MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_009381	TGTT	2	8	3161320	3161327	0 %	75 %	25 %	0 %	145600047
50002	NC_009381	TAA	2	6	3161335	3161340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145600047
50003	NC_009381	TCA	2	6	3161353	3161358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600047
50004	NC_009381	TCTGC	2	10	3161366	3161375	0 %	40 %	20 %	40 %	145600047
50005	NC_009381	GTT	2	6	3161417	3161422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145600047
50006	NC_009381	GCA	2	6	3161459	3161464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145600047
50007	NC_009381	CTG	2	6	3161511	3161516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600047
50008	NC_009381	TCA	2	6	3161644	3161649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600047
50009	NC_009381	TTG	2	6	3161695	3161700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145600047
50010	NC_009381	CTG	2	6	3161718	3161723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600047
50011	NC_009381	TTG	2	6	3161784	3161789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145600047
50012	NC_009381	CCA	2	6	3161878	3161883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600047
50013	NC_009381	ACA	2	6	3161918	3161923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145600047
50014	NC_009381	ACG	2	6	3161950	3161955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145600047
50015	NC_009381	TTA	2	6	3161956	3161961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145600047
50016	NC_009381	CG	3	6	3161967	3161972	0 %	0 %	50 %	50 %	145600047
50017	NC_009381	CAT	2	6	3161982	3161987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600047
50018	NC_009381	TTAC	2	8	3162285	3162292	25 %	50 %	0 %	25 %	145600048
50019	NC_009381	CA	3	6	3162567	3162572	50 %	0 %	0 %	50 %	145600048
50020	NC_009381	ACCA	2	8	3163134	3163141	50 %	0 %	0 %	50 %	145600049
50021	NC_009381	CAT	2	6	3163148	3163153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600049
50022	NC_009381	CTT	2	6	3163157	3163162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145600049
50023	NC_009381	TAA	2	6	3163184	3163189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145600049
50024	NC_009381	ACGC	2	8	3163199	3163206	25 %	0 %	25 %	50 %	145600049
50025	NC_009381	CTGG	2	8	3163503	3163510	0 %	25 %	50 %	25 %	145600050
50026	NC_009381	CAT	2	6	3163548	3163553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600050
50027	NC_009381	ATC	2	6	3163627	3163632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600050
50028	NC_009381	CAC	2	6	3163656	3163661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600050
50029	NC_009381	CGCACG	2	12	3163897	3163908	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	145600050
50030	NC_009381	GCC	2	6	3163922	3163927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145600050
50031	NC_009381	AGTA	2	8	3164008	3164015	50 %	25 %	25 %	0 %	145600050
50032	NC_009381	CAC	2	6	3164019	3164024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600050
50033	NC_009381	CAG	2	6	3164164	3164169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145600050
50034	NC_009381	T	6	6	3164171	3164176	0 %	100 %	0 %	0 %	145600050
50035	NC_009381	GTA	2	6	3164239	3164244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600050
50036	NC_009381	GAT	2	6	3164248	3164253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600050
50037	NC_009381	TCA	2	6	3164270	3164275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600050
50038	NC_009381	GCA	2	6	3164322	3164327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145600050
50039	NC_009381	ACATC	2	10	3164442	3164451	40 %	20 %	0 %	40 %	145600050
50040	NC_009381	GA	3	6	3164453	3164458	50 %	0 %	50 %	0 %	145600050
50041	NC_009381	TCT	2	6	3164616	3164621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145600050
50042	NC_009381	TCA	2	6	3164681	3164686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600050
50043	NC_009381	CACCC	2	10	3164689	3164698	20 %	0 %	0 %	80 %	145600050
50044	NC_009381	GGC	2	6	3164718	3164723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145600050
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50047	NC_009381	CCAA	2	8	3164777	3164784	50 %	0 %	0 %	50 %	145600050
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50049	NC_009381	T	6	6	3164911	3164916	0 %	100 %	0 %	0 %	145600050
50050	NC_009381	TGC	2	6	3164922	3164927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600050
50051	NC_009381	CAT	2	6	3165001	3165006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600050
50052	NC_009381	T	6	6	3165033	3165038	0 %	100 %	0 %	0 %	145600050
50053	NC_009381	TTCT	2	8	3165124	3165131	0 %	75 %	0 %	25 %	145600050
50054	NC_009381	T	6	6	3165187	3165192	0 %	100 %	0 %	0 %	145600050
50055	NC_009381	CAT	2	6	3165244	3165249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600050
50056	NC_009381	CAT	2	6	3165360	3165365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600050
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50058	NC_009381	T	7	7	3165402	3165408	0 %	100 %	0 %	0 %	145600050
50059	NC_009381	CTT	2	6	3165459	3165464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145600050
50060	NC_009381	ATC	2	6	3165472	3165477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600050
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50064	NC_009381	TCG	2	6	3165659	3165664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600050
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50066	NC_009381	CAA	2	6	3165750	3165755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145600050
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50082	NC_009381	GTA	2	6	3166811	3166816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600051
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50089	NC_009381	AAT	2	6	3167166	3167171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145600051
50090	NC_009381	CAG	2	6	3167271	3167276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145600051
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50100	NC_009381	TCA	2	6	3168620	3168625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600053
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50107	NC_009381	CAG	2	6	3168855	3168860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145600053
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50112	NC_009381	GAC	2	6	3168956	3168961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145600053
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50116	NC_009381	TTC	2	6	3169275	3169280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145600053
50117	NC_009381	CTT	2	6	3169304	3169309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145600053
50118	NC_009381	TTC	2	6	3169377	3169382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145600053
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50120	NC_009381	TGC	2	6	3169431	3169436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600053
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50144	NC_009381	A	6	6	3171468	3171473	100 %	0 %	0 %	0 %	145600055
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50202	NC_009381	ATC	2	6	3174887	3174892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600058
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50207	NC_009381	AC	3	6	3175519	3175524	50 %	0 %	0 %	50 %	145600058
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50212	NC_009381	CAT	2	6	3175781	3175786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600059
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50217	NC_009381	TGA	2	6	3175918	3175923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600059
50218	NC_009381	CT	3	6	3175979	3175984	0 %	50 %	0 %	50 %	145600059
50219	NC_009381	GTG	2	6	3176010	3176015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145600059
50220	NC_009381	TTAA	2	8	3176016	3176023	50 %	50 %	0 %	0 %	145600059
50221	NC_009381	TC	3	6	3176026	3176031	0 %	50 %	0 %	50 %	145600059
50222	NC_009381	CTGG	2	8	3176056	3176063	0 %	25 %	50 %	25 %	145600059
50223	NC_009381	CAC	2	6	3176074	3176079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145600059
50224	NC_009381	ACT	2	6	3176116	3176121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145600059
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50229	NC_009381	ATG	3	9	3176367	3176375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145600059
50230	NC_009381	TCT	2	6	3176443	3176448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145600059
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50232	NC_009381	CTT	2	6	3176555	3176560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145600059
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50467	NC_009381	GAAA	2	8	3191367	3191374	75 %	0 %	25 %	0 %	145600075
50468	NC_009381	TGC	2	6	3191399	3191404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145600075
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