MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua chromosome

Total Repeats: 76244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008150	T	7	7	258642	258648	0 %	100 %	0 %	0 %	162100187
4002	NC_008150	CAG	2	6	258667	258672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162100187
4003	NC_008150	GCG	2	6	258714	258719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162100187
4004	NC_008150	TGG	2	6	258744	258749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162100187
4005	NC_008150	AAC	2	6	258752	258757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162100187
4006	NC_008150	TGA	2	6	258782	258787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162100187
4007	NC_008150	TGC	2	6	258800	258805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162100187
4008	NC_008150	CAA	2	6	258868	258873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162100187
4009	NC_008150	GAA	2	6	258880	258885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162100187
4010	NC_008150	TTGC	2	8	258997	259004	0 %	50 %	25 %	25 %	162100187
4011	NC_008150	GCGGT	2	10	259012	259021	0 %	20 %	60 %	20 %	162100187
4012	NC_008150	TGG	2	6	259032	259037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162100187
4013	NC_008150	ATG	2	6	259269	259274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806219
4014	NC_008150	TAA	2	6	259286	259291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806219
4015	NC_008150	GTTC	2	8	259317	259324	0 %	50 %	25 %	25 %	108806219
4016	NC_008150	T	6	6	259331	259336	0 %	100 %	0 %	0 %	108806219
4017	NC_008150	CAG	2	6	259339	259344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806219
4018	NC_008150	TAA	2	6	259364	259369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806219
4019	NC_008150	A	6	6	259457	259462	100 %	0 %	0 %	0 %	108806219
4020	NC_008150	A	7	7	259501	259507	100 %	0 %	0 %	0 %	108806219
4021	NC_008150	AG	3	6	259551	259556	50 %	0 %	50 %	0 %	108806219
4022	NC_008150	AGCT	2	8	259559	259566	25 %	25 %	25 %	25 %	108806219
4023	NC_008150	CCCA	2	8	259635	259642	25 %	0 %	0 %	75 %	108806219
4024	NC_008150	A	6	6	259680	259685	100 %	0 %	0 %	0 %	108806219
4025	NC_008150	TAC	2	6	259715	259720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806219
4026	NC_008150	GGT	2	6	259899	259904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806220
4027	NC_008150	CGC	3	9	259952	259960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806220
4028	NC_008150	TGA	2	6	260057	260062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806220
4029	NC_008150	ACT	2	6	260100	260105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806220
4030	NC_008150	TGCA	2	8	260214	260221	25 %	25 %	25 %	25 %	108806220
4031	NC_008150	AT	3	6	260314	260319	50 %	50 %	0 %	0 %	108806220
4032	NC_008150	TGT	2	6	260343	260348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806220
4033	NC_008150	TGAT	2	8	260376	260383	25 %	50 %	25 %	0 %	108806220
4034	NC_008150	C	7	7	260441	260447	0 %	0 %	0 %	100 %	108806220
4035	NC_008150	TGG	2	6	260450	260455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806220
4036	NC_008150	AATC	2	8	260564	260571	50 %	25 %	0 %	25 %	108806220
4037	NC_008150	ATT	2	6	260676	260681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806220
4038	NC_008150	CGGT	2	8	260746	260753	0 %	25 %	50 %	25 %	108806220
4039	NC_008150	AAAT	2	8	260757	260764	75 %	25 %	0 %	0 %	108806220
4040	NC_008150	TAT	2	6	260801	260806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806220
4041	NC_008150	TAA	2	6	260811	260816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806220
4042	NC_008150	TGG	2	6	260876	260881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806220
4043	NC_008150	GTTT	2	8	260933	260940	0 %	75 %	25 %	0 %	108806220
4044	NC_008150	T	6	6	260938	260943	0 %	100 %	0 %	0 %	108806220
4045	NC_008150	GGT	3	9	261282	261290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806221
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4047	NC_008150	CCG	2	6	261380	261385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806221
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4051	NC_008150	AGCAAT	2	12	261664	261675	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	108806221
4052	NC_008150	ACCG	2	8	261840	261847	25 %	0 %	25 %	50 %	108806222
4053	NC_008150	GT	3	6	261955	261960	0 %	50 %	50 %	0 %	108806222
4054	NC_008150	TGT	2	6	261968	261973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806222
4055	NC_008150	TAT	2	6	262035	262040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806222
4056	NC_008150	GGT	2	6	262056	262061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806222
4057	NC_008150	GCT	3	9	262185	262193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806222
4058	NC_008150	AT	3	6	262268	262273	50 %	50 %	0 %	0 %	108806222
4059	NC_008150	CAG	2	6	262275	262280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806222
4060	NC_008150	ACC	2	6	262304	262309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806222
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4062	NC_008150	GTT	2	6	262429	262434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806223
4063	NC_008150	GCG	2	6	262488	262493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806223
4064	NC_008150	GCT	2	6	262510	262515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806223
