MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua chromosome

Total Repeats: 76244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008150	CTG	2	6	305	310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108805999
2	NC_008150	TTG	2	6	387	392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108805999
3	NC_008150	AACC	2	8	443	450	50 %	0 %	0 %	50 %	108805999
4	NC_008150	TGT	2	6	484	489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108805999
5	NC_008150	TAA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108805999
6	NC_008150	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108805999
7	NC_008150	TCA	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806000
8	NC_008150	TTG	2	6	885	890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806000
9	NC_008150	CTG	2	6	899	904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806000
10	NC_008150	TAA	2	6	934	939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806000
11	NC_008150	GTG	2	6	957	962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806000
12	NC_008150	CTT	2	6	979	984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806000
13	NC_008150	T	6	6	998	1003	0 %	100 %	0 %	0 %	108806000
14	NC_008150	AGC	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806000
15	NC_008150	CGT	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806000
16	NC_008150	GTT	2	6	1072	1077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806000
17	NC_008150	GTGC	2	8	1194	1201	0 %	25 %	50 %	25 %	108806000
18	NC_008150	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806000
19	NC_008150	A	6	6	1437	1442	100 %	0 %	0 %	0 %	108806001
20	NC_008150	ACA	3	9	1457	1465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806001
21	NC_008150	CAA	2	6	1506	1511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806001
22	NC_008150	CATT	2	8	1644	1651	25 %	50 %	0 %	25 %	108806001
23	NC_008150	ATTC	2	8	1758	1765	25 %	50 %	0 %	25 %	108806001
24	NC_008150	GCG	2	6	1878	1883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806001
25	NC_008150	TGG	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806001
26	NC_008150	ATG	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806001
27	NC_008150	ATG	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806001
28	NC_008150	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806001
29	NC_008150	TCT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806001
30	NC_008150	ATCA	2	8	2269	2276	50 %	25 %	0 %	25 %	108806001
31	NC_008150	TGC	2	6	2344	2349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806001
32	NC_008150	ACA	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806001
33	NC_008150	CTG	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806001
34	NC_008150	GCG	2	6	2537	2542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806002
35	NC_008150	TGG	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806002
36	NC_008150	CTG	3	9	2657	2665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806002
37	NC_008150	TTTA	2	8	2762	2769	25 %	75 %	0 %	0 %	108806002
38	NC_008150	GCC	2	6	2787	2792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806002
39	NC_008150	ACC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806002
40	NC_008150	GTTG	2	8	2815	2822	0 %	50 %	50 %	0 %	108806002
41	NC_008150	ATT	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806002
42	NC_008150	ATG	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806002
43	NC_008150	GCG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806002
44	NC_008150	TCA	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806002
45	NC_008150	T	6	6	3067	3072	0 %	100 %	0 %	0 %	108806002
46	NC_008150	GCG	2	6	3125	3130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806002
47	NC_008150	ACTC	2	8	3148	3155	25 %	25 %	0 %	50 %	108806002
48	NC_008150	AAT	2	6	3183	3188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806002
49	NC_008150	TGA	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806002
50	NC_008150	CCT	2	6	3223	3228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108806002
51	NC_008150	CTGG	2	8	3241	3248	0 %	25 %	50 %	25 %	108806002
52	NC_008150	GCA	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806002
53	NC_008150	TGG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806002
54	NC_008150	CAC	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806002
55	NC_008150	AAC	2	6	3534	3539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806002
56	NC_008150	TGA	3	9	3540	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806002
57	NC_008150	T	6	6	3627	3632	0 %	100 %	0 %	0 %	108806002
58	NC_008150	TCC	2	6	3741	3746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108806002
59	NC_008150	ATTC	2	8	3772	3779	25 %	50 %	0 %	25 %	108806002
60	NC_008150	GTT	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806002
61	NC_008150	A	8	8	3884	3891	100 %	0 %	0 %	0 %	108806002
62	NC_008150	TGC	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806002
63	NC_008150	ACC	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806002
64	NC_008150	CAG	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806002
65	NC_008150	TGT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806003
66	NC_008150	GTT	2	6	4030	4035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806003
67	NC_008150	TTG	2	6	4046	4051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806003
68	NC_008150	TTG	2	6	4061	4066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806003
69	NC_008150	CCA	2	6	4081	4086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806003
70	NC_008150	GCCA	2	8	4113	4120	25 %	0 %	25 %	50 %	108806003
71	NC_008150	GAT	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806003
72	NC_008150	TAAA	2	8	4132	4139	75 %	25 %	0 %	0 %	108806003
73	NC_008150	GTT	2	6	4168	4173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806003
74	NC_008150	CAG	3	9	4205	4213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806003
75	NC_008150	TGG	2	6	4217	4222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806003
