MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYV

Total Repeats: 1052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006153	GTC	2	6	55	60	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593847
2	NC_006153	TC	3	6	76	81	0 %	50 %	0 %	50 %	51593847
3	NC_006153	AGT	2	6	130	135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593847
4	NC_006153	ATC	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593847
5	NC_006153	CCT	2	6	185	190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593847
6	NC_006153	GCC	2	6	211	216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593847
7	NC_006153	ATC	2	6	217	222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593847
8	NC_006153	ATAG	2	8	340	347	50 %	25 %	25 %	0 %	51593847
9	NC_006153	CTG	4	12	366	377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593847
10	NC_006153	TGC	2	6	391	396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593847
11	NC_006153	GC	3	6	517	522	0 %	0 %	50 %	50 %	51593847
12	NC_006153	GT	3	6	549	554	0 %	50 %	50 %	0 %	51593847
13	NC_006153	CGA	2	6	593	598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593847
14	NC_006153	GAT	2	6	620	625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593847
15	NC_006153	C	6	6	748	753	0 %	0 %	0 %	100 %	51593847
16	NC_006153	CCA	2	6	776	781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593847
17	NC_006153	C	8	8	806	813	0 %	0 %	0 %	100 %	51593847
18	NC_006153	TGC	2	6	831	836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593847
19	NC_006153	CTT	2	6	879	884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593847
20	NC_006153	CTC	2	6	963	968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593847
21	NC_006153	TGA	2	6	1055	1060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593847
22	NC_006153	TGGAT	2	10	1102	1111	20 %	40 %	40 %	0 %	51593847
23	NC_006153	GTT	2	6	1313	1318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593847
24	NC_006153	AAC	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593847
25	NC_006153	TAC	2	6	1410	1415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593847
26	NC_006153	GT	3	6	1535	1540	0 %	50 %	50 %	0 %	51593847
27	NC_006153	AAC	2	6	1544	1549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593847
28	NC_006153	CATC	2	8	1565	1572	25 %	25 %	0 %	50 %	51593847
29	NC_006153	TCC	2	6	1582	1587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593847
30	NC_006153	CAC	2	6	1605	1610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593847
31	NC_006153	GCCAT	2	10	1612	1621	20 %	20 %	20 %	40 %	51593847
32	NC_006153	GCT	2	6	1736	1741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593847
33	NC_006153	TAT	2	6	1755	1760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593847
34	NC_006153	TGGCT	2	10	1875	1884	0 %	40 %	40 %	20 %	51593847
35	NC_006153	GT	3	6	1958	1963	0 %	50 %	50 %	0 %	51593847
36	NC_006153	AG	3	6	2033	2038	50 %	0 %	50 %	0 %	51593847
37	NC_006153	TCC	2	6	2097	2102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593847
38	NC_006153	CTG	2	6	2266	2271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593848
39	NC_006153	CTG	2	6	2277	2282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593848
40	NC_006153	TCG	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593848
41	NC_006153	TTC	2	6	2389	2394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593848
42	NC_006153	A	7	7	2447	2453	100 %	0 %	0 %	0 %	51593848
43	NC_006153	GCG	2	6	2462	2467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593848
44	NC_006153	GC	3	6	2470	2475	0 %	0 %	50 %	50 %	51593848
45	NC_006153	TCA	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593848
46	NC_006153	ATA	2	6	2546	2551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593848
47	NC_006153	CA	3	6	2577	2582	50 %	0 %	0 %	50 %	51593848
48	NC_006153	GGT	2	6	2653	2658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593848
49	NC_006153	CA	3	6	2665	2670	50 %	0 %	0 %	50 %	51593848
50	NC_006153	CCA	2	6	2974	2979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593849
51	NC_006153	GT	3	6	2994	2999	0 %	50 %	50 %	0 %	51593849
52	NC_006153	TAA	2	6	3002	3007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593849
53	NC_006153	ATG	2	6	3042	3047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593849
54	NC_006153	TCC	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593849
55	NC_006153	CCCT	2	8	3204	3211	0 %	25 %	0 %	75 %	51593849
56	NC_006153	CAG	2	6	3225	3230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593849
57	NC_006153	GGT	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593850
58	NC_006153	TGA	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593850
59	NC_006153	TAA	2	6	3595	3600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593850