4065	NC_008150	GCC	3	9	262599	262607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806223
4066	NC_008150	ATG	2	6	262616	262621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806223
4067	NC_008150	ACTTT	2	10	262665	262674	20 %	60 %	0 %	20 %	108806223
4068	NC_008150	TCC	2	6	262677	262682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108806223
4069	NC_008150	GA	3	6	262834	262839	50 %	0 %	50 %	0 %	108806223
4070	NC_008150	CGC	2	6	262924	262929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806223
4071	NC_008150	AGCA	2	8	262991	262998	50 %	0 %	25 %	25 %	108806223
4072	NC_008150	A	6	6	263322	263327	100 %	0 %	0 %	0 %	108806224
4073	NC_008150	CATATC	2	12	263374	263385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806224
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4075	NC_008150	CCA	2	6	263453	263458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806224
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4081	NC_008150	C	6	6	263652	263657	0 %	0 %	0 %	100 %	108806224
4082	NC_008150	CCG	2	6	263681	263686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806224
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4087	NC_008150	ATTGA	2	10	263983	263992	40 %	40 %	20 %	0 %	108806224
4088	NC_008150	TTG	2	6	264113	264118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806224
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4093	NC_008150	ACCA	2	8	264363	264370	50 %	0 %	0 %	50 %	108806224
4094	NC_008150	TGGTT	2	10	264399	264408	0 %	60 %	40 %	0 %	108806224
4095	NC_008150	ATCT	2	8	264487	264494	25 %	50 %	0 %	25 %	108806224
4096	NC_008150	GCG	2	6	264520	264525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806224
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4103	NC_008150	TC	3	6	265140	265145	0 %	50 %	0 %	50 %	108806224
4104	NC_008150	AATAA	2	10	265148	265157	80 %	20 %	0 %	0 %	108806224
4105	NC_008150	TTC	2	6	265162	265167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806224
4106	NC_008150	ATT	2	6	265174	265179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806224
4107	NC_008150	TTG	2	6	265192	265197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806224
4108	NC_008150	GTT	3	9	265209	265217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806224
4109	NC_008150	CTT	2	6	265218	265223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806224
4110	NC_008150	TAA	2	6	265270	265275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806224
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4112	NC_008150	GAGC	2	8	265350	265357	25 %	0 %	50 %	25 %	108806224
4113	NC_008150	AAT	2	6	265407	265412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806224
4114	NC_008150	CAC	2	6	265733	265738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806225
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4119	NC_008150	GTT	2	6	265943	265948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806225
4120	NC_008150	CAT	2	6	265991	265996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806225
4121	NC_008150	ATTTT	2	10	266018	266027	20 %	80 %	0 %	0 %	108806225
4122	NC_008150	ATC	2	6	266040	266045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806225
4123	NC_008150	CT	3	6	266048	266053	0 %	50 %	0 %	50 %	108806225
4124	NC_008150	GA	3	6	266064	266069	50 %	0 %	50 %	0 %	108806225
4125	NC_008150	AAT	2	6	266070	266075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806225
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4246	NC_008150	TGA	2	6	273587	273592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806232
4247	NC_008150	TGC	2	6	273623	273628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806232
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4249	NC_008150	TGG	2	6	273724	273729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806232
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4251	NC_008150	TGT	2	6	273855	273860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806232
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4365	NC_008150	CTTGG	2	10	281494	281503	0 %	40 %	40 %	20 %	108806238
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4489	NC_008150	ACA	2	6	288133	288138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806243
4490	NC_008150	CAA	2	6	288176	288181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806243
4491	NC_008150	ATT	2	6	288537	288542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806244
4492	NC_008150	TCG	2	6	288557	288562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806244
4493	NC_008150	ACAA	2	8	288577	288584	75 %	0 %	0 %	25 %	108806244
4494	NC_008150	A	6	6	288631	288636	100 %	0 %	0 %	0 %	108806244
4495	NC_008150	GAT	2	6	288646	288651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806244
4496	NC_008150	CAA	2	6	288665	288670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806244
4497	NC_008150	ATG	2	6	288689	288694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806244
4498	NC_008150	AGC	3	9	288722	288730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806244
4499	NC_008150	GAA	2	6	288745	288750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806244
4500	NC_008150	TGGTC	2	10	288828	288837	0 %	40 %	40 %	20 %	108806245

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