MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 plasmid pMT

Total Repeats: 1574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008118	A	6	6	96110	96115	100 %	0 %	0 %	0 %	108793822
1502	NC_008118	ACC	2	6	96181	96186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793823
1503	NC_008118	GC	3	6	96214	96219	0 %	0 %	50 %	50 %	108793823
1504	NC_008118	ATGG	2	8	96236	96243	25 %	25 %	50 %	0 %	108793823
1505	NC_008118	GGAT	2	8	96289	96296	25 %	25 %	50 %	0 %	108793823
1506	NC_008118	ATT	2	6	96418	96423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793823
1507	NC_008118	CGC	2	6	96449	96454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793823
1508	NC_008118	GGA	2	6	96462	96467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108793823
1509	NC_008118	GC	3	6	96586	96591	0 %	0 %	50 %	50 %	108793823
1510	NC_008118	GGC	2	6	96600	96605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793823
1511	NC_008118	CG	3	6	96614	96619	0 %	0 %	50 %	50 %	108793823
1512	NC_008118	CTG	2	6	96684	96689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793823
1513	NC_008118	GAT	2	6	96697	96702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793823
1514	NC_008118	GGT	2	6	96714	96719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793823
1515	NC_008118	CAG	2	6	96753	96758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793823
1516	NC_008118	TGC	2	6	96824	96829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793823
1517	NC_008118	TGGA	2	8	96856	96863	25 %	25 %	50 %	0 %	108793823
1518	NC_008118	ACC	2	6	97362	97367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793824
1519	NC_008118	GCA	2	6	97411	97416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793824
1520	NC_008118	GGA	2	6	97457	97462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108793824
1521	NC_008118	CCAGGA	2	12	97520	97531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793824
1522	NC_008118	CGC	2	6	97583	97588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793824
1523	NC_008118	GAA	2	6	97602	97607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793824
1524	NC_008118	TGA	2	6	97673	97678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793824
1525	NC_008118	CAG	2	6	97811	97816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793824
1526	NC_008118	CGA	2	6	98595	98600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793825
1527	NC_008118	GCG	2	6	98632	98637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793825
1528	NC_008118	GGC	2	6	98740	98745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793825
1529	NC_008118	AAGA	2	8	98798	98805	75 %	0 %	25 %	0 %	108793825
1530	NC_008118	A	6	6	98905	98910	100 %	0 %	0 %	0 %	108793826
1531	NC_008118	AGC	2	6	98914	98919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1532	NC_008118	A	7	7	98920	98926	100 %	0 %	0 %	0 %	108793826
1533	NC_008118	GAA	2	6	98941	98946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793826
1534	NC_008118	GCC	2	6	98956	98961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793826
1535	NC_008118	CTG	2	6	99088	99093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1536	NC_008118	CGGA	2	8	99119	99126	25 %	0 %	50 %	25 %	108793826
1537	NC_008118	GGT	2	6	99145	99150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793826
1538	NC_008118	GACT	2	8	99155	99162	25 %	25 %	25 %	25 %	108793826
1539	NC_008118	CTG	2	6	99172	99177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1540	NC_008118	GAC	2	6	99232	99237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1541	NC_008118	CCTCG	2	10	99246	99255	0 %	20 %	20 %	60 %	108793826
1542	NC_008118	AGC	2	6	99269	99274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1543	NC_008118	GC	3	6	99273	99278	0 %	0 %	50 %	50 %	108793826
1544	NC_008118	CCG	2	6	99290	99295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793826
1545	NC_008118	TCGGCT	2	12	99362	99373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1546	NC_008118	GCA	2	6	99634	99639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1547	NC_008118	ACGGC	2	10	99683	99692	20 %	0 %	40 %	40 %	108793826
1548	NC_008118	CAG	2	6	99754	99759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1549	NC_008118	AGC	4	12	99869	99880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1550	NC_008118	CGA	2	6	99927	99932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1551	NC_008118	AGG	2	6	99968	99973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108793826
1552	NC_008118	GAC	2	6	99997	100002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1553	NC_008118	GAA	2	6	100090	100095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793826
1554	NC_008118	CAG	2	6	100104	100109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1555	NC_008118	CGC	2	6	100143	100148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793826
1556	NC_008118	GCT	2	6	100167	100172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1557	NC_008118	GGC	2	6	100209	100214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793826
1558	NC_008118	GCA	2	6	100221	100226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1559	NC_008118	TCT	2	6	100274	100279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793826
1560	NC_008118	ACG	2	6	100294	100299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1561	NC_008118	CTG	2	6	100417	100422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1562	NC_008118	CAC	2	6	100446	100451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793826
1563	NC_008118	CTT	2	6	100452	100457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793826
1564	NC_008118	CGG	2	6	100467	100472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793826
1565	NC_008118	GGC	2	6	100575	100580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793826
1566	NC_008118	TGG	2	6	100603	100608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793826
1567	NC_008118	CGA	2	6	100613	100618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1568	NC_008118	GCG	2	6	100690	100695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793826
1569	NC_008118	GAA	2	6	100713	100718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793826
1570	NC_008118	GCA	2	6	100726	100731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1571	NC_008118	GCA	2	6	100752	100757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1572	NC_008118	GAC	2	6	100816	100821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793826
1573	NC_008118	ACC	2	6	100855	100860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793826
1574	NC_008118	CGC	2	6	100872	100877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793826

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