60	NC_006153	AGT	2	6	3632	3637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593850
61	NC_006153	T	6	6	3639	3644	0 %	100 %	0 %	0 %	51593850
62	NC_006153	GC	3	6	5012	5017	0 %	0 %	50 %	50 %	229310098
63	NC_006153	CATC	2	8	5107	5114	25 %	25 %	0 %	50 %	229310098
64	NC_006153	GTT	2	6	5131	5136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229310098
65	NC_006153	GCT	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229310098
66	NC_006153	GGTA	2	8	5284	5291	25 %	25 %	50 %	0 %	229310098
67	NC_006153	AGCGC	2	10	5314	5323	20 %	0 %	40 %	40 %	229310098
68	NC_006153	GTA	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229310098
69	NC_006153	CGG	2	6	5486	5491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229310098
70	NC_006153	CG	3	6	5517	5522	0 %	0 %	50 %	50 %	229310098
71	NC_006153	T	7	7	5602	5608	0 %	100 %	0 %	0 %	229310098
72	NC_006153	ATG	2	6	5657	5662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229310098
73	NC_006153	TG	3	6	5661	5666	0 %	50 %	50 %	0 %	229310098
74	NC_006153	TGG	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229310098
75	NC_006153	TCGCC	2	10	5822	5831	0 %	20 %	20 %	60 %	51593852
76	NC_006153	GCCA	2	8	5920	5927	25 %	0 %	25 %	50 %	51593852
77	NC_006153	TC	3	6	6026	6031	0 %	50 %	0 %	50 %	51593853
78	NC_006153	TCTG	2	8	6053	6060	0 %	50 %	25 %	25 %	51593853
79	NC_006153	TGAA	2	8	6113	6120	50 %	25 %	25 %	0 %	51593853
80	NC_006153	T	6	6	6145	6150	0 %	100 %	0 %	0 %	51593853
81	NC_006153	GTT	2	6	6168	6173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593853
82	NC_006153	ATG	2	6	6779	6784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593854
83	NC_006153	GT	3	6	6890	6895	0 %	50 %	50 %	0 %	51593854
84	NC_006153	GCT	2	6	6940	6945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593854
85	NC_006153	AGG	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51593854
86	NC_006153	GGA	2	6	7002	7007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51593854
87	NC_006153	CCA	2	6	7104	7109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593854
88	NC_006153	AT	3	6	7128	7133	50 %	50 %	0 %	0 %	51593854
89	NC_006153	CA	3	6	7140	7145	50 %	0 %	0 %	50 %	51593854
90	NC_006153	TCA	2	6	7518	7523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593855
91	NC_006153	CTGC	2	8	7530	7537	0 %	25 %	25 %	50 %	51593855
92	NC_006153	TTTCCA	2	12	7551	7562	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	51593855
93	NC_006153	CTT	3	9	7644	7652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593855
94	NC_006153	TGAC	2	8	8261	8268	25 %	25 %	25 %	25 %	51593856
95	NC_006153	CTG	2	6	8314	8319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593856
96	NC_006153	CG	3	6	8374	8379	0 %	0 %	50 %	50 %	51593856
97	NC_006153	GGC	2	6	8419	8424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593856
98	NC_006153	GCC	2	6	8428	8433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593856
99	NC_006153	AGA	2	6	8612	8617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593857
100	NC_006153	TGGAAA	2	12	8701	8712	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	51593857
101	NC_006153	GCAG	2	8	8726	8733	25 %	0 %	50 %	25 %	51593857
102	NC_006153	TGA	2	6	8740	8745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593857
103	NC_006153	GCC	2	6	8814	8819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593858
104	NC_006153	GA	3	6	8931	8936	50 %	0 %	50 %	0 %	51593858
105	NC_006153	ATG	2	6	9120	9125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593859
106	NC_006153	ACT	2	6	9418	9423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593859
107	NC_006153	GT	3	6	9459	9464	0 %	50 %	50 %	0 %	51593859
108	NC_006153	GAA	2	6	9467	9472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593859
109	NC_006153	T	6	6	9517	9522	0 %	100 %	0 %	0 %	51593859
110	NC_006153	TTC	2	6	9532	9537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593859
111	NC_006153	GTT	2	6	9551	9556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593859
112	NC_006153	T	6	6	9577	9582	0 %	100 %	0 %	0 %	51593859
113	NC_006153	TTTC	2	8	9651	9658	0 %	75 %	0 %	25 %	51593859
114	NC_006153	CAT	2	6	9681	9686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593859
115	NC_006153	TC	3	6	9756	9761	0 %	50 %	0 %	50 %	51593859
116	NC_006153	CAATTG	2	12	9783	9794	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	51593859
117	NC_006153	TAC	2	6	9939	9944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593859
118	NC_006153	CTTA	2	8	9979	9986	25 %	50 %	0 %	25 %	51593859
119	NC_006153	CTG	3	9	10044	10052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593859
120	NC_006153	GCT	2	6	10058	10063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593859
121	NC_006153	CAG	2	6	10065	10070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593859
