MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua chromosome

Total Repeats: 76244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008150	GGCT	2	8	196518	196525	0 %	25 %	50 %	25 %	108806160
3002	NC_008150	TGG	2	6	196551	196556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806160
3003	NC_008150	G	8	8	196561	196568	0 %	0 %	100 %	0 %	108806160
3004	NC_008150	TTG	2	6	196593	196598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806160
3005	NC_008150	ATC	2	6	196607	196612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806160
3006	NC_008150	CAAGG	2	10	196637	196646	40 %	0 %	40 %	20 %	108806160
3007	NC_008150	GCG	2	6	196667	196672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806160
3008	NC_008150	TTG	2	6	196802	196807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806160
3009	NC_008150	GTT	2	6	196813	196818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806160
3010	NC_008150	CGG	2	6	196824	196829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806160
3011	NC_008150	ATC	2	6	196988	196993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806161
3012	NC_008150	TGG	2	6	197027	197032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806161
3013	NC_008150	GAT	2	6	197065	197070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806161
3014	NC_008150	TG	3	6	197078	197083	0 %	50 %	50 %	0 %	108806161
3015	NC_008150	CCG	2	6	197142	197147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806161
3016	NC_008150	GC	3	6	197211	197216	0 %	0 %	50 %	50 %	108806161
3017	NC_008150	GCA	2	6	197220	197225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806161
3018	NC_008150	TTGG	2	8	197242	197249	0 %	50 %	50 %	0 %	108806161
3019	NC_008150	AGC	2	6	197345	197350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806161
3020	NC_008150	GCC	2	6	197374	197379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806161
3021	NC_008150	GTG	2	6	197381	197386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806161
3022	NC_008150	GGC	2	6	197482	197487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806161
3023	NC_008150	TCG	2	6	197589	197594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806161
3024	NC_008150	GCT	2	6	197604	197609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806161
3025	NC_008150	TTA	3	9	197622	197630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806161
3026	NC_008150	GTC	2	6	197636	197641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806161
3027	NC_008150	A	6	6	198188	198193	100 %	0 %	0 %	0 %	108806162
3028	NC_008150	TTAT	2	8	198263	198270	25 %	75 %	0 %	0 %	108806162
3029	NC_008150	AGCA	2	8	198277	198284	50 %	0 %	25 %	25 %	108806162
3030	NC_008150	TTC	2	6	198344	198349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806162
3031	NC_008150	GC	3	6	198355	198360	0 %	0 %	50 %	50 %	108806162
3032	NC_008150	ACG	2	6	198650	198655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806162
3033	NC_008150	TGA	2	6	198663	198668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806162
3034	NC_008150	TTGG	2	8	198671	198678	0 %	50 %	50 %	0 %	108806162
3035	NC_008150	T	6	6	198692	198697	0 %	100 %	0 %	0 %	108806162
3036	NC_008150	G	6	6	198764	198769	0 %	0 %	100 %	0 %	108806162
3037	NC_008150	CGG	2	6	198840	198845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806162
3038	NC_008150	AAG	2	6	198874	198879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806162
3039	NC_008150	CAA	2	6	198886	198891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806162
3040	NC_008150	TTGTCA	2	12	198933	198944	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	108806162
3041	NC_008150	CGG	2	6	199023	199028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806162
3042	NC_008150	TAT	2	6	199030	199035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806162
3043	NC_008150	CCG	2	6	199053	199058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806162
3044	NC_008150	CT	3	6	199059	199064	0 %	50 %	0 %	50 %	108806162
3045	NC_008150	GTAT	2	8	199080	199087	25 %	50 %	25 %	0 %	108806162
3046	NC_008150	GCG	2	6	199089	199094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806162
3047	NC_008150	TGT	2	6	199101	199106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806162
3048	NC_008150	A	6	6	199117	199122	100 %	0 %	0 %	0 %	108806162
3049	NC_008150	CCGG	2	8	199133	199140	0 %	0 %	50 %	50 %	108806162
3050	NC_008150	TGG	2	6	199206	199211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806162
3051	NC_008150	ATT	2	6	199229	199234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806162
3052	NC_008150	GCA	2	6	199243	199248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806162
3053	NC_008150	GTTT	2	8	199252	199259	0 %	75 %	25 %	0 %	108806162
3054	NC_008150	TGGTCT	2	12	199305	199316	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	108806162
3055	NC_008150	CAG	2	6	199355	199360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806162
3056	NC_008150	GCC	2	6	201201	201206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806163
3057	NC_008150	CGC	2	6	201215	201220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806163
3058	NC_008150	CTG	2	6	201224	201229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806163
3059	NC_008150	TCGC	2	8	201314	201321	0 %	25 %	25 %	50 %	108806163
3060	NC_008150	CATT	2	8	201368	201375	25 %	50 %	0 %	25 %	108806163
3061	NC_008150	TC	4	8	201379	201386	0 %	50 %	0 %	50 %	108806163
3062	NC_008150	CAGGAG	2	12	201394	201405	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	108806163
3063	NC_008150	GTTCG	2	10	201412	201421	0 %	40 %	40 %	20 %	108806163
3064	NC_008150	GAC	2	6	201434	201439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806163
3065	NC_008150	CTT	2	6	201591	201596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806163
3066	NC_008150	TGG	2	6	201597	201602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806163
3067	NC_008150	CG	3	6	201608	201613	0 %	0 %	50 %	50 %	108806163
3068	NC_008150	TC	3	6	201722	201727	0 %	50 %	0 %	50 %	108806163
3069	NC_008150	AAGGT	2	10	201761	201770	40 %	20 %	40 %	0 %	108806163
3070	NC_008150	GCTG	2	8	201881	201888	0 %	25 %	50 %	25 %	108806163
3071	NC_008150	AGC	2	6	201956	201961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806163
3072	NC_008150	A	6	6	201988	201993	100 %	0 %	0 %	0 %	108806163
3073	NC_008150	TGA	2	6	202011	202016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806163
3074	NC_008150	CAT	2	6	202048	202053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806163
