MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 plasmid pMT

Total Repeats: 1574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008118	TCT	2	6	62421	62426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793793
1002	NC_008118	GTC	2	6	62444	62449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793793
1003	NC_008118	TGAAC	2	10	62509	62518	40 %	20 %	20 %	20 %	108793793
1004	NC_008118	GCTC	2	8	62538	62545	0 %	25 %	25 %	50 %	108793793
1005	NC_008118	GAA	2	6	62565	62570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793793
1006	NC_008118	CAGA	2	8	62578	62585	50 %	0 %	25 %	25 %	108793793
1007	NC_008118	TCA	2	6	62709	62714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793793
1008	NC_008118	TGG	2	6	62791	62796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793793
1009	NC_008118	CTT	2	6	62830	62835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793793
1010	NC_008118	TCG	2	6	62841	62846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793793
1011	NC_008118	TCC	2	6	62862	62867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793793
1012	NC_008118	TCT	2	6	62988	62993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793793
1013	NC_008118	CTC	2	6	63002	63007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793793
1014	NC_008118	GCG	2	6	63054	63059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793793
1015	NC_008118	ACC	2	6	63137	63142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793793
1016	NC_008118	TCG	2	6	63144	63149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793793
1017	NC_008118	CAT	2	6	63175	63180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793793
1018	NC_008118	CAT	2	6	63325	63330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793793
1019	NC_008118	CTT	2	6	63331	63336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793793
1020	NC_008118	GTC	3	9	63347	63355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793793
1021	NC_008118	TCG	2	6	63399	63404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793793
1022	NC_008118	GAT	2	6	63459	63464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793793
1023	NC_008118	AGC	2	6	63524	63529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793793
1024	NC_008118	TTC	2	6	63632	63637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793793
1025	NC_008118	GAC	2	6	63677	63682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793793
1026	NC_008118	GAA	2	6	63692	63697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793793
1027	NC_008118	TG	3	6	63786	63791	0 %	50 %	50 %	0 %	108793793
1028	NC_008118	ACG	2	6	63803	63808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793793
1029	NC_008118	CT	3	6	63892	63897	0 %	50 %	0 %	50 %	108793793
1030	NC_008118	CGT	2	6	63994	63999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793793
1031	NC_008118	CGC	2	6	64033	64038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793793
1032	NC_008118	TGA	2	6	64328	64333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793794
1033	NC_008118	TGTT	2	8	64342	64349	0 %	75 %	25 %	0 %	108793794
1034	NC_008118	TTC	2	6	64398	64403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793794
1035	NC_008118	CCAT	2	8	64435	64442	25 %	25 %	0 %	50 %	108793794
1036	NC_008118	CTA	2	6	64850	64855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793796
1037	NC_008118	CAA	2	6	64884	64889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793796
1038	NC_008118	TC	3	6	64894	64899	0 %	50 %	0 %	50 %	108793796
1039	NC_008118	TTC	2	6	65023	65028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793796
1040	NC_008118	GAA	2	6	65032	65037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793796
1041	NC_008118	A	6	6	65063	65068	100 %	0 %	0 %	0 %	108793796
1042	NC_008118	ATCAG	2	10	65115	65124	40 %	20 %	20 %	20 %	108793796
1043	NC_008118	GTT	2	6	65125	65130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793796
1044	NC_008118	TTG	2	6	65221	65226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793795
1045	NC_008118	GATG	2	8	65233	65240	25 %	25 %	50 %	0 %	108793795
1046	NC_008118	ATT	2	6	65336	65341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793795
1047	NC_008118	CTT	2	6	65352	65357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793795
1048	NC_008118	GTG	2	6	65409	65414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793795
1049	NC_008118	TTC	2	6	65454	65459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793795
1050	NC_008118	CTT	3	9	65506	65514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793795
1051	NC_008118	AAC	2	6	65555	65560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793795
1052	NC_008118	GCA	2	6	65702	65707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793795
1053	NC_008118	GCC	2	6	65723	65728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793795
1054	NC_008118	AAT	2	6	65754	65759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793795
1055	NC_008118	CG	3	6	65808	65813	0 %	0 %	50 %	50 %	108793795
1056	NC_008118	TTG	2	6	65840	65845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793795
1057	NC_008118	ATCA	2	8	65872	65879	50 %	25 %	0 %	25 %	108793795
1058	NC_008118	TCA	2	6	65913	65918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793795
1059	NC_008118	AAC	2	6	66104	66109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793795
1060	NC_008118	GAA	2	6	66119	66124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793795
