MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua chromosome

Total Repeats: 76244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008150	ACCA	2	8	318714	318721	50 %	0 %	0 %	50 %	108806271
5002	NC_008150	AGA	2	6	318944	318949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806272
5003	NC_008150	CAG	2	6	319122	319127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806272
5004	NC_008150	TAA	2	6	319146	319151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806272
5005	NC_008150	GCTTCG	2	12	319177	319188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806272
5006	NC_008150	GC	3	6	319211	319216	0 %	0 %	50 %	50 %	108806272
5007	NC_008150	ACA	2	6	319250	319255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806272
5008	NC_008150	TGC	2	6	319273	319278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806272
5009	NC_008150	CCA	2	6	319283	319288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806272
5010	NC_008150	AAC	2	6	319309	319314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806272
5011	NC_008150	CCAG	2	8	319376	319383	25 %	0 %	25 %	50 %	108806272
5012	NC_008150	ACG	2	6	319428	319433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806272
5013	NC_008150	CAG	2	6	319446	319451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806272
5014	NC_008150	C	7	7	319457	319463	0 %	0 %	0 %	100 %	108806272
5015	NC_008150	CT	3	6	319552	319557	0 %	50 %	0 %	50 %	108806272
5016	NC_008150	GC	3	6	319629	319634	0 %	0 %	50 %	50 %	108806272
5017	NC_008150	TGAG	2	8	319739	319746	25 %	25 %	50 %	0 %	108806272
5018	NC_008150	TGG	2	6	319796	319801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806272
5019	NC_008150	TGT	2	6	319846	319851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806272
5020	NC_008150	CGC	2	6	320009	320014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806273
5021	NC_008150	GGCC	2	8	320137	320144	0 %	0 %	50 %	50 %	108806273
5022	NC_008150	TAT	2	6	320230	320235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806273
5023	NC_008150	CAT	2	6	320275	320280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806273
5024	NC_008150	TCA	2	6	320358	320363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806273
5025	NC_008150	CTG	2	6	320381	320386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806273
5026	NC_008150	TGA	2	6	320412	320417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806273
5027	NC_008150	GAA	3	9	320463	320471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806273
5028	NC_008150	TGG	2	6	320499	320504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806273
5029	NC_008150	AGC	2	6	320567	320572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806273
5030	NC_008150	ATG	2	6	320607	320612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806273
5031	NC_008150	CGCT	2	8	320771	320778	0 %	25 %	25 %	50 %	108806274
5032	NC_008150	GTG	2	6	320859	320864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806274
5033	NC_008150	TGG	2	6	320958	320963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806274
5034	NC_008150	TGT	2	6	320996	321001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806274
5035	NC_008150	CAT	2	6	321002	321007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806274
5036	NC_008150	CAG	2	6	321067	321072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806274
5037	NC_008150	GGT	2	6	321073	321078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806274
5038	NC_008150	GGCT	2	8	321099	321106	0 %	25 %	50 %	25 %	108806274
5039	NC_008150	TAT	2	6	321119	321124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806274
5040	NC_008150	GGC	2	6	321203	321208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806274
5041	NC_008150	TG	3	6	321259	321264	0 %	50 %	50 %	0 %	108806274
5042	NC_008150	C	6	6	321295	321300	0 %	0 %	0 %	100 %	108806274
5043	NC_008150	CAC	2	6	321319	321324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806274
5044	NC_008150	CTG	2	6	321333	321338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806274
5045	NC_008150	GTG	2	6	321339	321344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806274
5046	NC_008150	CCG	2	6	321363	321368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806274
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5051	NC_008150	CCA	2	6	321524	321529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806274
5052	NC_008150	TGG	2	6	321583	321588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806274
5053	NC_008150	TGC	2	6	321619	321624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806274
5054	NC_008150	GCTTG	2	10	321647	321656	0 %	40 %	40 %	20 %	108806274
5055	NC_008150	TG	3	6	321664	321669	0 %	50 %	50 %	0 %	108806274
5056	NC_008150	TAT	2	6	321682	321687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806274
5057	NC_008150	TCTA	2	8	321688	321695	25 %	50 %	0 %	25 %	108806274
5058	NC_008150	CTT	2	6	321709	321714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806274
5059	NC_008150	ATG	2	6	321891	321896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806274
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5061	NC_008150	TGGC	2	8	321920	321927	0 %	25 %	50 %	25 %	108806274
5062	NC_008150	AAC	2	6	321944	321949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806274
5063	NC_008150	TTTA	2	8	322312	322319	25 %	75 %	0 %	0 %	108806275
5064	NC_008150	CAT	2	6	322347	322352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806275
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5070	NC_008150	GAG	2	6	322545	322550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108806275
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5079	NC_008150	GCCA	2	8	322912	322919	25 %	0 %	25 %	50 %	108806275
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5095	NC_008150	TGG	2	6	324130	324135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806276