3075	NC_008150	TGA	2	6	202093	202098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806163
3076	NC_008150	AGCGC	2	10	202161	202170	20 %	0 %	40 %	40 %	108806164
3077	NC_008150	GAA	2	6	202239	202244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806164
3078	NC_008150	TCA	2	6	202256	202261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806164
3079	NC_008150	CGG	2	6	202300	202305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806164
3080	NC_008150	CTCA	2	8	202376	202383	25 %	25 %	0 %	50 %	108806164
3081	NC_008150	CAG	3	9	202504	202512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806164
3082	NC_008150	ACG	2	6	202560	202565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806164
3083	NC_008150	C	6	6	202585	202590	0 %	0 %	0 %	100 %	108806164
3084	NC_008150	TCA	2	6	202597	202602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806164
3085	NC_008150	TGA	2	6	202604	202609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806164
3086	NC_008150	TCAG	2	8	202627	202634	25 %	25 %	25 %	25 %	108806164
3087	NC_008150	GAA	2	6	202635	202640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806164
3088	NC_008150	TTC	2	6	202650	202655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806164
3089	NC_008150	GCA	2	6	202746	202751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806164
3090	NC_008150	TCAAA	2	10	202799	202808	60 %	20 %	0 %	20 %	108806164
3091	NC_008150	CAGA	2	8	202826	202833	50 %	0 %	25 %	25 %	108806164
3092	NC_008150	TGG	2	6	202899	202904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806165
3093	NC_008150	CGT	2	6	202930	202935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806165
3094	NC_008150	CAA	2	6	203000	203005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806165
3095	NC_008150	TG	3	6	203197	203202	0 %	50 %	50 %	0 %	108806166
3096	NC_008150	GTAA	2	8	203477	203484	50 %	25 %	25 %	0 %	108806166
3097	NC_008150	GAT	2	6	203702	203707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806167
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3099	NC_008150	ACG	2	6	203743	203748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806167
3100	NC_008150	GCCA	2	8	203795	203802	25 %	0 %	25 %	50 %	108806167
3101	NC_008150	GCT	2	6	203837	203842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806167
3102	NC_008150	TGC	2	6	203927	203932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806167
3103	NC_008150	TCA	2	6	204011	204016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806167
3104	NC_008150	CAT	2	6	204057	204062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806167
3105	NC_008150	ATC	2	6	204064	204069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806167
3106	NC_008150	CCA	2	6	204142	204147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806167
3107	NC_008150	ATG	2	6	204191	204196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806167
3108	NC_008150	TTG	2	6	204208	204213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806167
3109	NC_008150	CTT	2	6	204228	204233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806167
3110	NC_008150	CAA	2	6	204358	204363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806167
3111	NC_008150	GGCG	2	8	204378	204385	0 %	0 %	75 %	25 %	108806167
3112	NC_008150	CG	3	6	204466	204471	0 %	0 %	50 %	50 %	108806167
3113	NC_008150	ATTG	2	8	204480	204487	25 %	50 %	25 %	0 %	108806167
3114	NC_008150	GGC	2	6	204514	204519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806167
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3117	NC_008150	GAG	2	6	204577	204582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108806167
3118	NC_008150	CAGC	2	8	204609	204616	25 %	0 %	25 %	50 %	108806167
3119	NC_008150	CGC	2	6	204625	204630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806167
3120	NC_008150	GTA	2	6	204711	204716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806167
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3122	NC_008150	AAAG	2	8	204730	204737	75 %	0 %	25 %	0 %	108806167
3123	NC_008150	CCA	2	6	204738	204743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806167
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3234	NC_008150	GCCA	2	8	211165	211172	25 %	0 %	25 %	50 %	108806173
3235	NC_008150	TGC	2	6	211211	211216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806173
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3239	NC_008150	A	6	6	211507	211512	100 %	0 %	0 %	0 %	108806174
3240	NC_008150	ATG	2	6	211537	211542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806174
3241	NC_008150	ACTTGC	2	12	211545	211556	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	108806174
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3243	NC_008150	CAG	2	6	211639	211644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806174
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3354	NC_008150	GCCAA	2	10	217917	217926	40 %	0 %	20 %	40 %	108806180
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3367	NC_008150	GAT	2	6	219007	219012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806181
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3486	NC_008150	T	6	6	226988	226993	0 %	100 %	0 %	0 %	108806188
3487	NC_008150	GCC	2	6	227006	227011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806188
3488	NC_008150	GTG	2	6	227022	227027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806188
3489	NC_008150	GAT	2	6	227032	227037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806188
3490	NC_008150	TGGCT	2	10	227118	227127	0 %	40 %	40 %	20 %	108806188
3491	NC_008150	ATT	2	6	227135	227140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806188
3492	NC_008150	CGG	2	6	227146	227151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806188
3493	NC_008150	ATG	2	6	227208	227213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806188
3494	NC_008150	GAA	2	6	227219	227224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806188
3495	NC_008150	GTC	2	6	227234	227239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806188
3496	NC_008150	TGCC	2	8	227241	227248	0 %	25 %	25 %	50 %	108806188
3497	NC_008150	CTG	2	6	227273	227278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806188
3498	NC_008150	TGA	2	6	227341	227346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806188
3499	NC_008150	GC	3	6	227360	227365	0 %	0 %	50 %	50 %	108806188
3500	NC_008150	GTT	2	6	227371	227376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806188

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