MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua chromosome

Total Repeats: 76244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008150	TTC	2	6	127048	127053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806104
2002	NC_008150	GCA	2	6	127074	127079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806104
2003	NC_008150	GTTT	2	8	127209	127216	0 %	75 %	25 %	0 %	108806104
2004	NC_008150	T	6	6	127230	127235	0 %	100 %	0 %	0 %	108806104
2005	NC_008150	CAAC	2	8	127305	127312	50 %	0 %	0 %	50 %	108806104
2006	NC_008150	AC	4	8	127419	127426	50 %	0 %	0 %	50 %	108806104
2007	NC_008150	GTT	2	6	127446	127451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806104
2008	NC_008150	GAA	2	6	127493	127498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806104
2009	NC_008150	TTA	2	6	127544	127549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806104
2010	NC_008150	TCG	2	6	127559	127564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806104
2011	NC_008150	GTT	2	6	127565	127570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806104
2012	NC_008150	T	6	6	127621	127626	0 %	100 %	0 %	0 %	108806104
2013	NC_008150	CTT	2	6	127629	127634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806104
2014	NC_008150	GCC	2	6	127854	127859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806105
2015	NC_008150	TGTCA	2	10	127866	127875	20 %	40 %	20 %	20 %	108806105
2016	NC_008150	TGT	2	6	127930	127935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806105
2017	NC_008150	GTT	2	6	127958	127963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806105
2018	NC_008150	TGG	2	6	127984	127989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806105
2019	NC_008150	ATT	2	6	128118	128123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806105
2020	NC_008150	TGC	2	6	128128	128133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806105
2021	NC_008150	ATC	2	6	128308	128313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806105
2022	NC_008150	GA	3	6	128356	128361	50 %	0 %	50 %	0 %	108806105
2023	NC_008150	AAC	2	6	128641	128646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806105
2024	NC_008150	CAT	2	6	128689	128694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806105
2025	NC_008150	GTA	2	6	128764	128769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806106
2026	NC_008150	CAG	2	6	128840	128845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806106
2027	NC_008150	ATCC	2	8	128919	128926	25 %	25 %	0 %	50 %	108806106
2028	NC_008150	CAA	2	6	128927	128932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806106
2029	NC_008150	GCA	2	6	129106	129111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806106
2030	NC_008150	ATCAC	2	10	129157	129166	40 %	20 %	0 %	40 %	108806106
2031	NC_008150	CCGT	2	8	129349	129356	0 %	25 %	25 %	50 %	108806106
2032	NC_008150	TTC	2	6	129378	129383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806106
2033	NC_008150	AG	3	6	129423	129428	50 %	0 %	50 %	0 %	108806106
2034	NC_008150	ATAA	2	8	129549	129556	75 %	25 %	0 %	0 %	108806106
2035	NC_008150	TAA	2	6	129812	129817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806106
2036	NC_008150	ATA	2	6	129904	129909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806106
2037	NC_008150	CCAC	2	8	129967	129974	25 %	0 %	0 %	75 %	108806106
2038	NC_008150	ATT	2	6	129975	129980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806106
2039	NC_008150	CTTG	2	8	130010	130017	0 %	50 %	25 %	25 %	108806106
2040	NC_008150	CAA	2	6	130327	130332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806107
2041	NC_008150	TCG	2	6	130344	130349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806107
2042	NC_008150	GCG	2	6	130363	130368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806107
2043	NC_008150	CTT	2	6	130448	130453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806107
2044	NC_008150	CGA	2	6	130476	130481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806107
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2046	NC_008150	CAA	2	6	130611	130616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806107
2047	NC_008150	CGTTT	2	10	130625	130634	0 %	60 %	20 %	20 %	108806107
2048	NC_008150	GCT	2	6	130635	130640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806107
2049	NC_008150	CCG	2	6	130661	130666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806107
2050	NC_008150	TGC	2	6	130674	130679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806107
2051	NC_008150	GTGCAG	2	12	130799	130810	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	108806107
2052	NC_008150	GCG	2	6	130836	130841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806107
2053	NC_008150	AGA	2	6	130848	130853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806107
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2055	NC_008150	TGC	2	6	130926	130931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806107
2056	NC_008150	TCT	2	6	130969	130974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806108
2057	NC_008150	CTA	2	6	130993	130998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806108
2058	NC_008150	ATTA	2	8	131004	131011	50 %	50 %	0 %	0 %	108806108
2059	NC_008150	ACT	2	6	131079	131084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806108
