MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_009381	AAT	2	6	3259485	3259490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145600134
51502	NC_009381	TTG	2	6	3259495	3259500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145600134
51503	NC_009381	A	6	6	3259524	3259529	100 %	0 %	0 %	0 %	145600134
51504	NC_009381	AAT	2	6	3259577	3259582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145600134
51505	NC_009381	CTT	2	6	3259850	3259855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145600135
51506	NC_009381	CAT	2	6	3259859	3259864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600135
51507	NC_009381	CGCC	2	8	3259960	3259967	0 %	0 %	25 %	75 %	145600135
51508	NC_009381	ACA	2	6	3259989	3259994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145600135
51509	NC_009381	CT	3	6	3260066	3260071	0 %	50 %	0 %	50 %	145600135
51510	NC_009381	CTGG	2	8	3260218	3260225	0 %	25 %	50 %	25 %	145600135
51511	NC_009381	CTC	2	6	3260317	3260322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145600135
51512	NC_009381	CAT	2	6	3260437	3260442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600135
51513	NC_009381	GTA	2	6	3260463	3260468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600135
51514	NC_009381	GTG	2	6	3260535	3260540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145600135
51515	NC_009381	TAT	2	6	3260551	3260556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
51516	NC_009381	GCC	2	6	3260558	3260563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145600135
51517	NC_009381	ACC	2	6	3260627	3260632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600135
51518	NC_009381	CAC	2	6	3260693	3260698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600135
51519	NC_009381	GCC	2	6	3260724	3260729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145600135
51520	NC_009381	AGCGT	2	10	3260766	3260775	20 %	20 %	40 %	20 %	145600135
51521	NC_009381	TCG	2	6	3260881	3260886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600135
51522	NC_009381	GCCGT	2	10	3260952	3260961	0 %	20 %	40 %	40 %	145600135
51523	NC_009381	TAGC	2	8	3260983	3260990	25 %	25 %	25 %	25 %	145600135
51524	NC_009381	ATT	2	6	3261056	3261061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
51525	NC_009381	TGT	2	6	3261092	3261097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145600135
51526	NC_009381	CAA	2	6	3261116	3261121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145600135
51527	NC_009381	AGT	2	6	3261185	3261190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600135
51528	NC_009381	TGA	2	6	3261210	3261215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600135
51529	NC_009381	ACTGCT	2	12	3261254	3261265	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	145600135
51530	NC_009381	AAC	2	6	3261302	3261307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145600135
51531	NC_009381	AATC	2	8	3261325	3261332	50 %	25 %	0 %	25 %	145600135
51532	NC_009381	CAC	2	6	3261337	3261342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600135
51533	NC_009381	TAT	2	6	3261526	3261531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
51534	NC_009381	AAC	2	6	3261533	3261538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145600135
51535	NC_009381	CTG	2	6	3261570	3261575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600135
51536	NC_009381	TCACCA	2	12	3261591	3261602	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	145600135
51537	NC_009381	TAT	2	6	3261616	3261621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
51538	NC_009381	TGC	2	6	3261622	3261627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600135
51539	NC_009381	ATT	3	9	3261683	3261691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
51540	NC_009381	GCTGG	2	10	3261705	3261714	0 %	20 %	60 %	20 %	145600135
51541	NC_009381	ACC	2	6	3261731	3261736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600135
51542	NC_009381	GAG	2	6	3261767	3261772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145600135
51543	NC_009381	TAA	2	6	3261790	3261795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145600135
51544	NC_009381	AATC	2	8	3261820	3261827	50 %	25 %	0 %	25 %	145600135
51545	NC_009381	CTA	2	6	3261894	3261899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600135
51546	NC_009381	CCAT	2	8	3261956	3261963	25 %	25 %	0 %	50 %	145600135
51547	NC_009381	TTA	2	6	3261981	3261986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
51548	NC_009381	C	6	6	3261987	3261992	0 %	0 %	0 %	100 %	145600135
51549	NC_009381	ATG	2	6	3262012	3262017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600135
51550	NC_009381	TTC	2	6	3262135	3262140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145600135
51551	NC_009381	AATG	2	8	3262176	3262183	50 %	25 %	25 %	0 %	145600135
51552	NC_009381	GAA	2	6	3262260	3262265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145600135
51553	NC_009381	AAT	2	6	3262271	3262276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145600135
51554	NC_009381	CGG	2	6	3262294	3262299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145600135
51555	NC_009381	CCAA	2	8	3262305	3262312	50 %	0 %	0 %	50 %	145600135
51556	NC_009381	TTA	2	6	3262323	3262328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
51557	NC_009381	GAA	2	6	3262371	3262376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145600135