1061	NC_008118	CTG	2	6	66216	66221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793795
1062	NC_008118	ATT	2	6	67008	67013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793832
1063	NC_008118	TACGGT	2	12	67021	67032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	108793832
1064	NC_008118	CTG	2	6	67053	67058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793832
1065	NC_008118	GAC	2	6	67120	67125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793832
1066	NC_008118	GA	3	6	67161	67166	50 %	0 %	50 %	0 %	108793832
1067	NC_008118	TGG	2	6	67211	67216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793832
1068	NC_008118	GCC	2	6	67309	67314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793832
1069	NC_008118	CAA	2	6	67329	67334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793832
1070	NC_008118	TAATTG	2	12	67365	67376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	108793832
1071	NC_008118	CCTT	2	8	67382	67389	0 %	50 %	0 %	50 %	108793832
1072	NC_008118	CAA	2	6	67416	67421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793832
1073	NC_008118	GTG	2	6	67436	67441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793832
1074	NC_008118	AAT	2	6	67484	67489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793832
1075	NC_008118	T	7	7	67512	67518	0 %	100 %	0 %	0 %	108793832
1076	NC_008118	AT	3	6	67520	67525	50 %	50 %	0 %	0 %	108793832
1077	NC_008118	T	6	6	67655	67660	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
1078	NC_008118	TGAT	2	8	67686	67693	25 %	50 %	25 %	0 %	108793797
1079	NC_008118	TC	3	6	67699	67704	0 %	50 %	0 %	50 %	108793797
1080	NC_008118	T	6	6	67728	67733	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
1081	NC_008118	TAT	2	6	67760	67765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793797
1082	NC_008118	GAT	2	6	67786	67791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793797
1083	NC_008118	CCA	2	6	67867	67872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793797
1084	NC_008118	TAC	2	6	67896	67901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793797
1085	NC_008118	ATT	2	6	67932	67937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793797
1086	NC_008118	CAT	2	6	67949	67954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793797
1087	NC_008118	TC	3	6	67988	67993	0 %	50 %	0 %	50 %	108793797
1088	NC_008118	T	6	6	68114	68119	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
1089	NC_008118	TTA	2	6	68144	68149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793797
1090	NC_008118	AATTCA	2	12	68237	68248	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	108793797
1091	NC_008118	AC	3	6	68333	68338	50 %	0 %	0 %	50 %	108793797
1092	NC_008118	TTA	2	6	68401	68406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793797
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1094	NC_008118	T	6	6	68462	68467	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
1095	NC_008118	A	7	7	68529	68535	100 %	0 %	0 %	0 %	108793797
1096	NC_008118	AAG	2	6	68555	68560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793797
1097	NC_008118	T	6	6	68587	68592	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
1098	NC_008118	AATTG	2	10	68642	68651	40 %	40 %	20 %	0 %	108793797
1099	NC_008118	TTA	2	6	68803	68808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793797
1100	NC_008118	CTTT	2	8	68833	68840	0 %	75 %	0 %	25 %	108793797
1101	NC_008118	T	8	8	68838	68845	0 %	100 %	0 %	0 %	108793797
1102	NC_008118	CCA	2	6	68959	68964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793797
1103	NC_008118	C	6	6	69055	69060	0 %	0 %	0 %	100 %	108793797
1104	NC_008118	CTG	2	6	69098	69103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793797
1105	NC_008118	GT	3	6	69104	69109	0 %	50 %	50 %	0 %	108793797
1106	NC_008118	ATGA	2	8	69150	69157	50 %	25 %	25 %	0 %	108793797
1107	NC_008118	CAC	2	6	69170	69175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793797
1108	NC_008118	C	6	6	69177	69182	0 %	0 %	0 %	100 %	108793797
1109	NC_008118	TTAC	2	8	69232	69239	25 %	50 %	0 %	25 %	108793797
1110	NC_008118	AAC	2	6	69294	69299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793797
1111	NC_008118	TAA	2	6	69319	69324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793797
1112	NC_008118	CTCG	2	8	69440	69447	0 %	25 %	25 %	50 %	108793797
1113	NC_008118	TTG	2	6	69474	69479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793797
1114	NC_008118	CCA	2	6	69483	69488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793797
1115	NC_008118	ATA	2	6	69546	69551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793797
1116	NC_008118	CCT	2	6	69568	69573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793797
1117	NC_008118	TAT	2	6	69602	69607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793797
1118	NC_008118	TGG	2	6	69687	69692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793797
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1120	NC_008118	TAAAA	2	10	69719	69728	80 %	20 %	0 %	0 %	108793797
1121	NC_008118	TAA	2	6	69753	69758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793797
1122	NC_008118	TTA	2	6	69785	69790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793797
1123	NC_008118	GAT	2	6	69838	69843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793797
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1125	NC_008118	AAT	2	6	69941	69946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793797
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