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2062	NC_008150	CAG	2	6	131516	131521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806109
2063	NC_008150	TGG	2	6	131538	131543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806109
2064	NC_008150	TG	4	8	131586	131593	0 %	50 %	50 %	0 %	108806109
2065	NC_008150	ATT	2	6	131837	131842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806109
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2067	NC_008150	ATATT	2	10	131850	131859	40 %	60 %	0 %	0 %	108806109
2068	NC_008150	CCG	2	6	132022	132027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806109
2069	NC_008150	ATC	2	6	132066	132071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806109
2070	NC_008150	TTTTAG	2	12	132124	132135	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	108806109
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2110	NC_008150	TA	4	8	135062	135069	50 %	50 %	0 %	0 %	162100189
2111	NC_008150	CAG	2	6	135155	135160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162100189
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2113	NC_008150	TC	3	6	135210	135215	0 %	50 %	0 %	50 %	162100189
2114	NC_008150	TGT	2	6	135247	135252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162100189
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2119	NC_008150	AGA	2	6	135550	135555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162100189
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2121	NC_008150	TCT	2	6	135635	135640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162100189
2122	NC_008150	TCT	2	6	135656	135661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162100189
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2232	NC_008150	GATG	2	8	148470	148477	25 %	25 %	50 %	0 %	108806117
2233	NC_008150	GGA	2	6	148482	148487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108806117
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2236	NC_008150	CCCG	2	8	149022	149029	0 %	0 %	25 %	75 %	108806118
2237	NC_008150	GCT	2	6	149062	149067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806118
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2240	NC_008150	ATA	2	6	149313	149318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806118
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2242	NC_008150	CGGGG	2	10	149425	149434	0 %	0 %	80 %	20 %	108806118
2243	NC_008150	GCC	3	9	149441	149449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806118
2244	NC_008150	GCA	2	6	149530	149535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806118
2245	NC_008150	CGC	2	6	149546	149551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806118
2246	NC_008150	CCT	2	6	149563	149568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108806118
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2248	NC_008150	CAG	2	6	149645	149650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806118
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2258	NC_008150	CTT	2	6	150157	150162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806118
2259	NC_008150	GTT	2	6	150168	150173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806118
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2352	NC_008150	GGT	2	6	157142	157147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806123
2353	NC_008150	TGA	2	6	157157	157162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806123
2354	NC_008150	TGGT	2	8	157192	157199	0 %	50 %	50 %	0 %	108806123
2355	NC_008150	GGC	2	6	157201	157206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806123
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2357	NC_008150	GGC	2	6	157355	157360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806123
2358	NC_008150	CTA	2	6	157415	157420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806123
2359	NC_008150	A	6	6	157643	157648	100 %	0 %	0 %	0 %	108806124
2360	NC_008150	TCA	2	6	157679	157684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806124
2361	NC_008150	T	6	6	157685	157690	0 %	100 %	0 %	0 %	108806124
2362	NC_008150	AT	3	6	157706	157711	50 %	50 %	0 %	0 %	108806124
2363	NC_008150	TTTC	2	8	157713	157720	0 %	75 %	0 %	25 %	108806124
2364	NC_008150	TCCT	2	8	157774	157781	0 %	50 %	0 %	50 %	108806124
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2489	NC_008150	GA	3	6	165725	165730	50 %	0 %	50 %	0 %	108806133
2490	NC_008150	CAT	2	6	165744	165749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806133
2491	NC_008150	GTG	2	6	165766	165771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806133
2492	NC_008150	ATG	2	6	165781	165786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806133
2493	NC_008150	ATTC	2	8	165828	165835	25 %	50 %	0 %	25 %	108806133
2494	NC_008150	GGA	2	6	165843	165848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108806133
2495	NC_008150	TTA	2	6	165908	165913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806134
2496	NC_008150	ATTTA	2	10	166007	166016	40 %	60 %	0 %	0 %	108806134
2497	NC_008150	AGA	2	6	166023	166028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806134
2498	NC_008150	GAT	2	6	166036	166041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806134
2499	NC_008150	A	7	7	166068	166074	100 %	0 %	0 %	0 %	108806134
2500	NC_008150	A	6	6	166105	166110	100 %	0 %	0 %	0 %	108806134

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