MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua chromosome

Total Repeats: 76244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008150	CGG	2	6	95279	95284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806074
1502	NC_008150	ATG	2	6	95289	95294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806074
1503	NC_008150	TGC	2	6	95299	95304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806074
1504	NC_008150	GTC	2	6	95358	95363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806074
1505	NC_008150	AGAT	2	8	95380	95387	50 %	25 %	25 %	0 %	108806074
1506	NC_008150	CCAG	2	8	95414	95421	25 %	0 %	25 %	50 %	108806074
1507	NC_008150	CAC	2	6	95440	95445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806074
1508	NC_008150	GCC	2	6	95465	95470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806074
1509	NC_008150	CAG	2	6	95579	95584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806075
1510	NC_008150	ACAT	2	8	95739	95746	50 %	25 %	0 %	25 %	108806075
1511	NC_008150	ATA	2	6	96116	96121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806076
1512	NC_008150	A	6	6	96126	96131	100 %	0 %	0 %	0 %	108806076
1513	NC_008150	CAAC	2	8	96195	96202	50 %	0 %	0 %	50 %	108806076
1514	NC_008150	GCC	2	6	96207	96212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806076
1515	NC_008150	ACC	2	6	96253	96258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806076
1516	NC_008150	AATG	2	8	96351	96358	50 %	25 %	25 %	0 %	108806076
1517	NC_008150	TGAT	2	8	96365	96372	25 %	50 %	25 %	0 %	108806076
1518	NC_008150	CAAG	2	8	96378	96385	50 %	0 %	25 %	25 %	108806076
1519	NC_008150	ACG	2	6	96412	96417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806076
1520	NC_008150	TGA	2	6	96432	96437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806076
1521	NC_008150	ATC	2	6	96442	96447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806076
1522	NC_008150	TAT	2	6	96513	96518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806076
1523	NC_008150	CAG	2	6	96632	96637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806076
1524	NC_008150	GCA	2	6	96642	96647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806076
1525	NC_008150	GCA	2	6	96675	96680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806076
1526	NC_008150	AAGA	2	8	96718	96725	75 %	0 %	25 %	0 %	108806077
1527	NC_008150	GCC	2	6	96805	96810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806077
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1529	NC_008150	TGA	2	6	96885	96890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806077
1530	NC_008150	CAC	2	6	96966	96971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806077
1531	NC_008150	CTT	2	6	97025	97030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806077
1532	NC_008150	GAC	2	6	97083	97088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806077
1533	NC_008150	TCAA	2	8	97111	97118	50 %	25 %	0 %	25 %	108806077
1534	NC_008150	CCAG	2	8	97184	97191	25 %	0 %	25 %	50 %	108806077
1535	NC_008150	AG	3	6	97239	97244	50 %	0 %	50 %	0 %	108806077
1536	NC_008150	GCC	2	6	97297	97302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806077
1537	NC_008150	GCC	2	6	97309	97314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806077
1538	NC_008150	ATC	2	6	97326	97331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806077
1539	NC_008150	GCCT	2	8	97389	97396	0 %	25 %	25 %	50 %	108806077
1540	NC_008150	CAT	2	6	97425	97430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806077
1541	NC_008150	CCT	2	6	97900	97905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108806078
1542	NC_008150	CTG	2	6	97938	97943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806078
1543	NC_008150	ACC	2	6	97970	97975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806078
1544	NC_008150	ATG	2	6	97991	97996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806078
1545	NC_008150	TAC	2	6	98006	98011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806078
1546	NC_008150	CAA	2	6	98075	98080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806078
1547	NC_008150	TGG	2	6	98097	98102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806078
1548	NC_008150	ACG	2	6	98163	98168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806078
1549	NC_008150	GA	3	6	98169	98174	50 %	0 %	50 %	0 %	108806078
1550	NC_008150	GAA	2	6	98263	98268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806078
1551	NC_008150	TGAT	2	8	98310	98317	25 %	50 %	25 %	0 %	108806078
1552	NC_008150	ATC	2	6	98354	98359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806078
1553	NC_008150	TGA	2	6	98436	98441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806078
1554	NC_008150	AAG	2	6	98501	98506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806078
1555	NC_008150	GTT	2	6	98543	98548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806078
1556	NC_008150	TTA	2	6	98608	98613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806078
1557	NC_008150	CAT	2	6	98641	98646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806078
1558	NC_008150	GT	3	6	98664	98669	0 %	50 %	50 %	0 %	108806078
1559	NC_008150	GCC	2	6	98687	98692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806078
1560	NC_008150	AAT	2	6	98792	98797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806078
1561	NC_008150	GGC	2	6	98875	98880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806078
1562	NC_008150	TGG	2	6	98895	98900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806078
1563	NC_008150	GC	3	6	99034	99039	0 %	0 %	50 %	50 %	108806078
1564	NC_008150	CCA	2	6	99138	99143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806078
1565	NC_008150	TTG	2	6	99147	99152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806078
1566	NC_008150	CGC	2	6	99184	99189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806078
1567	NC_008150	TCG	3	9	99216	99224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806078
1568	NC_008150	CCG	2	6	99267	99272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806078
1569	NC_008150	CAG	2	6	99298	99303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806078
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1571	NC_008150	CCA	2	6	99504	99509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806078
1572	NC_008150	CGA	2	6	99577	99582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806078