122	NC_006153	T	9	9	10161	10169	0 %	100 %	0 %	0 %	51593859
123	NC_006153	CTG	2	6	10281	10286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593859
124	NC_006153	CTC	2	6	10321	10326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593859
125	NC_006153	AAC	2	6	10349	10354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593859
126	NC_006153	ACGT	2	8	11379	11386	25 %	25 %	25 %	25 %	51593860
127	NC_006153	ATC	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593860
128	NC_006153	TCT	2	6	11537	11542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593860
129	NC_006153	GGC	2	6	11709	11714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593860
130	NC_006153	TC	3	6	11715	11720	0 %	50 %	0 %	50 %	51593860
131	NC_006153	CGA	2	6	11747	11752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593860
132	NC_006153	TCA	3	9	11759	11767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593860
133	NC_006153	AAG	2	6	11776	11781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593860
134	NC_006153	ATG	2	6	11813	11818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593860
135	NC_006153	AGCC	2	8	11824	11831	25 %	0 %	25 %	50 %	51593860
136	NC_006153	AGT	2	6	11852	11857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593860
137	NC_006153	CAT	2	6	11914	11919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593860
138	NC_006153	TCA	2	6	11972	11977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593860
139	NC_006153	G	6	6	12042	12047	0 %	0 %	100 %	0 %	51593860
140	NC_006153	TGTC	2	8	12105	12112	0 %	50 %	25 %	25 %	51593860
141	NC_006153	CTG	2	6	12139	12144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593860
142	NC_006153	CGC	2	6	12342	12347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593860
143	NC_006153	GCG	2	6	12355	12360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593860
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145	NC_006153	CTC	2	6	12700	12705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593860
146	NC_006153	CTG	2	6	12719	12724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593860
147	NC_006153	TGT	2	6	12830	12835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593860
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151	NC_006153	CAT	2	6	13089	13094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593860
152	NC_006153	AGG	2	6	13097	13102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51593860
153	NC_006153	T	6	6	13105	13110	0 %	100 %	0 %	0 %	51593860
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159	NC_006153	CGC	2	6	13571	13576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593860
160	NC_006153	AAC	2	6	13653	13658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593860
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162	NC_006153	AGGG	2	8	13997	14004	25 %	0 %	75 %	0 %	51593861
163	NC_006153	CTG	2	6	14012	14017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593861
164	NC_006153	GAA	2	6	14030	14035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593861
165	NC_006153	GAA	2	6	14053	14058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593861
166	NC_006153	GT	3	6	14124	14129	0 %	50 %	50 %	0 %	51593861
167	NC_006153	TGA	2	6	14143	14148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593861
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169	NC_006153	GA	3	6	14251	14256	50 %	0 %	50 %	0 %	51593861
170	NC_006153	GCTAA	2	10	14261	14270	40 %	20 %	20 %	20 %	51593861
171	NC_006153	ACT	2	6	14314	14319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593861
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176	NC_006153	GAA	3	9	15589	15597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593862
177	NC_006153	TGG	2	6	15672	15677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593862
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243	NC_006153	AT	3	6	20085	20090	50 %	50 %	0 %	0 %	51593868
244	NC_006153	TAAG	2	8	20097	20104	50 %	25 %	25 %	0 %	51593868
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252	NC_006153	ATC	2	6	20671	20676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593869
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258	NC_006153	TGG	2	6	21034	21039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593869
259	NC_006153	GGC	2	6	21040	21045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593869
260	NC_006153	GCAG	2	8	21079	21086	25 %	0 %	50 %	25 %	51593869
261	NC_006153	TAC	2	6	21280	21285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593870
262	NC_006153	ATCTAT	2	12	21309	21320	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	51593870
263	NC_006153	GCA	2	6	21329	21334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593870