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5106	NC_008150	CGG	2	6	324649	324654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806276
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5114	NC_008150	CTGAA	2	10	325677	325686	40 %	20 %	20 %	20 %	108806277
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5122	NC_008150	AGC	2	6	326221	326226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806278
5123	NC_008150	AGTA	2	8	326260	326267	50 %	25 %	25 %	0 %	108806278
5124	NC_008150	CTTT	2	8	326272	326279	0 %	75 %	0 %	25 %	108806278
5125	NC_008150	CTT	2	6	326294	326299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806278
5126	NC_008150	TAAT	2	8	326395	326402	50 %	50 %	0 %	0 %	108806278
5127	NC_008150	GAA	2	6	326475	326480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806278
5128	NC_008150	TA	3	6	326493	326498	50 %	50 %	0 %	0 %	108806278
5129	NC_008150	TCA	2	6	326647	326652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806278
5130	NC_008150	TGC	2	6	326666	326671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806278
5131	NC_008150	TCG	2	6	326752	326757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806278
5132	NC_008150	CTG	3	9	328039	328047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806279
5133	NC_008150	AT	3	6	328066	328071	50 %	50 %	0 %	0 %	108806279
5134	NC_008150	CTC	2	6	328088	328093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108806279
5135	NC_008150	GAA	2	6	328175	328180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806279
5136	NC_008150	TTGCT	2	10	328211	328220	0 %	60 %	20 %	20 %	108806279
5137	NC_008150	GGA	2	6	328344	328349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108806279
5138	NC_008150	TGT	2	6	328433	328438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806279
5139	NC_008150	AC	3	6	328449	328454	50 %	0 %	0 %	50 %	108806279
5140	NC_008150	GTTT	2	8	328476	328483	0 %	75 %	25 %	0 %	108806279
5141	NC_008150	T	6	6	328493	328498	0 %	100 %	0 %	0 %	108806279
5142	NC_008150	TG	3	6	328508	328513	0 %	50 %	50 %	0 %	108806279
5143	NC_008150	TCAGAA	2	12	328517	328528	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	108806279
5144	NC_008150	ATG	2	6	329059	329064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806280
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5146	NC_008150	ATA	2	6	329080	329085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806280
5147	NC_008150	TGG	2	6	329112	329117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806280
5148	NC_008150	GAT	2	6	329124	329129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806280
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5150	NC_008150	TAT	2	6	329203	329208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806280
5151	NC_008150	G	6	6	329226	329231	0 %	0 %	100 %	0 %	108806280
5152	NC_008150	CTT	2	6	329246	329251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806280
5153	NC_008150	ACC	2	6	329313	329318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806280
5154	NC_008150	TAG	2	6	329397	329402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806280
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5157	NC_008150	A	6	6	329770	329775	100 %	0 %	0 %	0 %	108806281
5158	NC_008150	AAAG	2	8	331810	331817	75 %	0 %	25 %	0 %	108806282
5159	NC_008150	GTT	2	6	331834	331839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806282
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5164	NC_008150	CTG	2	6	332096	332101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806282
5165	NC_008150	CTG	2	6	332120	332125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806282
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5182	NC_008150	GCT	2	6	332692	332697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806283
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5231	NC_008150	TG	3	6	335313	335318	0 %	50 %	50 %	0 %	108806285
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5241	NC_008150	GCC	2	6	335718	335723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806285
5242	NC_008150	GCTG	2	8	335774	335781	0 %	25 %	50 %	25 %	108806285
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5245	NC_008150	GCTG	2	8	335958	335965	0 %	25 %	50 %	25 %	108806286
5246	NC_008150	GTG	2	6	335978	335983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806286
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5250	NC_008150	GCT	2	6	336174	336179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806286
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5350	NC_008150	CTG	2	6	340577	340582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806288
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5360	NC_008150	TCAA	2	8	341025	341032	50 %	25 %	0 %	25 %	108806288
5361	NC_008150	CAG	2	6	341054	341059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806288
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5364	NC_008150	GCTGG	2	10	341104	341113	0 %	20 %	60 %	20 %	108806288
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5403	NC_008150	TCA	2	6	342824	342829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806289
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5486	NC_008150	ACG	2	6	348988	348993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806294
5487	NC_008150	CAA	2	6	349095	349100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806294
5488	NC_008150	ACC	2	6	349111	349116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806294
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5490	NC_008150	GT	3	6	349205	349210	0 %	50 %	50 %	0 %	108806294
5491	NC_008150	AAG	2	6	349297	349302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806294
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5494	NC_008150	ACTGG	2	10	349490	349499	20 %	20 %	40 %	20 %	108806294
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