	TCA	2	6	323780	323785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597601
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5120	NC_009381	TGG	3	9	324156	324164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597601
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5488	NC_009381	GTT	2	6	344669	344674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597618
5489	NC_009381	ATG	2	6	344690	344695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597618
5490	NC_009381	TTC	2	6	344721	344726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597618
5491	NC_009381	ACGC	2	8	344748	344755	25 %	0 %	25 %	50 %	145597618
5492	NC_009381	CAC	2	6	344769	344774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597618
5493	NC_009381	TTC	2	6	344820	344825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597618
5494	NC_009381	ATATC	2	10	345321	345330	40 %	40 %	0 %	20 %	145597619
5495	NC_009381	GCT	2	6	345358	345363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597619
5496	NC_009381	AAT	2	6	345368	345373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597619
5497	NC_009381	TGC	2	6	345630	345635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597619
5498	NC_009381	GCT	2	6	345679	345684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597619
5499	NC_009381	TAT	2	6	345708	345713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597619
5500	NC_009381	TTC	2	6	345850	345855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597619

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