76	NC_008150	TGGC	2	8	4262	4269	0 %	25 %	50 %	25 %	108806003
77	NC_008150	ATC	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806003
78	NC_008150	GAT	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806003
79	NC_008150	CTGT	2	8	4470	4477	0 %	50 %	25 %	25 %	108806003
80	NC_008150	AGTG	2	8	4538	4545	25 %	25 %	50 %	0 %	108806003
81	NC_008150	TGG	2	6	4548	4553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806003
82	NC_008150	TGC	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806003
83	NC_008150	TAA	2	6	4610	4615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806003
84	NC_008150	CAA	2	6	4643	4648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806003
85	NC_008150	TCA	2	6	4737	4742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806003
86	NC_008150	GAA	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806003
87	NC_008150	GTA	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806003
88	NC_008150	CTT	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806003
89	NC_008150	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806003
90	NC_008150	TCAA	2	8	4890	4897	50 %	25 %	0 %	25 %	108806003
91	NC_008150	TGG	2	6	4908	4913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806003
92	NC_008150	TTC	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806003
93	NC_008150	CTG	2	6	4971	4976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806003
94	NC_008150	CAG	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806003
95	NC_008150	GCT	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806003
96	NC_008150	CTT	3	9	5266	5274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806003
97	NC_008150	TCA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806003
98	NC_008150	GCG	2	6	5375	5380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806003
99	NC_008150	GGA	2	6	5406	5411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108806003
100	NC_008150	TGC	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806003
101	NC_008150	AACG	2	8	5469	5476	50 %	0 %	25 %	25 %	108806003
102	NC_008150	GCC	2	6	5680	5685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806004
103	NC_008150	CGC	2	6	5694	5699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806004
104	NC_008150	CTG	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806004
105	NC_008150	TCGC	2	8	5793	5800	0 %	25 %	25 %	50 %	108806004
106	NC_008150	CATT	2	8	5847	5854	25 %	50 %	0 %	25 %	108806004
107	NC_008150	TC	4	8	5858	5865	0 %	50 %	0 %	50 %	108806004
108	NC_008150	CAGGAG	2	12	5873	5884	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	108806004
109	NC_008150	GTTCG	2	10	5891	5900	0 %	40 %	40 %	20 %	108806004
110	NC_008150	GAC	2	6	5913	5918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806004
111	NC_008150	CTT	2	6	6070	6075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806004
112	NC_008150	TGG	2	6	6076	6081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806004
113	NC_008150	CG	3	6	6087	6092	0 %	0 %	50 %	50 %	108806004
114	NC_008150	TC	3	6	6201	6206	0 %	50 %	0 %	50 %	108806004
115	NC_008150	AAGGT	2	10	6240	6249	40 %	20 %	40 %	0 %	108806004
116	NC_008150	GCTG	2	8	6360	6367	0 %	25 %	50 %	25 %	108806004
117	NC_008150	AGC	2	6	6435	6440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806004
118	NC_008150	A	6	6	6467	6472	100 %	0 %	0 %	0 %	108806004
119	NC_008150	TGA	2	6	6490	6495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806004
120	NC_008150	CAT	2	6	6527	6532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806004
121	NC_008150	TGA	2	6	6572	6577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806004
122	NC_008150	AGCGC	2	10	6640	6649	20 %	0 %	40 %	40 %	108806005
123	NC_008150	GAA	2	6	6718	6723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806005
124	NC_008150	TCA	2	6	6735	6740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806005
125	NC_008150	CGG	2	6	6779	6784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806005
126	NC_008150	CTCA	2	8	6855	6862	25 %	25 %	0 %	50 %	108806005
127	NC_008150	CAG	3	9	6983	6991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806005
128	NC_008150	ACG	2	6	7039	7044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806005
129	NC_008150	C	6	6	7064	7069	0 %	0 %	0 %	100 %	108806005
130	NC_008150	TCA	2	6	7076	7081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806005
131	NC_008150	TGA	2	6	7083	7088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806005
132	NC_008150	TCAG	2	8	7106	7113	25 %	25 %	25 %	25 %	108806005
133	NC_008150	GAA	2	6	7114	7119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806005
134	NC_008150	TTC	2	6	7129	7134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806005
135	NC_008150	GCA	2	6	7225	7230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806005
136	NC_008150	TCAAA	2	10	7278	7287	60 %	20 %	0 %	20 %	108806005
137	NC_008150	CAGA	2	8	7305	7312	50 %	0 %	25 %	25 %	108806005
138	NC_008150	CGT	2	6	7409	7414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806006
139	NC_008150	TTCT	2	8	7477	7484	0 %	75 %	0 %	25 %	108806006
140	NC_008150	GAT	2	6	7494	7499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806006
141	NC_008150	GA	3	6	7876	7881	50 %	0 %	50 %	0 %	108806007
142	NC_008150	T	6	6	7933	7938	0 %	100 %	0 %	0 %	108806007
143	NC_008150	GTC	2	6	7967	7972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806007
144	NC_008150	AGG	2	6	8020	8025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108806007
145	NC_008150	TGG	2	6	8085	8090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806007
146	NC_008150	TGG	2	6	8104	8109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806007
147	NC_008150	CTT	2	6	8113	8118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806007
148	NC_008150	CGC	2	6	8182	8187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806007
149	NC_008150	TAT	2	6	8341	8346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806007
