MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 chromosome

Total Repeats: 72907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008149	CTG	2	6	305	310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810167
2	NC_008149	TTG	2	6	387	392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810167
3	NC_008149	AACC	2	8	443	450	50 %	0 %	0 %	50 %	108810167
4	NC_008149	TGT	2	6	484	489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810167
5	NC_008149	TAA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108810167
6	NC_008149	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108810167
7	NC_008149	TCA	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108810168
8	NC_008149	TTG	2	6	885	890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810168
9	NC_008149	CTG	2	6	899	904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810168
10	NC_008149	TAA	2	6	934	939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108810168
11	NC_008149	GTG	2	6	957	962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810168
12	NC_008149	CTT	2	6	979	984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108810168
13	NC_008149	T	6	6	998	1003	0 %	100 %	0 %	0 %	108810168
14	NC_008149	AGC	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108810168
15	NC_008149	CGT	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810168
16	NC_008149	GTT	2	6	1072	1077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810168
17	NC_008149	GTGC	2	8	1194	1201	0 %	25 %	50 %	25 %	108810168
18	NC_008149	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810168
19	NC_008149	A	6	6	1437	1442	100 %	0 %	0 %	0 %	108810169
20	NC_008149	ACA	3	9	1457	1465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108810169
21	NC_008149	CAA	2	6	1506	1511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108810169
22	NC_008149	CATT	2	8	1644	1651	25 %	50 %	0 %	25 %	108810169
23	NC_008149	ATTC	2	8	1758	1765	25 %	50 %	0 %	25 %	108810169
24	NC_008149	GCG	2	6	1878	1883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810169
25	NC_008149	TGG	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810169
26	NC_008149	ATG	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810169
27	NC_008149	ATG	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810169
28	NC_008149	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810169
29	NC_008149	TCT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108810169
30	NC_008149	ATCA	2	8	2269	2276	50 %	25 %	0 %	25 %	108810169
31	NC_008149	TGC	2	6	2344	2349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810169
32	NC_008149	ACA	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108810169
33	NC_008149	CTG	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810169
34	NC_008149	GCG	2	6	2537	2542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810170
35	NC_008149	TGG	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810170
36	NC_008149	CTG	3	9	2657	2665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810170
37	NC_008149	TTTA	2	8	2762	2769	25 %	75 %	0 %	0 %	108810170
38	NC_008149	GCC	2	6	2787	2792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108810170
39	NC_008149	ACC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108810170
40	NC_008149	GTTG	2	8	2815	2822	0 %	50 %	50 %	0 %	108810170
41	NC_008149	ATT	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810170
42	NC_008149	ATG	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810170
43	NC_008149	GCG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810170
44	NC_008149	TCA	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108810170
45	NC_008149	T	6	6	3067	3072	0 %	100 %	0 %	0 %	108810170
46	NC_008149	GCG	2	6	3125	3130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810170
47	NC_008149	ACTC	2	8	3148	3155	25 %	25 %	0 %	50 %	108810170
48	NC_008149	AAT	2	6	3183	3188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108810170
49	NC_008149	TGA	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810170
50	NC_008149	CCT	2	6	3223	3228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108810170
51	NC_008149	CTGG	2	8	3241	3248	0 %	25 %	50 %	25 %	108810170
52	NC_008149	GCA	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108810170
53	NC_008149	TGG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810170
54	NC_008149	CAC	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108810170
55	NC_008149	AAC	2	6	3534	3539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108810170
56	NC_008149	TGA	3	9	3540	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810170
57	NC_008149	T	6	6	3627	3632	0 %	100 %	0 %	0 %	108810170
58	NC_008149	TCC	2	6	3741	3746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108810170
59	NC_008149	ATTC	2	8	3772	3779	25 %	50 %	0 %	25 %	108810170
60	NC_008149	GTT	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810170
61	NC_008149	A	8	8	3884	3891	100 %	0 %	0 %	0 %	108810170
62	NC_008149	TGC	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810170
63	NC_008149	ACC	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108810170
64	NC_008149	CAG	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108810170
65	NC_008149	TGT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810171
66	NC_008149	GTT	2	6	4030	4035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810171
67	NC_008149	TTG	2	6	4046	4051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810171
68	NC_008149	TTG	2	6	4061	4066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810171
69	NC_008149	CCA	2	6	4081	4086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108810171
70	NC_008149	GCCA	2	8	4113	4120	25 %	0 %	25 %	50 %	108810171
71	NC_008149	GAT	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810171
72	NC_008149	TAAA	2	8	4132	4139	75 %	25 %	0 %	0 %	108810171
73	NC_008149	GTT	2	6	4168	4173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810171
74	NC_008149	CAG	3	9	4205	4213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108810171
75	NC_008149	TGG	2	6	4217	4222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810171
76	NC_008149	TGGC	2	8	4262	4269	0 %	25 %	50 %	25 %	108810171
77	NC_008149	ATC	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108810171
78	NC_008149	GAT	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810171
79	NC_008149	CTGT	2	8	4470	4477	0 %	50 %	25 %	25 %	108810171
80	NC_008149	AGTG	2	8	4538	4545	25 %	25 %	50 %	0 %	108810171
81	NC_008149	TGG	2	6	4548	4553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810171
82	NC_008149	TGC	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810171
83	NC_008149	TAA	2	6	4610	4615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108810171
84	NC_008149	CAA	2	6	4643	4648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108810171
85	NC_008149	TCA	2	6	4737	4742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108810171