264	NC_006153	TA	3	6	21366	21371	50 %	50 %	0 %	0 %	51593870
265	NC_006153	TA	3	6	21373	21378	50 %	50 %	0 %	0 %	51593870
266	NC_006153	TCA	2	6	21553	21558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593870
267	NC_006153	GCA	2	6	21596	21601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593871
268	NC_006153	A	6	6	21603	21608	100 %	0 %	0 %	0 %	51593871
269	NC_006153	AT	3	6	21729	21734	50 %	50 %	0 %	0 %	51593871
270	NC_006153	CAG	2	6	21961	21966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593872
271	NC_006153	CAC	2	6	22098	22103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593872
272	NC_006153	TCA	2	6	22157	22162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593872
273	NC_006153	GGAT	2	8	22385	22392	25 %	25 %	50 %	0 %	51593873
274	NC_006153	CAT	2	6	22412	22417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593873
275	NC_006153	AGAT	2	8	22447	22454	50 %	25 %	25 %	0 %	51593873
276	NC_006153	TGA	2	6	22460	22465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593873
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279	NC_006153	TTC	2	6	23159	23164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593875
280	NC_006153	AGAA	2	8	23203	23210	75 %	0 %	25 %	0 %	51593875
281	NC_006153	T	7	7	23254	23260	0 %	100 %	0 %	0 %	51593875
282	NC_006153	GTT	2	6	23275	23280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593875
283	NC_006153	TC	3	6	23282	23287	0 %	50 %	0 %	50 %	51593875
284	NC_006153	TTC	2	6	23309	23314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593875
285	NC_006153	GTA	2	6	23316	23321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593875
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288	NC_006153	AAT	2	6	23498	23503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593875
289	NC_006153	GA	4	8	23509	23516	50 %	0 %	50 %	0 %	51593875
290	NC_006153	TCG	2	6	23602	23607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593875
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293	NC_006153	CTG	2	6	23771	23776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593875
294	NC_006153	ACG	2	6	23812	23817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593875
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297	NC_006153	TTCC	2	8	23916	23923	0 %	50 %	0 %	50 %	51593875
298	NC_006153	AAGC	2	8	23971	23978	50 %	0 %	25 %	25 %	51593875
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301	NC_006153	AATT	2	8	24043	24050	50 %	50 %	0 %	0 %	51593875
302	NC_006153	TCA	2	6	24082	24087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593875
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339	NC_006153	GCCA	3	12	26627	26638	25 %	0 %	25 %	50 %	51593879
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355	NC_006153	TCA	2	6	28588	28593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593882
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360	NC_006153	ATT	2	6	28740	28745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593882
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362	NC_006153	AACA	2	8	28895	28902	75 %	0 %	0 %	25 %	51593882
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380	NC_006153	TTC	2	6	30326	30331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593883
381	NC_006153	AGG	2	6	30471	30476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51593883
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383	NC_006153	ATC	2	6	30608	30613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593884
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386	NC_006153	TTTG	2	8	30669	30676	0 %	75 %	25 %	0 %	51593884
387	NC_006153	CAA	2	6	30736	30741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593884
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391	NC_006153	GTT	2	6	31545	31550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593885
392	NC_006153	ATT	2	6	31559	31564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593885
393	NC_006153	ATT	2	6	31597	31602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593886
394	NC_006153	GCA	2	6	31604	31609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593886
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396	NC_006153	TTA	2	6	31637	31642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593886
397	NC_006153	TAT	3	9	31661	31669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593886
398	NC_006153	TAAA	2	8	31754	31761	75 %	25 %	0 %	0 %	51593886
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405	NC_006153	GTC	2	6	32637	32642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593887
406	NC_006153	A	6	6	32911	32916	100 %	0 %	0 %	0 %	51593888
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