150	NC_008150	T	6	6	8396	8401	0 %	100 %	0 %	0 %	108806007
151	NC_008150	T	6	6	8423	8428	0 %	100 %	0 %	0 %	108806007
152	NC_008150	CGT	2	6	8538	8543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806007
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154	NC_008150	TTA	2	6	8573	8578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806007
155	NC_008150	CTT	2	6	8608	8613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806007
156	NC_008150	ACC	2	6	8743	8748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806007
157	NC_008150	ATT	2	6	8756	8761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806007
158	NC_008150	AT	4	8	8789	8796	50 %	50 %	0 %	0 %	108806007
159	NC_008150	GGT	2	6	8827	8832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806007
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161	NC_008150	TCG	2	6	8967	8972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806007
162	NC_008150	TTG	2	6	8990	8995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806007
163	NC_008150	ATT	2	6	9034	9039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806007
164	NC_008150	GTTG	2	8	9048	9055	0 %	50 %	50 %	0 %	108806007
165	NC_008150	TAT	3	9	9082	9090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806007
166	NC_008150	ACC	2	6	9092	9097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806007
167	NC_008150	GAT	2	6	9160	9165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806007
168	NC_008150	CGG	2	6	9207	9212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806007
169	NC_008150	AATG	2	8	9229	9236	50 %	25 %	25 %	0 %	108806007
170	NC_008150	ATT	2	6	9250	9255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806007
171	NC_008150	GTGTT	2	10	9291	9300	0 %	60 %	40 %	0 %	108806007
172	NC_008150	GGT	2	6	9385	9390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806007
173	NC_008150	GAT	2	6	9469	9474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806007
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178	NC_008150	ACC	2	6	9959	9964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806008
179	NC_008150	AGA	2	6	10063	10068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806008
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248	NC_008150	AATT	2	8	13172	13179	50 %	50 %	0 %	0 %	108806012
249	NC_008150	GT	3	6	13289	13294	0 %	50 %	50 %	0 %	108806012
250	NC_008150	CCA	2	6	13382	13387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806012
251	NC_008150	TAA	2	6	13391	13396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806012
252	NC_008150	AGTA	2	8	13611	13618	50 %	25 %	25 %	0 %	108806012
253	NC_008150	CTT	2	6	13639	13644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806012
254	NC_008150	TGA	2	6	20368	20373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806013
255	NC_008150	A	7	7	20486	20492	100 %	0 %	0 %	0 %	108806013
256	NC_008150	CT	3	6	20522	20527	0 %	50 %	0 %	50 %	108806013
257	NC_008150	TTG	2	6	20555	20560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806013
258	NC_008150	AAC	2	6	20606	20611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806013
259	NC_008150	CTC	2	6	20673	20678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108806013
260	NC_008150	TAT	2	6	20728	20733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806013
261	NC_008150	GGC	2	6	20788	20793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806013
262	NC_008150	CG	3	6	20826	20831	0 %	0 %	50 %	50 %	108806013
263	NC_008150	CT	3	6	20840	20845	0 %	50 %	0 %	50 %	108806013
264	NC_008150	TATC	2	8	20848	20855	25 %	50 %	0 %	25 %	108806013
265	NC_008150	TGA	2	6	20899	20904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806013
266	NC_008150	CTC	2	6	20916	20921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108806013
267	NC_008150	CAA	2	6	20957	20962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806013
268	NC_008150	GTC	2	6	20986	20991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806013
269	NC_008150	AGA	2	6	20992	20997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806013
270	NC_008150	ATG	2	6	21063	21068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806013
271	NC_008150	ATT	2	6	21135	21140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806013
272	NC_008150	CAT	2	6	21174	21179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806013
273	NC_008150	ACT	2	6	21219	21224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806013
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275	NC_008150	TTGA	2	8	21273	21280	25 %	50 %	25 %	0 %	108806013
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277	NC_008150	A	7	7	21504	21510	100 %	0 %	0 %	0 %	108806014
278	NC_008150	AATT	2	8	21549	21556	50 %	50 %	0 %	0 %	108806014
279	NC_008150	ATT	2	6	21558	21563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806014
280	NC_008150	T	6	6	21604	21609	0 %	100 %	0 %	0 %	108806014
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282	NC_008150	AGTT	2	8	21726	21733	25 %	50 %	25 %	0 %	108806015
283	NC_008150	TGC	2	6	21751	21756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806015
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285	NC_008150	GCA	2	6	21859	21864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806015
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289	NC_008150	ATG	2	6	22107	22112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806015
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291	NC_008150	ATTG	2	8	22183	22190	25 %	50 %	25 %	0 %	108806015
292	NC_008150	GGT	2	6	22253	22258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806015
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381	NC_008150	ATG	2	6	26440	26445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806017
382	NC_008150	T	6	6	26499	26504	0 %	100 %	0 %	0 %	108806017
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391	NC_008150	TCA	3	9	26949	26957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806018
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