MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua chromosome

Total Repeats: 76244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008150	CTGG	2	8	288881	288888	0 %	25 %	50 %	25 %	108806245
4502	NC_008150	A	6	6	288973	288978	100 %	0 %	0 %	0 %	108806245
4503	NC_008150	GATG	2	8	289026	289033	25 %	25 %	50 %	0 %	108806245
4504	NC_008150	ACG	2	6	289142	289147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806245
4505	NC_008150	TAC	2	6	289260	289265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806245
4506	NC_008150	GGT	2	6	289275	289280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806245
4507	NC_008150	AAG	2	6	289316	289321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806245
4508	NC_008150	AGC	2	6	289358	289363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806245
4509	NC_008150	GGC	2	6	289432	289437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806245
4510	NC_008150	TGA	2	6	289457	289462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806246
4511	NC_008150	TC	3	6	289477	289482	0 %	50 %	0 %	50 %	108806246
4512	NC_008150	TGG	2	6	289531	289536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806246
4513	NC_008150	T	6	6	289554	289559	0 %	100 %	0 %	0 %	108806246
4514	NC_008150	CTGC	2	8	289605	289612	0 %	25 %	25 %	50 %	108806246
4515	NC_008150	ATG	2	6	289674	289679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806246
4516	NC_008150	GTTT	2	8	289688	289695	0 %	75 %	25 %	0 %	108806246
4517	NC_008150	TA	3	6	289744	289749	50 %	50 %	0 %	0 %	108806246
4518	NC_008150	T	6	6	289854	289859	0 %	100 %	0 %	0 %	108806246
4519	NC_008150	TTTC	2	8	289948	289955	0 %	75 %	0 %	25 %	108806246
4520	NC_008150	AAC	2	6	289997	290002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806246
4521	NC_008150	GAA	2	6	290015	290020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806246
4522	NC_008150	TGT	2	6	290051	290056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806246
4523	NC_008150	CTG	2	6	290097	290102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806246
4524	NC_008150	GT	3	6	290134	290139	0 %	50 %	50 %	0 %	108806246
4525	NC_008150	GAA	2	6	290184	290189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806246
4526	NC_008150	ATC	2	6	290330	290335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806247
4527	NC_008150	GCA	2	6	290410	290415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806247
4528	NC_008150	TTG	2	6	290445	290450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806247
4529	NC_008150	CGT	2	6	290538	290543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806247
4530	NC_008150	CAA	2	6	290596	290601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806247
4531	NC_008150	CGG	2	6	290723	290728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806247
4532	NC_008150	TGT	2	6	290730	290735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806247
4533	NC_008150	AACG	2	8	290764	290771	50 %	0 %	25 %	25 %	108806247
4534	NC_008150	GCC	2	6	290975	290980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806248
4535	NC_008150	CGC	2	6	290989	290994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806248
4536	NC_008150	CTG	2	6	290998	291003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806248
4537	NC_008150	TCGC	2	8	291088	291095	0 %	25 %	25 %	50 %	108806248
4538	NC_008150	CATT	2	8	291142	291149	25 %	50 %	0 %	25 %	108806248
4539	NC_008150	TC	4	8	291153	291160	0 %	50 %	0 %	50 %	108806248
4540	NC_008150	CAGGAG	2	12	291168	291179	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	108806248
4541	NC_008150	GTTCG	2	10	291186	291195	0 %	40 %	40 %	20 %	108806248
4542	NC_008150	GAC	2	6	291208	291213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806248
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4544	NC_008150	TGG	2	6	291371	291376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806248
4545	NC_008150	CG	3	6	291382	291387	0 %	0 %	50 %	50 %	108806248
4546	NC_008150	TC	3	6	291496	291501	0 %	50 %	0 %	50 %	108806248
4547	NC_008150	AAGGT	2	10	291535	291544	40 %	20 %	40 %	0 %	108806248
4548	NC_008150	GCTG	2	8	291655	291662	0 %	25 %	50 %	25 %	108806248
4549	NC_008150	AGC	2	6	291730	291735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806248
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4551	NC_008150	TGA	2	6	291785	291790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806248