1573	NC_008150	AT	3	6	99604	99609	50 %	50 %	0 %	0 %	108806078
1574	NC_008150	GGTCA	2	10	99632	99641	20 %	20 %	40 %	20 %	108806078
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1588	NC_008150	GAT	2	6	100406	100411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806079
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1591	NC_008150	ACC	2	6	100523	100528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806079
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1593	NC_008150	AAT	2	6	100614	100619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806079
1594	NC_008150	CGG	2	6	100795	100800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806080
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1599	NC_008150	GGGAT	2	10	101016	101025	20 %	20 %	60 %	0 %	108806080
1600	NC_008150	CCTG	2	8	101036	101043	0 %	25 %	25 %	50 %	108806080
1601	NC_008150	CAT	2	6	101082	101087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806080
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1604	NC_008150	CG	3	6	101188	101193	0 %	0 %	50 %	50 %	108806080
1605	NC_008150	CAA	2	6	101254	101259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806080
1606	NC_008150	TGC	2	6	101300	101305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806080
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1609	NC_008150	GCT	2	6	101762	101767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806081
1610	NC_008150	A	6	6	101810	101815	100 %	0 %	0 %	0 %	108806081
1611	NC_008150	TGA	2	6	101819	101824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806081
1612	NC_008150	CA	3	6	101903	101908	50 %	0 %	0 %	50 %	108806081
1613	NC_008150	TGGA	2	8	101976	101983	25 %	25 %	50 %	0 %	108806081
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1616	NC_008150	TGC	2	6	102034	102039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806081
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1619	NC_008150	TTCC	2	8	102080	102087	0 %	50 %	0 %	50 %	108806081
1620	NC_008150	ACA	2	6	102136	102141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806081
1621	NC_008150	C	7	7	102155	102161	0 %	0 %	0 %	100 %	108806081
1622	NC_008150	GAC	2	6	102179	102184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806081
1623	NC_008150	ATA	2	6	102247	102252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806081
1624	NC_008150	TCG	2	6	102437	102442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806081
1625	NC_008150	ATG	2	6	102592	102597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806082
1626	NC_008150	TAC	2	6	102620	102625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806082
1627	NC_008150	AG	3	6	102759	102764	50 %	0 %	50 %	0 %	108806082
1628	NC_008150	AAC	2	6	102820	102825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806082
1629	NC_008150	CATC	2	8	102920	102927	25 %	25 %	0 %	50 %	108806082
1630	NC_008150	T	6	6	102964	102969	0 %	100 %	0 %	0 %	108806082
1631	NC_008150	GAT	2	6	103043	103048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806082
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1633	NC_008150	CA	3	6	103451	103456	50 %	0 %	0 %	50 %	108806083
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1639	NC_008150	TGA	2	6	104319	104324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806085
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1642	NC_008150	AATC	2	8	104476	104483	50 %	25 %	0 %	25 %	108806085
1643	NC_008150	CGA	2	6	104520	104525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806085
1644	NC_008150	ACTG	2	8	104648	104655	25 %	25 %	25 %	25 %	108806086
1645	NC_008150	CTG	2	6	104688	104693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806086
1646	NC_008150	CTG	2	6	104748	104753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806086
1647	NC_008150	ACTT	2	8	104802	104809	25 %	50 %	0 %	25 %	108806086
1648	NC_008150	CA	3	6	104827	104832	50 %	0 %	0 %	50 %	108806086
1649	NC_008150	CAC	2	6	104862	104867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806086
1650	NC_008150	ATC	2	6	104900	104905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806087
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1652	NC_008150	GTTT	2	8	105035	105042	0 %	75 %	25 %	0 %	108806087
1653	NC_008150	ATCG	2	8	105050	105057	25 %	25 %	25 %	25 %	108806087
1654	NC_008150	CGG	2	6	105132	105137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806087
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1656	NC_008150	ATT	2	6	105285	105290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806088
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1658	NC_008150	TG	3	6	105340	105345	0 %	50 %	50 %	0 %	108806088
1659	NC_008150	T	6	6	105446	105451	0 %	100 %	0 %	0 %	108806088
1660	NC_008150	TCAA	2	8	105544	105551	50 %	25 %	0 %	25 %	108806088
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1679	NC_008150	CATT	2	8	106685	106692	25 %	50 %	0 %	25 %	108806090
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1688	NC_008150	AAGGT	2	10	107078	107087	40 %	20 %	40 %	0 %	108806090
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1751	NC_008150	CCA	2	6	111168	111173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806093
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1989	NC_008150	ATC	2	6	126456	126461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806103
1990	NC_008150	TGG	2	6	126634	126639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806103
1991	NC_008150	GCC	2	6	126649	126654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806103
1992	NC_008150	CAAT	2	8	126656	126663	50 %	25 %	0 %	25 %	108806103
1993	NC_008150	GGT	2	6	126696	126701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806103
1994	NC_008150	CAC	2	6	126710	126715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806103
1995	NC_008150	ATC	2	6	126721	126726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806103
1996	NC_008150	CG	3	6	126753	126758	0 %	0 %	50 %	50 %	108806103
1997	NC_008150	CCG	2	6	126781	126786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806103
1998	NC_008150	GGTA	2	8	126923	126930	25 %	25 %	50 %	0 %	108806104
1999	NC_008150	TCG	2	6	126941	126946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806104
2000	NC_008150	CCA	2	6	126950	126955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806104

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