86	NC_008149	GAA	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108810171
87	NC_008149	GTA	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810171
88	NC_008149	CTT	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108810171
89	NC_008149	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810171
90	NC_008149	TCAA	2	8	4890	4897	50 %	25 %	0 %	25 %	108810171
91	NC_008149	TGG	2	6	4908	4913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810171
92	NC_008149	TTC	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108810171
93	NC_008149	CTG	2	6	4971	4976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810171
94	NC_008149	CAG	2	6	4979	4984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108810171
95	NC_008149	GCT	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810171
96	NC_008149	CTT	3	9	5266	5274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108810171
97	NC_008149	TCA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108810171
98	NC_008149	GCG	2	6	5375	5380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810171
99	NC_008149	GGA	2	6	5406	5411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108810171
100	NC_008149	TGC	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810171
101	NC_008149	TTCT	2	8	5518	5525	0 %	75 %	0 %	25 %	108810171
102	NC_008149	GAT	2	6	5535	5540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810171
103	NC_008149	GA	3	6	5917	5922	50 %	0 %	50 %	0 %	108810172
104	NC_008149	T	6	6	5974	5979	0 %	100 %	0 %	0 %	108810172
105	NC_008149	GTC	2	6	6008	6013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810172
106	NC_008149	AGG	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108810172
107	NC_008149	TGG	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810172
108	NC_008149	TGG	2	6	6145	6150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810172
109	NC_008149	CTT	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108810172
110	NC_008149	CGC	2	6	6223	6228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108810172
111	NC_008149	TAT	2	6	6382	6387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810172
112	NC_008149	T	6	6	6437	6442	0 %	100 %	0 %	0 %	108810172
113	NC_008149	T	6	6	6464	6469	0 %	100 %	0 %	0 %	108810172
114	NC_008149	CGT	2	6	6579	6584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810172
115	NC_008149	ATT	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810172
116	NC_008149	TTA	2	6	6614	6619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810172
117	NC_008149	CTT	2	6	6649	6654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108810172
118	NC_008149	ACC	2	6	6784	6789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108810172
119	NC_008149	ATT	2	6	6797	6802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810172
120	NC_008149	AT	4	8	6830	6837	50 %	50 %	0 %	0 %	108810172
121	NC_008149	GGT	2	6	6868	6873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810172
122	NC_008149	GGC	3	9	6910	6918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810172
123	NC_008149	TCG	2	6	7008	7013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810172
124	NC_008149	TTG	2	6	7031	7036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810172
125	NC_008149	ATT	2	6	7075	7080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810172
126	NC_008149	GTTG	2	8	7089	7096	0 %	50 %	50 %	0 %	108810172
127	NC_008149	TAT	3	9	7123	7131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810172
128	NC_008149	ACC	2	6	7133	7138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108810172
129	NC_008149	GAT	2	6	7201	7206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810172
130	NC_008149	CGG	2	6	7248	7253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810172
131	NC_008149	AATG	2	8	7270	7277	50 %	25 %	25 %	0 %	108810172
132	NC_008149	ATT	2	6	7291	7296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810172
133	NC_008149	GTGTT	2	10	7332	7341	0 %	60 %	40 %	0 %	108810172
134	NC_008149	GGT	2	6	7426	7431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810172
135	NC_008149	GAT	2	6	7510	7515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810172
136	NC_008149	CGT	2	6	7521	7526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810172
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138	NC_008149	CCCA	2	8	7645	7652	25 %	0 %	0 %	75 %	108810172
139	NC_008149	A	6	6	7898	7903	100 %	0 %	0 %	0 %	108810173
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143	NC_008149	TGC	2	6	8151	8156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810173
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149	NC_008149	GAT	2	6	8560	8565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810174
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162	NC_008149	TTA	2	6	9154	9159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810174
163	NC_008149	CGG	2	6	9203	9208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810174
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169	NC_008149	ATT	2	6	9517	9522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108810176
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254	NC_008149	ATTG	2	8	20220	20227	25 %	50 %	25 %	0 %	108810180
255	NC_008149	GGT	2	6	20290	20295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108810180
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262	NC_008149	TTG	2	6	20540	20545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810180
263	NC_008149	TA	3	6	20581	20586	50 %	50 %	0 %	0 %	108810180
264	NC_008149	ACC	2	6	20600	20605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108810180
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266	NC_008149	TTG	2	6	20674	20679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108810180
267	NC_008149	G	6	6	20715	20720	0 %	0 %	100 %	0 %	108810180
268	NC_008149	GCC	2	6	20725	20730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108810180
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275	NC_008149	AGCTTG	2	12	21206	21217	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	108810180
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285	NC_008149	TGC	2	6	21552	21557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108810181
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288	NC_008149	ACA	2	6	21619	21624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108810181
289	NC_008149	GGC	2	6	21670	21675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108810181
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386	NC_008149	TGA	2	6	27321	27326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108810184
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388	NC_008149	GCC	2	6	27368	27373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108810184
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