51558	NC_009381	TGT	2	6	3262406	3262411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145600135
51559	NC_009381	TAT	2	6	3262423	3262428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
51560	NC_009381	ATT	2	6	3262541	3262546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
51561	NC_009381	TAT	2	6	3262610	3262615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
51562	NC_009381	AT	3	6	3262618	3262623	50 %	50 %	0 %	0 %	145600135
51563	NC_009381	TAT	2	6	3262714	3262719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
51564	NC_009381	CCA	2	6	3262734	3262739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600135
51565	NC_009381	TAG	2	6	3262762	3262767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600135
51566	NC_009381	TCA	2	6	3262819	3262824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600135
51567	NC_009381	CAT	2	6	3262831	3262836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600135
51568	NC_009381	CATT	2	8	3262852	3262859	25 %	50 %	0 %	25 %	145600135
51569	NC_009381	TTG	2	6	3262866	3262871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145600135
51570	NC_009381	TTA	2	6	3262887	3262892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
51571	NC_009381	TTAAA	2	10	3262921	3262930	60 %	40 %	0 %	0 %	145600135
51572	NC_009381	TAT	2	6	3262946	3262951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
51573	NC_009381	AG	3	6	3263010	3263015	50 %	0 %	50 %	0 %	145600135
51574	NC_009381	ACC	2	6	3263021	3263026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600135
51575	NC_009381	TAC	2	6	3263047	3263052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600135
51576	NC_009381	GTC	2	6	3263103	3263108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600135
51577	NC_009381	A	6	6	3263238	3263243	100 %	0 %	0 %	0 %	145600135
51578	NC_009381	ATT	2	6	3263300	3263305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
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51581	NC_009381	ATATT	2	10	3263434	3263443	40 %	60 %	0 %	0 %	145600135
51582	NC_009381	TTG	2	6	3263458	3263463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145600135
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51584	NC_009381	ATT	2	6	3263546	3263551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
51585	NC_009381	AT	3	6	3263554	3263559	50 %	50 %	0 %	0 %	145600135
51586	NC_009381	CAT	2	6	3263707	3263712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600135
51587	NC_009381	CGCC	2	8	3263715	3263722	0 %	0 %	25 %	75 %	145600135
51588	NC_009381	TAT	3	9	3263743	3263751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
51589	NC_009381	A	6	6	3263769	3263774	100 %	0 %	0 %	0 %	145600135
51590	NC_009381	TAA	2	6	3263786	3263791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145600135
51591	NC_009381	TAT	2	6	3263800	3263805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
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51593	NC_009381	ATTTAA	2	12	3263849	3263860	50 %	50 %	0 %	0 %	145600135
51594	NC_009381	ATT	3	9	3263882	3263890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
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51598	NC_009381	TAC	2	6	3264052	3264057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600135
51599	NC_009381	A	7	7	3264109	3264115	100 %	0 %	0 %	0 %	145600135
51600	NC_009381	CAC	2	6	3264160	3264165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600135
51601	NC_009381	TCC	2	6	3264368	3264373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145600135
51602	NC_009381	CAC	2	6	3264422	3264427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600135
51603	NC_009381	TCTGA	2	10	3264440	3264449	20 %	40 %	20 %	20 %	145600135
51604	NC_009381	C	9	9	3264468	3264476	0 %	0 %	0 %	100 %	145600135
51605	NC_009381	CAA	2	6	3264553	3264558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145600135
51606	NC_009381	TCC	2	6	3264566	3264571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145600135
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51608	NC_009381	CAC	2	6	3264625	3264630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600135
51609	NC_009381	TAT	2	6	3264691	3264696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600135
51610	NC_009381	CCA	2	6	3264771	3264776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600135
51611	NC_009381	GCA	2	6	3264789	3264794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145600135
51612	NC_009381	TAA	2	6	3264821	3264826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145600135
51613	NC_009381	GTG	2	6	3264891	3264896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145600135
51614	NC_009381	CCA	2	6	3264931	3264936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600135
51615	NC_009381	AT	3	6	3264942	3264947	50 %	50 %	0 %	0 %	145600135
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51617	NC_009381	C	7	7	3265000	3265006	0 %	0 %	0 %	100 %	145600135
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51736	NC_009381	GTT	2	6	3271792	3271797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145600140
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51739	NC_009381	CTG	2	6	3272003	3272008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600140
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51750	NC_009381	CAC	2	6	3272974	3272979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600142
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