4552	NC_008150	CAT	2	6	291822	291827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806248
4553	NC_008150	TGA	2	6	291867	291872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806248
4554	NC_008150	AGCGC	2	10	291935	291944	20 %	0 %	40 %	40 %	108806249
4555	NC_008150	GAA	2	6	292013	292018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806249
4556	NC_008150	TCA	2	6	292030	292035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806249
4557	NC_008150	CGG	2	6	292074	292079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806249
4558	NC_008150	CTCA	2	8	292150	292157	25 %	25 %	0 %	50 %	108806249
4559	NC_008150	CAG	3	9	292278	292286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806249
4560	NC_008150	ACG	2	6	292334	292339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806249
4561	NC_008150	C	6	6	292359	292364	0 %	0 %	0 %	100 %	108806249
4562	NC_008150	TCA	2	6	292371	292376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806249
4563	NC_008150	TGA	2	6	292378	292383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806249
4564	NC_008150	TCAG	2	8	292401	292408	25 %	25 %	25 %	25 %	108806249
4565	NC_008150	GAA	2	6	292409	292414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806249
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4567	NC_008150	GCA	2	6	292520	292525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806249
4568	NC_008150	TCAAA	2	10	292573	292582	60 %	20 %	0 %	20 %	108806249
4569	NC_008150	CAGA	2	8	292600	292607	50 %	0 %	25 %	25 %	108806249
4570	NC_008150	GCT	2	6	292911	292916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806250
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4574	NC_008150	AATGC	2	10	293165	293174	40 %	20 %	20 %	20 %	108806250
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4587	NC_008150	GTA	2	6	293975	293980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806251
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4592	NC_008150	TAA	2	6	294370	294375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806252
4593	NC_008150	AGA	2	6	294429	294434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806252
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4603	NC_008150	GGC	2	6	294730	294735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806252
4604	NC_008150	TGG	2	6	294866	294871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806252
4605	NC_008150	TTC	2	6	294913	294918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806252
4606	NC_008150	CGG	2	6	295011	295016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806252
4607	NC_008150	TTGA	2	8	295130	295137	25 %	50 %	25 %	0 %	108806252
4608	NC_008150	TTCA	2	8	295154	295161	25 %	50 %	0 %	25 %	108806252
4609	NC_008150	TG	3	6	295523	295528	0 %	50 %	50 %	0 %	108806253
4610	NC_008150	CGG	2	6	295533	295538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806253
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4622	NC_008150	ATC	2	6	296204	296209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806253
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4986	NC_008150	CAGATA	2	12	318077	318088	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	108806271
4987	NC_008150	TA	3	6	318116	318121	50 %	50 %	0 %	0 %	108806271
4988	NC_008150	GC	3	6	318124	318129	0 %	0 %	50 %	50 %	108806271
4989	NC_008150	GGC	2	6	318193	318198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806271
4990	NC_008150	CCG	2	6	318211	318216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806271
4991	NC_008150	ATC	2	6	318248	318253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806271
4992	NC_008150	CAG	2	6	318263	318268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806271
4993	NC_008150	GCC	2	6	318309	318314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806271
4994	NC_008150	CG	3	6	318355	318360	0 %	0 %	50 %	50 %	108806271
4995	NC_008150	G	6	6	318385	318390	0 %	0 %	100 %	0 %	108806271
4996	NC_008150	GCG	2	6	318449	318454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806271
4997	NC_008150	GGGCG	2	10	318471	318480	0 %	0 %	80 %	20 %	108806271
4998	NC_008150	GCT	2	6	318599	318604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806271
4999	NC_008150	GGCAA	2	10	318657	318666	40 %	0 %	40 %	20 %	108806271
5000	NC_008150	TGCGG	2	10	318678	318687	0 %	20 %	60 %	20 %	108806271

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